7月15日《自然》杂志精选

封面故事: 猴与人的分化 灵长类的化石记录很稀少,仍然存在实质性的缺口。其中一个缺口是“旧世界”的猴子与“新世界”高等灵长类的类人猿和人类的分化。这种分化以前仅限于“非洲—阿拉伯大陆”的渐新世,但在沙特西北一个新的、处在进化树根部的狭鼻猿的发现缩小了这个缺口。沙特发现的这个材料来自距今约2800万年前的渐新世中期,它的狭鼻猿分化特征非常少,说明“旧世界”的猴子与“新世界”的类人猿之间的分化发生在那个时期之后。本期封面所示为头盖骨的前部,其犬齿和上颚宽臼齿都在原处。头盖骨的大小表明这是一个中等大小的灵长类,体重在15公斤和20公斤之间。自然保护工作的选择性 有人提出,表现差的保护区应当失去其保护地位,所节省的资金应用到效果好的其他地方。这种观点不易被保护工作者和地方游说团体所接受。但根据对澳大利亚近7000个保护区的表现所作的一项研究,从长期来看这种观点可能是最好的政策。大约70......阅读全文

基因组DNA甲基化分析方法

早期的基因组DNA甲基化分析技术,如SssI甲基转移酶分析法、氯乙醛反应法、免疫学抗体技术等,已经不能满足现代表观遗传学研究的需求。今年来常用的基因组甲基化的方法有以下两种。1. 甲基化敏感扩增多态性实验甲基化敏感扩增多态性实验技术被用于检测双向型真菌的DNA甲基化,它是在扩增片段长度多态性技术的基

在基因组范围定位DNA甲基化

  DNA甲基化在哺乳动物基因表达中扮演了重要角色。尽管通过线粒体遗传且随时间稳定,但是细胞分化、疾病或环境影响都会改变DNA甲基化的模式。近年来,科学家们开发出多种新方法,试图在基因组范围定位DNA甲基化。   尽管从理论上来说,全基因组亚硫酸氢盐测序能让研究人员全面观察甲基化组,但它还是面临技

甲基化的基因组直接测序法

  基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解

深度分析人体病毒组

  自从微生物学诞生以来,研究人员着重关注让我们、我们驯养的家畜和种植的植物患病的病原体。鉴于症状的产生是了解特定病毒是否在几年前就已存在的唯一方法,因此大多数得到很好研究的病毒是那些导致疾病的病毒。但是很多病毒长期地感染人类,不会导致疾病,但是可能会导致年龄非常小的、年龄非常大的或者存在免疫抑制的

7月15日《自然》杂志精选

封面故事: 猴与人的分化   灵长类的化石记录很稀少,仍然存在实质性的缺口。其中一个缺口是“旧世界”的猴子与“新世界”高等灵长类的类人猿和人类的分化。这种分化以前仅限于“非洲—阿拉伯大陆”的渐新世,但在沙特西北一个新的、处在进化树根部的狭鼻猿的发现缩小了这个缺口。沙特发现的

《自然》:首个甲虫基因组问世

一个国际科研团体将在3月27日的《自然》杂志上发表他们的最新研究成果——首个甲虫全基因组序列。新测序的甲虫中文名称为赤拟谷盗(red flour beetle),学名为Tribolium castaneum,是农业上的一大害虫。因此,它也成为第一种进行基因组测序的害虫,这对农业除害具有重要意义。

《自然》:葡萄基因组测定完成

葡萄成为人类完成基因测序的第一种水果作物和第四种开花植物  一项由法国科学家领导的最新研究捍卫了法国作为“葡萄酒之都”的荣誉,他们完整测定了一种葡萄的基因组。葡萄也由此成为人类完成基因测序的第一种水果作物和第四种开花植物(其它3种分别是小麦、拟南芥和白杨木),这有望加深科学家对开花植物进化过程的理解

线虫基因组中存在DNA甲基化现象

  2012年10月18日,吉林大学和华大基因合作完成的旋毛形线虫不同发育阶段DNA甲基化差异分析的相关研究成果在国际著名期刊《基因组生物学》(Genome Biology)上发表。该研究首次证实了线虫基因组中存在DNA甲基化现象,改写了长期以来认为线虫中没有该表观遗传修饰的历史,同时也使以DN

全基因组甲基化定量检测技术LUMA

  LUMA介绍   基因组DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的变化被认为是正常和病理细胞过程中的重要的事件,有助于正常发育和分化以及癌症和其他疾病。在此,我们介绍一种新的方法评估全基因组DNA甲基化,称为荧光甲基化检测(Luminometric Methyl

家蚕基因组甲基化谱研究获突破

我国科学家利用新一代测序技术构建家蚕丝腺甲基化谱  由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院、西南大学、上海肿瘤所等合作的研究成果“家蚕基因组甲基化谱”,5月2日在国际著名学术杂志《自然—生物技术》(Nature Biotechnology)上发表,这是中国科学家

全基因组测序解读重要甲基化机制

  DNA看起来只是AGTC四种碱基的简单排列,可一旦它与组蛋白包装形成染色质,情况就复杂得多了。组蛋白主要有四种,分别是H2A、H2B、H3和H4。这些组蛋白要么令DNA盘绕起来保持沉默,要么将DNA解开允许基因表达。组蛋白上的化学修饰(如甲基化),能够影响它对基因的控制。   H3K4me3是

全基因组甲基化定量检测技术LUMA

LUMA介绍基因组DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的变化被认为是正常和病理细胞过程中的重要的事件,有助于正常发育和分化以及癌症和其他疾病。在此,我们介绍一种新的方法评估全基因组DNA甲基化,称为荧光甲基化检测(Luminometric Methylat

“折纸DNA”设计控制病毒组装

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504958.shtm 衣壳涂层在不同厚度和形状的结构上的适用性。图片来源:《自然·纳米技术》科技日报北京7月17日电 (记者张梦然)据发表在最新一期《自然·纳米技术》上的一项研究,澳大利亚格里菲斯

乙脑病毒组装奥秘获揭示

中国农业科学院哈尔滨兽医研究所重要人畜共患病与烈性外来病专家团队在乙型脑炎病毒复制周期机制研究方面取得新进展,首次揭示了宿主因子SPCS1参与乙型脑炎病毒组装的奥秘。相关学术成果近日在线发表于国际著名专业期刊《病毒学杂志》上。 流行性乙型脑炎病毒与登革热病毒、西尼罗病毒、寨卡病毒等同属黄病

《自然》:海绵基因组草图绘制完成

  一个国际研究小组在8月5日出版的英国《自然》杂志上报告说,他们绘制出了海绵的基因组草图,并从中发现了许多有助于探索多细胞动物起源的信息。   这个由美国、德国、澳大利亚等国研究人员组成的小组报告说,他们完成了大堡礁海绵基因组测序草图,结果显示其中包含约1.8万个基因。海绵6亿多年前就出现在地球

基因组直接测序法检测甲基化的介绍

  基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解

基因组直接测序法检测DNA的甲基化

基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解反应

显微技术突破揭秘植物病毒组装

  最近,一项关于“一种植物病毒如何组装”的新研究,可以为将来病毒载药进入人体的应用,奠定基础。  这项研究,是由来自英国利兹大学Astbury结构分子生物学中心和英国John Innes中心的一个研究小组完成,描述了豇豆花叶病毒CPMV)的空版结构,以及可让病毒构建自我并压缩其基因组的分子“胶水”

《自然》首次证实:基因甲基化缺失是致癌重要成因

  人体每个细胞都含有完整的DNA基因,其不仅含有人体所有遗传信息,而且基因中的所谓甲基基团是人体组织的必要成分。德国耶拿人体老化研究所研究人员首次证实,DNA出错并甲基化缺失是导致癌症的一个重要成因。这项研究结果刊登在最新出版的《自然》杂志上。  人体每个组织由特定属性的组织特异细胞构成。基因选择

揭示全基因组DNA甲基化、半甲基化与遗传突变的新方法

  5月31日,中国科学院北京生命科学研究院研究员孙中生团队与北京大学肿瘤医院合作,在Briefings in Bioinformatics上,发表了题为A new approach to decode DNA methylome and genomic variants simultaneousl

《自然》封面:大熊猫基因组测序

  由深圳华大基因研究院发起,中国科学院昆明动物研究所、中国科学院动物研究所、成都大熊猫繁育研究基地和中国保护大熊猫研究中心参与的合作研究成果《大熊猫基因组测序和组装》,1月21日以封面故事形式在国际权威杂志《自然》上发表。   在国家林业局、深圳市政府、深圳市盐田区政府及相关企业的支持下,“

人类基因组DNA甲基化数据分析

  近期来自电子科技大学,清华大学等处的研究人员从CpG岛等基本定义出发,阐述了高通量DNA甲基化的检测技术以及针对芯片技术与下一代测序技术的低水平数据处理方法,并重点对比了基于机器学习理论对CpG位点及CpG岛甲基化水平的预测算法,以及所利用的特征对预测效果的影响与发展趋势。  DNA甲基化是表观

北京基因组所发表RNA甲基化新发现

  在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA最后流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以在不改变DNA序列的基础上调控基因的表达,并由此决定细胞的分化和发育情况。实际上,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。  N6-methyladenosine(m

进行全基因组甲基化检测需要多少钱

建库是5000块钱一个库,测序就是1500每G,看您要测多少G的数据量,信息分析大概要5000块钱左右吧。。。

2018国自然研究热点二:-RNA甲基化研究深度剖析

  一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?   1、高分文章频现   说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。   图:

《自然》发表首个人类泛基因组草图

   当地时间5月10日,人类泛基因组参考联盟(Human Pangenome Reference Consortium)发表了首个人类泛基因组草图。相关的四篇论文均已发布,其中三篇发布在《自然》(Nature)杂志,一篇发布在《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)杂志。  

《自然》:科学家成功测序水螅基因组

  一个国际科研小组日前完成了水螅基因组的测序工作,相关成果3月14日公布在英国《自然》杂志网络版上。   水螅是一种腔肠动物,大多雌雄同体,通常进行无性生殖,夏初或秋末进行有性生殖。测序结果显示,水螅基因数目与人类基因相似,二者也分享了诸多相同基因。令科学家们惊讶的是,水螅也存在与亨廷顿舞蹈症以

《自然》获得首创性全基因组RNAi库

来自奥地利科学院维也纳分子生物学研究院(Institute of Molecular Biotechnology of the Austrian Academy of Sciences)的研究人员以果蝇为研究对象,利用一套完整的基因组序列数据,从达到了88%覆盖率的蛋白编码基因中获得了全基因组范围内

《自然》:重新认识人类基因组

“DNA元件百科全书”首批成果出炉,人类生物学再树里程碑     继“人类基因组计划”后最大的国际合作计划之一——“DNA元件百科全书”计划(Encyclopedia of DNA Elements,简称ENCODE)日前发表了一系列重要文章,挑战了关于人类基因组的传统理论,即人类基因蓝图不是由孤

《自然》社论关注人类基因组测序

  2月10日出版的《自然》杂志刊登社论——《最好的还未到来》(Best is yet to come),回顾了人类基因组测序工程过去10年的发展并展望其值得期盼的辉煌未来。以下为文章主要内容:  从比尔·克林顿(Bill Clinton)到托尼·布莱尔(Tony Blair),2001年