《科学》:基因组大规模筛选新技术助力癌症研究
3000种基因经初次筛选后,大约24个符合要求 多年来生物学家一直在搜寻癌细胞的弱点,以期找到对付癌症的线索。美国科学家近日研究出了一种基因组大规模筛选技术,有望提供一种强大的经济有效的方法以挑选出对付癌症的新药靶。相关论文发表在2月1日的《科学》(Science)上。 2005年,美国国立卫生研究院斥资15亿美元发起“癌症基因组地图”(TCGA)项目,目的是搜寻在很多癌症中发生变异的基因。不过有很多科学家批评说,TCGA过分强调基因测序而忽视了功能性研究,而后者能够确定哪种变异是最重要的。哈佛医学院的遗传学家Stephen Elledge就是持这种观点的人之一。 在最新的研究中,Elledge和冷泉港实验室的分子生物学家Gregory Hannon及同事一道,构建了新的病毒载体,每一个载体都含有一个RNA分子,用来关闭带有补充序列的基因。载体还带有DNA“条形码”,这样研究人员稍后就能确定哪......阅读全文
大规模癌症基因组研究发表《Nature》文章
髓母细胞瘤是儿童最常见的恶性脑瘤。大多数患者年龄在16岁以下。主要有4个亚组:Wnt、Sonic Hedgehog (SHH)、3组和4组。这些亚群由不同基因变化驱动,起始于不同细胞,常常表现出不同临床状况。Wnt组中,约95%患者可以成为长期存活者,3组患者只有50%。目前,尚无针对3组和4组
大象为啥不生癌症?秘密在基因组里
今年的诺贝尔化学奖让我们对DNA损伤修复的研究有了一些认识,知道DNA损伤非常容易发生,但是生物进化获得了能修复这些损伤的系统。尽管如此,在多细胞生物大量DNA损伤和修复过程中,仍然无法完全避免出现DNA发生突变的后果,这些突变大多数情况下容易带来肿瘤等恶劣后果。 如果所有细胞都存在类似的DN
大型研究为癌症基因组分析奠定基础
12月9日,国际癌症基因组协会(ICGC)在著名的《Nature Communications》杂志,发表了一篇令人瞠目的文章,它为即将到来的癌症基因组学研究时代,奠定了基础。该项目,是由Centro Nacional de Analisis Genómico (CNAG-CRG)和German
Nature:癌症基因组分析的新浪潮
肺癌与乳腺癌不一样,与胰腺癌也不一样,然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日,Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道 这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析,寻找跨
Nature:癌症基因组分析的新浪潮
肺癌与乳腺癌不一样,与胰腺癌也不一样,然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日,Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道 这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析,寻找跨
Nature:全基因组测序重新定义癌症之王基因组突变蓝图
近日,一项发表于国际著名杂志Nature上的研究论文中,来自英国和澳大利亚的研究人员对100位胰腺癌患者癌症组织的基因组进行了深入分析,结果发现了4种不同的亚型,这或许可以帮助后期开发治疗胰腺癌患者的新型疗法。文章中研究人员利用全基因组测序技术揭示了肿瘤基因组结构性改变的光谱模式,该技术可以帮助
Science:癌症基因组中的突变“热点”不一定会推动癌症
Science一篇文章描述了DNA单链如何以所谓的"发夹"结构折叠起来,对许多癌症中表达的基因编辑酶的突变高度敏感。但是,这些突变"热点"中的许多发生在与癌症完全无关的基因中,包括基因组的许多非编码区域。图片来源:Science MGH癌症中心的Dr.Michael Lawrence说:"一个
科学家造出“心脏芯片”帮助筛选药物
美国加州大学伯克利分校生物工程师正在开发一种先进的“心脏芯片”(heart-on-a-chip)。目前,他们的芯片是一个装在1英寸长的硅树脂上的搏动心肌细胞网,也是一个实际上的人类心脏组织的模型。经心血管药物测试证明,可作为一种药物筛选工具。这种器官芯片代表人们在开发精准、快速药物毒性测试方法上
基于碱基编辑的全基因组扰动文库构建与筛选技术
通过全基因组规模扰动文库的构建与筛选,从宏观基因组层面系统研究基因型与表型的对应关系,是微生物功能基因组学研究的重要方法。相较于单个基因扰动文库的构建与筛选,混合文库的构建与筛选可通过一次实验实现特定条件下对上千个基因的同时筛选,显著提高通量。近年来,CRISPR/Cas技术凭借着精简高效、可编
全球癌症基因组图谱计划又一研究突破
最近,发表在国际杂志the New England Journal of Medicine上的一篇研究论文中,来自从事癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)研究计划的科学家通过进行研究,对第二种常见类型的肾癌的两种类型进行了分子特性的分析,并且对这种常见类型的肾癌进行了
癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据
研究人员希望,数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。 这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望:“让我们测序你的肿瘤,或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过,现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道如何处理这些
-【Cell综述】从癌症基因组到精准肿瘤学
迅速发展的基因组技术让有限的肿瘤活检材料获得更广泛的分子分析,从而促进更广泛地实施个性化癌症治疗。以基因组为基础通过不同肿瘤的患者分类化目前还不太可能取代在解决临床需要时对组织来源的考虑,包括开发和实施新的合理目标的肿瘤疗法。 1是否要再分类 在本综述的讨论中考虑以基因组为基础的病人分类,要
全基因组测序有望改善癌症预防与诊断
美国德州大学(UT)西南医学中心研究人员证明,全基因组测序可识别病人患遗传性癌症的风险,有望改善癌症的预防、诊断和护理。这项研究首次用全基因组测序评估了258个癌症病人的基因组,提高了诊断出有癌变倾向的基因变异的能力。相关论文在线发表于最近的《E生物医学》杂志上。 “全基因组测序是一种新的基因
-“10,000个癌症基因组计划”宣告完成
旨在绘制出1万个肿瘤基因组景观图谱的美国重大科研项目——“癌症基因组图集”(The Cancer Genome Atlas,TCGA)计划已正式宣告结束。这一于2006年启动,耗资1亿美元的研究项目现在是国际肿瘤基因组协作组(International Cancer Genome Consort
《Cell》:如何根据癌症基因组图谱分析肿瘤
时至今日,这一计划已经取得了许多成果,最新Cell杂志公布了泛癌症图谱(Pan-Cancer Atlas),这也是癌症基因组图谱(TCGA)的收官项目,同期Cell杂志介绍了根据癌症基因组图谱分类的肿瘤类型列表,以及相关的一些主要发现(每种肿瘤类型的标记论文)。 生物通报道:2005年美国国立
《癌症自然评论》:科学家提出癌症转移新解释
美国科学家通过一项长期研究,提出了癌症在全身散播的一种新解释。他们认为,转移过程可能与原初肿瘤中,癌细胞与白细胞的融合有关。这一单一事件就可以为癌症的肆虐打下基础。相关论文发表在5月的《癌症自然评论》(Nature Reviews Cancer)上。 这项由耶鲁大学医学院进行的研究持续了15年,研究
《科学》:科学家完成牛基因组测序
有助于优质肉、奶生产 一个国际科学家团队4月23日说,他们已完成了牛的基因组测序工作,这一成果将有助于生产质量更好的牛肉和牛奶。 在美国农业研究局和贝勒医学院的领导下,来自25个国家的300多位科学家以海福特牛为样品牛,历经6年完成了基因组测序工作。24日出版的新一期美国《科学》杂志
谷物筛选器筛选原理
谷物筛选是指根据粮食颗粒大小的不同,利用一层或数层静止的或运动的筛面对物料进行分选的方法。因为筛选和重力分选的主要对象是谷物,其介于固体和液体之间而被称为散粒体。散粒体具有流动性和自动分级性能。谷物筛选器就是一款专门检验颗粒粮食、油料试样的含杂率及大米中、糠粉含量,确定其品质等级的仪器。
新型系统有望帮助筛选出能抵御癌症的多种治疗性化合
近日,一项刊登在国际杂志Journal of Biological Chemistry上的研究报告中,来自美国国家推进转化科学中心的科学家们通过研究开发了一种新系统,或能帮助加速寻找抑制诱发一系列癌症的酶类的特殊化合物。图片来源:commons.wikimedia.org 目前研究人员利用这种
-美国癌症中心筛选失败药物用于治疗特殊基因型患者群体
去年美国国家癌症研究中心(National Cancer Institute, NCI)宣布开始一项研究旨在重新分析过去十年中在临床试验中未能对大多数患者产生疗效的抗癌药物以用于治疗一些特殊基因型的癌症患者。纽约的 Memorial Sloan-Kettering Cancer Cent
俄生物学家筛选出可降解石油的细菌基因组
莫斯科罗蒙诺索夫国立大学物理化学生物研究所在巴伦支海寻找到一种细菌,并从该细菌中筛选出可降解石油和其它环境污染物的基因组,相关成果发表在《Marine Genomics》学术期刊上。 Thalassolituus oleivorans细菌K–188型菌种是在巴伦支海水面收集到的,该菌种含有可
Nature-Medicine:全基因组CRISPR筛选找到“癌中之王”薄弱环节
胰腺癌生长快而且转移率高,是一种非常致命的恶性疾病,被称为“癌中之王”。胰腺导管腺癌(PDA)是胰腺癌的一个主要类型,它拥有抵御化疗的物理屏障,能诱导多种免疫抑制。多伦多大学的研究人员最近通过全基因组CRISPR–Cas9筛选找到了PDAC细胞的弱点,这项研究于十一月二十一日发表在Nature
科学家发表抗衰老药物筛选新框架
近日,电子科技大学医学院衰老中心副研究员鲜波课题组联合四川省人民医院神经内科以及北京市疾控中心的研究团队,聚焦于抗衰老药物的表型药物发现工作,构建了一个新的机器学习框架,为解决抗衰老药物开发中的复杂科学问题提供了全新的视角与解决方案。相关成果发表于《细胞衰老》上。尽管目前已鉴定出多个与寿命调控密切相
科学家开发出高效新型遗传筛选技术
探索基因及其表达的蛋白在特定生理、病理、发育等过程中所起的作用一直是生命科学领域研究的重要内容。尽管利用RNA干扰鉴定高等生物基因功能的技术已经普及,但是这种方法经常伴随脱靶现象;而且由于只能部分抑制基因表达,往往不足以造成表型变化从而影响对其基因型的判断。近几年基因编辑技术的出现,使得对单一基
科学家称癌症是“人造”现代病-古代无癌症
据英国《每日邮报》和《每日电讯报》10月14日消息,通过对古埃及和南美的木乃伊进行研究,科学家发现,癌症并非“自然的”,纯粹是“人造的”。现代生活方式的糜烂、污染水平的与日俱增,以及饮食习惯的不健康,都是癌症产生的温床。 研究发现,自18世纪工业革命以来,人类的死亡率开始急速飙
-Nature:基因组复制或为解析癌症进化提供线索
有机体细胞中的基因组拷贝数越多,细胞或越易于从生长和适应中获益。近日,一篇刊登于国际杂志Nature上的研究论文中,来自克瑞顿大学(Creighton University)的研究人员通过对酵母菌的研究发现,多倍体或许可以极大地帮助细胞去适应周围的环境,多倍体即有机体细胞中的基因组拷贝数超过2倍
梁晗:从癌症基因组中寻找性别差异
如果有一种软件能告诉你今后患上癌症的可能性是多少,而其中判断的因素之一就是你的性别是男还是女,你会相信吗?可能大部分人都会摇头:怎么可能性别影响如此之大。但越来越多的研究表明,性别在癌症中起着不可忽视的作用。 来自美国德州大学MD安德森癌症中心的一项研究通过调查13种癌症类型,在分子水平上认识
全基因组测序是癌症诊断的强有力工具
一位没有明显癌症家族史的妇女却罹患了早发性乳腺癌和卵巢癌,以及与治疗有关的急性髓细胞样白血病。研究人员对这名妇女进行了全基因组测序,所用的是从该患者的皮肤和骨髓中获取的DNA。在许多被怀疑患癌症可能性增加了的病人中,常规性的候选基因测试(如BRCA1 和 BRCA2突变检测)无法显示出有用的
Science:应为广泛的癌症基因组测试提供医保覆盖
美国前国家癌症研究所主任Harold Varmus和密歇根大学法学院教授Rebecca Eisenberg在Science期刊上发表一篇政策论坛论文,主张让癌症患者更好地使用基因组测试。他们建议政府和私人支付者(保险公司)更好地利用数据库和登记处来确定基因组测试是否能够用于癌症患者的个人化治疗。
梁晗:从癌症基因组中寻找性别差异
如果有一种软件能告诉你今后患上癌症的可能性是多少,而其中判断的因素之一就是你的性别是男还是女,你会相信吗?可能大部分人都会摇头:怎么可能性别影响如此之大。但越来越多的研究表明,性别在癌症中起着不可忽视的作用。 来自美国德州大学MD安德森癌症中心的一项研究通过调查13种癌症类型,在分子水平上认