基因组的三维结构

摘要: 阐明染色质复杂结构的技术有染色质构象捕获(chromatin conformation capture, 3C)及更高通量的衍生技术4C、5C,这些提供了长距离的染色质相互作用,但不能扩展到整个染色质相互反应组。在2009年末,两种新方法的迸发,有望绘出全基因组范围的相互作用图谱。 如果将人的所有染色体相连并充分伸展的话,其长度可达2米左右,如此庞大的DNA链要全部储存在直径约10微米的细胞核中。此外,基因及其调控元件需要交流,染色质必须打开,允许转录和复制。因此,人们常常提出这样的疑问:“基因的线性顺序与空间排布如何关联?”“基因如何被遥远的元件所调控?”。 阐明染色质复杂结构的技术有染色质构象捕获(chromatin conformation capture, 3C)及更高通量的衍生技术4C、5C,这些提供了长距离的染色质相互作用,但不能扩展到整个染色质相互反应组。在2009年末,两种新方法的迸发,有......阅读全文

染色质DNA基因组的介绍

  凡是具有细胞形态的生物其遗传物质都是DNA,只有少数病毒的遗传物质是RNA。在真核细胞中,每条未复制的染色体包含一条纵向贯穿的DNA分子。狭义而言,某一生物的细胞中储存于单倍染色体组中的总遗传信息,组成该生物的基因组。真核生物基因组DNA的含量比原核生物高得多。  突变分析结果表明,并非所有基因

单链DNA基因组结构揭示了真核病毒的祖先事件

海藻病毒(Marine algae viruses)是控制海洋生态系统中微生物群落的重要组成部分,在病毒进化的早期起着基础性作用。在这里,我们关注的是一个主要的海藻病毒群,单链DNA(ssDNA)病毒Bacilladnaviridae。我们提出了海藻病毒Chaetoceros tenuissimus

DNA复制链的延伸

  DNA新生链的合成由DNA聚合酶Ⅲ所催化,然而,DNA必须由螺旋酶在复制叉处边移动边解开双链。这样就产生了一种拓扑学上的问题:由于DNA的解链,在DNA双链区势必产生正超螺旋,在环状DNA中更为明显,当达到一定程度后就会造成复制叉难再继续前进,从而终止DNA复制。但是,在细胞内DNA复制不会因出

研究揭示Agos蛋白指导导向DNA链切割靶标DNA链的机制

  2018年12月27日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志在线发表题为Two symmetric arginine residues play distinct roles in Thermus thermophilus Argonaute DNA guide strand-mediated

核酸染色实验——DNA

核酸是细胞内的一种大分子化合物,核酸不仅存在于细胞核内,也存在于细胞质中,动物、植物和微生物等都含有核酸。核酸可分为核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA)。经过染料和化学试剂,能够清楚地显示 DNA 和核仁组成区嗜银蛋白(AgNOR)物质。实验方法原理在一般情况下,通过盐酸水解后使 DNA 残基

我国学者揭示Agos蛋白指导导向DNA链切割靶标DNA链机制

  近日,《Proceedings of the National Academy of the Sciences of the United States of America,PNAS》杂志在线发表题为“Two symmetric arginine residues play distinct

DNA双链末端的概念

中文名称平端英文名称blunt end定  义DNA双链末端平齐而无突出单链。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

双链DNA的结构特点

中文名称双链DNA英文名称double-stranded DNA;dsDNA定  义由两条DNA单链通过碱基互补作用而构成的DNA分子。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

细胞化学词汇单链DNA

中文名称:单链DNA外文名称:single-stranded DNA术语含义:单链DNA就是指以这种状态存在的DNA。单链DNA在分子流体力学性质、吸收光谱、碱基反应性质等方面都和双链DNA不同。某些噬菌体粒子内含有单链环状的DNA,这样的噬菌体DNA在细胞内增殖时则形成双链DNA。

双链DNA探针标记法

  分子生物研究中,最常用的探针即为双链DNA探针,它广泛应用于基因的鉴定、临床诊断等方面。  双链DNA探针的合成方法主要有下列两种:切口平移法和随机引物合成法。  1.切口平移法(nick translation) 当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连

单链DNA的结构特点

单链DNA就是指以这种状态存在的DNA。单链DNA在分子流体力学性质、吸收光谱、碱基反应性质等方面都和双链DNA不同。某些噬菌体粒子内含有单链环状的DNA,这样的噬菌体DNA在细胞内增殖时则形成双链DNA。

单链DNA探针技术简介

用双链探针杂交检测另一个远缘DNA时,探针序列与被检测序列间有很多错配。而两条探针互补链之间的配对却十分稳定,即形成自身的无效杂交,结果使检测效率下降。采用单链探针则可解决这一问题。单链DNA探针的合成方法主要有下列两种:(1) 以M13载体衍生序列为模板,用Klenow片段合成单链探针; (2)

双链互补DNA的定义

中文名称双链互补DNA英文名称double-strand cDNA;dscDNA定  义以双链互补DNA为模板合成的双链DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

单链互补DNA的定义

中文名称单链互补DNA英文名称single-strand cDNA;sscDNA定  义在逆转录酶催化下,以信使核糖核酸(mRNA)为模板合成与mRNA序列互补的单链DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

双链DNA的结构特点

中文名称双链DNA英文名称double-stranded DNA;dsDNA定  义由两条DNA单链通过碱基互补作用而构成的DNA分子。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

DNA母链的复制方式

①时期:有丝分裂间期和减数第一次分裂的间期。②场所:主要在细胞核中。③条件:a、模板:亲代DNA的两条母链;b、原料:四种脱氧核苷酸为;c、能量:(ATP);d、一系列的酶。缺少其中任何一种,DNA复制都无法进行。④过程:a、解旋:首先DNA分子利用细胞提供的能量,在解旋酶的作用下,把两条扭成螺旋的

细胞化学词汇双链DNA

中文名称:双链DNA英文名称:double-stranded DNA;dsDNA定  义:由两条DNA单链通过碱基互补作用而构成的DNA分子。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

抗双链DNA抗体(aniDNA)的简介

  抗DNA抗体包括抗双链DNA抗体、抗单链DNA抗体和抗zDNA抗体。 检验中一般是指与双链DNA和单链DNA都反应的抗双链DNA抗体。 抗双链DNA抗体阳性是系统性红斑狼疮的标志,阳性率达90%以上,有较高的特异性,因而抗双链DNA抗体对系统性红斑狼疮的诊断和治疗监控极重要。抗双链DNA抗体在其

解旋酶打开DNA双链过程破解

  美国温安洛研究所近日发布公告称,该所科学家和洛克菲勒大学合作,成功破解CMG解旋酶参与真核生物内DNA(脱氧核糖核酸)复制的结构过程,并首次观察到其与DNA间的相互作用。这项发表在美国《国家科学院学报》上的最新研究,为生命繁殖之谜提供了全新注解。  温安洛研究所教授李慧琳(音译)从酵母生物体内提

细胞化学词汇DNA四链体

中文名称:DNA四链体英文名称:DNA tetraplex定  义:富含鸟嘌呤序列的四链DNA所形成的一种结构。已发现两种主要的类型,一类为重复的鸟嘌呤序列的回折形成的反平行链;另一类由四条独立的平行链相系而成。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科) 

双链DNA探针切口平移法

   当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'端补上核苷酸,从而使切口沿着DNA链移动,用

细胞化学词汇单链互补DNA

中文名称:单链互补DNA英文名称:single-strand cDNA;sscDNA定  义:在逆转录酶催化下,以信使核糖核酸(mRNA)为模板合成与mRNA序列互补的单链DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科) 

双链DNA探针切口平移法

当双链DNA 分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA 聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'端补上核苷酸,从而使切口沿着DNA

DNA三链体的结构特点

中文名称DNA三链体英文名称DNA triplex定  义DNA的一种特殊的结构,是由第三条核苷酸链通过胡斯坦碱基配对,与双螺旋DNA中的一条链以特殊的氢键相连形成的一种三股螺旋DNA结构。三股链均为同型聚嘌呤或聚嘧啶;第三个碱基以A或T与A≒T碱基对中的A配对;G或C与G≒C碱基对中的G配对,C必

解旋酶打开DNA双链过程破解

  美国温安洛研究所近日发布公告称,该所科学家和洛克菲勒大学合作,成功破解CMG解旋酶参与真核生物内DNA(脱氧核糖核酸)复制的结构过程,并首次观察到其与DNA间的相互作用。这项发表在美国《国家科学院学报》上的最新研究,为生命繁殖之谜提供了全新注解。  温安洛研究所教授李慧琳(音译)从酵母生物体内提

细胞化学词汇DNA双链体

中文名称:DNA双链体英文名称:DNA duplex定  义:两条以3′,5′-磷酸二酯键相连而成的反向多核苷酸链通过沿着其轴向的互补碱基对的氢键交联在一起形成的双链DNA,通常形成双螺旋的结构。可以共价闭合成环状分子,形成超螺旋DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学

抗单链DNA抗体的概述

  抗ssDNA是抗DNA抗体中临床意义和重要性都不如抗dsDNA的一种,DNA是一个大分子的复合物,由两条核苷酸链形成的双螺旋结构。加热时碱基间的氢键断裂,DNA变性产生ssDNA。抗ssDNA的反应位点主要是ssDNA上的嘌呤和嘧啶构成的碱基。

双链DNA探针切口平移法

当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'端补上核苷酸,从而使切口沿着DNA链移动,

细胞化学词汇DNA三链体

中文名称:DNA三链体英文名称:DNA triplex定  义:DNA的一种特殊的结构,是由第三条核苷酸链通过胡斯坦碱基配对,与双螺旋DNA中的一条链以特殊的氢键相连形成的一种三股螺旋DNA结构。三股链均为同型聚嘌呤或聚嘧啶;第三个碱基以A或T与A≒T碱基对中的A配对;G或C与G≒C碱基对中的G配对

双链DNA探针标记法介绍

分子生物研究中,最常用的探针即为双链DNA探针,它广泛应用于基因的鉴定、临床诊断等方面。双链DNA探针的合成方法主要有下列两种:切口平移法和随机引物合成法。1. 切口平移法(nick translation) 当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的