2010全国质谱大会大会报告(三)

复旦大学 杨芃原教授 来自复旦大学的杨芃原教授做了题为“糖蛋白结构的高通量质谱分析”的报告。杨教授介绍,由于理论的数据库大小是天文数字,使糖蛋白的结构分析成为目前糖蛋白分析瓶颈。杨教授在报告中介绍了用MALDI进行糖蛋白de-novo解谱,进而用ESI搜索糖蛋白数据库的糖蛋白结构鉴定方法。重点介绍了数据库是如何建立的。 杨教授课题组的解决思路是,增加如多级质谱等各谱图阶段的信息(但由于质谱的速度和检出限,高通量使用尚有问题),减少检索时所需的已知信息,创建高可信度的糖肽数据库,并撰写新的检索软件。具体方案为:1)建立完备、精简的包含糖位点的肽库及糖链库,通过实验获得肽库,根据文献获得糖链最大组成的糖链库,穷举它们的结构后,再人工排除不合理结构,获得针对特定样品的糖链库。2)构建针对特定样品的糖结构库。3)筛选出谱图中可能的糖碎裂峰。4)对碎裂峰进行匹配,获得糖肽组成,使用上一步骤获得峰......阅读全文

质谱技术在蛋白组研究中的应用(二)

6 质谱仪的最新进展 用质谱检测蛋白,首先考虑到用PMF与 MALDI-TOF联用,如果无法检测,下一步就用ESI-MS/MS创建序列标签。在PMF分析中,MALDI的平板中只需一小部分样本就足以检测,剩下的样本就可以用来创建序列标签。并且,在MALDI-TOF仪器上,用一种叫做“源后延迟”

质谱技术在蛋白组研究中的应用(一)

[摘要] 质谱对于现代蛋白质化学研究是一项重要的技术。也可用于蛋白组分析,在同一时间监控上千种蛋白的表达情况。首先蛋白质混合物可以用双向凝胶电泳分开,再用质谱及随后的蛋白质数据库检索对单个蛋白进行鉴定和分析。最近几年,质谱领域取得了令人鼓舞的进展,使得全自动、高通量的蛋白检测成为可能。质谱也

布鲁克明星质谱参展BCEIA-推动“真”单细胞蛋白组学

  分析测试百科网讯 2021年9月27日-29日,第十九届北京分析测试学术报告会暨展览会(BCEIA 2021)在北京•中国国际展览中心开幕。布鲁克质谱中国区大客户经理李晨博士接受了分析测试百科网的采访,为我们带来了展会产品的精彩解读。分析测试百科网作为展会支持媒体,全程跟踪报道。布鲁克质谱中国区

岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究

  靶向代谢组学中,通常需要同时检测多个目标组分,这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。   岛津超快速质谱(UFMS)拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例,其驻留时间(Dwell time≥0.8 ms)、切换时间(Pause time≥1 ms)、扫描速度(Scan s

岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究

靶向代谢组学中,通常需要同时检测多个目标组分,这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。  岛津超快速质谱(UFMS)拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例,其驻留时间(Dwell time≥0.8 ms)、切换时间(Pause time≥1 ms)、扫描速度(Scan speed≤3

蛋白组学:质谱技术用于结核病的诊断及精准治疗

  分析测试百科网讯 结核病离我们有多近?前不久,国内某一级城市向市民们发出一条短信,呼吁小心感染肺结核。根据世界卫生组织(WHO)的统计,每年有1000万例 结核病,其中200万例死亡,结核病是重大的全球健康问题。更糟糕的是,结核菌可以潜伏在一个人的肺组织数十年,然后自发产生全身结核病,然后可以传

技术进步为质谱血浆蛋白组学带来了巨大飞跃

  近日美国质谱学会年会(ASMS)上发布的最新数据表明,新的仪器和工作流程极大地提高了基于质谱的血浆蛋白组学实验的覆盖深度和通量。这些进步可使质谱成为各应用领域中更有用的工具,包括血浆蛋白生物标志物的开发以及迄今由Olink和SomaLogic等亲和性平台主导的大规模人群研究。  血浆是一种易于获

与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有何优点

那年夏天Forever与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有以下优点:①代谢组学放大了基因和蛋白表达的微小变化,从而使检测更容易;②代谢组学的研究不需建立全基因组测序及大量表达序列 标签(EST)的数据库,且代谢产物的种类要远小于基因和蛋白的数目.③ 由于给定的代谢产物在每个组织中都是一样的,所以研究

安捷伦与贝勒医学院建立代谢组学质谱中心

  近日,安捷伦和贝勒医学院表示,他们已在BCM's Alkek Center for Molecular Discovery开启安捷伦卓越质谱中心。  安捷伦将为中心提供两个质谱代谢工作系统:6495 三重四极杆 LC/MS和6550 iFunnel QTOF LC / MS系统,具有可切换的GC

高分辨质谱Orbitrap直击靶标代谢组学新热点

在生命科学奇妙世界里,基因、核酸、蛋白和小分子代谢产物构成了细胞生命活动的基本要素,以这些物质为基础的诸多组学技术的发展,推动着生命科学研究不断向前。 基因-蛋白-代谢-表型之间的互动成为生命科学研究中研究的范式⁽¹⁾,研究成果可谓精妙纷呈、大放异彩。 图1:基因-蛋白-代谢-表型之间的互动成为生命

蛋白组与代谢组在猪肉品质鉴定中的话语权

对食物是否鲜香判断的重要依据是其口感,决定口感好坏的因素有新鲜度、烹调方式、食物本身所含的风味物质等,但起决定性作用的应该是风味物质。风味物质在生物学上叫内源性代谢物。肌肉组织是肉的主要成分,利用蛋白组学技术对屠宰后猪的肌肉进行研究后发现与猪肉品质特征相关的重要蛋白标志物:与系水力和色泽相关的蛋白主

质谱组学,引领精准

  8月,上海。炎炎夏日,骄阳似火,正值生机盎然的季节,一场造福行业发展的合作协议今日于上海签订。赛默飞世尔科技(中国)有限公司和上海中科新生命生物科技有限公司在多组学及精准医疗领域,建立战略合作伙伴关系。出席本次签订协议的嘉宾有赛默飞世尔科技(中国)有限公司商务运营副总裁冯时瀚先生、上海中科新生命

大连化物所在多维液相色谱质谱技术用于代谢组深度覆盖

  近日,中国科学院大连化学物理研究所高分辨分离分析及代谢组学研究组(1808组)在利用多维液相色谱-质谱技术用于代谢组深度覆盖研究中取得新进展,相关研究结果被Analytical Chemistry杂志收录。   酰基辅酶A是一类重要的代谢物,在许多生物过程中发挥作用。由于其性质差异较大,很难用

2016CMSS精彩第三弹:代谢组学和无机质谱专场

  为进一步加强国内外质谱界学术交流,并采用更新颖的互联网形式组织交流活动,将质谱新技术和研究应用拓展和普及到更多的人,共同提高我国质谱研究及应用水平,中国质谱学会将在2016年11月1日-4日,组织“2016 CMSS中国质谱学会质谱网络研讨会”。会议邀请30位质谱大咖与您在线对话,报告内容涵盖质

Bruker推出用于MALDI成像、代谢组学等新型质谱解决方案

  分析测试百科网讯 Bruker在ASMS 2017上展示了几种新型和创新的高性能质谱解决方案,用于代谢组学、蛋白质形态分析和毒理学。Bruker还举办了MALDI创新25年庆典,重点是高通量MALDI分析、临床和成像解决方案。  Bruker总裁兼首席执行官Frank H. Laukien博士评

质谱综述:上交大吕海涛首次定义精准修饰代谢组学新法

近日,上海交通大学吕海涛研究员再次受邀在组学与质谱学领域著名杂志《Mass Spectrometry Reviews》(中科院分区1区TOP级杂志,影响因子9.526)发表评论文章“Mass spectrometry and associated technologies delineate the

多维液相色谱质谱技术用于代谢组深度覆盖研究获进展

  近日,中国科学院大连化学物理研究所高分辨分离分析及代谢组学研究组(1808组)在利用多维液相色谱-质谱技术用于代谢组深度覆盖研究中取得新进展,相关研究结果被Analytical Chemistry杂志收录。  酰基辅酶A是一类重要的代谢物,在许多生物过程中发挥作用。由于其性质差异较大,很难用一种

朱正江:基于离子淌度质谱的非靶向代谢组学研究

  分析测试百科网讯 2020年9月14日,由中国质谱学会(中国物理学会质谱分会)主办,分析测试百科网和中国质谱学会网承办的2020年中国质谱学会质谱网络研讨会(2020 CMSS)正式开幕。本届质谱网络研讨会正值中国质谱学会成立40周年,按报告内容涉及领域包括生命科学与组学、药物药理毒理分析、元素

AB-SCIEX与LECO合作为代谢组学领域提供质谱解决方案

  两家先进的技术公司合同开发出GC/MS 和 LC/MS捆绑解决方案   2013年3月18日—全球提供精确质量技术的GC/MS领导者——LECO公司与LC/MS技术全球领先的AB SCIEX公司公布一个联合营销协议,为那些同时需要LC和GC两种分离能力的代谢组学研究人员,提供了以液质和气质

大咖面对面丨代谢组学前景广阔-质谱构建核心平台

  临床质谱近年来发展迅猛,许多诊断标志物都是小分子代谢物,表明代谢组学从研究到临床转化的路径更快;与此同时,代谢组学近年来在生命医学、植物学、暴露组学等研究中发挥了越来越重要的作用,几乎每一项多组学研究的卓越成果都离不开代谢组学。在成为热点的同时,代谢组学研究目前还存在数据库不够丰富、代谢流方法不

中国医科大学附属第一医院采购单细胞蛋白组学质谱

  中国医科大学附属第一医院单细胞蛋白组学质谱(国家医学检验临床医学研究中心)采购招标项目的潜在供应商应在线上获取招标文件,并于2022年12月23日 09时00分(北京时间)前递交投标文件。  一、项目基本情况  项目编号:JH22-210000-64371  项目名称:中国医科大学附属第一医院单

PEA邻位延伸分析技术的进化史-洞见蛋白组质组学未来

从中心法则洞见蛋白组质组学发展未来上世纪60年代末,分子生物学中心法则(Genetic Central Dogma)首次从分子水平揭示生命遗传信息的传递奥秘。这一黄金中心法则“DNA转录生成RNA,RNA翻译产生蛋白质,蛋白质反过来协助前两项流程,并协助DNA完成自我复制”在近60年生命科学发展的过

杭州质谱学术大会系列:Astral突破质谱组学新极限

  ——2020-2023杭州质谱学术大会系列报导  6月11日,中国质谱学术大会 “新方法与新技术”专场报告中,来自北京生命科学研究所董梦秋研究员、中科院大连化物所张丽华研究员、南京大学鞠幌先教授、赛默飞应用主管范自全等专家、学者和企业代表带来了关于蛋白质相互作用、结构分析的最新质谱检测方法与应用

代谢组学分析新方法基于纳升电喷雾质谱直接进样

  近日,大化所生物分子高分辨分离分析及代谢组学研究组(1808组)许国旺研究员团队在纳升电喷雾质谱直接进样的代谢组学分析新方法研究方面取得新进展,基于纳升电喷雾直接进样的高分辨质谱(nanoESI DI-HRMS),分别结合质谱信息非依赖采集(DIA)、拼接式质谱采集、毛细管微探针取样等技术,实现

许国旺:拟靶向代谢组学—让质谱更好地服务于临床研究

“精准分析”我们的成功故事系列——写在前面的话  “精准分析•量化释能”——我们的成功故事系列栏目,是SCIEX帮助科学家们分享有意义的科学发现和研究成果的科普平台。我们期待让更多的人感受到科学和“质谱”的力量,“让质谱改变每个人的生活”始终是SCIEX最美好的愿景。SCIEX非常荣幸能够参与到这一

靶向代谢组学新质生产力-—-岛津专利全谱二维液质联用技术来了!

  01 导语  在靶向代谢组学检测中,样品基质通常较为复杂,所需分析的化合物数量多、极性范围广。当各目标物极性差异过大时,往往难以通过单一方法完成所有目标化合物的分析。通常采用两种样品前处理方式、两种分析方法和两种色谱柱,分别完成强极性和弱极性物质的分析。这种方式耗时耗力,且可能产生冗余数据,不利

代谢及脂质组学液质应用培训班通知

  基于质谱的代谢组学已成为疾病机理研究、临床生物标志物发现、新药靶点开发、环境暴露、食品真伪或溯源、农业和林业科学等方面的重要科研手段而被广泛应用。为了助力代谢组学领域的质谱学者更好地运用LC-MS/MS系统进行研究,SCIEX将在天津举办“代谢及脂质组学液质应用培训班”,内容主要涉及:  1)代

质谱技术实践与应用研讨会|一文看懂什么是代谢组学!

  代谢组学是系统生物学的重要组成之一,与基因组、转录组、蛋白组共同解释了生命体从微观 DNA 分子到分泌小分子代谢物的整个变化过程。代谢组学侧重体现机体正在发生的事情,与表型关系更加紧密。  代谢组学通过检测生物体被扰动后小分子代谢物的变化,发现其种类、数量及其变化规律,其研究对象大多是分子量在

蛋白组学的研究方法

蛋白组学的研究方法如下:蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否,很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基(20/4), 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰,如磷酸化和糖基化等,给分离和分析蛋白质带来很