昆明动物所建立人类线粒体DNA数据综合分析平台

近年来,随着测序技术的快速发展和成本的降低,越来越多的人类线粒体DNA(mtDNA)基因组序列被测定,公共数据库中相关数据的存储量也显著增加。为了快速有效的分析、存储和利用这些已有数据以及处理新增mtDNA数据,中国科学院昆明动物研究所姚永刚研究员课题组的硕士研究生樊隆搭建了一个人类mtDNA数据综合分析平台(MitoTool: www.mitotool.org)。 该平台的功能主要包括:(1)根据mtDNA序列中的特征变异位点自动划分mtDNA的单倍群(haplogroup);(2)判断报道的mtDNA序列是否有错、线粒体单倍群的划分是否有误;(3)显示mtDNA上变异位点的跨物种保守性及其潜在致病性;(4)统计分析病例组-正常对照组研究中线粒体单倍群分布的差异;(5)提供多种线粒体相关数据的检索和下载服务。整个平台界面简单,使用便捷,并为用户提供了详细的操作指南。 目前,关于该综合分析平台的研究......阅读全文

昆明动物所建立人类线粒体DNA数据综合分析平台

  近年来,随着测序技术的快速发展和成本的降低,越来越多的人类线粒体DNA(mtDNA)基因组序列被测定,公共数据库中相关数据的存储量也显著增加。为了快速有效的分析、存储和利用这些已有数据以及处理新增mtDNA数据,中国科学院昆明动物研究所姚永刚研究员课题组的硕士研究生樊隆搭建了一个人

Science揭示细胞凋亡期间,mtDNA逃离线粒体机制

  在一项新的研究中,由澳大利亚莫纳什大学生物医学发现研究所的Benjamin Kile教授领导的一个国际研究团队发现并拍摄了在细胞死亡期间线粒体DNA(mtDNA)逃离线粒体(细胞内产生能量的细胞器)的确切时刻。相关研究结果发表在2018年2月23日的Science期刊上,论文标题为“BAK/BA

完整线粒体mtDNA提取神器SageHLS在测序合成的应用

有关线粒体DNA:线粒体是一种存在于大多数细胞中的由两层膜包被的细胞器,细胞中制造能量的结构,是细胞进行有氧呼吸的主要场所。线粒体病是遗传缺陷引起线粒体异常,致使ATP合成障碍、能量来源不足等导致的一组异质性病变,又称为线粒体细胞病。常见的线粒体疾病有Leber遗传性视神经病变(LHON)、线粒体脑

推翻教科书!线粒体DNA可通过父系遗传

  对于大多数哺乳动物来说,线粒体和线粒体DNA都是只通过母系遗传。尽管其他生物偶尔会经历父系遗传,但之前关于人类父系遗传线粒体的报道大多是因为污染或样本混淆。  然而,美国辛辛那提儿童医院的黄涛生博士和梅奥诊所的Paldeep Atwal博士本周在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表论文,称他们在

线粒体脑肌病的病学进展

  随着遗传学和分子生物学的飞速发展,对线粒体脑肌病发病机制的探索取得了显著进展。首先Anderson等于1987年完成了mtDNA的全部序列分析,Holt于1988年发现线粒体肌病的肌肉组织中mtDNA大片段缺失,同年Wallace报道了第一例LHON病人的mtDNA点突变,Zeviani报道了m

线粒体脑肌病的病学进展

  随着遗传学和分子生物学的飞速发展,对线粒体脑肌病发病机制的探索取得了显著进展。首先Anderson等于1987年完成了mtDNA的全部序列分析,Holt于1988年发现线粒体肌病的肌肉组织中mtDNA大片段缺失,同年Wallace报道了第一例LHON病人的mtDNA点突变,Zeviani报道了m

宋质银/舒力等揭示氧化应激下线粒体自噬新机制

  EMBO J |   不同生理刺激导致线粒体的损伤类别及程度有很大不同,从而启动不同的线粒体自噬信号通路,因此鉴定不同生理刺激下线粒体自噬机制一直是线粒体领域研究重点及前沿。氧化应激是机体的主要生理刺激,是指体内氧化与抗氧化作用失衡的一种状态(倾向于氧化),也是机体细胞损伤重要因素。氧化应激导致

线粒体病的实验室检查

  血生化检查  (1)血乳酸、丙酮酸最小运动量试验:约80%的病人运动后10分钟血乳酸和丙酮酸仍不能恢复正常,为阳性;线粒体脑肌病患者CSF乳酸含量也增高;  (2)线粒体呼吸链复合酶活性降低。  2.mtDNA分析  (1)CPEO和KSS为mtDNA片段缺失,可能发生在卵子或胚胎形成期;  (

中国科学家实现线粒体致病突变体内原位纠正

华东师范大学教授李大力、刘明耀团队联合临港实验室青年研究员陈亮团队,开发出高性能线粒体腺嘌呤碱基编辑器(eTd-mtABEs),并利用eTd-mtABEs成功构建了感音神经性耳聋和Leigh综合症大鼠疾病模型。此外,团队使用重新改造的DdCBE变体,首次实现线粒体致病突变的体内原位纠正,成功逆转了l

发表论文的捷径?线粒体测序论文太多

  David Roy Smith是来自加拿大韦仕敦大学的一位生物学助理教授,近期他在The Scientist杂志上发文,指出目前涌现了太多线粒体基因组测序论文,2014年GenBank中新增的线粒体基因组序列信息多达上千条,这几乎比上一年激增了15%。  Smith指出,很少有人会质疑这些线粒体

线粒体病的检查

  (一)实验室检查  1.血生化检查  (1)血乳酸、丙酮酸最小运动量试验:约80%的病人运动后10分钟血乳酸和丙酮酸仍不能恢复正常,为阳性;线粒体脑肌病患者CSF乳酸含量也增高;  (2)线粒体呼吸链复合酶活性降低。  2.mtDNA分析  (1)CPEO和KSS为mtDNA片段缺失,可能发生在

关于线粒体病的检查介绍

  (一)实验室检查  1.血生化检查  (1)血乳酸、丙酮酸最小运动量试验:约80%的病人运动后10分钟血乳酸和丙酮酸仍不能恢复正常,为阳性;线粒体脑肌病患者CSF乳酸含量也增高;  (2)线粒体呼吸链复合酶活性降低。  2.mtDNA分析  (1)CPEO和KSS为mtDNA片段缺失,可能发生在

关于线粒体疾病的检查方式介绍

  (一)实验室检查  1.血生化检查  (1)血乳酸、丙酮酸最小运动量试验:约80%的病人运动后10分钟血乳酸和丙酮酸仍不能恢复正常,为阳性;线粒体脑肌病患者CSF乳酸含量也增高;  (2)线粒体呼吸链复合酶活性降低。  2.mtDNA分析  (1)CPEO和KSS为mtDNA片段缺失,可能发生在

线粒体病的实验室检查及辅助检查

  实验室检查  1.血生化检查  (1)血乳酸、丙酮酸最小运动量试验:约80%的病人运动后10分钟血乳酸和丙酮酸仍不能恢复正常,为阳性;线粒体脑肌病患者CSF乳酸含量也增高;  (2)线粒体呼吸链复合酶活性降低。  2.mtDNA分析  (1)CPEO和KSS为mtDNA片段缺失,可能发生在卵子或

线粒体疾病遗传的特点

线粒体疾病遗传的特点有母系遗传、存在异质性和阈值以及遗传性等特点,具体如下。一、母系遗传卵子与精子细胞核的结合是对等的,但细胞质的结合是远远不对等的。在绝大多数情况下,突变的线粒体DNA通过母亲卵子细胞质的线粒体传给子代,通过父亲传递的极为罕见。二、有数量概念一个细胞的细胞质中可有几千个线粒体DNA

Nat-Metabol:最新研究挑战科学家们对机体过早衰老的理解

  近日,一项刊登在国际杂志Nature Metabolism上的研究报告中,来自东芬兰大学的科学家们通过研究发现,线粒体DNA功能的紊乱或会以不同于此前想象中的方式来加速机体的衰老过程;机体衰老速度的加快或许是细胞中异常核苷酸水平和受损细胞核DNA的维持导致的结果。图片来源:CC0 Public

线粒体基因组的DNA相关介绍

  与细胞核DNA相比,mtDNA作为生物体种系发生的“分子钟”(molecular clock)有其自身的优点:①突变率高,是核DNA的10倍左右,因此即使是在近期内趋异的物种之间也会很快地积累大量的核苷酸置换,可以进行比较分析;②因为精子的细胞质极少,子代的mtDNA基本上都是来自卵细胞,所以m

一例以中枢神经系统感染为主要表现的线粒体脑肌病...

一例以中枢神经系统感染为主要表现的线粒体脑肌病病例分析患者杨某,男性,49岁,其母亲有糖尿病病史。于2011年8月15日无明显诱因下出现头痛,以前额为明显,无恶心、呕吐,无双侧眼球一过性黑朦,无二便失禁。 当时症状可耐受,未引起注意,同年8月17日家人发现患者反应迟钝、行为异常,言语不能伴有意识模糊

艺高人胆大!相当“嚣张”的测序技术——单细胞器测序

  线粒体疾病如何诊断和治疗?(运用成熟的单线粒体分离技术在显微镜下挑取单个小鼠线粒体。)  宾夕法尼亚大学医学院James Eberwine领导的研究小组刚开发了一种适用于单个线粒体的分离和测序技术“单线粒体测序(single-mitochondrion sequencing)”利用这种新方法他们

科学家首次用TALENs技术编辑线粒体基因

  美国的研究人员开发出一种新方法来清除线粒体内的突变DNA,从而有望治疗多种线粒体病。据介绍,这也是TALENs技术首次用于线粒体基因的编辑。这项研究成果于8月4日在线发表在《Nature Medicine》上。   线粒体病通常是由突变的线粒体DNA(mtDNA)引起的,在大部分情况下它与

线粒体脑肌病的简介

  线粒体是真核细胞内一种重要和独特的细胞器,被称为细胞内的“动力工厂”。线粒体通过氧化磷酸化作用,进行能量转换,为细胞进行各种生命活动提供所需的能量。而且在细胞凋亡及某些代谢途径中也起重要作用。线粒体是细胞内最易受损伤的一个敏感的细胞器,它可显示细胞受损伤的程度。线粒体DNA (mitochond

线粒体脑肌病的简介

  线粒体是真核细胞内一种重要和独特的细胞器,被称为细胞内的“动力工厂”。线粒体通过氧化磷酸化作用,进行能量转换,为细胞进行各种生命活动提供所需的能量。而且在细胞凋亡及某些代谢途径中也起重要作用。线粒体是细胞内最易受损伤的一个敏感的细胞器,它可显示细胞受损伤的程度。线粒体DNA (mitochond

最新研究表明线粒体可由父系遗传

  近日发表在PNAS 《美国科学院院刊》上的一项研究表明,线粒体可由父系遗传。来自美国辛辛那提儿童医院的黄涛生博士和梅奥诊所的Paldeep Atwal博士称他们在三个家庭中发现了mtDNA双亲遗传。  传统观念里,大多数哺乳动物的线粒体和线粒体DNA都是只通过母系遗传。尽管有其他物种已被发现线粒

最新研究表明线粒体可由父系遗传

  近日发表在PNAS 《美国科学院院刊》上的一项研究表明,线粒体可由父系遗传。来自美国辛辛那提儿童医院的黄涛生博士和梅奥诊所的Paldeep Atwal博士称他们在三个家庭中发现了mtDNA双亲遗传。  传统观念里,大多数哺乳动物的线粒体和线粒体DNA都是只通过母系遗传。尽管有其他物种已被发现线粒

蚜虫mtDNACOI/COII基因序列测定及系统发育分析

实验概要本研究通过分析三种蚜虫mtDNA COI/COII基因序列的进化,揭示了三种蚜虫与已知其它蚜虫的该段序列的进化关系。实验材料本研究中的蚜虫为桃蚜、豆蚜、棉蚜。桃蚜、豆蚜、棉蚜在实验室内分别用萝卜、菜豆、黄瓜进行饲养;各种群分别置于50X50X50的正方体铁架外罩100目双层沙网内,饲养条件为

线粒体病的鉴别及并发症

  鉴别  但应注意炎症肌病和其他肌病可同时伴存线粒体和糖原堆积之可能,严防过多过滥诊断线粒体肌病。线粒体肌病需与多发性肌炎,重症肌无力,周期性瘫痪和眼咽型进行性肌营养不良等鉴别。  并发症  线粒体病一般在婴儿、儿童或成年早期发病,呈进行性或阶段进展性病程,婴幼儿常见的表现主要有死胎或死产、进行性

PNAS-|-单细胞测序新技术揭示了这种有害线粒体DNA突变

  线粒体功能下降是衰老和年龄相关疾病的基础,但线粒体DNA (mtDNA)突变在这些过程中的作用仍然难以捉摸。为了研究mtDNA突变的模式,在单细胞水平上量化mtDNA突变及其相关的致病效应尤为重要。然而,现有的单细胞mtDNA测序方法由于成本高和mtDNA靶率低而效率低下。  2022年12月2

线粒体脑肌病的基因遗传

  遗传型中包括核DNA(nDNA)缺陷和线粒体DNA(mt DNA)缺陷: (1) nDNA缺陷:底物传递障碍,即肉毒碱原发或继发缺失,脂质沉积病;底物利用障碍,如脂肪酸和丙酮酸代谢异常;三羧酸循环障碍,如延胡索酸酶缺乏、二氢脂脱氢酶缺乏、琥珀酸脱氢酶缺乏以及乌头酸酶联合缺陷等;氧化磷酸化偶联障碍

线粒体损伤与检测方法研究进展

作者:左钱飞,张海献,鲁鹏飞  摘 要:线粒体是细胞活动的“能源工厂”,在各种致病因素作用下线粒体极易出现各种结构和功能损伤,这在疾病的发展中起着十分重要的影响,文章就线粒体结构和功能损伤及其检测方法作一综述。   关键词:线粒体损伤;mtDNA;凋亡   Abstract:Mitochondria

线粒体病的并发症

  线粒体病一般在婴儿、儿童或成年早期发病,呈进行性或阶段进展性病程,婴幼儿常见的表现主要有死胎或死产、进行性脑病、肌无力、癫痫、生长发育迟滞等,成人常见的表现包括双眼视力下降、年青人卒中样发作、肌阵挛癫痫、肌无力、眼睑下垂和视物成双、糖尿病、胃肠疾病等。mtDNA突变导致的疾病一般母系遗传,即患者