SSCP原理

SSCP原理及特点 日本Orita等研究发现,单链DNA片段呈复杂的空间折叠构象,这种立体结构主要是由其内部碱基配对等分子内相互作用力来维持的,当有一个碱基发生改变时,会或多或 少地影响其空间构象,使构象发生改变,空间构象有差异的单链DNA分子在聚丙烯酰 胺凝胶中受排阻大小不同.因此,通过非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE),可以非常敏锐地将构象上有差异的分子分离开.作者称该方法为单链构象多态性 (Single-Strand Conformation Polymorphism,SSCP)分析.在随后的研究中,作者又将SSCP用于检查PCR扩增产物的基因突变,从而建立了PCR-SSCP技术,进一步提高了检测突变方法的简便性和灵敏性.其基本过程是:①PCR扩增靶DNA;②将特异的PCR扩增产物变性,而后快速复性,使之成为具有一定空间结构的单链DNA分子;③将适量的单 链DNA进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳;④最后通过放射性自......阅读全文

SSCP原理

SSCP原理及特点 日本Orita等研究发现,单链DNA片段呈复杂的空间折叠构象,这种立体结构主要是由其内部碱基配对等分子内相互作用力来维持的,当有一个碱基发生改变时,会或多或 少地影响其空间构象,使构象发生改变,空间构象有差异的单链DNA分子在聚丙烯酰 胺凝胶中受排阻大小不同.因此,通过非变性聚丙

PCRSSCP原理及应用

随着分子生物学技术的发展,检测基因结构和突变的方法不断涌现.尤其是PCR技术问 世以后,各种与PCR相结合的基因检测技术进一步推动了基因研究的发展.如不对称 PCR产物的直接测序、核糖核酸酶酶切法(Ribonuclease cleavage,RNAase)、限制性 片段长度多态性分析(Restric

PCRSSCP、-RTPCRSSCP-区别

仅仅是扩增的方法不同而已,一个是普通的PCR,一个是RTPCR.如果需要鉴定染色体的DNA序列有无差别或基因突变,可以用PCR-SSCP,我曾做过这方面的实验,检测病人有无基因的点突变,同时扩增病人和正常人的基因片段,然后做sscp,只要有一个核苷酸的区别,变性SDS-PAGE后,条带就会有很大的区

PCRSSCP、-RTPCRSSCP-区别

仅仅是扩增的方法不同而已,一个是普通的PCR,一个是RTPCR.如果需要鉴定染色体的DNA序列有无差别或基因突变,可以用PCR-SSCP,我曾做过这方面的实验,检测病人有无基因的点突变,同时扩增病人和正常人的基因片段,然后做sscp,只要有一个核苷酸的区别,变性SDS-PAGE后,条带就会有很大的区

PCRSSCP实验原理和操作步骤

【实验目的】1.了解PCR-SSCP技术的原理。2.了解并熟悉PCR-SSCP技术的步骤。 【实验原理】 PCR-SSCP是1989年日本Orita等创建的筛查突变的新技术。它是一种简单、快速、经济的点突变筛查手段。PCR-SSCP技术的基本原理是PCR扩增后的DNA片段经变性成单链DNA,

PCRSSCP

一.  样品的制备1. 设计引物。用Oliga6.0对目的基因进行分析,设定引物,引物长度18-21个碱基,扩增片段以200-300bp最为合适。2. PCR扩增并检测。根据不同的引物挑选适合的退火温度进行PCR扩增。扩增产物用2-2.5%的琼脂糖胶跑水平电泳检测,上样量3-5ul。PCR产物为10

SSCP检测SNP原理,步骤及常见问题总结整理

SSCP原理:sscp称为单链构象多态性,它是基于DNA构象来检测PCR产物单链碱基微小差异的方法,因其检测敏感,快速和所需装置简便而在分子生物学各个领域广泛应用。但该方法的试验结果受多种因素的影响,如:PCR产物,温度,电压,PAGE胶的浓度和交联度等,因而重复性比较差。因此在做SSCP时要注意各

SSCP检测SNP原理,步骤及常见问题总结整理

SSCP原理:sscp称为单链构象多态性,它是基于DNA构象来检测PCR产物单链碱基微小差异的方法,因其检测敏感,快速和所需装置简便而在分子生物学各个领域广泛应用。但该方法的试验结果受多种因素的影响,如:PCR产物,温度,电压,PAGE胶的浓度和交联度等,因而重复性比较差。因此在做SSCP时要注意各

PCRSSCP-技术实验

聚合酶链式反应-单链构象多态(Polymerase Chain Reaction-Single Strand Conformation Polymorphism,PCR-SSCP)技术可用于:(1)癌基因和抑癌基因突变的筛查检测;(2)遗传病的致病基因分析;(3)基因诊断,基因制图等领域。实验方法原

PCRSSCP-技术实验

实验原理聚合酶链式反应-单链构象多态(Polymerase Chain Reaction-Single Strand Conformation Polymorphism,PCR-SSCP)技术是在PCR技术基础上发展起来的,它是一种简单、快速、经济的用来显示在PCR反应产物中单碱基突变(点突变)

PCRSSCP-技术实验

            实验方法原理 PCR-SSCP技术的基本原理是PCR扩增后的DNA片段经变性成单链DNA,单链DNA在中性聚丙烯酰胺凝胶中电泳时形成不同的立体构象,其构象直接影响泳动速率,相同长度的 DNA单链其核苷酸顺序仅有单个碱基的差别,就可以产

PCRSSCP的原理特点、操作方法和应用2

2)电泳取10μlPCR产物,加入10μl变性剂(95%甲酰胺,10mmol/LEDTA,0.02%溴酚蓝)、30μl 石蜡油,煮沸5min,取出立刻放入冰浴中2min以上,然后将水相全部上样,10-15℃下电泳.开始在300V电压下电泳5min,然后在120V电泳8h,取下凝胶,将其浸在含

PCRSSCP的原理特点、操作方法和应用1

随着分子生物学技术的发展,检测基因结构和突变的方法不断涌现.尤其是PCR技术问 世以后,各种与PCR相结合的基因检测技术进一步推动了基因研究的发展.如不对称 PCR产物的直接测序、核糖核酸酶酶切法(Ribonuclease cleavage,RNAase)、限制性 片段长度多态性分析(Res

PCRSSCP技术检测细菌

长期以来,临床上主要用细菌培养和血清学方法检测病原菌,但均不能达到快速诊断细菌感染的目的。常规PCR技术采用针对特定病原菌的特异性引物,由于临床病原菌往往不明,需用多种不同引物和扩增程序进行PCR扩增,亦难实现快速诊断。PCR-SSCP技术主要用于基因突变的检测,利用该技术鉴定细菌虽有报道[1,2,

PCRSSCP技术检测细菌

16SrRNA基因以快速鉴定细菌陶洪群1 李向阳1 杨雷2 杨锦江11.温州医学院附属第二医院检验科? 3250272.温州医学院分子生物实验中心? 325027  长期以来,临床上主要用细菌培养和血清学方法检测病原菌,但均不能达到快速诊断细菌感染的目的。常规PCR技术采用针对特定病原菌的特异性引物

PCRSSCP技术检测细菌

长期以来,临床上主要用细菌培养和血清学方法检测病原菌,但均不能达到快速诊断细菌感染的目的。常规PCR技术采用针对特定病原菌的特异性引物,由于临床病原菌往往不明,需用多种不同引物和扩增程序进行PCR扩增,亦难实现快速诊断。PCR-SSCP技术主要用于基因突变的检测,利用该技术鉴定细菌虽有报道[1,2,

PCR-SSCP标记技术

实验概要日本Orita等研究发现,单链DNA片段呈复杂的空间折叠构象,这种立体结构主要是由其内部碱基配对等分子内相互作用力来维持的,当有一个碱基发生改变时,会或多或少地影响其空间构象,使构象发生改变,空间构象有差异的单链DNA分子在聚丙烯酰胺凝胶中受排阻大小不同.因此,通过非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(

单链构象多态性分析(SSCP)技术

SSCP是一种简便快速的检测DNA或cDNA突变的技术。        其技术原理和过程是:将PCR扩增到的待测DNA或cDNA片段变性,成为单链DNA,在一定条件下,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳将单链DNA变性。        由于单链DNA的空间构象与分子内碱基组成密切相关,一个碱基的差异即可形成不同

HLA基因分型方法:PCR-SSCP法

PCR-SSCP法1)提取DNA同前RFLP法 2)PCR扩增同前PCR-RFLP,也可加入1μCi32P-dCTP标记产物。 3)非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳1.取PCR的扩增产物,加凝胶加样液3μl,95℃加热变性2min,冰浴骤冷。同位素掺入的DNA取1μl稀释10倍,加样3μl。2.取样品用微量

PCR技术(十二):PCRSSCP的发展现状

随着分子生物学技术的发展,检测基因结构和突变的方法不断涌现.尤其是PCR技术问 世以后,各种与PCR相结合的基因检测技术进一步推动了基因研究的发展.如不对称 PCR产物的直接测序、核糖核酸酶酶切法(Ribonuclease cleavage,RNAase)、限制性 片段长度多态性分析(Restric

SNP的检测方法(直接测序法与PCRSSCP)

人类基因组中存在着广泛的多态性,最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代,即单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)。SNP通常是一种二等位基因的(biallelic),即二态的遗传变异,SNP的数量大、分布广,在组成人类基因组的

PCR单链构象多态性分析

  PCR -单链构象多态性分析(PCR -single strand conformation analysis,PCR -SSCP) 是近年来在基因突变检测中运用最广泛的方法之一。PCR -SSCP 技术凭借突变可引起单链DNA三级构象改变,通过观察单链DNA在非变性聚丙烯酰胺凝胶中的迁移率漂移

PCRSSCP(聚合酶链反应单链构象多态)实验步骤

一. 样品的制备1. 设计引物。用Oliga6.0对目的基因进行分析,设定引物,引物长度18-21个碱基,扩增片段以200-300bp最为合适。2. PCR扩增并检测。根据不同的引物挑选适合的退火温度进行PCR扩增。扩增产物用2-2.5%的琼脂糖胶跑水平电泳检测,上样量3-5ul。PCR产物为 10

单链构象多态性的原理及应用

单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism, SSCP)是一种分离核酸的技术,可以分离相同长度但序列不同的核酸(性质类似于DGGE和TGGE,但方法不同)。原理单链构象多态性(Single-strand conformation polymorph

PCRRFLPSSCP及测序用于霍乱弧菌ctxAB基因多态

  建立PCR-RFLP-SSCP及测序方法,用于分析霍乱弧菌肠毒素AB(ctx-AB)基因多态性。针对ctx-AB基因设计引物,扩增片段为528bp,包括ctx-B编码基因375bp,引物序列为5′-GGT GTA AAA TTC CTT GAC G-3′和5′-GGT TCG ATG ATG A

特异引物的PCR标记的相关介绍

  特异引物的PCR标记所用引物是针对已知序列的 DNA 区段而设计的,具有特定核苷酸序列(通常为 18—24 bp),可在常规PCR复性温度下进行扩增,对基因组 DNA 的特定区域进行多态性分析。  ①序列标志位点  (Sequence Tagged Sites,STS)  STS是对以特定对引物

基因突变检测方法

基因突变检测方法:1.PCR-SSCP法是在非这性聚丙烯酰胺凝胶上,短的单链DNA和RNA分子依其大街基序列不同而形成不同构象,一个碱基的改变将影响其构象而导致其在凝胶上的移动速度改变。其基本原理为单链DNA在中性条件下会形成二级结构,这种二级结构依赖于其碱基组成,即使一个碱基的不同,也会形成不同的

聚合酶链反应一单链构象多态性分析-(PCRSSCP)

聚合酶链反应-单链构象多态性分析(Single Strand Conformation Polymorphism Analysis of Polymerase Chain Reaction Products, PCR-SSCP)是近年来发展起来的一种基因分析方法。 PCR-SSCP分析的基本程序为:

聚合酶链反应一单链构象多态性分析-(PCRSSCP)

  聚合酶链反应-单链构象多态性分析(Single Strand Conformation Polymorphism Analysis of Polymerase Chain Reaction Products, PCR-SSCP)是近年来发展起来的一种基因分析方法。   PCR-SSCP分析的基本

SNP的检测知识

SNP的检测知识:人类基因组中存在着广泛的多态性,最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代,即单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)。SNP通常是一种二等位基因的(biallelic),即二态的遗传变异,SNP的数量大、分布广,在组成人