何川、贾桂芳Nature子刊发布表观遗传学新成果
来自芝加哥大学、北京大学的研究人员在新研究中,揭示出了拟南芥m6A甲基化组(methylome)的独特特征。他们的研究结果发表在11月28日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 芝加哥大学的何川(Chuan He)教授、Joy Bergelson教授以及北京大学的贾桂芳(Guifang Jia)副教授是这篇论文的共同通讯作者。 N6-甲基腺苷(N6-methyl-adenosine(m6A))是发生在碱基A第六位N原子上的甲基化形式,作为真核生物RNA最常见的一种RNA转录后修饰,其导致了超过80%的RNA碱基甲基化,在各种物种都可以观察到这种RNA修饰。 这种修饰方式是在2012年由来自康奈尔大学维尔医学院的研究人员所发现。当时研究人员发现长期被视作是生成蛋白质的简单蓝图的信使RNA(mRNA),它的一个碱基腺嘌呤上往往会被添加一个甲基而发生化学修饰。过去mRNA被认为只包含4个碱基,......阅读全文
SUMO化修饰调控m6A-RNA甲基化酶METTL3及其催化功能分子机制
RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域,近3个月以来,该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析,感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号(2018国自然热点二:RNA甲基化研究深度剖析)。 近三个月高分文章部分列表: 2月28日
METTL3调控m6A甲基化修饰对小鼠脂肪细胞发育的重要作用1
文章导读今 天我们为大家解读一篇今年4月3日发表在Nature communication(IF=11.878)的文章,作者研究了m6A修饰对小鼠脂肪组织发育的影响。棕色脂肪组织(BAT)通过线粒体产生并耗散热量,对机体起到保暖和控制肥胖的重要作用,而BAT的出生后发育,正是它们获得这些功能的关键。
METTL3调控m6A甲基化修饰对小鼠脂肪细胞发育的重要作用2
(2)BAT中敲除Mettl3对基因表达的影响为了研究iBAT发育中的分子机制,作者进行了RNA-seq(云序可提供此服务),分析比较了BKO和正常小鼠的iBAT中基因的表达情况。GO分析表明BKO小鼠iBAT下调基因中富集了与发育、产热等功能相关基因,而上调基因中富集的多与炎症、肌肉发育相关。qP
揭秘神经发育过程中m6ARNA甲基化与组蛋白修饰间的关系2
(3)Mettl14缺失导致晚期出生神经元数量减少在P0小鼠中,作者通过特定标记识别相应的神经元亚型,在六个不同的皮层中发现了RGCs分化的神经元。其中,Cux1在晚期出生的神经元中表达,是II-IV的标记物,对标记信号进行定量结果表明相比于CK小鼠而言Mettl14-cKO小鼠中Cux1+的信号值
揭秘神经发育过程中m6ARNA甲基化与组蛋白修饰间的关系1
文章导读表观转录组学的研究在生物发育和疾病相关性等方面正越来越引起人们的关注。其中m6A修饰的研究是表观转录组学研究的一大热点。研究表明,m6A标签在mRNA和lncRNA中超过10,000种,并且m6A参与mRNA的转录后修饰也成为基因表达中的一种重要的调控机制。m6A的在基因表达调控方面功能作用
METTL3调控m6A甲基化修饰对小鼠脂肪细胞发育的重要作用3
(4)体外细胞实验验证METTL3对棕色脂肪形成的作用为验证METTL3是否直接影响棕色脂肪细胞的分化,作者分离出正常小鼠的棕色前体脂肪细胞,通过转染敲除Mettl3,发现前体细胞发生分化异常,并且其内棕色脂肪细胞标志基因、分化相关基因、产热相关基因、脂肪生成和分解基因、脂肪酸氧化基因等表达均下调。
核酸的修饰酶
The restriction/modification system in bacteria is a small-scale immune systemfor protection from infection by foreign DNA. W. Arber and S. Linn (1969
修饰系统的定义
中文名称修饰系统英文名称modification system定 义参与修饰作用的组成与机制。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),总论(二级学科)
修饰碱基的概念
又称修饰碱基,这些碱基在核酸分子中含量比较少,但他们是天然存在不是人工合成的,是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。
修饰碱基的概念
又称稀有碱基,这些碱基在核酸分子中含量比较少,但他们是天然存在不是人工合成的,是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。
DNA修饰的概念
中文名称DNA修饰英文名称DNA modification定 义DNA合成后,通过一系列化学加工使其结构发生某些改变。如DNA的甲基化等。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
修饰碱基的作用以及常见的修饰碱基是什么?
DNA和RNA分子中还含有核酸链形成后经过修饰形成的其它非主要碱基。这些碱基大多是在上述嘌呤或嘧啶碱的不同部位甲基化(methylation)或进行其它的化学修饰而形成的衍生物。DNA中最常见的修饰碱基是5-甲基胞嘧啶(m5C)。RNA中有许多修饰的碱基,包括核苷类假尿苷(Ψ)、二氢尿苷(D)、肌苷
从修饰肽序列中判定修饰肽的溶解性方法
1.非HPLC纯化的修饰肽中有哪些杂质?答:粗品和脱盐级别的修饰肽中修饰肽和非修饰肽类杂质:如非全长修饰肽和修饰肽后处理的一些原料如DTT、TFA等。2.HPLC纯化的修饰肽有哪些杂质?答:经过HPLC纯化的修饰肽,仍会有一些一些杂质存在,其中的杂质主要是短肽和微量TFA。3.多长的修饰肽为合适?答
SUMO化修饰调控m6A-RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种...
SUMO化修饰调控m6A RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种全新分子机制RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域,近3个月以来,该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析,感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号(2018国自然热点二:R
甲基化的甲基化的功能
甲基化是蛋白质和核酸的一种重要的修饰,调节基因的表达和关闭,与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关,是表观遗传学的重要研究内容之一。 最常见的甲基化修饰有DNA甲基化和组蛋白甲基化。DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、D
什么是化学修饰?
凡通过化学基团的引入或除去,而使蛋白质或核酸共价结构发生改变的现象。
细胞化学词汇DNA修饰
中文名称:DNA修饰英文名称:DNA modification定 义:DNA合成后,通过一系列化学加工使其结构发生某些改变。如DNA的甲基化等。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
限制修饰系统结构
细菌的限制修饰系统包含三个连锁基因:(1)hsd R:编码限制性核酸内切酶(2)hsd M:编码限制性甲基化酶(3)hsd S:编码限制性酶和甲基化酶的协同表达
细胞化学基础修饰碱基
又称稀有碱基,这些碱基在核酸分子中含量比较少,但他们是天然存在不是人工合成的,是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。如:5-甲基胞苷、5,6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷:假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同,即尿嘧啶5位碳与核苷形成
GSDMD的棕榈酰化修饰
GSDMD是细胞焦亡过程中的关键蛋白,此前的研究表明GSDMD在细胞焦亡发生时可被Caspase切割,从而释放出N端结构域,释放出的N端结构域进一步形成寡聚体并上膜打孔,最终造成细胞死亡。但此前的研究发现人源GSDMD的C191A突变体会影响其寡聚和造成细胞死亡的能力,因此本文作者尝试探究GSDMD
组蛋白修饰的意义
通过影响组蛋白与DNA双链的亲和性,从而改变染色质的疏松或凝集状态,或通过转录因子与结构基因启动子的亲和性来发挥基因调控作用。这些修饰之间存在协同和级联效应,更为灵活地影响染色质的结构与功能,通过多种修饰方式的组合发挥其调控功能。
多肽合成与修饰技术
实验技术:多肽 合成是一个固相合成顺序一般从C端(羧基端)向 N端(氨基端)合成。过去的多肽合成是在溶液中进行的称为液相合成法。从1963年Merrifield发展成功了固相多肽合成方法以来,经过不断的改进 和完善,到今天固相法已成为多肽和蛋白质合成中的一个常用技术,表现出了经典液相合成
表观遗传学修饰
组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节,这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因
何谓化学修饰调节
凡通过化学基因的引入或除去,而使蛋白质或核酸共价结构发生改变的现象。化学修饰(chemical modification)调节方式有别于别构调节。它以引起酶分子共价键的变化、化学结构的改变而影响酶活性。酶的化学修饰是在另一种酶的催化下完成的,是体内快速调节的另一种重要方式。化学修饰的方式包括磷酸化与
甲基红试验
培养基: 葡萄糖 0.5g 多价蛋白胨 0.5g 磷酸氢二钾 0.5g 蒸馏水 100ml 将上述成分溶于蒸馏水,校更pH为 7.2,分装,高压灭菌121℃10min,冷却备用。 试剂:甲基红 0.1g溶于95%乙醇 300ml,然后加蒸馏水至500ml。 方法:将待检菌接种
食品中1甲基咪唑、2甲基咪唑及4甲基咪唑的测定
GB 5009.282-2020 食品安全国家标准 食品中1-甲基咪唑、2-甲基咪唑及4-甲基咪唑的测定GB5009.282-2020.pdf
聚乙二醇修饰剂(PEG修饰剂)及其他衍生物(二)
分枝型PEG修饰G-CSF 、直链型PEG修饰G-CSF及未修饰G-CSF 的药代动力学比较,分枝型PEG修饰产物半衰期可提高5倍以上。PEG-PTS修饰G-CSF的HPSEC检测,证明其具有高的修饰选择性,且活性保持60%以上 mPEG-hydrazide修
筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控...
筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控机制技术简介用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过Western Blot检测特定的RNA结合蛋白是否与R
聚乙二醇修饰剂(PEG修饰剂)及其他衍生物(一)
一、聚乙二醇修饰剂 近年来,蛋白质多肽等生物大分子药物和天然产物药物分子被越来越多的应用于疾病治疗领域,极大地推动了医药事业的发展。然而,生物大分子在药用过程中的作用却由于其半衰期短、容易产生免疫原性抗原性、易被酶解、有一定药理毒性等问题被大大限制。为有效解决该问题,国家生化工程技术研
聚聚乙二醇修饰剂(PEG修饰剂)及其他衍生物
一、聚乙二醇修饰剂 近年来,蛋白质多肽等生物大分子药物和天然产物药物分子被越来越多的应用于疾病治疗领域,极大地推动了医药事业的发展。然而,生物大分子在药用过程中的作用却由于其半衰期短、容易产生免疫原性抗原性、易被酶解、有一定药理毒性等问题被大大限制。为有效解决该问题,国家生化