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据云南广播电视台《都市条形码》微信公众号报道，1月21日，国家卫生健康委确认昆明市首例输入性新型冠状病毒感染的肺炎确诊病例。云南省疾控中心急性传染病防制所所长伏晓庆介绍，1月17日中午12点，实验室收到患者采样标本，下午3点就完成了核酸检测，结果呈阳性。 1月18日凌晨1点，实验室开始病毒全基因组序列测定，20日上午10点测序工作完成，经过与国家公布的新型冠状病毒全基因组序列进行比对分析，证明测序结果与公布的序列高度同源，确证云南发现病例为新型冠状病毒感染的肺炎确诊病例。伏所长还表示，全基因组测序技术对于疫情研判、防控方案制定与措施采取，有至关重要的作用。图1：云南CDC技术专家正在进行病毒MiSeq测序前的准备（图片来源：云南省CDC提供）图2：云南CDC技术专家正在生物安全柜中进行测序文库样品的前处理（图片来源：云南省CDC提供）图3：利用Illumina平台测定的、且在GenBank上公布的新冠病毒全基因组完整序列。......阅读全文
新型冠状病毒（2019-nCoV）导致的肺炎疫情源自武汉，蔓延全国。Illumina因美纳作为全球基因测序的领先品牌，为了全力支持中央及各地政府的疾病防控工作，我们火速开展行动： 调动全球资源，增援疫区防控物资 Illumina因美纳将向湖北红十字会捐赠200万元人民币专项资金，用于新型冠状
近日，国际核心学术期刊《病毒学杂志》在线发表了军事医学科学院军事兽医研究所涂长春领衔的联合课题组在蝙蝠病毒方面的最新研究成果。他们在云南蝙蝠体内检测出了新型 SARS 样冠状病毒，全基因组序列测定与抗原性分析表明该病
近日，国际权威医学期刊《柳叶刀》刊登了一篇由数名中国医学专家撰写的关于武汉疫情的论文，其中披露了一个此前“不为人知”的重要疫情细节。 这一此前未曾被公开披露的细节，也很快引起了国外一些科学杂志的关注。 "现在看起来，华南海鲜批发市场并不是(新型冠状）病毒的唯一源头了”。 说出上面
随着新冠肺炎对全球的威胁与日俱增，越来越多的各国专家也对新冠病毒（2019-nCoV或SARS-CoV-2）的来源投下更多关注的目光。本文从流行病学调查、病毒基因比对、跨物种感染研究以及关键的“中间宿主”等领域，对新冠病毒来源进行了全景式梳理与深度挖掘，为读者提供一个深刻而全新的视角。 一、华
截止北京时间2月4号08时，全国确诊人数已经达到20471例，疑似23214例，死亡425例，治愈632例。美国目前共有11例确诊病例，分布在马塞诸萨州波士顿（一例）、华盛顿州（一例）、伊利诺伊州（两例）、加州（六例）和亚利桑那州（一例）。 就在2月3号，中国科学家在国际顶级学术期刊Natur
近日，我国军事医学科学院军事兽医研究所研究员涂长春领衔的联合课题组，在云南蝙蝠体内检测出了新型SARS（非典型性肺炎）样冠状病毒。全基因组序列测定与抗原性分析表明，该病毒具备感染人的能力，推断其很可能是SARS病毒的祖先或“亲属”，这一发现为理清SARS来源提供了重要数据。这一蝙蝠病毒方面的最新
晚上9点，是记者和刘为勇约定的采访时间。 然而，直到深夜12点以后，他还没有回复微信。 刘为勇在武汉，华中科技大学同济医学院附属同济医院检验科，做新型冠状病毒检测工作。检验科新型冠状病毒检测团队部刘为勇在实验室 直到第二天下午，记者才等到他。 熬3通宵测出全基因组序列 拿到结果有不好预感
SARS和Zika等新兴传染病对公共卫生构成了重大威胁。尽管进行了广泛的研究，但是如何，何时何地出现新疾病仍然是不确定的来源。最近在中国湖北省武汉市报告了一种严重的呼吸系统疾病。自第一位患者于2019年12月12日住院以来，截至2020年2月3日，已报告至少17205例病例。流行病学调查表明，此
SARS和Zika等新兴传染病对公共卫生构成了重大威胁。尽管进行了广泛的研究，但是如何，何时何地出现新疾病仍然是不确定的来源。最近在中国湖北省武汉市报告了一种严重的呼吸系统疾病。自第一位患者于2019年12月12日住院以来，截至2020年2月3日，已报告至少17205例病例。流行病学调查表明，此
随着疫情进入攻坚阶段，基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而，若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究，需获取完整的病毒基因组信息，这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性，华大智造可为新型冠状病毒高通量
石正丽研究组正在进行样本处理。中国科学院武汉病毒研究所供图 SARS样冠状病毒的自然宿主菊头蝠。广东省昆虫研究所张礼标研究员供图 电子显微镜下的SARS冠状病毒粒子。中国科学院武汉病毒研究所杨兴娄博士供图 石正丽研究组在野外作业。中国科学院武汉病毒研究所供图 15株蝙蝠SARS样冠状病毒
严重急性呼吸综合征（SARS）和寨卡（Zika）等新兴传染病对公共卫生构成了重大威胁。尽管进行了广泛的研究，但是如何、何时和何地出现新疾病仍然具有相当大的不确定性。最近在中国湖北省武汉市报道了一种严重的呼吸系统疾病。自第一位患者于2019年12月12日住院以来，截至2020年1月25日，已报道了
新型冠状病毒疫情日益严峻，武汉地区医护人员口罩、防护服、检测试剂等物资稀缺的新闻牵动每个国人的心。由于试剂缺乏，很多患者不能被第一时间确诊和收治，导致很多后续治疗工作推进缓慢。 1月25日下午，湖北召开新型肺炎疫情防控工作发布会。湖北省医保局副局长刘松林介绍，新型冠状病毒感染导致的肺炎，早诊断
1月26日，湖北省疾控中心成功从一名武汉市本地肺炎患者的肺泡灌洗液样本中分离获得一毒株；随即利用Illumina测序技术展开对毒株全基因组序列测定工作，文库制备、上机测序与数据比对分析一气呵成。这一系列工作为湖北省新冠疫情防控、病毒变异监测奠定了坚实基础。随着更多毒株分离与测序，将为揭示病毒传播
2月27日，国家卫健委高级别专家组组长钟南山在新闻通气会上表示，疫情首先出现在中国，不一定是发源在中国。 同时，最新研究表明，继蛇、穿山甲、水貂之后，龟类也可能是新冠病毒的潜在中间宿主。 有关新冠病毒溯源的新进展源源不断。然而，它从哪里来？如何到达人类？又为什么是武汉？这些问题迄今没有答案，
2月27日，国家卫健委高级别专家组组长钟南山在新闻通气会上表示，疫情首先出现在中国，不一定是发源在中国。 同时，最新研究表明，继蛇、穿山甲、水貂之后，龟类也可能是新冠病毒的潜在中间宿主。 有关新冠病毒溯源的新进展源源不断。然而，它从哪里来？如何到达人类？又为什么是武汉？这些问题迄今没有答案，
目前检测新型冠状病毒感染的方法依赖于特定的基因序列，不过已有新的测定方法正在开发，满足日益增长的对快速检测的需求。 根据SARS-CoV-2基因组的快速测序和COVID-19爆发早期的数据分布，研究人员开发出来多种测定方法，基于病毒的遗传片段诊断患者。但是，随着潜在病例数量的增加以及对全球大流
此前，网上不断有各种版本的流言，或多或少都把此次疫情的发生与国内科研机构的实验室病毒标本泄露关联在一起。 对此，2月2日下午，中国科学院武汉病毒所研究员石正丽在朋友圈说：“2019新型冠状病毒是大自然给人类不文明生活习惯的惩罚，我石正丽用我的生命担保，和实验室没有关系。” 《中国科学报》记者
消失的零号病人 零号病人并不一定是第一个发病者。 而是第一个感染，并且把病毒传播给其它人的人。 因此，第一个出现症状并发病的人叫做一号病人。 那么，零号病人的医学意义是什么呢？专家给出了提示： 1. 能够锁定传染源，比如是否接触了什么动物？ 2. 锁定传播方式，比如跟动物是如何接触的？
分析测试百科网讯 近日，美国联邦法院已授予Illumina一项初步禁令，该禁止将阻止华大基因及其子公司（包括华大智造）在美国分销和推广其基因测序产品。 Illumina是在今年2月份提出了这项初步禁令，指控华大基因旗下多款基因测序仪侵犯Illumina在美国的专利，其中包括Illumina的独
过去100年发生的多起事件让世人密切关注未来发生传染病大流行的风险。2018年是1918年流感流行的100周年，估计有数千万人死于100年前那次流感。现在拥有比一个世纪前更好的干预措施，季节性流感疫苗，但不一定完全有效预防。每年需要接种或选择接种的人所占比例较小。世界上还有抗生素可以帮助治疗细菌
1月22日，国家基因组科学数据中心正式发布2019新型冠状病毒资源库。该库整合了世界卫生组织（WHO）、中国疾病预防控制中心（CDC）、美国国家生物技术信息中心（NCBI）、全球流感序列数据库（GISAID）等机构公开发布的冠状病毒基因组序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章。同时，对不
1月22日，国家基因组科学数据中心正式发布2019新型冠状病毒资源库。该库整合了世界卫生组织（WHO）、中国疾病预防控制中心（CDC）、美国国家生物技术信息中心（NCBI）、全球流感序列数据库（GISAID）等机构公开发布的冠状病毒基因组序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章。同时，对不
在过去的二十年中，冠状病毒已引起两次大规模疫情：严重急性呼吸综合征（SARS）和中东呼吸综合征（MERS）。一般认为，主要在蝙蝠中发现的SARS 相关冠状病毒（SARSr-CoV）可能会导致未来疫情暴发。 在一项新的研究中，中国科学院武汉病毒研究所、武汉金银潭医院和湖北省疾病预防控制中心的研究
9月9日，来自深圳的消息，国产基因测序仪DNBSEQ-T7（原命名MGISEQ-T7）正式交付商用。从去年10月发布以来，诸多业内人士和媒体将T7誉为中国基因产业突破上游技术壁垒，实现跨越发展的现实注脚。 从关山难越，到部分引领，中国基因测序仪的研制开发攀越关山、跋涉荆棘，经历了起伏跌宕的20
2019新型冠状病毒（2019-nCoV），因2019年武汉病毒性肺炎病例而被发现，2020年1月12日被世界卫生组织命名。冠状病毒是一个大型病毒家族，已知可引起感冒以及中东呼吸综合征（MERS）和严重急性呼吸综合征（SARS）等较严重疾病。新型冠状病毒是以前从未在人体中发现的冠状病毒新毒株。
基因测序不断发展，我国基因测序市场规模大DNA、基因编码概念自50年代才开始出现，首个基因测序技术自70年代开始发展，我国自对遗传病基因诊断开始发展基因测序行业，但尚未进入临床实验室阶段，自90年代才开始正式进入临床实验室阶段。90年代，靶向药物问世，人类基因组计划开始实行。1999年我国基因测序技
近日有研究认为，穿山甲可能是新型冠状病毒的潜在中间宿主，这引发了一些争议和讨论。那什么是病毒中间宿主？这项研究对防控病毒有何启示？图片来源于网络 中间宿主可以说是病毒从自然宿主传播到人类过程中的“二传手”，一个著名案例就是果子狸被认为是严重急性呼吸综合征（SARS）冠状病毒中间宿主。2002年
探寻阴谋论的证据 阴谋论仍然没有打算收手，似乎，我们有一个遗漏的问题没有解答： 石教授团队在自然杂志发表的论文当中还提到，武汉新型冠状病毒RNA序列当中有一个长度为1378个核苷酸的新序列，似乎并不来自与其最接近的RaTG13，而更像是来自蝙蝠SARS类冠状病毒（SARSr-CoV）。 有人指
2019年底爆发新型冠状病毒性肺炎COVID-19疫情，全球已有许多感染和死亡病例，截止2020年3月1日，累计确诊超8万人，死亡近三千例，但仍存在许多临床疑似病例无法确诊。既往COVID-19诊断依赖于qPCR核酸检测，但是该方法显示出较高的假阴性率和低敏感性（阳性检出率仅为30％至50％），