北京基因组所发表RNA甲基化新发现
在分子生物学的中心法则中，遗传信息从DNA、RNA最后流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰，这些修饰可以在不改变DNA序列的基础上调控基因的表达，并由此决定细胞的分化和发育情况。实际上，mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 N6-methyladenosine（m6A）是真核生物mRNA上最常见的一种转录后修饰，介导了超过80%的RNA碱基甲基化。这种甲基化修饰非常普遍，出现频率大约是3-5个残基/mRNA。近年来，科学家们正在逐步揭开这种mRNA甲基化的神秘面纱。 最近中科院北京基因组研究所的研究团队在二月十一日的Molecular Cell杂志上发表文章，阐明了m6A及其结合蛋白YTHDC1在pre-mRNA剪切中的调控作用。这篇文章的通讯作者是中科院北京基因组研究所的杨运桂研究员。 m6A研究中一般将插入甲基的蛋白称为“书写器”（writer），将去甲基化酶称为“擦除器”（erase......阅读全文
单碱基编辑系统在植物中建立mRNA剪接操控新方法
mRNA前体的剪接是高等生物体内基因转录后加工的重要过程，传统mRNA的剪接遵循“GU-AG”法则，即主要剪接体包含三个保守的剪接位点，即位于内含子5’端的“GU”、3’端的“AG”和靠近3’端的分支点“A”。剪接体通过选择一种或多种剪接位点可将mRNA前体加工为一种或多种成熟的mRNA，即组成
何川、贾桂芳Nature子刊发布表观遗传学新成果
来自芝加哥大学、北京大学的研究人员在新研究中，揭示出了拟南芥m6A甲基化组（methylome）的独特特征。他们的研究结果发表在11月28日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。 芝加哥大学的何川（Chuan He）教授、Joy Bergelson教授以及北京大学
RNA甲基化整体水平鉴定的方法汇总
RNA甲基化（RNA methylation）是一类表观遗传修饰，在已经发现的超过100种不同的RNA化学修饰中，主要有6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine, m6A）、5-甲基胞嘧啶（C5-methylcytidine, m5C）和1-甲基腺嘌呤（N1-methylad
Cell综述：RNA修饰的新作用
迄今为止，科学家们已经发现了上百种RNA修饰类型，但是其中大多数在mRNA和调控非编码RNAs中还是很罕见的。近期的一些研究发现指出，这些修饰中有至少有一些含量丰富，且保守性强。本期Cell杂志以此为中心，介绍了两种RNA修饰方式的分子机制，和生物学功能。 这两种RNA修饰方式分别是N6-甲基
小白必看！RNA甲基化整体水平鉴定的方法汇总
RNA甲基化（RNA methylation）是一类表观遗传修饰，在已经发现的超过100种不同的RNA化学修饰中，主要有6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine, m6A）、5-甲基胞嘧啶（C5-methylcytidine, m5C）和1-甲基腺嘌呤（N1-methyladenos
甲基化——肿瘤检测治疗的又一靶标？
前言在测序和相关技术不断进步的今天，研究人员不仅能够获得DNA、RNA的碱基序列，更能够获得碱基修饰的复杂信息。目前已经证明DNA甲基化能够导至的肿瘤产生，而Ribomed、基准医疗和鹍远基因等公司作为该领域的先行者，已经开发出相关产品。RNA作为中心法则的下游分子，也有多种多样的修饰，特别是m6A
上海药物所小分子调控核酸去甲基化研究取得阶段进展
中科院上海药物研究所杨财广课题组与蒋华良课题组合作，基于mRNA中N6位甲基化修饰的腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)去甲基化酶FTO结构开展小分子调控研究，首次获得了对核酸去甲基化酶，例如FTO具有酶活和细胞活性的小分子抑制剂。论文于10月11日在线发表于《美国化学会
研究揭示RNA甲基化调控斑马鱼母源mRNA稳定性机制
斑马鱼母源-合子转换 (maternal-to-zygotic transition, MZT)过程伴随着母源RNA和蛋白质的降解以及合子基因组的激活(maternal-to-zygotic transition, ZGA)。已有研究表明多种关键因素通过母源和合子途径促进母源mRNA降解，其中包
Genome－research：不同RNA－m5C甲基化修饰存在巨大差异
近年来，RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一，不断有CNS的文章问世，m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰，也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期，来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RESEARCH（
北京基因组所等发现RNA甲基化调控基因出核新机制
中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂研究组和郑州大学第一附属医院生殖与遗传专科医院孙莹璞研究组、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究组合作研究，揭示了m5C（5-甲基胞嘧啶）修饰在mRNA的分布图谱规律及其对调控mRNA出核作用新机制。该研究成果以5-
RNA甲基化调控基因出核新机制
中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂研究组和郑州大学第一附属医院生殖与遗传专科医院孙莹璞研究组、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究组合作研究，揭示了m5C（5-甲基胞嘧啶）修饰在mRNA的分布图谱规律及其对调控mRNA出核作用新机制。该研究成果以5-
不同RNA－m5C甲基化修饰存在巨大差异
导读近年来，RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一，不断有CNS的文章问世，m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰，也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期，来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RESEA
Genome－research：不同RNA－m5C甲基化修饰存在巨大差异
导读 近年来，RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一，不断有CNS的文章问世，m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰，也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期，来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RES
蛋白质合成翻译阶段的基因调控介绍
蛋白质合成翻译阶段的基因调控有三个方面： ① 蛋白质合成起始速率的调控； ② MRNA的识别； ③ 激素等外界因素的影响。蛋白质合成起始反应中要涉及到核糖体、mRNA蛋白质合成起始因子可溶性蛋白及tRNA，这些结构和谐统一才能完成蛋白质的生物合成。mRNA则起着重要的调控功能。 真核生物
组成碱基对的碱基有哪些？
组成碱基对的碱基包括A、G、T、C、U。严格地说，碱基对是一对相互匹配的碱基(即A：T，G：C，A：U相互作用)被氢键连接起来。
细胞化学基础碱基的种类修饰碱基
DNA和RNA分子中还含有核酸链形成后经过修饰形成的其它非主要碱基。这些碱基大多是在上述嘌呤或嘧啶碱的不同部位甲基化（methylation）或进行其它的化学修饰而形成的衍生物。DNA中最常见的修饰碱基是5-甲基胞嘧啶（m5C）。RNA中有许多修饰的碱基，包括核苷类假尿苷（Ψ）、二氢尿苷（D）、肌苷
新型全转录组单碱基分辨率N6甲基腺苷（m6A）检测方法
在已知的100多种RNA化学修饰中，N6-甲基腺苷（m6A）是真核细胞mRNA中最丰富的形式之一，占所有腺苷的0.1%~0.4%。m6A修饰可影响mRNA代谢的不同阶段以及长非编码RNA和microRNA产生，是RNA和表观修饰领域的重要研究方向。已有研究表明，m6A能够影响多种生物学过程，包括
翻译水平上的调控
蛋白质合成翻译阶段的基因调控有三个方面：① 蛋白质合成起始速率的调控；② MRNA的识别；③ 激素等外界因素的影响。蛋白质合成起始反应中要涉及到核糖体、mRNA蛋白质合成起始因子可溶性蛋白及tRNA，这些结构和谐统一才能完成蛋白质的生物合成。mRNA则起着重要的调控功能。真核生物mRNA的“扫描模式
科学家揭示RNA甲基化调控实体瘤膀胱癌发生机制
m5C修饰是mRNA上分布广泛的碱基修饰形式之一，但对于进入细胞质内的含有m5C修饰的mRNA的命运决定及其在生理和病理中的调控作用目前尚不清楚。 中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队联合中山大学肿瘤医院周芳坚团队、谢丹团队和中科院生物化学与细胞生物学研究所黄旲团队合作研究，发现m5C通过细胞
研究揭示RNA甲基化调控实体瘤膀胱癌发生机制
m5C修饰是mRNA上分布广泛的碱基修饰形式之一，但对于进入细胞质内的含有m5C修饰的mRNA的命运决定及其在生理和病理中的调控作用目前尚不清楚。 中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队联合中山大学肿瘤医院周芳坚团队、谢丹团队和中科院生物化学与细胞生物学研究所黄旲团队合作研究，发现m5C通过细胞
北京基因组所RNA－m6A甲基化调控mRNA剪切研究获进展
6-甲基腺嘌呤【N6-methyl-adenosine(m6A)】是高等生物mRNA中含量最为丰富的甲基化修饰形式之一，发生于保守序列RRACH（R=G ,A； H=A,C or U）中，富集在mRNA的外显子编码区及3’-非编码区。类似于DNA甲基化修饰，RNA的m6A甲基化修饰也是可逆的，由
Oligopull－down结合质谱、蛋白解构技术等研究实体瘤膀胱癌
m5C修饰是mRNA上分布广泛的碱基修饰形式之一，但对于进入细胞质内的含有m5C修饰的mRNA的命运决定及其在生理和病理中的调控作用目前尚不清楚。中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队联合中山大学肿瘤医院周芳坚团队、谢丹团队和中科院生物化学与细胞生物学研究所黄旲团队合作研究，发现m5C通过细胞质内
m5C－RNA甲基化测序介绍
m5C RNA甲基化简介通过分析近几年的国自然立项，可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势：特别是从2015年的5项到2017年的25项，项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇，可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段，多篇文章荣登CNS级别期刊。RNA甲基
碱基互补配对原则的碱基互补的介绍
在脱氧核糖核酸分子中，含氮碱基为腺嘌呤(A)，鸟嘌呤(G)，胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)。每一种碱基与一个糖和一个磷酸结合形成一种核苷酸。在其双链螺旋结构中，磷酸-糖-磷酸-糖的序列，构成了多苷酸主链。在主链内侧连结着碱基，但一条链上的碱基必须与另一条链上的碱基以相对应的方式存在，即腺嘌呤对应胸
何川教授Nature，Cell子刊解析表观遗传学
早年毕业于中国科技大学的何川教授现任芝加哥大学生物物理动态研究所主任，以及北京大学合成与功能生物分子中心主任。何川教授研究组主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究，近期在Nature Biotechnology，Molecular Cell杂志上发表新研究成果，解析基因组及
PLOS－Genetics：甲基转移酶OsFIP在植物早期孢子发生的作用
N6-甲基腺苷（m6A）RNA甲基化在不同物种的发育过程中起重要作用。然而，单子叶植物中m6A RNA甲基化的知识仍然有限。2019年5月22号，中山大学陈月琴 、张玉婵研究团队等人在PLOS Genetics上在线发表了题为The subunit of RNA N6-methyladenosi
m5C－RNA修饰表达谱文章教您如何另辟蹊径快速发文
文章导读随着RNA修饰在生物领域的持续火热，关于m6A修饰的研究已经广 泛开展并发表，至今已觉不新鲜；5-甲基胞嘧啶RNA甲基化（m5C）是一类新的修饰方式，参与调控细胞应激、发育和基因表达等方面，目前m5C研究正处 方兴未艾之际，大量的科学研究工作也亟待开展，非常适合有探索性和新颖性需求的老师。这
云序生物独家首发m5C－RNA甲基化测序
m5C RNA甲基化简介 通过分析近几年的国自然立项，可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势：特别是从2015年的5项到2017年的25项，项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇，可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段，多篇文章荣登CNS级别期刊
什么是碱基？
碱基指嘌呤和嘧啶的衍生物，是核酸、核苷、核苷酸的成分。
什么是碱基？
碱基，在化学中本是“碱性基团”的简称。有机物中大部分的碱性基团都含有氮原子，称为含氮碱基，氨基（-NH2）是最简单的含氮碱基。碱基，在生物化学中又称核碱基、含氮碱基，是形成核苷的含氮化合物，核苷又是核苷酸的组分。碱基、核苷和核苷酸等单体构成了核酸的基本构件。核碱基间可以形成碱基对，且彼此堆叠，所以，