一个lncRNA可能是成功受孕的关键
蛋白质——是几乎所有生物机制的基础,是由从DNA基因序列转录而来的RNA分子所产生的。然而,大部分的转录RNA并没有被转换成蛋白质,并且似乎没有重要的作用。最近,日本理化研究所(RIKEN)RNA生物学实验室的Shinichi Nakagawa及其同事发现,一个特别的长非编码RNA(lncRNA),在某些情况下可能对于生育是至关重要的。相关研究结果最近发表在发育生物学国际著名期刊《Development》。 作为先前研究项目的一部分,Nakagawa及其研究小组制备了一种转基因小鼠品系,它们在一个称为Neat1的lncRNA其编码基因上具有一个敲除突变。虽然大多数的lncRNA敲除没有显示明显的效果,但研究人员在这些Neat1敲除雌性小鼠当中发现了很高的不孕率。所以他们打算进一步进行调查。 研究小组发现,大约一半的雌性基因敲除小鼠存在生育问题,要么是不能怀孕,要么是产出很小的幼崽。然而,出人意料的是,这种影响是随机的。一......阅读全文
关于怀孕那些事
怀孕是大部分女性人生中的大事。从刚得知怀孕的欣喜,到经历几个月的漫长等待,到最后分娩时的痛苦,都对给妈妈们留下深刻的回忆。对于准备当妈妈的人来说,如何备孕是首先应当考虑的问题;对于孕妇来说,如何保护自己与胎儿的健康是则是另外一项十分重要的问题;分娩的方式以及孩子日后的健康生长则需要更加长久的考虑
药物作用靶点筛选与基因敲除技术的关系
2018年一对双胞胎婴儿的CCR5基因敲除的事件在社会上引起了轩然大波,抛开这次事件而言,作为一项生物研究技术,基因敲除在药物研发领域应用也很广泛,今天我们来看一下它在药物作用靶点筛选上的作用吧! 通过药物作用的靶点来设计开发创新药物是目前创新药制剂开发的一条重要线索,每年都会有作用于新靶
中国科学家实现灵长类动物基因定向敲除
这是两只运用CRISPRA/Cas9技术成功实现基因靶向修饰的食蟹猴(1月10日摄)。 记者从云南省科技厅获悉,经过近一年的努力,中国科学家在云南昆明成功培育了多只被去除特定基因的猴子,实现了基因靶向修饰技术在灵长类动物身上的应用,并于近期在国际权威学术刊物发表了相关成果,将为人类遗传疾病
旅美华裔学者直接参与“基因敲除小鼠”试验
70岁的意大利裔美国人卡佩基等美英三位学者本月8号获得今年的诺贝尔生理学或医学奖。旅美华裔学者邓初夏当年曾是卡佩基科研团队的成员。日前他在接受本台驻美国记者采访时,谈到了自己参与“基因敲除小鼠”试验的感受。 1986年,邓初夏考入犹他大学研究生院,师从卡佩基,成为从事“基因敲除”试验的第一个研究
湖北农科院用CRISPR制备基因敲除克隆猪
来自湖北省农科院畜牧兽医研究所、河南科技大学和中科院水生生物研究所的研究人员,用CRISPR/Cas9系统和Cre/LoxP,敲除了猪初生细胞中肌生成抑制蛋白(MSTN)的一个等位基因,制备了无选择标记的MSTN基因敲除克隆猪。相关研究结果发表在8月17日的《Scientific Reports
华人科学家首次培育出基因敲除大鼠
可能在不久的未来,大鼠将会代替小鼠,重新成为实验室里的头号“动物明星”。最近,国际顶级学术期刊《自然》发表了华人科学家的最新成果——首次培育出了基因敲除的大鼠。这一突破解开了20多年来“无法用基因敲除的方法来构建大鼠疾病动物模型”的难题,使得这种“与人类更接近”的动物能更好地为人类疾病
药物作用靶点筛选与基因敲除技术的关系
2018年一对双胞胎婴儿的CCR5基因敲除的事件在社会上引起了轩然大波,抛开这次事件而言,作为一项生物研究技术,基因敲除在药物研发领域应用也很广泛,今天我们来看一下它在药物作用靶点筛选上的作用吧! 通过药物作用的靶点来设计开发创新药物是目前创新药制剂开发的一条重要线索,每年都会有作用于新靶
新一批敲除小鼠序列数据存入基因银行
美国得克萨斯州基因组医学研究所将其敲除小鼠库的超过275000个核苷酸序列信息存入了美国国立卫生研究院的基因银行。 以休斯敦为根据地的得克萨斯州基因组医学研究所于今年5月加入国际敲除小鼠协会。在美国国立卫生研究院号召在国际科学界广泛分享小鼠研究信息后,该研究所表示愿意向美国健康研究院提供基因序列
Nature方法:大型单基因敲除人类单倍体细胞库
由奥地利科学院和维也纳Haplogen的研究人员领导的一个研究小组,利用一种称之为“基因捕获”( gene trap)的技术构建出了一个人类单倍体细胞库,该细胞库中包括有3000多种细胞系,每个细胞系都具有一种不同的突变基因。这项研究工作发布在8月25日的《自然方法》(Nature Me
新技术能同时“敲除”动物体内不同基因
据《自然》杂志20日报道,瑞士苏黎世联邦理工学院领导的研究团队开发出一种方法,可极大简化和加快对基因功能的研究:使用CRISPR-Cas技术,可同时在单个动物的不同细胞内敲除不同的基因,每个细胞被改变的基因不超过一个,从而能平行观察不同基因变化导致的细胞走向。 追踪疾病遗传原因的一种行之有效的
基因敲除(KO)在验证抗体特异性的应用
抗体作为基础科学研究和临床试验常用的工具之一,主要通过抗原-抗体的反应揭示蛋白质在生命活动中的变化。尽管它们被广泛的使用,但是没有相关标准以确保商业抗体特异性和质量上的一致性。这使得科学界一直存在“重现危机”,浪费了科学家们大量的时间和金钱,妨碍生命科学研究的快速发展。因此,对抗体进行敏感性和特异性
设计cas9条件性基因敲除小鼠
其关键是构建带有两个Loxp位点的小鼠,即flox(flanked by loxP)小鼠。今天我们就来详细介绍一下如何设计。共分三步:第一步,选择外显子。第二步,设计sgRNA。第三步,设计SSODN。听起来蛮简单的哈?下面我们详细讲讲。第一步,选择外显子。1. 尽量选择敲除所有转录本共用的外显子。
Science:“恶基因”导致怀孕失败,突变频率竟高达45%
非整倍性(即细胞中的染色体数目不正确)在早期胚胎中极其常见,是导致怀孕失败的主要原因。4月9日,发表在《科学》杂志上的一项研究中,科学家们发现非整倍性与母亲的基因突变有关。令人意外的是,这种突变在人群中非常常见,似乎在进化中发挥了积极的作用。 事实上,约75%的人类胚胎会出现非整倍性,大多数会
Nature关注遗传学新动向:人类基因敲除研究
数十年来,生物学家们一直在小鼠或其他动物模型中,通过失活目的基因来进行功能研究。现在这种基因敲除(knockout)研究有了更理想的模型,那就是人类。 当然,这并不是说像处理小鼠那样,对人类进行遗传学改造。事实上,研究者们是通过分析成百上千的人类基因组,在其中寻找失活某个基因的天然突变。他们希
应用优化CRISPR技术建立基因完全敲除的小鼠及猴
6月6日,《细胞研究》在线发表了一项成果,应用改进的“C-CRISPR”技术可以获得单基因或多基因功能完全敲除的小鼠及猴。这项研究由中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心的杨辉研究组、熊志奇研究组以及神经所苏州非人灵长类研究平台孙强团队合作完成。该研究通过将多个
条件性基因敲除的基本原理Flp/FRT系统
条件性基因敲除的基本原理 Flp / FRT 系统该系统与Cre/loxP系统相同,也是由一个重组酶 和一段特殊的DNA序列组成。从进化的角度上考虑,Flp/FRT系统是Cre/loxP系统在真核细胞内的同源系统。其中.重组酶Flp是酵母细胞内的一个由423个氨基酸组成的单体蛋白。与Cre相似,Fl
斑马鱼的基因敲除定制(Cas9KO)法介绍
利用 CRISPR/Cas9 技术,针对靶基因序列设计 sgRNA, 指导 Cas9 蛋白在特定基因位点引起 DNA 双链断裂,在非同源性末端接合修复断裂 DNA 的过程中,靶基因碱基突变或缺失被引入到斑马鱼基因组中,最终导致靶基因无法正常转录翻译,达到基因敲除的目的。目前我们利用 CRISPR
斑马鱼的基因敲除定制(Cas9KO)法介绍
利用 CRISPR/Cas9 技术,针对靶基因序列设计 sgRNA, 指导 Cas9 蛋白在特定基因位点引起 DNA 双链断裂,在非同源性末端接合修复断裂 DNA 的过程中,靶基因碱基突变或缺失被引入到斑马鱼基因组中,最终导致靶基因无法正常转录翻译,达到基因敲除的目的。目前我们利用 CRIS
利用I型CRISPRCas系统实现大片段基因敲除
CRISPR-Cas系统是细菌和古细菌中广泛存在的一种由RNA介导抵抗外援病毒或者核酸入侵的“获得性免疫系统”。CRISPR-Cas系统主要分为两大类:I类(Class I)利用多亚基效应复合物来实现对靶标序列的识别和切割过程;而II类(Class 2)则由单一蛋白来执行相关功能,作用机制相对简
广州生物院等建立世界首个基因敲除狗模型
近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院和南京大学-南京生物医药研究院、广州医药研究总院等合作,利用CRISPR/Cas9技术成功培育两只肌肉生长抑制素(MSTN)基因敲除狗,在世界上首次建立了狗的基因打靶技术体系。该成果于10月12日在线发表于Journal of Molecular Cell
朱强课题组建立麻竹内源基因的敲除的基因编辑系统
福建农林大学教授朱强课题组以东南亚地区广泛种植的麻竹为材料,建立了适合麻竹内源基因的敲除的基因编辑系统,实现了对麻竹基因的定点敲除。相关成果近日发表于《植物生物技术杂志》。该研究为竹子分子生物学的发展及通过分子育种方法进行竹子农艺性状的改良提供了有力的技术支撑。图片来源于网络 目前,世界上约有
倚天屠龙,谁与争锋——且看基因敲除与RNA干扰的关系
研究历史 20世纪80年代初,胚胎干细胞分离和体外培养的成功为基因敲除奠定了技术基础。1985年,首次证实的哺乳动物细胞中同源重组(homology recombination, HR)的存在为基因敲除奠定了理论基础[2]。为了编辑基因,传统的靶向特定等位基因的同源重组技术被使用,但是,这
基因敲除小鼠在药物依赖性研究中的应用(一)
基因敲除(gene knockout ) 是 80年代初出现的一项新的基因工程技术, 是制备转基因动物的重要技术之一。利用该技术可以培育先天缺陷某一特定基因的动物, 以此研究该特定基因的生理功能或在疾病发生发展中的意义。近年来基因敲除小鼠在药物依赖性研究中也得到广泛的应用。在传统的药物依赖性
神经科学所通过基因编辑技术敲除整条染色体
中国“青年千人计划”获得者杨辉研究员提出了一项新的研究。这项研究第一次证实了性染色体和常染色体可以通过基因编辑特异性消除。”他认为该方法或有助于治疗唐氏综合征。 中科院神经科学研究所、脑科学与智能技术卓越创新中心杨辉研究组与北京大学胡家志实验室合作完成的一项最新成果发表于国际学术期刊《基因组生
用CRISPR构建诱导性基因敲除人类干细胞系
来自威斯康星大学的研究人员报告称,他们开发出了一种新策略来快速构建诱导性基因敲除(iKO)人类多能干细胞(hPSC)系。相关研究论文发布在7月2日的《细胞干细胞》(Cell stem cell)杂志上 威斯康星大学的张素春(Su-Chun Zhang)教授及助理研究员Yuejun Chen是这
中国专家解读诺贝尔医学奖:“基因敲除小鼠”缘何获奖
首都医科大学宣武医院细胞治疗中心主任张愚8日介绍,本年度诺贝尔生理学或医学奖得主的最大贡献在于,他们创造了一套完整的“基因敲除小鼠”的方式,把任意改变小鼠基因变为现实,不仅可以研究单个基因在动物体内的功能,而且为人类攻克某些遗传因素引发的疾病,提供了药物试验的动物模型。 张愚介绍,所谓“基因敲除小鼠
《Nature》子刊:新CRISPR技术-轻松实现单碱基精确基因敲除
CRISPR-Cas9系统为研究者提供了精准编辑DNA的技术手段,如今,研究人员又利用它开发出了靶向酿酒酵母(S. cerevisiae)单基因的技术,研究人员通过删除DNA序列中1个碱基即可关闭基因。这种基因组级别的生物工程与传统的靶向单个基因或有限数量基因的策略相比,未来将更方便研究者独立研
利用CRISPR/Cas9技术构建基因敲除大鼠及小鼠模型
国际著名生物学期刊《Nature Biotechnology》(2012年影响因子为32.44)于8月8日在线正式发表了上海市调控生物学重点实验室、华东师范大学生科院生命医学研究所刘明耀教授和李大力副教授课题组的最新研究成果。这是继今年6月该课题组在《Nucleic Acids Rese
CRISPR/Cas9完全性基因敲除鼠的鉴定方法
基因工程小鼠基因型PCR鉴定的基本原则是利用基因工程小鼠基因组与野生型小鼠基因组的序列差异,以小鼠基因组DNA为模板进行PCR,并以凝胶电泳比对比不同基因型特异产物的大小,根据条带大小来区分小鼠的不同基因型。上期我们讲述了PCR胶浓度、电泳电压及时间的选择,今天我们就开始学习CRISPR/Cas9完
如何让基因敲除效率提升3倍,价格降低一半?
CRISPR/Cas9基因编辑技术以它效率高、操作简便、成本低等特点被广泛应用于基因敲除小鼠实验中,但是在将RNAs注入受精卵的环节中,传统的显微注射技术需要借助显微操作系统人工逐个进行受精卵注射,十分耗时。同时,想要提高基因敲除的成功率,需要获得更多受精卵,再加上人工设计基因打靶方案耗时费力,