7月15日《自然》杂志精选

封面故事: 猴与人的分化 灵长类的化石记录很稀少,仍然存在实质性的缺口。其中一个缺口是“旧世界”的猴子与“新世界”高等灵长类的类人猿和人类的分化。这种分化以前仅限于“非洲—阿拉伯大陆”的渐新世,但在沙特西北一个新的、处在进化树根部的狭鼻猿的发现缩小了这个缺口。沙特发现的这个材料来自距今约2800万年前的渐新世中期,它的狭鼻猿分化特征非常少,说明“旧世界”的猴子与“新世界”的类人猿之间的分化发生在那个时期之后。本期封面所示为头盖骨的前部,其犬齿和上颚宽臼齿都在原处。头盖骨的大小表明这是一个中等大小的灵长类,体重在15公斤和20公斤之间。自然保护工作的选择性 有人提出,表现差的保护区应当失去其保护地位,所节省的资金应用到效果好的其他地方。这种观点不易被保护工作者和地方游说团体所接受。但根据对澳大利亚近7000个保护区的表现所作的一项研究,从长期来看这种观点可能是最好的政策。大约70......阅读全文

我国学者揭示乙型脑炎病毒组装奥秘

  中国农业科学院哈尔滨兽医研究所重要人畜共患病与烈性外来病专家团队在乙型脑炎病毒复制周期机制研究方面取得新进展,首次揭示了宿主因子SPCS1参与乙型脑炎病毒组装的奥秘。相关学术成果近日在线发表于国际著名专业期刊《病毒学杂志》上。图片来源于网络  流行性乙型脑炎病毒与登革热病毒、西尼罗病毒、寨卡病毒

全球病毒组项目欲揪出百万未知病毒

据美国《科学新闻》双周刊网站近日报道,定于2018年启动的“全球病毒组项目(Global Virome Project)”计划耗资12亿美元,在今后10年内,确定仍未“现身”的约百万种病毒(其中40%—50%的病毒可能感染人类),以便预防下一次病毒大流行。俗话说:知己知彼,百战不殆。为了有效防范下一

北京基因组所揭示RNA甲基化调控基因剪接机制

  中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂课题组在研究m6A甲基化修饰调节mRNA选择性剪接规律过程中,发现了读码器YTHDC1通过招募前体mRNA剪接因子SRSF3同时抑制剪接因子SRSF10与RNA的结合,促进外显子被保留的分子机制。该研究结果于2016

自然子刊:揭示基因组编辑新机制

  中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所杨力研究组与上海科技大学陈佳研究组、南京医科大学沈彬研究组合作研究揭示了胞嘧啶脱氨酶(APOBEC)在CRISPR/Cas9引发的DNA断裂修复过程中产生突变的新机制,为进一步提高基因组编辑保真度提供了新思路。  C

《自然》发表国际肿瘤基因组计划专题报道

      4月15日,国际权威科学期刊《自然》杂志将发表关于国际肿瘤基因组计划的专题报道,介绍该计划所取得的发展历程、研究计划以及研究成果等。  全球联手解读“天书”  “国际癌症基因组联合计划,是继国际人类基因组计划后,人类基因研究的新里程碑。”浙江大学医学院

《自然》:美首次对老鼠基因组调控序列测序

  美国科学家在7月1日出版的英国《自然》杂志上撰文表示,他们首次详细标示出了老鼠基因组功能序列中一个重要部分——调控序列的详细情况。老鼠是生物医学研究中最广泛使用的哺乳动物模型,因此,最新研究也将有助于我们进一步解读人类基因组。  加州大学圣地亚哥分校路德维格癌症研究所基因调控实验

武汉病毒研究所在食虫蝙蝠肠道中发现多种新型病毒

  中科院武汉病毒研究所石正丽研究员带领的研究团队采用宏基因组学方法,对我国蝙蝠肠道病毒首次进行了系统研究,结果发表在《病毒学杂志》(Journal of Virology)上(2012, 86(8):4620. DOI: 10.1128/JVI.06671-11)。  蝙蝠是哺乳动

中国科学家首次发现线虫基因组存在DNA甲基化现象

中国科学家最新研究成果首次证实在旋毛虫基因组中发现了甲基转移酶并证实了DNA甲基化的存在,改写了长期以来认为线虫中没有该种表观遗传修饰的历史。同时也使以DNA甲基化序列做靶标进行抗寄生虫药物研发成为可能,为抗旋毛形线虫病的药物开发提供了全新思路。 吉林大学人兽共患病研究所和华大基因研究院合作完成的

Nature-Genetics:单细胞全基因组DNA甲基化组新发现

  北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心,北大生命科学学院与第三医院等处的研究人员发表了题为“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimplantation Embryos”的文章,利用单细胞DNA甲基化组高通量测序方法,首次在单细胞分辨

基因组所等RNA甲基化表观转录组学研究获进展

  2014年1月,中国科学院北京基因组研究所基因组变异与精准生物医学实验室“百人计划”研究员杨运桂研究组,与中国科学院动物研究所“百人计划”研究员刘峰研究组合作开展的“m6A甲基转移酶复合物鉴定”研究,发现了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)

《自然》:2种疟疾寄生虫基因组序列测定

疟疾裂殖子 一个由美英等国科学家组成的国际研究小组近日测定了两种致命疟疾寄生虫的基因组序列。这两种疟疾寄生虫分别名为Plasmodium knowlesi和Plasmodium vivax,其中P. knowlesi最近被认为是感染人类的一个主要疟疾病原体,而P. vivax则会致人极度虚弱,

“基因组编辑核酸酶”当选《自然》年度研究方法

    《自然—方法学》视频介绍“基因组编辑核酸酶”   《自然》杂志子刊《自然—方法学》在最新一期推出了2011年度研究方法专刊,评选出了本年度研究方法——基因组编辑核酸酶(Gene-editing nucleases)。专刊包括社论、新闻特写、评论、视频等内容;同时,还评出其他8个值得关注的研

草莓基因组研究取得成果-|《自然遗传学》

  《自然-遗传学》本周在线发表的一篇论文Origin and evolution of the octoploid strawberry genome报告了一个几近完整的草莓参照基因组。该基因组为了解这一广受欢迎的水果的起源和演化历史提供了新见解。八倍体草莓的演化史。Edger et al.  八

科学家揭秘全国范围内蚊虫病毒组特征

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519660.shtm蚊子,除了日常恼人之外,更是一种常见的病毒传播媒介,通过其传播的疾病包括疟疾、黄热病、登革热等。随着全球气候变暖,蚊虫的繁殖速度和传播疾病的能力也得到了增强,由虫媒病毒引起的新发传染病

日常蚊虫消杀对预防疾病初始流行作用有限

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500563.shtm蚊虫能够传播寨卡、登革、脑炎、基孔肯雅、黄热等多种病毒疾病,长期以来被认为是一种威胁人类健康的生物。最近,由中国科学院北京生命科学院研究院、中国科学院动物研究所、海南医科大学合作完成的

Cell:染色体水平油松基因组组装和甲基化研究取得进展

  近期,北京林业大学生物科学与技术学院联合安诺优达在国际知名期刊Cell(IF:41.582)在线发表了题为“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章,研究者对油松进行了

北京基因组所开发完成DNA甲基化重编程数据库

  DNA甲基化是一个重要的表观遗传标记,在胚胎早期发育过程中起到至关重要的作用,不同物种所采用的机制亦各不相同。因而,整合多个物种的海量甲基化数据并提供在线的数据浏览、获取及其功能分析,可帮助更多研究人员深入探析不同物种在早期发育时期的DNA甲基化差异,并揭示其DNA甲基化重编程过程与机制。   

甲基化的甲基化的功能

甲基化是蛋白质和核酸的一种重要的修饰,调节基因的表达和关闭,与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关,是表观遗传学的重要研究内容之一。 最常见的甲基化修饰有DNA甲基化和组蛋白甲基化。DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、D

《自然—方法学》发表媲美基因组测序速度的组装算法。

  10年前,Illumina基因组测序技术进入市场时,前所未有的庞大数据量淘汰了较早开发的测序分析工具。  历史总是重演。如今,第三代测序技术已经达到低成本群体测序规模的临界点。  12月10日,《自然—方法学》在线发表了第一个能够跟上基因组测序产生速度的组装算法。  论文作者、中国农业科学院农业

《自然》:中美科学家联合绘出番木瓜基因组草图

记者从南开大学了解到,中美科学家在世界上首次绘制完成一株转基因经济作物的全基因组图谱。这篇名为《转基因热带水果植物——番木瓜的基因组草图》的成果发表在4月24日出版的国际权威科学杂志《自然》上。 这项转基因经济作物的全基因组图谱研究成果,对农作物育种、农业生产和人类对转基因植物的认识具有极其重要的意

首个山羊基因组图谱在《自然•生物技术》杂志发表

  2012年12月24日,由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院等单位合作完成的首个山羊全基因组图谱在《自然•生物技术》(Nature Biotechnology)杂志在线发表。本研究采用新一代测序技术(NGS)与全基因组酶切图谱(Whole-genome mapping)技术相结

《自然—生物技术》:美教授“自绘”个人基因组图谱

  斯蒂芬·夸克(Stephen Quake)   一台机器、3个人、5万美元,美国斯坦福大学教授斯蒂芬·夸克(Stephen Quake)最近用“自绘”个人基因组图谱的经历说明,这项“游戏”已不再是谁也玩不起的了。   斯坦福大学8月10日发表声明说,夸克在两名同事的帮助下,利用一台冰箱大

科研人员开发病毒分类新工具,大幅提升病毒注释率

记者11日从中国海洋大学获悉,该校海洋生命学院汪岷教授团队基于序列比对和图论方法,开发了病毒分类新工具Viral Taxonomic Assignment Pipeline(VITAP)。该成果近日在国际知名期刊《自然-通讯》(Nature Communications)上发表,为病毒组学和病毒生态

深海沉积物病毒多样性和辅助代谢功能研究获进展

  在海洋环境中,病毒是仅次于原核生物的第二大生物量成分。它们的生态意义不仅限于宿主裂解,还包括水平基因转移和通过辅助代谢基因调节宿主代谢。这些辅助代谢基因可以编码关键的代谢酶,在感染期间有效地重塑细胞过程,并可能影响生物地球化学循环。  近日,中国科学院海洋研究所研究团队揭示了深海不同冷泉和海山沉

家蚕高分辨率甲基化图谱成功构建

  作为表观遗传学的一种重要标记,DNA甲基化在基因组防御、基因调控等方面都发挥着重要作用。相对于动植物,昆虫甲基化水平很低,其功能也一直存在争议。近年来,随着越来越多昆虫甲基化基因和甲基化酶的报道,昆虫甲基化的功能和生物学意义引起了广泛的兴趣。   近期,中国科学院昆明动

北京基因组所RNA-m6A甲基化调控mRNA剪切研究获进展

  6-甲基腺嘌呤【N6-methyl-adenosine(m6A)】是高等生物mRNA中含量最为丰富的甲基化修饰形式之一,发生于保守序列RRACH(R=G ,A; H=A,C or U)中,富集在mRNA的外显子编码区及3’-非编码区。类似于DNA甲基化修饰,RNA的m6A甲基化修饰也是可逆的,由

北京基因组所等首次精准解析结核分枝杆菌复合群甲基化

  结核病是全球最常见的传染病之一,据WTO“2015年全球结核病年报”报告,2014年全球新增感染人数960万,死亡150万,新增耐多药结核(MDR)病例48万(其中我国新增结核感染病例93万,居全球第三位),其目前仍是全球第二大传染病。结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberc

全基因组甲基化测序技术可用于肺结节良恶性无创诊断

   近期,中国科学院合肥物质科学研究院健康与医学技术研究所研究员聂金福、副研究员洪波生物信息学研究团队、研究员王宏志课题组和安徽医科大学二附院赵大海团队合作,在肿瘤早筛领域取得进展,开发出基于血液cfDNA甲基化的肺结节良恶性无创诊断模型。相关研究成果在线发表在Cancer Science上。  

吉大和华大基因联合发现线虫基因组中存在DNA甲基化现象

2012年10月18日,吉林大学和华大基因合作完成的旋毛形线虫不同发育阶段DNA甲基化差异分析的相关研究成果在国际著名期刊《基因组生物学》(Genome Biology)上发表。该研究首次证实了线虫基因组中存在DNA甲基化现象,改写了长期以来认为线虫中没有该表观遗传修饰的历史,同时也使以DNA甲基化

北京基因组所等发现RNA甲基化调控基因出核新机制

  中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂研究组和郑州大学第一附属医院生殖与遗传专科医院孙莹璞研究组、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究组合作研究,揭示了m5C(5-甲基胞嘧啶)修饰在mRNA的分布图谱规律及其对调控mRNA出核作用新机制。该研究成果以5-