4D组学新时代!更精确的磷酸化修饰组学
离子淌度分离概念的引入使得蛋白质组学进入了4D新时代。4D蛋白质组学是在3D分离即保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度的基础之上增加了第四个维度,离子淌度(mobility)的分离(图1),进而大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的全面提升。更精确的磷酸化修饰组学磷酸化是研究最广泛的翻译后修饰类型,在多种生命活动的调控包括生物的生长发育、信号转导以及疾病进程等过程中发挥至关重要的功能。当下蛋白质组学研究正如火如荼地发展,随着技术的不断成熟,依赖于质谱的蛋白质磷酸化的检测,极大地推动了磷酸化蛋白质组学的发展。然而对于传统的质谱技术来说,磷酸化深度并精确的鉴定主要有两大挑战,1)生物样品中不同的磷酸化肽段丰度会呈现出几个数量级的差异,这需要更高的质谱扫描速度和灵敏度来鉴定到低丰度的磷酸化肽段;2)同一个肽段发生磷酸化位点......阅读全文
蛋白质N磷酸化修饰富集方法进展
蛋白质N-磷酸化修饰富集方法进展 江波1, 高博2, 魏淑娴2, 梁振1, 张丽华1,*, 张玉奎1 1.中国科学院大连化学物理研究所,医学蛋白质组全国重点实验室,国家色谱研究中心, 中国科学院分离分析化学重点实验室,辽宁 大连 116023 2.中国石油大学(华东)化学化工学院,山东 青
癌症外泌体的磷酸化蛋白质组学进展-|-PNAS-IF9.423
外泌体研究是医学研究中非常重要的一个方面,生物标志物、免疫调控、干细胞等均是外泌体研究的热门方向。而基于质谱的蛋白质组学是研究外泌体不可或缺的一项技术,现已有许多利用蛋白质组学技术研究外泌体的文献发出,今天小编跟大家分享一篇关于外泌体的磷酸化蛋白质组学突破性进展的文章。2017年2月1日,国际著名学
癌症外泌体的磷酸化蛋白质组学进展-|-PNAS-IF9.423
外泌体研究是医学研究中非常重要的一个方面,生物标志物、免疫调控、干细胞等均是外泌体研究的热门方向。而基于质谱的蛋白质组学是研究外泌体不可或缺的一项技术,现已有许多利用蛋白质组学技术研究外泌体的文献发出,今天小编跟大家分享一篇关于外泌体的磷酸化蛋白质组学突破性进展的文章。 2017年2月1日
北京大学第一医院780万采购离子淌度4D组学质谱系统
项目概况 北京大学第一医院科研平台建设项目离子淌度4D组学质谱系统 招标项目的潜在投标人应在北京市丰台区金泽东路通用时代中心C座获取招标文件,并于2023年11月01日 09点30分(北京时间)前递交投标文件。一、项目基本情况项目编号:B0708-CMC23N7625项目名称:北京大学第一医院科研平
460万元!中科院采购血浆4D蛋白质组学质谱分析系统
近日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心发布《分子细胞科学卓越创新中心血浆4D蛋白质组学质谱分析系统招标》公告,预计花费近460万元采购高灵敏高分辨血浆4D蛋白质组学质谱分析系统。详细信息如下: 一、项目名称:中国科学院分子细胞科学卓越创新中心质谱分析系统采购项目 二、招标编号:OITC-G
通过蛋白质组学技术对营养胁迫中泛素化修饰变化情况...
通过蛋白质组学技术对营养胁迫中泛素化修饰变化情况的分析与解读Cell Death and Disease IF=5.965Liver ubiquitome uncovers nutrient-stress-mediated trafficking and secretion of complemen
没有最多,只有更多细胞外囊泡中磷酸化蛋白质组学研究
蛋白磷酸化水平的变化可指针疾病的变化,但却鲜有磷酸化蛋白被开发成为疾病诊断标记物。细胞外囊泡是由膜封闭的微环境,不受外界蛋白酶和其他酶的影响。这使得细胞外囊泡在体液中高度稳定,为开发磷酸化蛋白应用于医学诊断提供了契机。 今天为大家介绍一篇细胞外囊泡中磷酸化蛋白相关的文章: Phosp
Cell:转移性前列腺癌的磷酸化蛋白质组学研究
癌症基因组学有望通过揭示驱动个体患者肿瘤细胞的遗传突变来实现个体化癌症治疗。但解读这一基因组数据仍然是个挑战。一些突变和其他遗传改变对癌细胞的影响,呈现在与细胞生长、增殖和其他癌症生物学标志相关的复杂分子互作(信号通路)网络中。通过绘制在前列腺癌细胞中活化的一些关键信号通路,研究人员能够确定可以
蛋白质组学技术对营养胁迫中泛素化修饰变化情况的分析
吃货们,为了健康,少吃点吧! 小编知道一名资深的吃货,无论什么都阻挡不了美食的诱惑。但我忍不住要阻止:“吃货们!为了健康,少吃点吧!” 为什么要让热爱美食的你们做出如此痛苦的选择呢?看看下面这篇文献解读你就知道了。 Cell Death and Disease IF=5.96
蛋白质组学技术对营养胁迫中泛素化修饰变化情况分析与
吃货们,为了健康,少吃点吧! 小编知道一名资深的吃货,无论什么都阻挡不了美食的诱惑。但我忍不住要阻止:“吃货们!为了健康,少吃点吧!” 为什么要让热爱美食的你们做出如此痛苦的选择呢?看看下面这篇文献解读你就知道了。 Cell Death and Disease IF=5.96
与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有何优点
那年夏天Forever与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有以下优点:①代谢组学放大了基因和蛋白表达的微小变化,从而使检测更容易;②代谢组学的研究不需建立全基因组测序及大量表达序列 标签(EST)的数据库,且代谢产物的种类要远小于基因和蛋白的数目.③ 由于给定的代谢产物在每个组织中都是一样的,所以研究
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的? 代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的? 代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的? 代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的? 代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
NLRP3磷酸化修饰与炎症小体通路激活的调控机制
9月21日,Molecular Cell在线发表了国家生物医学分析中心李涛研究员和周涛研究员合作的题为“NLRP3 phosphorylation is an essential priming event for inflammasome activation”的最新研究成果。该文报道了磷
权威文献告诉您—为何要做磷酸化组与普通蛋白质组联合
磷酸化修饰被很多研究者认为是修饰之王,是生物体内极为重要的一种翻译后修饰:从数量上来说,真核生物体内有超过三分之一的蛋白可以发生磷酸化修饰;从功能上来说,磷酸化在正常生理、免疫应答、疾病的发生发展,及植物的逆境胁迫响应与激素表达等各种生物过程中均发挥至关重要的作用。 近期微信公
北京大学第一医院花费780万成功采购离子淌度4D组学质谱系统
2023年11月1日,北京大学第一医院发布《北京大学第一医院科研平台建设项目离子淌度4D组学质谱系统中标公告》,7766000.00元中标离子淌度4D组学质谱系统。详细信息如下:一、项目编号:B0708-CMC23N7625(招标文件编号:B0708-CMC23N7625) 二、项目名称:北京大学
琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的...(二)
2. 筛选修饰蛋白进行验证并探究修饰位点功能进一步,作者对6个候选琥珀酰化蛋白进行验证(LuxS、PkG等),先通过Co-IP富集候选的修饰蛋白,随后利用琥珀酰化抗体进行WB,证明了这些蛋白确实发生了琥珀酰化修饰。随后,作者锁定了一个调节群体感应自诱导剂AI-2的合成酶-----LuxS进行深入研究
琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的...(一)
琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的代谢调控机制 随着组学研究步入后基因组时代,蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管,相对于发展迅速的医学等领域,水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚,但目前已有不少高质量文章发表,这为水产科学研究领域打开了
JCB:“流放”DNA的表观遗传学修饰
皮肤细胞在发挥作用时启动的基因与肝细胞完全不同,而其他基因需要保持关闭。将基因“流放”到细胞核边缘,是能够一举关闭大量基因的重要途径。Johns Hopkins大学的一项新研究揭示了DNA被发配到细胞核边疆的具体机制,这一过程对于控制基因表达和决定细胞命运至关重要。相关论文发表在近期的Journ
双剑合璧-|-sumo化与磷酸化修饰联合分析赢高分文章
随着质谱技术的不断进步,大规模修饰组学的方法也越来越成熟,PTM作为生物体内非常重要的生理现象也逐步被揭示出参与各项生命活动。今天我们就一起来学习一篇运用质谱技术对磷酸化修饰和类泛素化修饰鉴定,找出两种修饰联合作用对在DNA复制损伤压力时的响应。该篇文献来自哥本哈根大学的研究人员于2017年1
双剑合璧-|-sumo化与磷酸化修饰联合分析赢高分文章
随着质谱技术的不断进步,大规模修饰组学的方法也越来越成熟,PTM作为生物体内非常重要的生理现象也逐步被揭示出参与各项生命活动。今天我们就一起来学习一篇运用质谱技术对磷酸化修饰和类泛素化修饰鉴定,找出两种修饰联合作用对在DNA复制损伤压力时的响应。该篇文献来自哥本哈根大学的研究人员于2017年1
中科大吴缅教授最新文章:p53磷酸化修饰
p53 蛋白被认为是迄今为止最著名的肿瘤抑制因子之一, 在肿瘤发生发展过程中发挥复杂而重要的调控作用. 在正常生理情况下, 细胞内的p53 维持在很低的水平, 当细胞受到多种刺激后, p53被翻译后修饰, 蛋白因稳定而活性被激活, 参与细胞周期阻滞、细胞凋亡、细胞衰老、细胞代谢等生命活动过程.
植物所揭示糖基化和磷酸化修饰介导小麦春化作用新机制
冬小麦开花需要长时间环境低温的诱导,该过程称之为春化作用。不同冬小麦品种的春化特性及其与冬春季气温适应程度会直接影响其产量。到目前为止,许多春化相关基因VRNs相继被克隆和研究,但人们对春化时间的衡量以及春化感知机制并不十分清楚,影响了冬小麦分子育种的开展。氧-乙酰氨基葡萄糖(O-GlcNAc)
发现组学力量,共推组学发展
分析测试百科网讯 2020年11月27日,由赛默飞世尔科技主办、分析测试百科网协办的组学技术前沿创新高峰论坛在成都隆重举行。本次会议旨在“发现质谱力量”,邀请国内组学领域大咖共讨质谱在组学研究中的“力量”,期望共同推动中国组学研究发展。赛默飞中国区色谱与质谱业务应用支持总监薄涛博士主持大会开幕赛
利用植物表型组学挖掘基因组学的成果
到2050年,全球人口将达到97亿,预计作物产量翻一番才能满足全球人口的粮食需求。为了达到这一目标,作物产量需每年增长2.4%,但目前作物产量平均增长率仅为1.3%。作物生产性能的遗传改良仍然是提高作物生产力的关键因素,但当前的改善速度无法满足可持续性和粮食安全的需要。为了确保粮食安全、生态系统的可
国自然冲刺蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点
每年三月初,都是科研界的“高考”倒计时,因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况,蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明,磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目,总研究资助金额超过2亿。 继上周的肠道微生物研究方案
国自然冲刺蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点
每年三月初,都是科研界的“高考”倒计时,因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况,蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明,磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目,总研究资助金额超过2亿。 继上周的肠道微生物研究方案解析后(国自然冲