英国将测序万人基因组用于疾病研究
近日，在英国伦敦的科学博物馆，维康基金会（Wellcome Trust）宣布了英国10K（UK10K）项目，即英国将在接下来的三年内测定10000个人的基因组序列。英国10K项目的负责人Richard Durbin表示，这项宏伟的计划将得到生物医学慈善会约1000万英镑的支持，10K项目旨在找出与肥胖和精神分裂症等疾病相关的罕见基因变异。 研究人员将测定已加入长期研究计划的4000名英国人的全基因组序列，其中一半的研究是针对英国的双胞胎来进行的，另一半则是针对父母与子女来开展。Durbin在英国维康基金会桑格研究所工作，他表示该项目将寻求发现每个人基因组中插入和缺失的位点，以便将这些突变位点与其不适的症状联系起来。他强调说，许多人都是自愿加入到研究计划，从出生起，他们就被研究人员所跟踪观察，许多生理指标也都经过了反复的测量。 另外的6000个人则只是测定其外显子序列，即编码蛋白的那部分基因。Durbin表示，参与......阅读全文
科学家公布恶性疟原虫大批量基因组序列
近期《自然—遗传学》公布了大量采集的恶性疟原虫的基因测序结果。疟原虫是导致疟疾产生的病因所在，这项研究结果有助我们更好地了解疟原虫为对青篙素这种近期在东南亚流行的抗疟疾首选药物产生抗药性而发生的进化过程。 Dominic Kwiatkowski等人从西非和东南亚的10个地区的825个近
揭示重复序列对三维基因组区隔化的调控作用
Cell Research | 沈晓骅/孙育杰课题组合作揭示重复序列对三维基因组区隔化的调控作用 哺乳动物基因组DNA全长近2 m，经过多层有序组织与折叠后分布于直径5-10 μm的细胞核中。染色质高级结构对基因表达，细胞分化和胚胎发育起着至关重要的作用。其中，基因组A/B区隔化（A/B c
一种全新的酶可对抗寄生的基因组TE序列
科学家们发现了一种名为 PUCH 的酶，它对于阻止寄生 DNA 序列在我们基因组中的传播至关重要。 这一发现可以让我们深入了解我们的身体如何识别和对抗内部威胁（如基因组寄生虫）和外部威胁（如病毒和细菌）。 德国美因茨分子生物学研究所 (IMB) 的 René Ketting 教授团队与奥地利维
西北农林科技大学PLOSGenetics发表红枣基因组序列测序结果
高品质的干枣基因组序列，以及从其近缘种树木的基因序列，能够阐明这种人类已经种植超过7000年的古老果树的驯化历史。近期，西北农林科技大学与美国康奈尔大学Boyce Thompson植物研究（BTI）以及北京林业大学的研究人员合作，对中国干枣进行了基因组测序，相关结果发表在12月22日的《PLOS G
一文读懂如何破解新冠病毒基因组全长序列
随着疫情进入攻坚阶段，基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而，若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究，需获取完整的病毒基因组信息，这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性，华大智造可为新型冠状病毒高通量测序、序列
解析斑鳖的全基因组序列及其适应性进化基础
斑鳖（Rafetus swinhoei）是目前地球上现存体型最大的鳖类物种，其背甲长度可达1.5米、体重可达115公斤。此外，斑鳖也是全球目前最濒危的龟鳖类物种。在2019年初，全球已经明确记录的斑鳖个体仅仅只有4只。然而，2019年4月13日，我国的雌性个体意外死亡（这也是当时全球唯一确定性别
瑞丽：此次疫情病毒基因组序列与德尔塔变异株高度同源
7月7日，记者从瑞丽市新冠肺炎疫情防控新闻发布会（第三场）上获悉，为加快基因测序速度，云南省疾控中心紧急调运一台基因测序设备到瑞丽，设立临时基因测序实验室，并派出专业技术人员对检出的阳性样本进行新冠肺炎基因测序。目前，已完成7份阳性样本测序，结果表明，基因组序列与德尔塔（Delta）变异株高度同
一文读懂如何破解新冠病毒基因组全长序列
随着疫情进入攻坚阶段，基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而，若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究，需获取完整的病毒基因组信息，这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性，华大智造可为新型冠状病毒高通量测序、序列
万人药物基因组研究项目采用罗氏NimbleGen序列捕获技术
来自美国的药物基因组研究专家将开展一个由一万人参加的药物基因组项目，将参加这个的医疗记录与他们的基因组信息进行关联，这些信息主要包括了84个与药物应答相关的基因情况。 为了获得与药物治疗相关的基因信息，研究人员将利用NimbleGen序列捕获产品，从全基因组DNA中富集这些
Nature子刊：从基因组序列快速发现新药的突破性方法
在一项寻找新药的研究中，美国Scripps研究所(TSRI)佛罗里达所区的科学家们开发出一种突破性方法，能够从基因组序列中设计新的候选药物。作为原理验证，他们发现了一种高效的化合物，能够导致癌细胞攻击自己而死。 TSRI的副教授Matthew Disney博士指导了这项研究，他说：“这
我国绘制完成世界首个蒙古族人全基因组序列图谱
我国科学家绘制完成了全世界首个蒙古族人全基因组序列图谱。这是记者12月18日在内蒙古自治区呼和浩特市召开的“世界首例蒙古族人全基因组序列图谱绘制完成成果发布会”上获得的消息。 据项目总负责人、内蒙古农业大学生命科学学院动物生物技术重点实验室主任周欢敏介绍，这一研究成果是我国科学家首次独立完
南京农业大学Nature子刊发布新基因组序列草图
由来自南京农业大学、德克萨斯大学奥斯汀分校的科学家们组成的一个国际研究小组，绘制出了一张最精确的美国棉花序列草图，并将很快构建出更为详细的、操控这一复杂棉花基因组的图谱。他们的研究发现有可能帮助培育出在质量上可媲美豪华埃及棉（Egyptian cotton）的廉价美国棉花，并帮助开发出一些减少杀
海洋所科研人员绘制完成牡蛎全基因组序列图谱
近日，牡蛎基因组计划（Oyster Genome Project，OGP）项目组宣布，历时两年的牡蛎基因组序列图谱终于绘制完成。这是世界上第一张养殖贝类的全基因组序列图谱，标志着基于短序列的高杂合度基因组拼接和组装技术获得了重大突破。据悉，目前的基因组图谱已达到国际领先的基因组图
Nature子刊：用于百万级生物样本库的基因组序列分析工具
人类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异，往往由DNA序列变化造成，这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究（Genome-Wide Association Study，GWAS）是通过比对大量人群的遗传信息，利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学
基因组所开发出编码蛋白质DNA序列并行比对工具ParaAT
中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员，带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT（Parallel Alignment and back-Translation）”。该研究成果发表在Biochemical and Biop
科学家利用基因组序列设计新药－－精确性瞄准致癌RNA
报道，来自美国弗罗里达大学斯克里普斯研究所(TSRI)的科学家称，他们开发出一种很有潜力的通用方法，可通过基因组序列来设计新药，并利用这种方法识别出一种高效化合物，其能让癌细胞攻击自身并最终死亡。相关论文在线发表于2月9日的《自然·化学生物学》。 “这还是第一次只凭借一个RNA序列，就理性
基因组内简单重复序列在对虾适应性进化中的作用
近日，由中国科学院海洋研究所李富花课题组主导完成的科研论文Simple sequence repeats drive genome plasticity and promote adaptive evolution in penaeid shrimp，在Communications Biolog
生物物理所揭示基因组重复序列Alu调控转录新机制
7月12日，中国科学院生物物理研究所薛愿超团队在《自然》（Nature）上，在线发表了题为Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity的研究论文。 转录调控在维持细胞功能和正常发育过程中起着关键作用。其中，增
前导序列
中文名前导序列外文名leader sequence前导序列是结构基因中编码区之前的一段序列，这部分序列能被转录，但不被翻译，在mRNA是从5′端起至结构基因第一编码子开始点（通常 AUG）为止，在蛋白质合成过程中不被翻译。
深圳华大基因研究院完成大熊猫基因组序列图谱
揭开大熊猫黑眼圈的奥秘 深圳华大基因研究院十月十一日在深圳第十届“高交会”上宣布，大熊猫“晶晶”基因组框架图绘制完成，这是世界首例用短序列进行新物种测序与组装新技术完成的大型基因组序列图。 据深圳华大基因研究员王俊博士介绍，大熊猫有二十一对染色体，基因组大小与人相似，约为三十亿个碱基对，包含二到
我国绘制并破译世界首例双峰驼全基因组序列图谱
记者17日从内蒙古农业大学获悉，我国科研人员近日完成了世界首例双峰驼全基因组序列图谱绘制和破译工作。专家表示，这项成果将对野生骆驼保护和家养骆驼品种改良起到重要指导作用，并将进一步推动骆驼产业的健康发展。 据了解，这个研究项目由内蒙古农业大学、上海交通大学、中国科学院上海生命科学研究院、南
－Nature：一种软骨鱼的第一个基因组序列
象鲨(Callorhinchus milii)是澳大利亚南部和新西兰温带水域的一种本地软骨鱼，生活在200米到500米深处，在春季迁移到浅水中进食。 本期Nature发表了这种鱼的基因组序列。与其他脊椎动物基因组所做比较显示，它是所有已知脊椎动物(包括腔棘鱼)中演化最慢的基因组。
蒙古高原四个特色物种全基因组序列图谱绘制完成
内蒙古农业大学和深圳华大基因研究院8月9日在呼和浩特市联合宣布，蒙古羊、蒙古牛、蒙古马和阿拉善双峰驼全基因组序列图谱绘制完成。这是我国科学家首次独立完成蒙古高原物种全基因组序列图谱，标志着我国地方畜种研究进入基因组水平。 蒙古羊、蒙古牛、蒙古马、阿拉善双峰驼是我国古老的原始品种和畜牧
科学家绘制完成世界首张大熊猫基因组序列图谱
新华网深圳１０月１１日电 题：科学家绘制完成世界首张大熊猫基因组序列图谱 新华社记者 彭勇 中国科学家１１日在深圳宣布：世界首张大熊猫基因组序列图谱绘制完成。科学家们说，它将为保护和人工繁育这个被称为“中国国宝”的濒危物种提供新的途径，以及推进针对大熊猫的其他科学研究。
最大规模的荟萃分析揭示新型冠状病毒的基因组序列特性
迄今为止，对新型冠状病毒（2019-nCoV）基因组进行最大规模的测序分析结果证实，这种病毒起源于蝙蝠，且病毒的异质性较低；近日，一项刊登在国际杂志Journal of Medical Virology上的研究报告中，来自博洛尼亚大学的科学家们通过研究在病毒的蛋白质中鉴别出了一种高度可变的基因组
科学家构建出目前最高质量的植物基因组参考序列
随着PacBio单分子实时（SMRT）测序技术的发展，利用它已能够独立完成高质量基因组草图的组装。然而，这些草图序列中仍然存在多种错误，比如序列中会包含有很多嵌合体（即不同位置的序列连接到了一起）或是组装质量比较差的区域等，特别是重复序列区域有的没有组装出来，有的组装出来多个序列，而且这些错误通
我国科学家完成大黄鱼全基因组序列图谱绘制
浙江省科技厅、上海市科委30日在浙江省舟山市共同宣布，来自浙江海洋学院、复旦大学、上海交通大学等院所的科学家已绘制完成大黄鱼的全基因组测序、组装和序列图谱。 据介绍，这是我国科学家完成的第二个鱼类基因组序列图谱，也是世界上首个石首鱼科鱼类基因组序列图谱。 大黄鱼属硬骨鱼
斑鳖的全基因组序列解析：其与中华鳖亲缘关系密切
记者12日从中国科学院昆明动物研究所获悉，该所和长沙生态动物园合作，成功组装出了全球最濒危龟鳖类物种斑鳖的高质量参考基因组序列，并解析其适应性进化基础。研究人员发现，斑鳖与中华鳖亲缘关系密切，然而在54.4百万年前开始分道扬镳。 斑鳖是目前地球上现存体型最大的鳖类物种，其背甲长度可达1.5米、
Illumina助力云南省CDC快速破译新型冠状病毒全基因组序列
据云南广播电视台《都市条形码》微信公众号报道，1月21日，国家卫生健康委确认昆明市首例输入性新型冠状病毒感染的肺炎确诊病例。云南省疾控中心急性传染病防制所所长伏晓庆介绍，1月17日中午12点，实验室收到患者采样标本，下午3点就完成了核酸检测，结果呈阳性。 1月18日凌晨1点，实验室开始病毒全基
中国农科院特产所首次破译鹿科动物全基因组序列
近日，由中国农业科学院特产研究所研究员李光玉带领创新团队在国际上首次破译鹿科动物全基因组序列。驯鹿全基因组测序的完成，不仅为研究人员从基因组水平挖掘驯鹿生长、代谢和抗寒等重要性状的分子机制提供了科学指导，而且为驯鹿驯化历史、基因组演化、群体遗传及鹿类动物的进化等理论研究奠定了重要基础。相关研究成