基因组的三维结构

摘要: 阐明染色质复杂结构的技术有染色质构象捕获(chromatin conformation capture, 3C)及更高通量的衍生技术4C、5C,这些提供了长距离的染色质相互作用,但不能扩展到整个染色质相互反应组。在2009年末,两种新方法的迸发,有望绘出全基因组范围的相互作用图谱。 如果将人的所有染色体相连并充分伸展的话,其长度可达2米左右,如此庞大的DNA链要全部储存在直径约10微米的细胞核中。此外,基因及其调控元件需要交流,染色质必须打开,允许转录和复制。因此,人们常常提出这样的疑问:“基因的线性顺序与空间排布如何关联?”“基因如何被遥远的元件所调控?”。 阐明染色质复杂结构的技术有染色质构象捕获(chromatin conformation capture, 3C)及更高通量的衍生技术4C、5C,这些提供了长距离的染色质相互作用,但不能扩展到整个染色质相互反应组。在2009年末,两种新方法的迸发,有......阅读全文

双链DNA探针切口平移法

当双链DNA 分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA 聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'端补上核苷酸,从而使切口沿着DNA

基因组DNA的提取

基因组DNA的提取概 述   基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分

基因组DNA的定义

中文名称基因组DNA英文名称genomic DNA定  义组成生物基因组的所有DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

基因组DNA的提取

第一节 概 述DNA的提取通常用于构建文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中,可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部,

纯化DNA实验_基因组DNA的快速纯化

试剂、试剂盒尾部缓冲液蛋白酶 K仪器、耗材离心管玻璃棒实验步骤第 1 天1. 大约 1.5 cm 长的尾部活检样品放在一个 1.5 ml 盛有 0.7 ml 尾部缓冲液的小离心管中,加 35 ul 10 mg/ml 蛋白酶 K,在 55℃ 振摇温育过夜。尾部缓冲液(配 25 ml)50 mmol/L

DNA的Feulgen染色法

1.目的与原理实验目的:   学习DNA的Feulgen染色方法,观察染色结果,了解反应原理。实验原理:   DNA经弱酸(1mol/L HCl)水解,其上的嘌呤碱和脱氧核糖之间的键打开,使脱氧核糖的一端形成游离的醛基,这些醛基在原位与Schiff试剂(无色品红亚硫酸溶液)反应,形成紫红色的化合物,

DNA的Feulgen染色法

1.目的与原理 实验目的: 学习DNA的Feulgen染色方法,观察染色结果,了解反应原理。 实验原理: DNA经弱酸(1mol/L HCl)水解,其上的嘌呤碱和脱氧核糖之间的键打开,使脱氧核糖的一端形成游离的醛基,这些醛基在原位与Schiff试剂(无色品红亚

DNA的Feulgen染色法

1.目的与原理实验目的:学习DNA的Feulgen染色方法,观察染色结果,了解反应原理。实验原理:DNA经弱酸(1mol/L HCl)水解,其上的嘌呤碱和脱氧核糖之间的键打开,使脱氧核糖的一端形成游离的醛基,这些醛基在原位与Schiff试剂(无色品红亚硫酸溶液)反应,形成紫红色的化合物,使细胞内含有

染色体外DNA的定义

中文名称染色体外DNA英文名称extrachromosomal DNA定  义存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

染色体外DNA的定义

中文名称染色体外DNA英文名称extrachromosomal DNA定  义存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

DNA荧光染色的样品制备

试剂、试剂盒 PBS仪器、耗材 DNA荧光染料 流式细胞仪实验步骤 DNA是细胞内含量比较恒定的参量,随着细胞增殖周期的各时相而发生变化。荧光染料(如PI)可选择性地定量嵌入核酸(DNA/RNA)的双螺旋碱基之间,与细胞特异性结合,DNA含量与荧光染料的结合量成正比,因此通过测定荧光强度可获知细胞的

染色体DNA的提取

一、实验目的与原理DNA是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象。DNA的提取是分子生物学实验技术中的最重要、最基本的操作。本实验通过植物样品在液氮下研磨以粉碎组织,通过裂解液裂解细胞,有机溶剂反复抽提,使DNA进入水相与蛋白质成分分开,在RNase作用下,降解RNA以纯

抗双链DNA抗体(aniDNA)的临床意义

  阳性或增高:  可能为系统性红斑狼疮,还可见于其他结缔组织病、慢性活动性肝炎等。  结果阳性可能疾病:  系统性红斑狼疮 、 系统性红斑狼疮性关节炎 、 系统性红斑狼疮所致脊髓病。

抗双链DNA抗体(aniDNA)的临床意义

  阳性或增高:  可能为系统性红斑狼疮,还可见于其他结缔组织病、慢性活动性肝炎等。  结果阳性可能疾病:  系统性红斑狼疮 、 系统性红斑狼疮性关节炎 、 系统性红斑狼疮所致脊髓病。

抗双链DNA抗体(aniDNA)的正常值

  Farr法结合活性小于或等于20%。  间接免疫荧光法阴性。  斑点免疫结合试验小于1:40(阴性)。  (注具体参考值请根据各实验室而定。)

抗双链DNA抗体(aniDNA)的正常值

  Farr法结合活性小于或等于20%。  间接免疫荧光法阴性。  斑点免疫结合试验小于1:40(阴性)。  (注具体参考值请根据各实验室而定。)

抗双链DNA抗体(aniDNA)的检查过程

  检查方法:测定抗双链dSDNA的方法有多种,如免疫扩散、对流免疫电泳、凝集试验、科体结合试验、间接免疫荧光法、放射免疫分析、酶联免疫吸附法等。目前最常用的是放射免疫分析、间接免疫荧光和酶联免疫吸附法。

抗双链DNA抗体(aniDNA)的临床意义

  阳性或增高:  可能为系统性红斑狼疮,还可见于其他结缔组织病、慢性活动性肝炎等。  结果阳性可能疾病:  系统性红斑狼疮 、 系统性红斑狼疮性关节炎 、 系统性红斑狼疮所致脊髓病。

抗双链DNA抗体(aniDNA)的检查过程

  检查方法:测定抗双链dSDNA的方法有多种,如免疫扩散、对流免疫电泳、凝集试验、科体结合试验、间接免疫荧光法、放射免疫分析、酶联免疫吸附法等。目前最常用的是放射免疫分析、间接免疫荧光和酶联免疫吸附法。

抗双链DNA抗体(aniDNA)的注意事项

  检查时要求:一般认为抗双链DNA的效价与病情相平行,即病情活动时,抗DNA抗体效价升高,病情缓解时,效价降低。由于各地测定的方法不同,所以正常值也不同,一般来说,结合率要大于20%以上才有临床意义。  检测技术的特异性都不是100%的。例如,绿蝇短膜虫动基体中虽不含ssDNA,但可能含少量组蛋白

如何判断提取的DNA是高纯度的双链DNA

首先:可以通过分光光度计A 260 / A 280的比值,用于评估样品的纯度,因为蛋白的吸收峰是 280 nm.纯净的样品,比值大于 1.8(DNA)或者2.0(RNA).如果比值低于 1.8 或者2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响.A 230表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物,多肽,苯酚

抗双链DNA抗体(aniDNA)的检查过程

  检查方法:测定抗双链dSDNA的方法有多种,如免疫扩散、对流免疫电泳、凝集试验、科体结合试验、间接免疫荧光法、放射免疫分析、酶联免疫吸附法等。目前最常用的是放射免疫分析、间接免疫荧光和酶联免疫吸附法。

血基因组DNA提取实验——血基因组DNA-试剂盒提取法

血基因组DNA提取可用于:(1)从冻全血、血浆、血清、骨髓、其他体液、淋巴细胞、培养细胞、病毒和线粒体中提取DNA;(2)用于后续测序、遗传信息学等研究。实验方法原理采用特殊的细胞裂解和蛋白去除液(包括蛋白酶K 裂解)从抗凝全血中得到基因组DNA。实验材料抗凝全血试剂、试剂盒血基因组DNA 试剂盒仪

什么是抗双链DNA抗体测定

  抗双链DNA抗体测定是对抗双链DNA抗体的测定。抗双链DNA抗体又称为抗天然DNA抗体,是抗核抗体的一种类型,几乎所有红斑狼疮病人都有该抗体的升高。目前认为,它在红斑狼疮的发病中起一定的作用,在一些病人中,DNA的大分子可存在于循环血液中或者粘附于多种器官的微血管上,如肾脏、肺和脑组织,与血液中

活人细胞中四链DNA的形成

DNA通常形成经典的双螺旋形状-两股彼此缠绕。实验室中已经形成了其他几种结构,但这并不一定意味着它们在活细胞内形成。先前已在细胞中检测到称为DNA G-四链体的四重螺旋结构。然而,所使用的技术需要杀死细胞或使用高浓度的化学探针来可视化其形成,因此尚未追踪其在正常条件下在活细胞中的实际存

分子遗传学词汇双链DNA

中文名称:双链DNA英文名称:double-stranded DNA;dsDNA定  义:由两条DNA单链通过碱基互补作用而构成的DNA分子。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

DNA四链体的结构和分类

中文名称DNA四链体英文名称DNA tetraplex定  义富含鸟嘌呤序列的四链DNA所形成的一种结构。已发现两种主要的类型,一类为重复的鸟嘌呤序列的回折形成的反平行链;另一类由四条独立的平行链相系而成。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

抗双链DNA抗体参考值

  健康人血清1:10稀释为阴性(绿蝇短膜虫法)。  健康人结合率≤20%(放射免疫分析法Farr试验)。  一般以待测血清A值/阴性对照A值(P/N)≥2.1为阳性,正常人P/N值<2.1(ELISA法)。  正常人为阴性(NC膜上不出现着色点)(滴金免疫渗滤试验)。

单链DNA文库的SELEX筛选实验

单链DNA文库的SELEX筛选实验可用于:(1)体外诊断;(2)体内治疗等。实验方法原理SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外,还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选,而且 DNA 文库具有更好的稳定性,操作也相对简便。实验材料3

细胞化学词汇双链DNA结合域

中文名称:双链DNA结合域外文名称:dsDNA-binding domain定       义:双链DNA结合域,DNA结合蛋白中与双链DNA结合的结构域。作       用:双杂交系统的基础是在一些转录因子上发现的模域(modular domains):一个DNA结合域,它可以结合一段特异的DNA