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蛋白质是怎样“梳妆打扮”的

9月23日,美国伯克利大学教授迈克尔·瑞普(Michael Rape)在《自然》杂志上在线发表了一篇论文,谈到了泛素化修饰依赖的蛋白质翻译的调节决定了细胞的命运。 许多人都知道,细胞内的各种生理生化过程,主要是由蛋白质来负责完成的。一个小小的细胞之内可以含有上百万个蛋白质分子,而蛋白质分子是由核糖体负责翻译合成的。 不过,这些蛋白质大分子在合成之后往往还要经历翻译后的修饰,蛋白质的修饰有着重要的生物学意义。泛素化修饰就是蛋白质翻译后修饰的一种。换句话说,一些“小伙伴”要把蛋白质“梳妆打扮”一番之后,再送它出去“执行任务”。蛋白的翻译后修饰有许多种类,它的“小伙伴”包括磷酸基团、泛素分子、乙酰基、甲基、糖苷链等等,不同的修饰发生在不同的氨基酸残基上。比如,磷酸化修饰可以发生在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸残基上;泛素化和乙酰化主要发生在赖氨酸残基上;而甲基化则可以发生在精氨酸和赖氨酸残基上;糖基化修饰有两类,发生在丝氨酸和苏氨酸上......阅读全文

中国医学科学院蛋白质组学大会报告集锦

  组蛋白翻译后修饰研究进展   中国科学院生物物理所的杨福全研究员在研讨会上做了题为《组蛋白翻译后修饰研究进展》的精彩报告。  中国科学院生物物理所 杨福全 研究员 杨研究员从以下几个方面,就近年来组蛋白翻译后修饰的研究进展做了综述。染色体和染色质   

清华大学3月连续发文 破译“组蛋白密码”识别新机制

          清华大学医学院基础医学系和结构生物学中心李海涛课题组日前在国际权威学术期刊《自然》(Nature, 2014年3月2日)和《基因与发育》(Genes & Dev,2014年3月3日)在线发表两篇论文

【盘点】定量蛋白组学将在未来10年飞速发展

  人类基因组计划的成功实施,我们已初步掌握了自身的遗传信息。但阐明人类基因组整体功能的功能基因组学仍任重而道远。蛋白质作为生命活动的"执行者",自然成为生命科学研究的新"宠儿"。几乎在所有生命科学领域内,科学研究工作者都需要对细胞、组织或完整生物体的蛋白进行定性描述或定量检测。对一种细胞、组织或完

2010全国质谱大会大会报告(二)

美国北卡大学Chaple Hill医学院 Chen, Xian(陈先)教授  来自美国北卡大学Chaple Hill医学院的 Chen, Xian(陈先)教授,做了题为“Systems Dissection of Signal Transduction by Using Quantitative P

用ETD线性离子阱质谱成功鉴定蛋白和翻译后修饰

 在翻译后修饰和/或极碱肽的序列分析方面,电子转移裂解( ETD )线性离子阱质谱是很有优势的工具。传统的诱导活化裂解(CAD)常用来鉴定蛋白,并试图确定和找到他们修饰的位点,但这种技术有其本身固有的缺点,下面将详细叙述。与线性离子阱的结合使用的ETD是蛋白质组学研究的一个可靠的技术,

用ETD线性离子阱质谱成功鉴定蛋白和翻译后修饰

By Andreas Huhmer, Director of Proteomics Marketing, Thermo Fisher Scientific       在翻译后修饰和/或极碱肽的序列分析方面,电子转移裂解( ETD )线性离子阱质谱

用ETD线性离子阱质谱成功鉴定蛋白和翻译后修饰

    在翻译后修饰和/或极碱肽的序列分析方面,电子转移裂解( ETD )线性离子阱质谱是很有优势的工具。传统的诱导活化裂解(CAD)常用来鉴定蛋白,并试图确定和找到他们修饰的位点,但这种技术有其本身固有的缺点,下面将详细叙述。与线性离子阱的结合使用的ETD是蛋白质组学研究的一个

环渤海色质谱学者精彩报告纷呈 贯彻“绿色化学”理念

  分析测试百科网讯 2016年8月11日,由辽宁省分析测试协会,辽宁省分析科学研究院主办的“第四届环渤海色质谱学术报告会暨辽宁省第十届学术年会分会”在丹东召开(相关报道:第四届环渤海色谱质谱学术会在丹东开幕 首次发布徽标)。大会上,众位环渤海的

Cell Metabolism:代谢性疾病生化机理并发现新的潜在药物靶标

  蛋白翻译后修饰是细胞生命活动的基本形式之一,也是细胞精细调控其诸多生理过程关键生物学通路之一,并与很多疾病的发生发展休戚相关。因此,负责蛋白翻译后修饰的调控酶成为当今新药研究领域的前沿和热点靶标。以其中蛋白激酶为例,近十年来在美国年销售额超过十亿美元的抗肿瘤药超过一半是靶向此类蛋白翻译后修饰调控

组蛋白研究进展速览!

  本文中,小编盘点了多篇研究报告,共同解析科学家们在组蛋白研究上取得的新成就,与大家一起学习!图片来源:Daniel N. Weinberg et al,doi:10.1038/s41586-019-1534-3  【1】Nature:揭示组蛋白标记H3K36me2招募DNMT3A并影响基因间DN

蛋白质组学实用分析技术一览

分析其实也属于技术的一部分,且在蛋白质组学研究中显得尤为重要,因为蛋白质组学研究提供的数据是生物学上最庞大的,而且蛋白质组比基因组具有更大的复杂性,因此蛋白质组信息学更有挑战性。今天小编先抛砖引玉地介绍几个常用的分析方法和软件。蛋白质定性分析蛋白质定性分析通常是指利用质谱法进行蛋白质鉴定和序列分析。

国自然冲刺蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点

  每年三月初,都是科研界的“高考”倒计时,因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况,蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明,磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目,总研究资助金额超过2亿。   继上周的肠道微生物研究方案解析后(国自然冲

表观遗传学修饰

组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节,这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因

环渤海第一届曁天津市第十九届色谱学术大会报告

基于液相色谱质谱技术鉴定蛋白质翻译后修饰的研究进展南开大学化学学院 张锴 教授  南开大学化学学院张锴教授作了题为《基于液相色谱质谱技术鉴定蛋白质翻译后修饰的研究进展》的报告,主要介绍了蛋白质翻译后修饰的富集技术,蛋白质修饰在生理过程中的动态变化检测和定量分析,蛋白质修饰的在细胞中的相互作用和网络关

清华教授发文:首次揭示组蛋白巴豆酰化特异识别机制

  生物通报道:组蛋白翻译后修饰是一类重要的表观遗传调控事件,被认为构成一类“组蛋白密码”,控制着染色质层面的遗传信息解读,在基因表达以及细胞命运决定等生命过程中发挥着关键作用。  来自清华大学医学院李海涛研究团队近期在组蛋白翻译后修饰研究领域取得了重要突破:他们通过对表观调控因子AF9和YEATS

上海药物所阐明代谢性疾病生化机理并发现潜在药物靶标

  蛋白翻译后修饰是细胞生命活动的基本形式之一,也是细胞精细调控其诸多生理过程关键生物学通路之一,并与很多疾病的发生发展休戚相关。因此,负责蛋白翻译后修饰的调控酶成为当今新药研究领域的前沿和热点靶标。以其中蛋白激酶为例,近十年来在美国年销售额超过十亿美元的抗肿瘤药超过一半是靶向此类蛋白翻译

看得见的蛋白互作新技术Duolink PLA

  现今,科技发展的齿轮正在高速运转,每隔2-3年就会出现一个重大的技术变革引领生命科学走向更精细、更微观、更真实的水平,这其中也包括蛋白的研究。在疾病的致病机理、分子机制、信号通路、药物筛选以及新型诊断标志物的发现中,传统的蛋白研究“金标准”方法如Co-IP、Western blot、ELISA、

Science:梳理患儿肿瘤细胞的基因组寻求答案

  组蛋白翻译后修饰方式出现异常,以及组蛋白修饰位置出现异常都会导致肿瘤发生。   高通量DNA测序技术的快速扩张让我们能够以前所未有的速度和精细度对人体疾病展开遗传学分析,尤其是对罕见的小儿疾病进行全基因组测序(whole-genome sequencing)更是有助于我们对儿童发育,以及多

见所未见:OptiMS拓展您的质谱潜能

鉴定翻译后修饰的位点  奥地利Innsbruck医学院生物中心临床生物化学部的Bettina Sarg博士  题目:Application of CESI-MS for the Analysis of Site-specific Protein Modifications   Betti

生物反应器的应用

应用1.改良乳汁品质;2.生产药用蛋白。3.外源基因在动物体内的位点整合问题;4.乳蛋白基因表达组织特异性问题;5.目的蛋白的翻译后修饰问题;6.转基因表达产物的分离和纯化问题;7.转基因的技术与方法问题;8.伦理道德问题。膀胱生物反应器膀胱反应器有着和乳腺反应器一样的优点:收集产物蛋白比较容易,不

蛋白质组学技术对营养胁迫中泛素化修饰变化情况的分析

  吃货们,为了健康,少吃点吧!   小编知道一名资深的吃货,无论什么都阻挡不了美食的诱惑。但我忍不住要阻止:“吃货们!为了健康,少吃点吧!”   为什么要让热爱美食的你们做出如此痛苦的选择呢?看看下面这篇文献解读你就知道了。   Cell Death and Disease IF=5.96

蛋白质组学技术对营养胁迫中泛素化修饰变化情况分析与

  吃货们,为了健康,少吃点吧!   小编知道一名资深的吃货,无论什么都阻挡不了美食的诱惑。但我忍不住要阻止:“吃货们!为了健康,少吃点吧!”   为什么要让热爱美食的你们做出如此痛苦的选择呢?看看下面这篇文献解读你就知道了。   Cell Death and Disease IF=5.96

通过蛋白质组学技术对营养胁迫中泛素化修饰变化情况...

通过蛋白质组学技术对营养胁迫中泛素化修饰变化情况的分析与解读Cell Death and Disease IF=5.965Liver ubiquitome uncovers nutrient-stress-mediated trafficking and secretion of complemen

宋保亮、仇文卫等发现胆固醇共价修饰新蛋白

  日前,由武汉大学宋保亮教授和华东师范大学仇文卫副教授为共同通讯作者的最新研究成果在线发表于《分子细胞》。这是继第一个胆固醇修饰蛋白hedgehog发现后,时隔20年发现的又一共价修饰蛋白,颠覆了长久以来认为hedgehog是唯一被胆固醇修饰蛋白的认识,并发现胆固醇除了导致心脑血管疾病外,还在发育

科学家破译“组蛋白密码”识别新机制

  记者日前从中科院上海应用物理研究所获悉,清华大学医学院基础医学系和结构生物学中心李海涛课题组利用上海光源生物大分子晶体学线站,从结构生物学角度解析组蛋白甲基化修饰识别新机制,进一步揭开了错综复杂的表观遗传调控的神秘面纱。相关成果近期分别在线发表于《自然》和《基因与发育》杂志。   据了解,真核

中科大吴缅教授最新文章:p53磷酸化修饰

  p53 蛋白被认为是迄今为止最著名的肿瘤抑制因子之一, 在肿瘤发生发展过程中发挥复杂而重要的调控作用. 在正常生理情况下, 细胞内的p53 维持在很低的水平, 当细胞受到多种刺激后, p53被翻译后修饰, 蛋白因稳定而活性被激活, 参与细胞周期阻滞、细胞凋亡、细胞衰老、细胞代谢等生命活动过程.

ETD:将成为蛋白质组学研究的标准方法

——访赛默飞ETD技术发明人John E.P. Syka 博士  【导语】质谱已经成为开展蛋白质组学研究的基础平台,更确切地说,具有MS/MS功能的质谱已成为蛋白质组学研究的基础平台。过去,CID/CAD技术是实现MS/MS功能的唯一手段,在蛋白质鉴定的自下而

上海药物所合作研究发现一种新组蛋白表观遗传修饰

  美国芝加哥大学Ben May癌症研究所赵英明教授实验室联合中科院上海药物研究所、美国加州大学圣地亚哥分校、法国Joseph Fourier大学等单位研究人员合作完成的关于组蛋白翻译后修饰系统研究的论文于9月18日在《细胞》杂志上在线发表。这也是上海药物所与赵英明教授合作的化学蛋白质组学研究中

染色质免疫沉淀法(Chromatin immunoprecitation,ChIP)

染色质免疫沉淀法(Chromatin immunoprecitation,ChIP)是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况,还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。核小体组蛋白可以发生多种翻译后的共价修饰,如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化等,这些

泛素样蛋白的来源及功能

真核生物蛋白可以通过与各种小分子物质或蛋白质相结合的方式被修饰。在众多的修饰方式当中有一种就是与泛素蛋白或泛素样蛋白(UBL)相结合,采用这种抗原肽修饰方法可以对多种生理过程进行调控。UBL蛋白可以控制被修饰蛋白与其它生物大分子(比如蛋白酶体或染色质)间的相互作用。各种UBL系统都会使用相应的酶来催