新基因网络模型可快速确认基因功能
美国得州大学奥斯汀分校研究人员开发出一种强大的新基因网络模型，可更加容易和快速地确认出控制线虫寿命及其肿瘤发展的致病基因。研究人员期冀通过扩展此项技术，未来可鉴别出造成人类疾病与其他身体功能失调症状的相关基因。该研究成果发表在1月27日的英国《自然—遗传学》（Nature Genetics）网络版上。 基因网络是生物体内所有基因之间相互关联的模型，研究人员把它戏称为基因的Facebook.com。经由基因与网络中其他基因的关联可认知这个基因在做什么，类似于人们使用在线交友网络系统与朋友和具有共同兴趣者进行联系。也就是说，如果你了解若干基因及其功能，通过网络就可以发现它们那些也在做类似事的“朋友”。 为了建构线虫的基因网络，研究人员综合了全世界约2000万份实验资料。由线虫16000个基因相互连接的线条所构成的复杂网络，看起来就像是一幅“现代艺术作品”。在一组研究中，研究人员着手寻找引起线虫体内肿瘤的基因。该肿......阅读全文
RNA干扰（转录后基因沉默）实验
RNA干扰 实验方法原理 1. 病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内，并利用宿主细胞进行转录时，常产生一些dsR
RNA干扰（转录后基因沉默）实验
RNA干扰（RNA interference, RNAi）是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA（double-stranded RNA，dsRNA）诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。目前主要用于（1）特异性剔除或关闭特定基因的表达 （2）探索基因功能和传染性疾病及恶性肿瘤的治疗 （3）使
基因敲除与RNA干扰的关系
20世纪80年代初，胚胎干细胞分离和体外培养的成功为基因敲除奠定了技术基础。1985年，首次证实的哺乳动物细胞中同源重组(homology recombination, HR)的存在为基因敲除奠定了理论基础[2]。为了编辑基因，传统的靶向特定等位基因的同源重组技术被使用，但是，这个方法在当年来说，存
RNAi干扰技术及应用进展研究（二）
1.2 RNAi的作用特点 (1)“共抑制”性。RNAi是双链RNA介导的转录后基因沉默机制，它的启动子相当活跃，外源基因可以转录，但不能正常积累mRNA；RNAi作用不仅使外源基因在转录后水平上失活，同时诱导与其同源的内源基因沉默。 (2) 高效性。试验证明双链RNA干扰mRNA 翻译的效率比
RNAi的机理与应用（一）
关于 RNAi 技术 RNA 干扰（RNA interference,RNAi）是指在进化过程中高度保守的、由双链 RNA( double-stranded RNA，dsRNA) 诱发的、同源 mRNA 高效特异性降解的现象。RNAi 受到追捧的原因主要有两个方面，一方面， RNAi 可以说是基
Nature：全新抑癌基因网络
来自美国冷泉港实验室，加拿大麦吉尔大学等多处研究机构的研究人员发表了题为“A tumour suppressor network relying on the polyamineChypusine axis”的文章，报道了一种基于多胺hypusine轴(polyamineChypusine
RNAi制备小分子干扰RNA（small－interfering－RNAs，siRNAs)的方法2
越来越多的研究人员开始采用小分子干扰RNA（small interfering RNAs，siRNAs)来抑制特定的哺乳动物基因表达。siRNA是一种短片断双链RNA分子，能够以同源互补序列的mRNA为靶目标降解特定的 mRNA，这个过程就是RNA干扰途径（RNA interference
RNAi制备小分子干扰RNA（small－interfering－RNAs，siRNAs)的方法1
最适用于：快速而经济地研究某个基因功能缺失的表型不适用于：长时间的研究项目，或者是需要一个特定的siRNA进行研究，特别是基因治疗体内表达前面的3种方法主要都是体外制备siRNAs，并且需要专门的RNA转染试剂将siRNAs转到细胞内。而采用siRNA表达载体和基于PCR的表达框架则属于：从转染到细
分子遗传学词汇转移RNA基因
中文名称：转移RNA基因英文名称：transfer RNA gene;tRNA gene定 义：转录后可产生tRNA的基因。应用学科：遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
C.elegans基因文库的分类和选择
自 1995 年成立以来，Dharmacon 在生物信息学，RNA 生物学和合成化学方面的专长 , 使我们能够开发出一整套研究基因功能的产品。作为 RNA 定制合成的领导者，Dharmacon 公司是 RNA 干扰新发现领域的早期参与者，并且在若干重要的科学发现中，以及确保沉默效率的 siRNA
专访RNAi前沿科学家刘一
5月14日的《Nature》杂志以封面文章形式发表了德克萨斯大学西南医学中心刘一的一篇RNAi研究前沿文章，刘一教授发现了一类新的RNAi分子，qiRNA。人们对RNAi的了解又深入了一步。 为了让读者更进一步的了解qiRNA，生物通记者采访了文章的通讯作者刘一教授，百忙中的刘一教授爽
Nature－Genetics：全基因组测序的诊断价值
根据《Nature Genetics》上发表的一项新成果，全基因组测序有望用于临床上的遗传病诊断。这项研究评估了影响全基因组测序在临床诊断中取得成功的因素。 这个国际研究小组由英国的研究人员领导，对156个病例或家庭开展了临床基因组测序。这些病例有着遗传疾病的特征，但无法通过之前的筛查检测来
Nature－Genetics揭示基因与环境的复杂互作
目前的个性化医疗主要是通过分子分析（尤其是基因测序）来鉴定遗传突变，进而评估个体患上特定疾病的风险。但日内瓦大学（UNIGE）的科学家们指出，真正的个性化医疗远没有这么简单。 研究人员对四百对双胞胎进行了RNA测序，量化了遗传背景和环境背景对基因表达的影响。这项发表在Nature Geneti
Nature－Genetics：全基因组测序的诊断价值
根据《Nature Genetics》上发表的一项新成果，全基因组测序有望用于临床上的遗传病诊断。这项研究评估了影响全基因组测序在临床诊断中取得成功的因素。 这个国际研究小组由英国的研究人员领导，对156个病例或家庭开展了临床基因组测序。这些病例有着遗传疾病的特征，但无法通过之前的筛查检测来解
《自然》获得首创性全基因组RNAi库
来自奥地利科学院维也纳分子生物学研究院（Institute of Molecular Biotechnology of the Austrian Academy of Sciences）的研究人员以果蝇为研究对象，利用一套完整的基因组序列数据，从达到了88%覆盖率的蛋白编码基因中获得了全基因组范围内
基因敲除，rna干扰，基因沉默有什么关系
基因敲除一般指永久的、不可逆转的敲除/失活靶基因，目前其中一种热门的，常见的基因敲除方法是CRISPR/Cas9，利用gRNA靶向靶基因并指导cas9切割基因双链，形成移码突变或片段敲除来完成基因敲除。基因沉默与基因敲除不同的地方在于，沉默可以是暂时性的、可逆转的失活基因/抑制基因表达，基因可以是存
生物物理所等揭示FUS蛋白异常导致神经退行致病机理
FUS（全称为fused in sarcoma/translocated in liposarcoma，FUS/TLS）是一个多功能的DNA/RNA结合蛋白，主要定位于细胞核，但可以在细胞核与细胞质中穿梭。FUS蛋白在RNA的转录、RNA的剪接和microRNA的加工等过程中发挥重要作用。FUS
Nature－Genetics：癌症“大爆炸”
南加州大学USC的科学家们首次追溯了结直肠癌(Colorectal cancer)的起源，并从中发现了癌细胞生长的重要线索，提出了癌症发生时的“大爆炸”理论。这项研究发表在二月九日的Nature Genetics杂志上。 “大爆炸”原本是一个经典的宇宙起源理论，该理论认为宇宙是在一次奇点大爆炸
RNAi的机理与应用（二）
首先，外源的或体内产生的长双链 RNA(long double stranded RNA, dsRNA) 首先被 Dicer 酶降解为长 21 ～ 23bp （碱基对）长度的小分子双链 RNA （称为小干扰核酸， small interfering RNA, siRNA), 这是一个依赖 A
Nature－genetics：突变基因分析为不治血癌带来新希望
近日，来自美国斯坦福大学医学院的研究人员在国际学术期刊nature genetics发表了一项最新研究进展，他们在病人基因组中发现了一组可能促进一种罕见免疫细胞癌发生的基因突变。目前这种叫做皮肤T细胞淋巴瘤的疾病仍是一种不治之症，至今还没有发现有效的治疗方法，而这项研究的结果或可为该疾病治疗带来
Nature－Genetics：基因组其实是这样转录的
在人类基因组中大约储存着两万个基因和数千个调控元件。基因编码蛋白质合成的信息，其他基因组元件负责调节基因活性和执行其他功能。所有这些DNA编码信息都需要被复杂的分子机器读取，并转换为细胞能使用的信息。 人们一般认为，读取基因就和读一个语句差不多。读取机器被多种序列引导到基因的起始位置，然后从左
你容易过敏吗？《Nature－Genetics》公布过敏疾病风险基因
皮肤过敏反应和哮喘有什么关系？众所周知，过敏性疾病往往同时发生或相继发生。存在某些特定基因为各种过敏体质负责？还是一种过敏性疾病容易引发另一种过敏？ 迄今为止，基因研究只关注个体过敏性疾病。此次世界规模的过敏性疾病遗传研究则采取了不同策略。来自柏林的工作组总共收集了36万名参与者的数据报告，重
Science重磅成果：RNAi是细胞平衡的一种必要手段
在我们星球上99%以上的细胞都处于一种静息休眠的状态，随便抓起一把土，这其中就包含着数以千计的微生物，把其中任何一种放到培养基中几乎都不会生长。这些细胞具有新陈代谢活性，也就是说它们是活的，但是它们并不会分裂，而且它们保持在一种相对“安静”的状态，除非在特定的条件下刺激它们，才有可能重新进入细胞周期
Rules－of－siRNA－design－for－RNA－interference－(RNAi)
General GuidelinessiRNA targeted sequence is usually 21 nt in length.Avoid regions within 50-100 bp of the start codon and the termination codonAvoid
小干扰RNA转录后基因沉默的介绍
siRNA诱导的转录后基因沉默始于RNA诱导的沉默复合物（RISC）的组装。该复合物通过切割编码靶基因的mRNA分子来沉默某些基因表达。为了开始该过程，两条siRNA链中的一条（引导链）将被装载到RISC中，而另一条链即过客链被降解。某些Dicer酶可能负责将引导链加载到RISC中。然后，siR
林东昕院士Nature－Genetics揭示抑癌lincRNA
中国医学科学院北京协和医学院的研究人员在新研究中揭示，在基因间长链非编码RNA (lincRNA) LINC00673中的一个胰腺癌风险变异为miR-1231构建了一个结合位点，干扰了PTPN11降解。这一重要的研究发现发布在5月23日的《自然遗传学》（Nature Genetics）杂志上。
2016国家自然科学基金：RNA干扰技术
来自国家自然科学基金委员会的消息，8月17日国家自然科学基金委员会公布了2016年国家自然科学基金申请项目评审结果，其中面上项目16934项、重点项目612项、创新研究群体项目38项、优秀青年科学基金项目400项、青年科学基金项目16112项、地区科学基金项目2872项、海外及港澳学者合作研究基
RNAi热点文章：一个miRNA的形成
《The Scientist》杂志将一篇2004年介绍miRNAs的文章评选为上周RNAi领域热点文章（hotpaper）。原文 X. Cai et al., “Human microRNAs are processed from capped, polyadenylated transcrip
美国院士最新Nature解析基因网络调控
来自加州大学伯克利分校分子与细胞生物学系的研究人员利用系统生物学方法，针对包含有多种保守型基因的被囊动物，分析了发育的基因调控网络结构在物种间的进化，指出了神经嵴这一关键结构的进化机制，为进一步解析物种发育进化提供了重要信息，相关成果公布在Nature杂志上。 领导这一研究的是加州大学伯克
吴立刚课题组Nature子刊发布RNAi新工具
来自中科院上海生命科学研究院的研究人员报告称，他们设计出了一种替代性的小干扰RNA（small interfering RNA，siRNA）前体，将之命名为saiRNA (single-stranded, Argonaute 2 (Ago2)-processed interfering RNA)