昆明动物所在生物多样性监测方法研究上取得突破
那些令人毛骨悚然的昆虫、令人惊声尖叫的小爬虫们，它们不再只是我们儿时玩伴藏匿在盒子里的“惊喜”，这些小虫子其实有着更为神奇的作用——监测环境中的生物多样性。 中国科学院昆明动物研究所研究员Douglas Yu领导的团队研究发现，通过对一定区域内昆虫样本的混合DNA测序，可以对该区域的生物多样性进行编目和监测。 该研究团队近期于国际生态学前沿杂志Ecology Letters上发表的文章展示了高通量条形码技术(metabarcoding)这一种新颖的生物多样性监测手段，这种技术与依赖于大量分类学专家的传统监测方法相比更为快速高效，同时可靠性高。 高通量条形码技术最大的突破在于人们利用它可以更容易地监测环境变化和濒危物种的状况。此项技术应用范围非常广泛，它不仅可以帮助科学家在巴布亚新几内亚寻找树袋鼠、预测哪些蛾类将随气候变化而消失，还可以为科学家的生态恢复实验进展进行监测，例如我国的生态橡胶林恢复项目、......阅读全文
我国蛇类DNA条形码参考数据集发布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498440.shtm
中国蛇类DNA条形码参考数据集发布
中国科学院昆明动物研究所（以下简称昆明动物所）研究员车静课题组联合国内科研团队开展合作，首次系统性构建了中国蛇类DNA条形码参考数据集（COI），对中国蛇类多样性进行了评估。日前，相关研究成果发表于《分子生态学资源》（Molecular Ecology Resources）。 据了解，两栖爬行
高通量测序数据分析
1. 是不是一定要用大型计算机? 除了序列拼接组装以外，其它分析不是一定要大型计算机，在普通的PC上也可以进行一些处理，当然，买一台或几台高性能的工作站电脑，能显著加快数据处理的速度。 2. 是不是一定要用Linux系统? 也不一定非用Linux不可，在Window下可以完成部分数据处理。
中草药DNA条形码高通量测序一体机HMBI－G30在京发布
近日，由中国中医科学院中药研究所和华大智造科技有限公司联合开发的中草药DNA条形码高通量基因测序一体机HMBI-G30在北京完成验收评审并发布。HMBI－G30是我国具有完全自主知识产权的全球首创中草药基因测序智能鉴定仪，具有重大的科研和产业价值。 准确鉴定草药基原物种的国际化通用方法，已成为
我国构建近海生物DNA条形码数据库－满足科研需求
科技部18日透露，通过科技基础性工作专项部署了“我国近海海洋生物DNA条形码资源库构建”重点项目，具体由中国科学院海洋研究所承担。根据不同类群的特点，项目将选择有代表性的重要海洋生物类群，如原核生物、植物、浮游动物、大型底栖无脊椎动物及鱼类等，在准确形态鉴定的基础上，系统并规模化地获取
昆明动物所在生物多样性监测方法研究上取得突破
那些令人毛骨悚然的昆虫、令人惊声尖叫的小爬虫们，它们不再只是我们儿时玩伴藏匿在盒子里的“惊喜”，这些小虫子其实有着更为神奇的作用——监测环境中的生物多样性。 中国科学院昆明动物研究所研究员Douglas Yu领导的团队研究发现，通过对一定区域内昆虫样本的混合DNA测序，可以对该区域的生
DNA条形码技术介绍
DNA条形码技术是通过DNA序列对物种进行快速、准确识别的技术。该技术为研究物种的进化 规律 、遗传变异、系统发育以及生物多样性等提供理论依据。由于该技术具有利用生物种群中的某些遗传保守性很强的DNA片段进行物种鉴定和亲缘关系的定位，了解其分支来源，甚至可以预知其进化方向等，使其成为近年来生
DNA条形码技术那点事
DNA条形码技术是通过DNA序列对物种进行快速、准确识别的技术。该技术为研究物种的进化 规律 、遗传变异、系统发育以及生物多样性等提供理论依据。由于该技术具有利用生物种群中的某些遗传保守性很强的DNA片段进行物种鉴定和亲缘关系的定位，了解其分支来源，甚至可以预知其进化方向等，使其成为近年来生物分
渔业生物DNA条形码信息采集与数据库构建工作会议召开
2014年9月11日至13日，科技基础性工作专项“我国重要渔业生物DNA条形码信息采集及其数据库构建”重点项目在青岛召开项目年度工作会议暨学术研讨会。专家组成员、科技部基础研究司有关同志出席了会议。 “我国重要渔业生物DNA条形码信息采集及其数据库构建”重点项目自2013年6月启动以来，各
版纳植物园在构建木材树种DNA条形码数据库方面获进展
木材树种是一类与人类息息相关的重要资源植物，对于维持全球生态系统服务功能和生物多样性保护具有重要价值。然而，木材非法活动经常出现在盗砍盗伐、非法加工和出口、虚假申报以规避濒危物种国际贸易公约（CITES）或避税等过程中，因此开发准确、快速的木材树种鉴定工具，对于遏制盗砍盗伐和相关非法贸易、保护生
昆明动物所在生物多样性快速监测方法研究中取得进展
近期，中国科学院昆明动物研究所研究员Douglas Yu课题组在Methods in Ecology and Evolution（MEE）上发表了第一篇描述“生物多样性汤（Biodiversity Soup）”这一高通量条形码技术流程的论文。如今，高通量条形码技术在环境保护和管理相关决策研究中的
研究开发出小分子RNA高通量测序数据整合分析软件
高通量测序技术的普及带来测序数据的高速增加，但分析工具的发展却远远跟不上研究的需要。目前大多数高通量测序数据分析工具的用户对象是具备一定数据分析能力的研究人员，大量的数据分析任务仍然落在少数生物信息实验室上，严重阻碍了整个研究领域的发展。功能更强大、使用更方便的生物信息分析工具亟待开发
辨识中药真假可用DNA条形码
对于黑白纹条形码，习惯于逛超市购物的人们并不陌生。如今，致力中药研究的科研人员研发出了DNA条形码，并将这一技术用于中药假药的快速简便识别。近日在天津市举办的中国科协第68期新观点、新学说学术沙龙上，中国中医科学院中药研究所所长陈士林教授介绍了这一新技术。 “从分子遗传学角度来看，物种表现
昆明动物所开发出适用于高通量异质性数据算法
挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而，肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题，而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感，容易产生假阴性结果。针对此，中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法
图像处理和函数型数据分析的高通量表型方法分析
高通量表型是植物学研究领域中的新兴技术。许多自动化表型系统已在温室和田间场景中得到了应用以研究植物的特征。其中最主要的创新之一是使用自动化图像采集设备来获取植物的原始图像：在设定的时间点为大量的植物记录多种类型（包括RGB、红外、荧光和高光谱等）的高分辨率图像。从图像中我们可以处理和提取有用的表型特
食品条形码“8”开头无关转基因
关于转基因食品的安全性争论还未停止，日前一条关于食品条形码以"8"开头即为转基因食品的微博引起不少人的重视，声称条形码以"8"开头的即为转基因食品。该微博同时认为，肿瘤的大面积爆发也与转基因食品有关。对此，记者向有关专家求证，条形码为"8"开头与转基因食品之间并无必然联系，国内所实行的编码标准也
高通量测序
高通量测序技术又称“下一代”测序技术，以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。高通量测序包括：大规模平行签名测序、聚合酶克隆、454焦磷酸测序、离子半导体测序和DNA 纳米球测序等技术。 高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变，一次对几十万到几百万条DN
商业条形码检测仪常用款型
CCD扫描器，激光手持式扫描器和全角度激光扫描器二种。 一、HHP QC条形码检测仪是利用光电藕合(HHP)原理，对条形码印刷图案进行成像，然后再译码。它的优势是：无转轴，马达，使用寿命长；价格便宜。HHP因战略原因，从2012年停产全线所有检测仪相关产品，专注于条码扫描枪的业务。 选择C
条形码8字开头是转基因食品？
近日，一篇“8开头的条形码是转基因食品”的帖子又在网上流转开来。信息时报记者多方求证了解到，该说法并不准确，条形码开头数字代表的是区域而非产品，而目前国内对于商品条形码并没有强制标准。此外，转基因食品必须在外包装文字说明，消费者通过外包装便可以辨别商品是否转基因。 “8”字开头不特指产品只代
实验室型高通量植物表型平台简介
实验室型高通量植物表型平台可以全自动、高通量对大量小植株进行成像的系统，可以选择配置可见光（VIS）成像、近红外（NIR）成像、红外（IR）成像、荧光成像或激光扫描3D成像（只适合高度15 cm以下的小植株）中的一种或多种。成像系统带程控移动装置，可以在X轴和Y轴上进行移动，并配有射频或条形码读
测序黑马10X－Genomics正式发售GemCode平台
2015年7月3日，10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器，引起业界关注。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补，产生长片段信息（10-100 kb），实现结构变异和单体型等分析。GemC
北京大学汤富酬等团队发布单细胞测序技术最新研究成果
基于第三代测序（TGS）平台的单细胞RNA-seq技术的进步加速了生物学研究。自2016年以来，已经开发了几种基于TGS平台的单细胞RNA-seq方法。由于受到低准确度和灵敏度的限制，它们要么结合基于NGS平台的方法降低错误率，要么通过牺牲通量来提高检测率。 2023年1月11日，北京大学汤富
带您了解基因测序技术的发展
在生物多样性急剧减少和物种消失的时代，有时被称为“第六次大灭绝”或“全新世灭绝”，人们对开发有效的生物多样性研究和监测工具提出了很高的要求。迄今为止，世界各地的分类学家已经描述了超过170万个物种。然而，这只是地球上预计存在的数百万生物的一小部分。当试图使用传统的基于形态学的方法对所有物种进行分
研究人员提出大尺度生物多样性监测方法
近日，中国科学院昆明动物研究所Douglas Yu课题组在《自然—生态学与进化》杂志上发表文章对实现大尺度生物多样性监测方法进行展望，为环境保护政策的制定提供了全面的科学依据。 大尺度实时生物多样性管理监测，对精细研究生物多样性格局动态和物种适应策略、预测生物兴衰和分布格局态势有重要意义。《中
岛津在ASMS推出新MALDITOF－MS软件包－简化成像数据分析
分析测试百科网讯 2018年6月4日，岛津科学仪器公司（SSI）宣布推出用于MALDI-8020台式系统的AuraSolution，SampleStation和QC Reporter软件包。这些MALDI-TOF质谱软件包便于自动分析。用于自动化的SampleStation和AuraSolut
高通量测序原理
高通量测序原理是将基因组 DNA 片断化，然后克隆到质粒载体上，再转化大肠杆菌。对于每个测序反应，挑出单克隆，并纯化质粒 DNA。高通量是相对于第一代测序的，第一代测序只能一次测1个样品的1段序列，产生的数据量相对来说很小，而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G，可以一次测很多的样本。高通量
高通量测序原理
高通量测序原理是将基因组 DNA 片断化，然后克隆到质粒载体上，再转化大肠杆菌。对于每个测序反应，挑出单克隆，并纯化质粒 DNA。高通量是相对于第一代测序的，第一代测序只能一次测1个样品的1段序列，产生的数据量相对来说很小，而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G，可以一次测很多的样本。高通量
高通量测序原理
高通量测序原理是将基因组 DNA 片断化，然后克隆到质粒载体上，再转化大肠杆菌。对于每个测序反应，挑出单克隆，并纯化质粒 DNA。高通量是相对于第一代测序的，第一代测序只能一次测1个样品的1段序列，产生的数据量相对来说很小，而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G，可以一次测很多的样本。高通量
高通量测序技术
没有测序的癌症诊断是不完整的，完整的癌症诊断应该包括一系列基于细胞遗传学技术、荧光原位杂交技术、标准分子技术以及NGS的预后与预测性分析。对于早期癌症患者来说，NGS序列分析在多种癌症的筛查技术中具有不容忽视的代表性;而对于晚期癌症患者，大量的侵入性测试往往只能筛查出少数几个药物靶点。 随
DNA“条形码”可快速定位体内纳米粒子
美国麻省理工学院、佐治亚理工学院和佛罗里达大学的科研团队找到一种新方法，以DNA（脱氧核糖核酸）序列作为“条形码”，能快速测出不同纳米粒子处于身体的哪个部位，有助于基因靶向疗法在体内的精确定位。相关论文发表在近期出版的美国《国家科学院学报》上。 科学家一直在寻求通过DNA或RNA（核糖核酸）递