何川、贾桂芳Nature子刊发布表观遗传学新成果
来自芝加哥大学、北京大学的研究人员在新研究中,揭示出了拟南芥m6A甲基化组(methylome)的独特特征。他们的研究结果发表在11月28日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 芝加哥大学的何川(Chuan He)教授、Joy Bergelson教授以及北京大学的贾桂芳(Guifang Jia)副教授是这篇论文的共同通讯作者。 N6-甲基腺苷(N6-methyl-adenosine(m6A))是发生在碱基A第六位N原子上的甲基化形式,作为真核生物RNA最常见的一种RNA转录后修饰,其导致了超过80%的RNA碱基甲基化,在各种物种都可以观察到这种RNA修饰。 这种修饰方式是在2012年由来自康奈尔大学维尔医学院的研究人员所发现。当时研究人员发现长期被视作是生成蛋白质的简单蓝图的信使RNA(mRNA),它的一个碱基腺嘌呤上往往会被添加一个甲基而发生化学修饰。过去mRNA被认为只包含4个碱基,......阅读全文
全套病毒RNA-m6A甲基化修饰研究工具的使用(二)
那么,病毒RNA修饰的研究工作流程有哪些呢? 首先,提取病毒RNA 无论您是从细胞,组织还是病毒等样品开始实验,高效而快速的RNA提取通常都是成功进行实验的第一步。工作流程的这一部分至关重要,因为足够的纯度和产量都是确保下游应用程序平稳准确运行的基本要求。
甲基化检测方法(亚硫酸氢盐修饰后测序法)1
第一部分 基因组DNA的提取。这一步没有悬念,完全可以购买供细胞或组织使用的DNA提取试剂盒,如果实验室条件成熟,自己配试剂提取完全可以。DNA比较稳定,只要在操作中不要使用暴力,提出的基因组DNA应该是完整的。此步重点在于DNA的纯度,即减少或避免RNA、蛋白的污染很重要。因此在提取过程中需使用蛋
6mA甲基化修饰调控工业微藻油脂合成过程揭示
微藻在全球光合作用、二氧化碳固定及初级生产力中贡献卓著,是颇有前景的合成生物学底盘细胞。为了探索工业固碳产油微藻的表观遗传机制和生理作用,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心以海洋微拟球藻为模式,解析了野生型和6mA扰动突变株中N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,6
全套病毒RNA-m6A甲基化修饰研究工具的使用(一)
如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行对我们有任何启发的话,那么要数对RNA修饰的研究了,此时研究病毒RNA以及其甲基化修饰等功能,显得比以往任何时候都更加重要。 而这是否意味着要研究病毒RNA本身不同的各种突变体或者表观遗传变化如何使这些病毒更灵活和感染力?还是研究从细胞和
全套病毒RNA-m6A甲基化修饰研究工具的使用(三)
随后, 需要检测m6A甲基化酶和脱甲基酶活性 如果您打算研究RNA甲基化酶或去甲基化酶的活性/抑制作用,我们建议您使用上述提到的功能强大的核提取试剂盒(OP-0002),该试剂盒可以快速提取核蛋白,同时可确保提取后的酶活性保持完整。 收集了核提取物后,进行甲
研究揭示叶绿体核糖体RNA甲基化修饰的机制和功能
核糖体RNA(rRNA)的甲基化修饰是生物界中普遍存在的一种转录后修饰机制,可以改变rRNA分子的局部空间结构,从而优化核糖体的蛋白翻译效率。不同物种之间的rRNA甲基化程度存在明显差别,是rRNA进化的标志性事件之一。叶绿体是高等植物中重要的细胞器,由蓝细菌经过内共生过程演化而来,具有自己的核
甲基化检测方法(亚硫酸氢盐修饰后测序法)(2)
第三部分 修饰后DNA纯化回收EP管如无特别说明均为高压蒸汽灭菌的。1. 将移液器枪头伸入石蜡油层下,先轻轻加压使其中一小段石蜡油排出,然后吸取混合液至一洁净1.5mlEP管中。2:以下使用Promega Wizard Cleanup DNA纯化回收系统(Promega,A7280)1)70℃水浴预
Genome-research:不同RNA-m5C甲基化修饰存在巨大差异
导读 近年来,RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰,也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期,来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RES
Genome-research:不同RNA-m5C甲基化修饰存在巨大差异
近年来,RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰,也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期,来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RESEARCH(
Cell-Res,Science发现新型RNA修饰m6Am甲基转移酶
RNA上存在一百多种化学修饰,其中N6-甲基腺嘌呤(m6A)作为真核生物mRNA上含量最普遍的化学修饰,参与调控了很多重要的生物学过程。不同于m6A,m6Am主要位于真核生物mRNA 5'端帽子之后的第一个碱基。早在1975年,科学家就鉴定到了m6Am的存在。 一项最近的研究发现m6A
研究揭示RNA甲基化修饰调控哺乳动物细胞微环境维持机制
近期,中国科学院西北生态环境资源研究院西北高原生物研究所研究员杨其恩课题组以小鼠为模型,揭示RNA甲基化修饰调控哺乳动物精原干细胞微环境维持的新机制。 成体干细胞命运决定受到特殊微环境调控,在大多数组织中,微环境的形成和维持机制并不明确。精原干细胞是一类经典的成体干细胞,是哺乳动物精子发生的基
生物物理所等在组蛋白甲基化修饰识别方面取得新进展
10月17日,《美国国家科学院院刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences)在线发表了生物大分子国家重点实验室许瑞明、饶子和课题组和北京生命科学研究所(NIBS)朱冰课题组合作的最新研究成果Distinct mode of
杰青学者Oncotarget最新文章-癌症转移过程中的甲基化修饰
表观基因组学指的就是指导基因关闭或开启的DNA修饰,科学家们发现一些表观缺陷会引发癌症,而且目前预测脑癌患者预后的方法也是基于表观肿瘤亚型。然而,表观基因组学十分复杂,作用机理并不十分明确。近期来自中科院遗传与发育生物学研究所的研究人员揭示TET2和TET3基因的甲基化修饰是黑色素瘤发生类EMT过程
研究揭示RNA去甲基化酶的氧化还原修饰调控番茄果实成熟机制
活性氧作为重要的信号分子,在植物抵御病原菌侵染、响应逆境胁迫以及维持正常生长发育的多个生物学过程中发挥重要的调控作用。在多种活性氧分子中,过氧化氢具有较长的半衰期,可调控干细胞分化、花粉管伸长、气孔发育、果实成熟等植物发育过程,但过氧化氢如何与其他信号途径协同作用,共同调控植物发育过程却不甚清楚。中
汪洌团队阐明甲基化修饰对肠道ILC3在免疫衰老中的调控
随着年龄的增长,全身免疫功能的退化被称为免疫衰老(immune-senescence),最终导致疫苗接种反应差、持续的低级别炎症和感染敏感性的增加。近几年来,我国人群的老龄化趋势日趋加剧,因此研究衰老进程中的免疫系统功能变化意义重大。肠道作为一个具有多种免疫细胞类型的复杂器官系统,在衰老过程中表
m5C高分m5C甲基化修饰技术研究方向汇总(一)
前言RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程,目前对m6A RNA甲基化的研究已进行的如火如荼,但除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达,其中包括m5C甲基化修饰在近期的研究中也不断有高分文章的出现(如表1)。云序生物是国内RNA修饰测序的领跑者,可针对mRNA
m5C高分m5C甲基化修饰技术研究方向汇总(二)
3. m5C——RNA测序提出对拟南芥转录组复杂性的新见解发表期刊:Nucleic Acids Research影响因子:11.5发表时间:2020.08.20文章链接:New insights into Arabidopsis transcriptome complexity revealed b
SUMO化修饰调控m6A-RNA甲基化酶METTL3及其催化功能
RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域,近3个月以来,该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析,感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号(2018国自然热点二:RNA甲基化研究深度剖析)。 近三个月高分文章部分列表: 2月28日
m6A(N6甲基腺嘌呤)修饰在动脉粥样硬化中的作用
动脉粥样硬化(atherosclerosis)是心血管系统最常见的疾病之一,对人类健康有严重危害。内皮细胞炎症反应作为动脉粥样硬化的第一步,会导致内皮细胞的通透性增加、屏障功能受损以及粘附分子的表达,促使单核细胞迁移并粘附于血管内皮表面,进而引发动脉粥样硬化的发生和发展。 N6-甲基腺嘌呤(m6A)
何川、贾桂芳研究组发文:植物mRNA化学修饰m6A去甲基酶
近期,北京大学化学学院的何川、贾桂芳课题组在在高等植物N6-甲基腺嘌呤(m6A)动态可逆调控的研究中取得重要进展,相关工作以“ALKBH10B is An RNA N6-Methyladenosine Demethylase Affecting Arabidopsis Floral Transi
多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰
荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物,受到紫外光或蓝紫光照射时,可激发成为激发态,当从激发态恢复基态时,发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上,利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染,操
PEG修饰及其修饰GLP1的意义
PEG修饰是一个使多肽或蛋白质在治疗或生物技术方面的效力得以提高的重要过程。当PEG以适当的方式连接在蛋白质或多肽上时,它能改变许多的特征,而主要的生物活性功能,如酶活性或特异结合位点,可以保留下来。PEG修饰通过如下几种途径改善药物的性能。首先,PEG连接在蛋白质或多肽的表面上,提高了它的分子大小
多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰
荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物,受到紫外光或蓝紫光照射时,可激发成为激发态,当从激发态恢复基态时,发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上,利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染,操
RNA加工修饰
中文名RNA加工修饰所属领域生物学定义RNA加工修饰,主要加工方式是切断和碱基修饰,真核生物tRNA前体一般无生物学特性,需要进行加工修饰。
翻译后修饰
中文名翻译后修饰外文名Post-translational modification定义翻译后修饰是指蛋白质在翻译后的化学修饰。对于大部分的蛋白质来说,这是蛋白质生物合成的较后步骤。
METTL3调控m6A甲基化修饰对小鼠脂肪细胞发育的重要作用
今 天我们为大家解读一篇今年4月3日发表在Nature communication(IF=11.878)的文章,作者研究了m6A修饰对小鼠脂肪组织发育的影响。 棕色脂肪组织(BAT)通过线粒体产生并耗散热量,对机体起到保暖和控制肥胖的重要作用,而BAT的出生后发育,正是它们获得这些功能的关
α微管蛋白三甲基化修饰在神经系统发育过程中作用机制
7月5日,Nature Communications在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员鲍岚课题组的最新研究进展——α-TubK40me3 is required for neuronal polarization and migration by p
METTL3调控m6A甲基化修饰对小鼠脂肪细胞发育的重要作用
今 天我们为大家解读一篇今年4月3日发表在Nature communication(IF=11.878)的文章,作者研究了m6A修饰对小鼠脂肪组织发育的影响。 棕色脂肪组织(BAT)通过线粒体产生并耗散热量,对机体起到保暖和控制肥胖的重要作用,而BAT的出生后发育,正是它们获得这些功能的关
多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰(一)
荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物,受到紫外光或蓝紫光照射时,可激发成为激发态,当从激发态恢复基态时,发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上,利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染,操作简
多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰(二)
(2)在整条肽中的某个Lys侧链接入FITC,Lys侧链为末端为-NH2的四碳直链烷基,直接起到了降低空间位阻的作用。这种修饰方式能够灵活的在整条肽中任何位置进行FITC修饰,而不仅仅局限于末端。我们所采用的FITC修饰多肽的两种形式,都具有操作简便,成功率高,容易分离纯化等优点。2.AMC修饰7-