NatureMethods：单细胞RNAseq方法的比较
随着大家对单细胞转录组分析的兴趣日益增加，开展单细胞RNA-seq的方法也在不断涌现。近日，斯坦福大学的研究人员比较了市场上各种单细胞RNA扩增方法，以系统评估单细胞RNA-seq方法的灵敏度和准确性。他们的研究结果发表在《Nature Methods》在线版上。 目前，整个转录组的高通量测序(RNA-seq)已广泛用于各种组织的基因表达分析。然而，人们开展单细胞转录组分析的愿望也越来越强烈，这是因为有些细胞量少珍贵，不足以开展传统的RNA-seq，也有人希望对异质群体中的细胞亚群开展分析。过去的基因表达“平均值”已不再能满足人们的需求。 近年来，开展单细胞RNA-seq的各种方法时有报道，但关于这些方法的通量和性能还存在一些问题。比如说，性能主要是通过灵敏度和精确性来评估的。然而，为了评估测定方法的有效性，还应当评估准确性，即测量值与真实值之间有多接近。 为此，斯坦福大学生物工程系的Stephen R......阅读全文
充满差异的单细胞蛋白表达
哈佛大学谢晓亮小组的最新研究结构显示，蛋白的数量（绿色）与mRNA的数量（红色）在各个细胞中有很大差异。 科学家们近日首次实现了对物种在整个表达谱范围内的蛋白表达噪声测量。该项成果是单分子技术与系统生物学交互融合的典范，预示了单细胞基因表达分析时代的来临。 在基因表达研究领域，传
Science：新型单细胞基因表达检测技术
发表在最新一期《科学》(Science)杂志上的一篇研究论文，证实了一种新型的大规模平行测序技术可借助于新一代测序(NGS)在单细胞水平上检测基因表达。 论文作者、来自Cellular Research, Inc公司的Christina Fan博士、Glenn Fu博士以及Stephen Fo
单细胞悬液制备方法介绍
01取样→预处理 取样是原代单细胞悬液制备非常重要的一步，其质量会直接影响到后续处理效果。 操作时，首先根据不同实验需求麻醉或处死动物后进行消毒、固定并切开相应位置皮肤暴露目的组织。 其次操作过程中有以下几点也需要注意： 严格无菌操作，快速处理； 针对不同组织类型控制环境温度； 保证
Science：人脑单细胞基因表达地图诉说惊人发现
人类大脑被称为世上最复杂的物质，里面有860亿错综复杂的、相互连接的神经元和数量同样庞大的胶质细胞。 有史以来人们对这一神秘器官一直充满好奇：它能生产浪漫的爱情诗歌，也能生产严谨的科学公式。由最初小小的胚胎和一点干细胞出发，成熟的大脑从何而来？ 根据今天发表的《Science》，加州大学旧金
单细胞转录组制备仪的功能
fluidigm C1 单细胞自动制备仪用于 mRNA 测序 更完整的流程 -首尾相连的流程对单细胞进行全转录组分析 最高的通量 -每次运行可前所未有的平行处理 96 个单细胞 更容易的操作 -直接从单细胞开始，简化的样本制备，只需 3 小时手工操作时间，没有 片段化和纯化步骤 更节省的成
培养细胞单细胞悬液的制备
实验材料 胰蛋白酶 细胞 试剂、试剂盒 EDTA·2Na PBS
培养细胞单细胞悬液的制备
实验材料 胰蛋白酶 细胞 试剂、试剂盒 EDTA·2Na PBS
脱落细胞单细胞悬液的制备
食管拉网细胞的单细胞悬液的制备 尿液脱落细胞的单细胞悬液的制备 胸、腹水脱落细胞的制备 冲洗液细胞样品的制备 实验方法原理 在临
GentleMACS/单细胞悬液制备文献集锦
种属 处理组织 文章名称 human
脱落细胞单细胞悬液的制备
实验方法原理 在临床工作中，可以收集到大量自然脱落细胞，这些细胞标本经过简单处理，便可成为较好的单细胞悬液供流式细胞术分析。主要包括脱落细胞、胸腹水细胞、尿液、内镜刷检细胞等。实验材料 细胞试剂、试剂盒 PBS仪器、耗材 尼龙滤网实验步骤 1. 将食管拉网器上的细胞洗脱到 20 ml PBS 液中，
培养细胞单细胞悬液的制备
实验材料 胰蛋白酶细胞试剂、试剂盒 EDTA·2NaPBS仪器、耗材 离心管实验步骤 一、培养细胞的特征一般细胞培养分为悬浮培养和贴壁培养，由于细胞的增殖有可能形成大小不等的细胞团块或连接成片。如果两个或多个细胞粘连在一块或细胞碎片过多都将影响 FCM 结果，进而导致实验失败。所以，制备合格的培养细
脱落细胞单细胞悬液的制备
食管拉网细胞的单细胞悬液的制备 尿液脱落细胞的单细胞悬液的制备 胸、腹水脱落细胞的制备 冲洗液细胞样品的制备 实验方法原理 在临
培养细胞单细胞悬液的制备
实验材料胰蛋白酶细胞试剂、试剂盒EDTA·2NaPBS仪器、耗材离心管实验步骤一、培养细胞的特征一般细胞培养分为悬浮培养和贴壁培养，由于细胞的增殖有可能形成大小不等的细胞团块或连接成片。如果两个或多个细胞粘连在一块或细胞碎片过多都将影响 FCM 结果，进而导致实验失败。所以，制备合格的培养细胞单细胞
siRNA表达框架制备方法的特点
siRNA表达框架（siRNA expression cassettes，SECs）是一种由PCR得到的siRNA表达模版，包括一个RNA pol Ⅲ启动子，一段发夹结构siRNA，一个RNA pol Ⅲ终止位点，能够直接导入细胞进行表达而无需事前克隆到载体中。和siRNA表达载体不同的是，SECs
单细胞基因表达分析的最新进展
将细胞培养板上的细胞放在显微镜下观察。表面上，它们都一样。实际上，它们一点都不相同。无论是DNA或RNA的水平，还是蛋白质或代谢物的水平，这些细胞相差甚远，而这些差异可能对细胞行为产生深远的影响。 多年来，研究人员一直缺乏工具，来高效拷问这些差异，不过今非昔比。有了新一代DNA测序仪和质谱仪，
单细胞基因表达分析解密血液早期发育调控网络
近日，著名国际期刊nature biotechnology发表了英国科学家的一项最新研究成果，他们应用单细胞基因表达分析与计算方法描述了血液发育的转录调控网络。这项研究为分析器官发育的调控网络提供了一种可行的方法。 研究人员指出，重建调控器官发育的分子途经受限于缺少对胚胎祖细胞进行研究的方法，
单细胞基因表达谱揭示小脑细胞分化机制
尽管小脑（Cerebellum）体积仅为全脑的十分之一左右, 但其神经元数量大约占全脑的一半以上。近来研究表明，小脑不仅对运动的调节和维持有着重要作用，而且影响情绪、认知等高级功能。小脑发育异常和功能障碍与许多神经和精神疾病有关，例如共济失调，震颤，自闭症障碍和精神分裂症等。了解疾病相关基因在小
骨髓细胞单细胞悬液的制备
实验材料 骨髓液 试剂、试剂盒 肝素抗凝剂 PBS 实验步骤
如何制备新鲜实体组织单细胞悬液
流式细胞术对细胞的各种参数分析必须基于单细胞的基础上，根据不同实体组织成分的特点可选择不同的分散细胞的方 法，以期达到单细胞产量高、细胞损伤小的目的。在实体组织分散为单细胞的过程中，解离的方法有可能瞬间或持久地影响细胞的性质，比如，形态上显而易见的细 胞膜破损，细胞表面上可出现泡状特征，还有一些是难
骨髓细胞单细胞悬液的制备
实验材料骨髓液试剂、试剂盒肝素抗凝剂PBS实验步骤1. 无菌抽取骨髓液 0.5 ml。2. 将骨髓标本滴入含 1000 U/ml 肝素抗凝剂的 1 ml PBS 液中。3. 再加入 PBS 液稀释至 10 mI。4. 用吸管吸取 5 ml 稀释骨髓液徐徐加入盛有 4 ml 的人类淋巴细胞分离液液面之
脾脏组织单细胞悬液的制备方法
1. 剪碎法：将组织块放入平皿后，加入少量F液及20%胎牛血清；用眼科剪将组织剪至匀浆状，加入5mlF液及20%胎牛血清；用吸管吸取组织匀浆，用100目不锈钢滤网(另购)过滤到试管内；离心沉淀1500转/分×3 min，再用细胞洗涤液清洗3次，每次以500rpm短时低速离心除去细胞碎片，以200目不
骨髓细胞单细胞悬液的制备
实验材料 骨髓液 试剂、试剂盒 肝素抗凝剂 PBS 实验步骤
siRNA表达载体制备方法的特点
多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶Ⅲ启动子（pol Ⅲ）中的一种，操纵一段小的发夹RNA（short hairpin RNA，shRNA）在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U6启动子和人H1启动子。之所以采用RNA pol Ⅲ启动子是由于它可以在哺乳动物细胞中表
siRNA表达框架制备siRNA的方法介绍
siRNA表达框架（siRNA expression cassettes，SECs）是一种由PCR得到的siRNA表达模版，包括一个RNA pol Ⅲ启动子，一段发夹结构siRNA，一个RNA pol Ⅲ终止位点，能够直接导入细胞进行表达而无需事前克隆到载体中。和siRNA表达载体不同的是，SECs
用于表达分析的－mRNA－的制备实验
实验方法原理 扩增步骤完全决定于干净、完整的起始 RNA。对培养的细胞，作者采用胍盐裂解再用树脂纯化（如 Qiagen RNeasy Kit）的方案。 扩增 mRNA 可从 Poly（A）＋或总 RNA 开始。尽管 poly（A）＋灵敏度更高，因为除 掉了 cDNA 反应期间大部分与 rRN
用于表达分析的－mRNA－的制备实验
基本方案 用于表达监测以及与寡核苷酸芯片杂交的 mRNA 扩增 备择方案 cDNA 和体外转录产物的固相可逆固定（SPRI）纯化 实验方法原理 扩增
细菌表达蛋白质和样本制备
一般直接用SDS凝胶加样缓冲液裂解，具体方法如下：[试剂与设备]（1）表达待检测蛋白质的细菌。（2）50mmoL／LTris-HCl（pH7.4）。（3）2xSDS凝胶加样缓冲液：100mmol／L Tris—HCl（pH6.8）200mmol／L 二硫苏糖醇（DTT）4％ SDS（电泳级）0.2％
北京生科院建立单细胞环形RNA分析技术及表达图谱
环形RNA是一类在真核细胞中广泛存在的内源性非编码RNA分子，在生物体发育过程中发挥重要作用。之前研究已在不同物种中鉴定出数百万个环形RNA分子，并产生了大量用于揭示生物体组织表达模式的环形RNA数据资源。然而，由于大多数环形RNA表达量较低，传统的转录组测序方法无法表征单个细胞环形RNA表达谱
首次揭示单细胞水平大豆根瘤基因表达的动态特征
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500742.shtm近日，中国农业科学院作物科学研究所大豆优异基因资源发掘与创新利用创新团队与国内高校合作，首次在单细胞水平解析了大豆根瘤成熟过程中基因表达的动态变化，并在未成熟的根瘤侵染细胞中成功鉴定到
首个豆科植物根尖单细胞表达图谱绘制成功
百脉根单细胞图谱细胞类型。中国农科院供图 近日，中国农业科学院生物技术研究所作物生物技术育种创新团队与国内其他科研单位合作，共同绘制完成首个豆科植物百脉根的根尖单细胞表达图谱，鉴定出根尖的主要细胞类型，发现了新的细胞类型特异基因，并分析了各个细胞类型的潜在功能，对研究豆科植物根系发育、结瘤固氮