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清华大学3月连续发文破译“组蛋白密码”识别新机制

清华大学医学院基础医学系和结构生物学中心李海涛课题组日前在国际权威学术期刊《自然》(Nature, 2014年3月2日)和《基因与发育》(Genes & Dev,2014年3月3日)在线发表两篇论文,从结构生物学角度解析组蛋白甲基化修饰识别新机制,进一步揭开错综复杂的表观遗传调控(epigenetic regulation)的神秘面纱。 何谓组蛋白密码? 组蛋白在翻译后的修饰中会发生改变,从而提供一种识别的标志,为其它蛋白与DNA的结合产生协同或拮抗效应,它是一种动态转录调控成分,称为组蛋白密码(Histone code)。 组蛋白修饰类型 真核生物基因表达调控不仅依赖于特定的DNA 序列元件,而且还受到特定组蛋白翻译后修饰的精密调节。目前鉴定出的组蛋白修饰化学类型已超过25种,包括甲基化,酰......阅读全文

清华教授发文:首次揭示组蛋白巴豆酰化特异识别机制

  生物通报道:组蛋白翻译后修饰是一类重要的表观遗传调控事件,被认为构成一类“组蛋白密码”,控制着染色质层面的遗传信息解读,在基因表达以及细胞命运决定等生命过程中发挥着关键作用。  来自清华大学医学院李海涛研究团队近期在组蛋白翻译后修饰研究领域取得了重要突破:他们通过对表观调控因子AF9和YEATS

蛋白质修饰研究现状与未来

  蛋白质的修饰与降解,和生命活动以及各种人类疾病密切相关,这一领域已成为全球生物医学界关注的焦点。蛋白质的糖基化修饰、磷酸化修饰、乙酰化修饰、泛素化修饰、亚硝基化修饰等,是蛋白在生物代谢过程中的重要装备,对研究疾病具有重要意义。蛋白质的正确的修饰对于蛋白降解也非常重要,从而保证生命活动的正常循环。

张锴:组蛋白赖氨酸修饰的鉴定和定量研究

天津医科大学 张锴老师  2014年8月29日第三届环渤海色谱质谱学术报告会在天津市万源龙顺庄园农业博览馆顺利召开。大会邀请到多位色谱质谱届专家学者做了精彩的报告。来自天津医科大学的张锴老师带来了《组蛋白赖氨酸修饰的鉴定和定量研究》的报告。  在组蛋白赖氨酸修饰的生物学意义中张锴老师表示赖

科学家破译“组蛋白密码”识别新机制

  记者日前从中科院上海应用物理研究所获悉,清华大学医学院基础医学系和结构生物学中心李海涛课题组利用上海光源生物大分子晶体学线站,从结构生物学角度解析组蛋白甲基化修饰识别新机制,进一步揭开了错综复杂的表观遗传调控的神秘面纱。相关成果近期分别在线发表于《自然》和《基因与发育》杂志。   据了解,真核

研究揭示SHL蛋白对抑制和活性组蛋白修饰的识别机制

  6月21日,《自然-通讯》(Nature Communications)杂志在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所植物逆境生物学研究中心植物分子遗传国家重点实验室杜嘉木研究组和威斯康辛大学麦迪逊分校钟雪花研究组合作完成的题为Dual recognition of H3K4m

研究揭示SHL蛋白对抑制和活性组蛋白修饰的识别机制

  6月21日,《自然-通讯》(Nature Communications)杂志在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所植物逆境生物学研究中心植物分子遗传国家重点实验室杜嘉木研究组和威斯康辛大学麦迪逊分校钟雪花研究组合作完成的题为Dual recognition of H3K4m

清华Nature子刊发表表观遗传学新成果

  生物通报道:高等生物的基因组DNA围绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。通过“读取”模块识别组蛋白共价修饰是表观遗传学调控的一个主要机制。  最近人们发现了多种组蛋白赖氨酸酰化,比如巴豆酰化(Kcr)、丁酰化(Kbu

Cell Research:一类全新植物异染色质蛋白

  研究人员发现一类植物特有的新型组蛋白甲基化阅读器ADCP1,并确定其为动物HP1(Heterochromatin Protein 1,异染色质蛋白1)功能同源蛋白,揭示出其在植物异染色质维持和转座子元件沉默中的作用,彰显了不同生命界中表观机制的复杂性和保守性。  2018年11月13日,清华-北

朱冰研究组继Science后再发PNAS文章

  北京生命科学研究所朱冰实验室今年8月在Science杂志上发表了题为“Dense Chromatin Activates Polycomb Repressive Complex 2 to Regulate H3 Lysine 27 Methylation”的研究论文,发现组蛋白甲基化酶P

2015国家自然科学基金:表观遗传学什么是重点

  来自国家自然科学基金委员会的消息,8月18日国家自然科学基金委员会公布了2015年国家自然科学基金申请项目评审结果,其中面上项目16709项、重点项目624项、创新研究群体项目38项、优秀青年科学基金项目400项、青年科学基金项目16155项、地区科学基金项目2829项、海外及港澳学者合作研究基

蛋白质是怎样“梳妆打扮”的

  9月23日,美国伯克利大学教授迈克尔·瑞普(Michael Rape)在《自然》杂志上在线发表了一篇论文,谈到了泛素化修饰依赖的蛋白质翻译的调节决定了细胞的命运。  许多人都知道,细胞内的各种生理生化过程,主要是由蛋白质来负责完成的。一个小小的细胞之内可以含有上百万个蛋白质分子,而蛋白质分子是由

陈建军/杨建华/何川/黄刚 揭示RNA m6A由组蛋白修饰决定

  近年来,RNA表观遗传学的研究发现RNA甲基化修饰,特别是m6A甲基化修饰,在哺乳动物的转录组中广泛存在,并且在多种生理和病理过程中发挥着重要的生物学功能,引领了RNA以及表观遗传学领域的又一个热潮。高通量测序揭示在人和小鼠的转录组中有1/3-1/2的mRNA转录本具有m6A修饰【1,2】。理论

【盘点】定量蛋白组学将在未来10年飞速发展

  人类基因组计划的成功实施,我们已初步掌握了自身的遗传信息。但阐明人类基因组整体功能的功能基因组学仍任重而道远。蛋白质作为生命活动的"执行者",自然成为生命科学研究的新"宠儿"。几乎在所有生命科学领域内,科学研究工作者都需要对细胞、组织或完整生物体的蛋白进行定性描述或定量检测。对一种细胞、组织或完

NSMB背靠背丨黄志伟 揭示其抑制type V型Cas12a活性的新机制

  CRISPR-Cas适应性免疫系统为细菌和古细菌对抗噬菌体和质粒入侵提供了核酸序列特异性的防御机制【1】。CRISPR-Cas系统分为6个亚型,其中II型CRISPR-Cas9和V 型CRISPR-Cas12a(Cpf1)系统被广泛应用于基因组编辑和多种多样的生物技术应用【2,3】。在噬菌体感染

表观遗传修饰家族又添新成员 组蛋白丁酰化新功能诠释

  近年来,芝加哥大学赵英明教授课题组运用高分辨质谱技术发现了多种组蛋白密码,极大丰富了表观遗传修饰调控机制。在刚刚上线的国际知名期刊Molecular Cell上,该课题组又同时报道了三项最新研究成果。其中第一项研究首次发现了一种跟酮体代谢密切相关的表观遗传新修饰——组蛋白三羟基丁酰化[1];第二

巴豆酰辅酶A水合酶CDYL调控组蛋白巴豆酰化影响精子发生

  组蛋白修饰是表观遗传学研究的重要方向,其影响了基因的表达调控,和众多生理、病理过程有密切的联系。除了研究较充分的组蛋白乙酰化、甲基化外,景杰生物的科学顾问,芝加哥大学赵英明教授课题组近年来鉴定了八种新型修饰,极大地增加人们对组蛋白修饰的认识,开辟了表观遗传调控的新领域。之后的一系列后续研究表明,

表观遗传学修饰对轴突再生调控作用的研究进展

  轴突是神经冲动传递过程中结构与功能的基本单位。无论在中枢抑或是周围神经系统损伤后,诱导有效的轴突再生过程是改善神经功能的基础。现已证实,脊髓损伤后轴突能否再生不仅取决于其固有的生长能力,还取决于轴突所处的环境。神经系统损伤后,神经细胞对轴突再生相关基因的表达动员能力及细胞骨架原料的形成能力是决定

生物物理所等在组蛋白甲基化修饰识别方面取得新进展

  10月17日,《美国国家科学院院刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences)在线发表了生物大分子国家重点实验室许瑞明、饶子和课题组和北京生命科学研究所(NIBS)朱冰课题组合作的最新研究成果Distinct mode of

李海涛教授携手华人科学家发表表观遗传重要成果

  来自德克萨斯大学MD安德森癌症中心、清华大学生命科学学院的研究人员在新研究中证实了,ZMYND11是组蛋白变异体H3.3特异性的H3K36me3“阅读器”蛋白,其将组蛋白变体介导的转录延伸控制与肿瘤抑制关联起来。这一重要研究发现在线发表在3月2日的《自然》(Nature)杂志上。   清华大学

石晓冰:CRISPR发现与癌症有关的蛋白“阅读器”

  近二十年来,科学家开始逐渐认识到DNA中的遗传密码只代表了生命蓝图中的一部分信息。遗传信息还来自于DNA结构上的特殊化学标签模式,这些表观遗传学标签决定了DNA包装的紧密程度以及特定基因的开关。  2014年,石晓冰研究组与清华大学李海涛教授研究组合作发现了一类新型组蛋白乙酰化修饰“阅读器”:Y

石晓冰Nature:CRISPR发现与癌症有关的蛋白“阅读器”

  生物通报道:我们经常需要使用员工证来出入工作场所,而在细胞中一种称为ENL的蛋白质也是采用同样的方式为治疗急性髓性白血病(AML)带来了新的希望。AML是一种侵袭性血癌,涉及所有年龄段的人们,是第二类最常见的白血病类型。  来自德州大学MD安德森癌症中心的一项研究发现了ENL在白血病进程中的重要

遗传发育所合作研究发现植物免疫新机制

  植物通过细胞表面免疫受体识别来自于病原微生物的分子,激活天然免疫;而病原微生物通过向植物细胞分泌效应蛋白,这些蛋白往往通过翻译后修饰宿主蛋白,抑制天然免疫反应;植物通过进化,利用动植物中保守的、定位于胞质的NLR类型的免疫受体识别效应蛋白,重新激活免疫反应。研究胞内免疫受体识别病原微生物效应蛋白

Immunity:重大进展!利用新型CAR-T免疫疗法治疗实体瘤

  嵌合抗原受体(chimeric antigen receptors, CAR)T细胞(CAR-T)是对病人自己的T细胞经过基因修饰而构建出的,在治疗血癌上取得成功,但是利用CAR-T治疗实体瘤并不那么成功,这是因为正常组织含有CAR-T靶向的蛋白,因而,CAR-T不仅攻击肿瘤,也会攻击正常组织。

《科学》发表同济大学高亚威团队联合研究成果

  摘要:1月17日,同济大学生命科学与技术学院、附属东方医院高亚威教授联合美国芝加哥大学教授何川、中科院北京基因组研究所研究员韩大力合作完成的研究成果“N6-methyladenosine of chromosome-associated regulatory RNA regulates chro

魏文胜:基因组编辑平台技术及未来产业运用发展趋势

  “基因组编辑未来产业运用发展是如今的热点,利用这个技术,不管做动植物转化改造还是医药领域应用,可以做的事情非常多,但是具体怎么落地?我跟大家一样,有的时候会觉得无从下手,所以今天我会更多从技术层面给大家做一个简单的介绍。”  △魏文胜 北京大学生命科学学院教授  以下是正文:  各位下午好!谢谢

清华大学、德克萨斯大学Cell联合发布表观遗传重要发现

  谈到配送,就连联邦快递(Federal Express®)和UPS快递(UPS®)也无法与人体相比。在癌症生物学中存在着一个令人惊叹的包装和传送系统,其影响了人体是否将会形成癌症。  组蛋白,这一染色质的主要组成元件是一个让人感兴趣的领域。人们认为染色质畸变可导致与癌症相关的DNA损伤。来自清华

施晓冰博士Cell发布表观遗传重要发现

  谈到配送,就连联邦快递(Federal Express®)和UPS快递(UPS®)也无法与人体相比。在癌症生物学中存在着一个令人惊叹的包装和传送系统,其影响了人体是否将会形成癌症。  组蛋白,这一染色质的主要组成元件是一个让人感兴趣的领域。人们认为染色质畸变可导致与癌症相关的DNA损伤。来自德克

RNA甲基化研究深度剖析

  一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?   1、高分文章频现   说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。

2018国自然研究热点二: RNA甲基化研究深度剖析

  一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?   1、高分文章频现   说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。   图:

Molecular Cell | 邵峰团队揭示新型糖基化修饰的催化机理

  糖基化修饰是自然界最重要的蛋白质翻译后修饰之一。根据糖基修饰与蛋白质的连接方式和修饰位点的不同,以及糖基是单糖或寡糖的不同,主要可分为如下几类:  2013年来自中国和澳大利亚的两个研究小组,在Nature发表文章,报道来自细菌的三型分泌系统效应蛋白NleB可以对死亡受体复合物中的接头蛋白TRA