图像处理和函数型数据分析的高通量表型方法分析
高通量表型是植物学研究领域中的新兴技术。许多自动化表型系统已在温室和田间场景中得到了应用以研究植物的特征。其中最主要的创新之一是使用自动化图像采集设备来获取植物的原始图像：在设定的时间点为大量的植物记录多种类型（包括RGB、红外、荧光和高光谱等）的高分辨率图像。从图像中我们可以处理和提取有用的表型特征，如植物的高度、宽度和大小。与传统方法相比，高通量表型系统能够以更高效、准确和无损的方式来提供研究者感兴趣的植物特征。为了提取植物性状，需要对植株的某个部分或整个植株进行分割。阈值分割是最简单、最常用的图像分割方法，它通过像素强度的临界值将图像分类为前景和背景。基于阈值分割方法，一些用于高通量植物表型分析的平台已被开发，包括HTPheno、Image Harvest和PlantCV等。上述软件采用了公认的步骤来处理植物图像并提取表型特征。然而这些平台仅专注于图像处理，对植物生长过程的统计建模和推断方面的功能有所欠缺。K均值聚......阅读全文
图像处理和函数型数据分析的高通量表型方法分析
高通量表型是植物学研究领域中的新兴技术。许多自动化表型系统已在温室和田间场景中得到了应用以研究植物的特征。其中最主要的创新之一是使用自动化图像采集设备来获取植物的原始图像：在设定的时间点为大量的植物记录多种类型（包括RGB、红外、荧光和高光谱等）的高分辨率图像。从图像中我们可以处理和提取有用的表型特
温室型高通量植物表型平台概述
温室型高通量植物表型平台可以全自动、高通量对大量植株（从幼苗到成熟植株即可）进行成像的系统，可以选择配置可见光（VIS）成像、近红外（NIR）成像、红外（IR）成像、荧光成像、根系近红外成像、高光谱成像中的一种或多种，每个成像模块包括顶部和侧面两个摄像头，结合样品旋转装置，就可以对植株进行3D形
分析数据的处理
一. 有效数字及其运算规则 1. 有效数字的意义和位数 （1）有效数字：所有准确数字和一位可疑数字（实际能测到的数字） （2）有效位数及数据中的“ 0 ” 1.0005， 五位有效数字 0.5000， 31.05% 四位有效数字 0.0540， 1.86
高通量测序数据分析
1. 是不是一定要用大型计算机? 除了序列拼接组装以外，其它分析不是一定要大型计算机，在普通的PC上也可以进行一些处理，当然，买一台或几台高性能的工作站电脑，能显著加快数据处理的速度。 2. 是不是一定要用Linux系统? 也不一定非用Linux不可，在Window下可以完成部分数据处理。
甘薯块根高通量NIRS表型分析研究获进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510451.shtm
大规模函数型数据分析存储空间与计算效率问题取得进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/507164.shtm在大数据时代下，随着互联网、云存储等技术的高速发展，实际分析处理中遇到的数据规模越来越大。尽管大规模函数型数据可以给我们带来海量信息，但是其对计算资源有着更高的需求，所需的计算时间更长
实验室型高通量植物表型平台简介
实验室型高通量植物表型平台可以全自动、高通量对大量小植株进行成像的系统，可以选择配置可见光（VIS）成像、近红外（NIR）成像、红外（IR）成像、荧光成像或激光扫描3D成像（只适合高度15 cm以下的小植株）中的一种或多种。成像系统带程控移动装置，可以在X轴和Y轴上进行移动，并配有射频或条形码读
分析数据的处理——分析数据的显著性检验
1. 平均值（）与标准值（m）之间的显著性检验 —— 检查方法的准确度 (20)若 t计 ³ t0.95, n 则 与 m 有显著性差异（方法不可靠） t计 < t0.95, n 则 与 m 无显著性差异（方法可靠）2. 两组平
分析数据的处理——可疑数据的取舍
1. Q-检验法 （3~10次测定适用，且只有一个可疑数据） （1） 将各数据从小到大排列：x1, x2, x3……xn ; （2）计算 （x大-x小）, 即 （xn -x1）; （3）计算 ( x可-x邻), （4）计算舍弃商 Q 计 =ô x可-x邻ô/ xn -x1
高通量表型分析平台可视化评估大麦病害程度
背景表型是新植物栽培品种发展的瓶颈，该研究引入了一种新的高光谱表型分析系统，此系统将冠层测量的高通量与高空间分辨率和可控测量环境的优势相结合。此外，测量的大麦生长在大容器（称为Mini-Plots）中，这使得植物能够在温室实验中形成田间表型，从而不受容器尺寸的影响。结果在接种白粉病后30天，通过Sp
全自动凝胶成像分析系统可对哪些图像进行分析处理？
全自动凝胶成像分析系统可用于DNA/RNA凝胶、蛋白质凝胶、放射自显影胶片、酶标板、薄层层析板等图像的成像及分析处理，能对条
全自动凝胶成像分析系统可对哪些图像进行分析处理
全自动凝胶成像分析系统可用于DNA/RNA凝胶、蛋白质凝胶、放射自显影胶片、酶标板、薄层层析板等图像的成像及分析处理，能对条带、斑点及、其他任何目标区域进行精确地总量分析、分子量分析，聚类分析、同源性分析等。
冲击试验机数据分析和处理能力
材质的好坏、设计的合理度，都会影响夹持效果及松卸时的难易度。测控系统显然太重要了。选择市场上稳定性强的、经受住时间检验的好产品就行。关于卧式冲击试验机与立式冲击试验机的问题，毋庸置疑，卧式冲击试验机为立式冲击试验机的升级替代品。无论从操作的简易程度还是整机的安全性能方面，卧式冲击试验机都要优于
免疫表型的分析程序
细胞表面抗原检测的染色方案 细胞胞质内及细胞核内抗原检测的染色方案 实验材料 单克隆抗体 抗凝血
免疫表型的分析程序
细胞表面抗原检测的染色方案 细胞胞质内及细胞核内抗原检测的染色方案 实验材料 单克隆抗体 抗凝血
免疫表型的分析程序
实验材料 单克隆抗体抗凝血试剂、试剂盒 溶血素PBS实验步骤 1. 取 20 单克隆抗体与 100 μl 抗凝血，共同混合置室温 20 min。2. 加溶血素 1500 μI，置室温避光 15 min，2500 r/min 离心 5 min。3. 弃上清，加 1500 μI PBS，混匀，2500
分析检验中的数据处理
在分析检验实验中，除了实验过程我们需要严谨细心外，zui后的数据处理也特别重要，在数据处理时，应该注意通用的几条数据处理规则：（1）记录测量仪器测量的数据时，其有效数字的位数应和测量仪器的分度值相适应。一般讲是以其zui小分度值的十分之一为测量仪器检测数据的有效数字的zui后一位。如果有明确规
质谱仪数据处理的分析离子流累积测量数据的处理
离子流累积测量数据的处理质谱测量中，将需要测量的质量峰按顺序采集一遍称为一个循环或称一个扫描（scan），几个循环划成一组，取一组数据（平均值与标准偏差），多组数据进行统计计算后得到最终结果（平均值与标准偏差）。平均值和标准偏差的计算公式为：离子流累积测量要求在测量的间隙同时测量本底数据，用累积数据
质谱仪质谱仪数据处理的分析离子流测量数据的处理
离子流累积测量数据的处理质谱测量中，将需要测量的质量峰按顺序采集一遍称为一个循环或称一个扫描（scan），几个循环划成一组，取一组数据（平均值与标准偏差），多组数据进行统计计算后得到最终结果（平均值与标准偏差）。平均值和标准偏差的计算公式为：离子流累积测量要求在测量的间隙同时测量本底数据，用累积数据
质谱仪质谱仪数据处理的分析扫描质谱数据的处理
对于逐点扫描得到的一段质谱数据，数据处理的首要任务是峰位置的判别。其实质是峰数据与既有模型的匹配过程，这与质谱仪的特性、扫描参数以及数据的统计信息等多种因素有关系。简单情况下，连续几个数据都大于设定的阈值（如最大值5％）即可认为该段数据是峰数据，而剩余的数据可认为是本底。在峰位置判别的基础上，根据本
高通量植物表型平台简介
高通量植物表型平台是植物表型组学、植物功能基因组学、现代遗传育种研究的强大工具。利用高通量植物表型平台可以快速获取大量植株的各种信息。现代农业育种的一个主要方向就是性状改良，获得更大的果实/种子，更高的含油量（油料作物），更发达的根系等等。通过高通量植物表型平台可以快速获取大量植物表型信息。
高通量研究脊椎动物多维表型的方法（一）
Nature Communications 4, February 12, 2013, Article number:1467, doi:10.1038/ncomms2475 Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Jaime Medina, Peter M. Eimo
高通量研究脊椎动物多维表型的方法（二）
3.颅面畸形三维重建与评估：每条斑马鱼幼体，记录高达320帧的图像，通过三维重构技术，形象化展示了斑马鱼幼体软骨复杂表型。图像显示的层析效果图充分显示了三种不同药物处理后的5dpf斑马鱼幼体的颅面骨骼变化。三种药物是：retinoic acid（视黄酸）、cyclopamine（环巴胺）和flu
植物冠层图像分析仪的测试原理和方法
植物冠层图象分析仪采用了冠层孔隙率与冠层结构相关的原理。它是根据光线穿过介质减弱的比尔定律，在对植物冠层定义了一系列假设前提的条件下，采用半理论半经验的公式，通过冠层孔隙率的测定，计算出冠层结构参数。这是目前世界上各种冠层仪一致采用的原理。在上述原理下，植物冠层图象分析仪采用的是对冠层下天穹半球
模式生物高通量多维表型研究方法概述（二）
3.颅面畸形三维重建与评估：每条斑马鱼幼体，记录高达320帧的图像，通过三维重构技术，形象化展示了斑马鱼幼体软骨复杂表型。图像显示的层析效果图充分显示了三种不同药物处理后的5dpf斑马鱼幼体的颅面骨骼变化。三种药物是：retinoic acid（视黄酸）、cyclopamine（环巴胺）和flu
高通量元素定量方法揭示健康人群元素表型
元素是生命体的基本组成成分，具有重要的生物学功能。元素组学通常关注元素组及其对外源性或内源性刺激的动态响应，以此来探究元素的功能。基于大型人群队列的多元素研究可以有效地揭示元素稳态失衡和人体病理状态间的密切关系，但生物样品数量大、可用体积小的特点对多元素定量方法提出了更高的要求。复旦大学人类表型组研
模式生物高通量多维表型研究方法概述（一）
摘要：动物个体内，多数由基因突变与生物活性分子所引发的复杂生理应答机制，无法使用细胞培养模型进行预测，而动物水平研究却进展缓慢。本研究中，我们利用微米分辨率的高通量光学投影层析成像系统，结合高效的大颗粒流式分选系统（Union Biometrica），实现了脊椎动物的整体多维度扫描。系统以前
采集和图像处理技术
每一个通道的 offset 和 gain 都应该单独调节（设置背景为 0，饱和为 4095），以便每一个荧光团都显示在完整的 12 位范围里。然后，对每个图像进行单独处理。尽管这是采集和显示多色图像的一个很方便的方法，但样品中两个信号的实际相对强度没法测定，因为每个信号的采集都是为了满足整个 12
植物表型研究文章TOP10（三）
TOP 4● 高通量表型和全基因组关联分析：研究揭示水稻的自然遗传变异(Nat Commun,2014)通过使用高通量测序技术对植物基因组学的研究迅速发展，传统的植物表型测试已远远落后。此文的作者开发了一个高通量水稻表型测定设施（HRPF），用于监测水稻生育期的13个传统农艺性状和2个新定义的性状。
EDXRF方法分析不锈钢的谱数据处理方法研究
本文选题于国家“863”计划项目“高精度手提式X荧光仪研发”（项目编号：2012AA06180301）。以定量分析不锈钢成分为研究目的，以能量色散X射线荧光分析法作为手段，运用多种数学方法使得谱数据准确、可信，以提高不锈钢中各元素的分析精度。不锈钢是一种性能优异，具有广泛用途的钢种，其产量也标志着一