华人学者Nature子刊：人类转录组跨平台靶向分析
来自普林斯顿大学等处的研究人员发表了题为“Targeted exploration and analysis of large cross-platform human transcriptomic compendia”的文章，公布了一种新研发的针对转录组数据的搜索引擎，利用这一平台，研究人员可以分析多种不同的芯片和高通量测序数据，这将会带来多基因搜索数据分析的新浪潮。 这一研究成果公布在1月15日的Nature Methods杂志在线版上。 文章的通讯作者分别为普林斯顿大学的Moses Charikar，Kai Li，和Olga G Troyanskaya，其中李凯（Kai Li，音译）教授早年毕业于吉林大学，获得中国科技大学硕士学位，1986年赴美深造，现为普林斯顿大学正教授终身教职。 生物医学领域进入大数据时代，这一点毋庸置疑，目前整个生物组学的大数据就已经达到10的60次方的数量级，而人类现在只完成了10的21......阅读全文
生物信息分析数据挖掘
DNA芯片技术能够在基因组水平分析基因表达，检测许多基因的转录水平及在不同条件下的基因转录变化，显示反映特征组织类型、发育阶段、环境条件应答、遗传改变的基因谱。基因芯片产生了海量的数据，仅仅进行差异表达分析还远远不够，如何管理分析这些数据、从中挖掘信息已经成为利用这一技术的新的难点。芯片数据大量出现
水德浮游生物大数据平台的使用与数据分析方法
水德浮游生物大数据平台 目前，绝大多数海洋和淡水生态领域的研究机构和业务监测单位，对浮游生物的研究手段还停留在人工镜检及手工测定的阶段，这样经常导致操作过程繁琐、工作量巨大、分析结果滞后，而且需要资深专业技术人员。此平台用于对浮游生物样品进行快速安全清洗、扫描成像、种类鉴定、数量统计、大小测量、生物
生物数据唤醒日常家居
谈到智能物体，多数的家居用品都相当地不够智能。它们蹲在固定位置，了无生气，跟主人毫无交流。但据亚力克斯·罗瑟拉和詹姆斯·克拉厄所言，即使是最不声不响的物体也能拥有神奇的互动性，而这只是个时间问题。这些设计师称，通过身体传达出的数据，家居用品将可以与我们进行互动。 在都柏林科学画廊生命记录展的
分析数据的处理——分析数据的显著性检验
1. 平均值（）与标准值（m）之间的显著性检验 —— 检查方法的准确度 (20)若 t计 ³ t0.95, n 则 与 m 有显著性差异（方法不可靠） t计 < t0.95, n 则 与 m 无显著性差异（方法可靠）2. 两组平
微生物数据分析云平台上线，人人都能做生信分析
GeneDock与中国疾病预防控制中心（中国CDC）传染病预防控制所合作开发的微生物数据分析云平台已于今日正式上线开放（https://analysis.mypathogen.org/）。这一项目由中国疾控中心传染病预防控制所发起，主要是为了提升传染病领域大数据的利用效率，实现高通量测序技术在
生物医疗大数据如何应用？
随着生物科技和医疗技术的迅猛发展、高通量手段的成熟，生物医疗行业的大数据急剧膨胀。然而，与其它行业的数据不同，生物医疗行业的数据呈现分散、破碎、低透明度、以及意义尚等解析等特征。不象其它行业，数据具有时效性以及数据很轻、易于解析；生物医疗行业的数据普遍很“重”、信息量超大、不同的解析策略可能得出
分析数据的处理——可疑数据的取舍
1. Q-检验法 （3~10次测定适用，且只有一个可疑数据） （1） 将各数据从小到大排列：x1, x2, x3……xn ; （2）计算 （x大-x小）, 即 （xn -x1）; （3）计算 ( x可-x邻), （4）计算舍弃商 Q 计 =ô x可-x邻ô/ xn -x1
spss怎样分析数据
spss数据分析的五种方法：1、线性模型；点击分析，一般线性模型，单变量，设置因变量和固定因子，点击确定即可。2、图表分析。3、回归分析，点击分析，打开回归，设置自变量和因变量数据，点击确定即可。4、直方图分析。5、统计分析。SPSS（Statistical Product and Service
分析数据的处理
一. 有效数字及其运算规则 1. 有效数字的意义和位数 （1）有效数字：所有准确数字和一位可疑数字（实际能测到的数字） （2）有效位数及数据中的“ 0 ” 1.0005， 五位有效数字 0.5000， 31.05% 四位有效数字 0.0540， 1.86
计算生物学家为分析解释遗传测序数据开发平台
我们可以在现场获得可操作信息，从而让我们很快地就如何向前推进做出决策。 对于设法治疗无明显致病原因患者的医生来说，基因测序技术可能会为他们指点迷津。但大量的信息也会使其很难快速找到答案。 两三年前，位于秘鲁利马的美国海军医学研究六所（NAMRU-6）的医生必须将其测序数据送往美国分析，这一过
数据的显示与分析
流式细胞仪收集细胞产生的各种电讯号，最终以数字及图式形式表示。每种讯号（除外前向散射光信号）都包括峰值脉冲信号和面积脉冲信号两种。峰值脉冲信号指的是脉冲的高度；面积脉冲信号指的是电压脉冲曲线内区域的大小。一、参数流式细胞仪的数据参数是指仪器采集的用于分析的信号，包括：1.前向散射光（线性、对数）FS
临床生化数据简要分析
1.检验前质量控制 :取样中的错误：采血时不顺利可导致溶血;标本量不足，取材时间不当，标本容器不适当，取样位置不当，标本储存不当，体位的影响，口服药物的影响等。溶血会影响很多项目: 影响比较明显的有ALT,AST,CKMB,LDH,GGT,血钾,铁, 使某些结果假性偏高或假性降低,无法准确测定;
临床生化数据简要分析
1.检验前质量控制 :取样中的错误：采血时不顺利可导致溶血;标本量不足，取材时间不当，标本容器不适当，取样位置不当，标本储存不当，体位的影响，口服药物的影响等。溶血会影响很多项目: 影响比较明显的有ALT,AST,CKMB,LDH,GGT,血钾,铁, 使某些结果假性偏高或假性降低,无法准确测定;
微生物领域数据库及其分析系统建设研究取得进展
中国科学院计算机网络信息中心大数据技术与应用发展部与中科院微生物研究所等，在微生物领域数据库及其分析系统建设方面取得新进展，提出了一种利用语义网技术构建知识图谱的方法，可将冠状病毒相关的毒株、基因组、蛋白序列、蛋白结构、抗体、文献和ZL等多源异构数据映射至资源描述框架（RDF），并构建了基于语义网框
青岛能源所微生物组大数据分析工具开发获进展
元基因组是当前微生物组大数据最主要的存在形式之一。由于元基因组数据的复杂性、异质性以及指数级增长的体量，从中深度且快速发掘微生物群落结构和功能上的变化规律，一直是业界的一个重要技术瓶颈。近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心发表了元基因组高性能计算分析软件Parallel-MET
刘昌孝院士谈大数据分析，是生物医学下个“风口”
自从人类基因组计划启动以来，以第二代高通量测序技术等为代表的各类组学技术飞速发展，推动了基因组、转录组、表观遗传组等生命科学组学数据的指数级增长，把生物医学数据推进到了大数据时代。大数据分析正在成为生物医学领域的下一个前沿，集数据存储、数据共享、数据分析和数据质量控制等融合数据形成大数据应用产业
新的生物信息学工具，可以分析CRISPR合并的筛选数据
由贝勒医学院的研究人员领导的团队开发了一种新的生物信息学工具，可以分析CRISPR合并的筛选数据，并以比其他现有方法更高的灵敏度和准确度确定潜在相关基因的候选基因。新的基于网络的分析工具也更快，更友好，因为它不需要生物信息学培训来使用它。该研究发表在《Genome Research》杂志上。
英国生物库数据开始对外开放
英国生物库数据于3月30日正式面向研究人员开放。通过这一数据库，全球的科学家都可以将近50万英国人的各种健康数据用于研究，这无疑对全球医学研究起到积极的推动作用。 英国生物库项目于2006年8月正式启动，旨在收集大量的生物样本和医学数据用于医学研究。数据收集目标为40岁到65岁的英国人，数
大数据：生物医学变革新契机
“我国目前每年医疗费用总额超过2.4万亿元，如果按照麦肯锡报告的预测，我国医疗领域利用大数据每年将节省医疗费用近2000亿元。”军事医学科学院研究员朱云平在11月29日召开的“第五届重大疾病防治科技创新高峰论坛”上如是说。 大数据影响的深度和广度仍在不断扩张。对于生物医学来说，其发展过程中积淀
植物生物学研究数据库
实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant
生物医学大数据亟待深挖利用
图片来源于网络 “我国是人类遗传资源大国，但不是强国，随着健康中国、大数据等国家重大战略的实施，迫切需要加强对人类遗传资源的深入研究和信息挖掘。” 10月10日，人类遗传资源开发创新研究高层论坛在京召开。中国生物技术发展中心主任张新民坦承，国家人类遗传资源管理和保护涉及生命伦理和国家安全，在资
世界微生物数据中心落户微生物所
在近日召开的第12届国际菌种保藏大会上，经过大会专家委员会评审并经世界菌种保藏联合会理事会审议通过，中国科学院微生物研究所在众多的竞争者中脱颖而出，成为世界微生物数据中心（World Data Center for Microorganisms, WDCM）新的主持单位。 W
微生物所发表中国微生物组数据平台
10月26日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar
生物信息学在基因芯片数据功能分析中的应用
随着人类基因组计划(Human Genome Project)即全部核苷酸测序的即将完成，人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代(Postgenome Era)，向基因的功能及基因的多样性倾斜。通过对个体在不同生长发育阶段或不同生理状态下大量基因表达的平行分析，研究相应基因在生物体内的功能
生物信息学在基因芯片数据功能分析中的应用
随着人类基因组计划(Human Genome Project)即全部核苷酸测序的即将完成，人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代(Postgenome Era)，向基因的功能及基因的多样性倾斜。通过对个体在不同生长发育阶段或不同生理状态下大量基因表达的平行分析，研究相应基因在生物体内的功能，
生物降解分析仪的检测系统和数据处理系统
检测系统： 压力计：灵敏度9.806Pa 内部液为硫酸铜溶液 硬制玻璃材质（安装框材质：丙烯）。 电解盘：容量500ml。电 极：白金（正极）、铜（负极）。 内部液：饱和硫酸铜溶液+5%硫酸。 培养盘：容量500ml（300ml样品培养用）。 空气罐材质：硬制玻璃。 搅拌器材质：
数据分析介绍(II)－Cytoscape
本期为大家介绍一个开放源码的生物资讯软件 –Cytoscape，它可以建构可视化的分子交互作用网络，并可将已有的基因表达信息(gene expression profiles) 整合进此网络中，轻易观察分子间 (蛋白质—蛋白质 或 蛋白质—DNA…) 的关联性。 Cytoscape 是
数据分析介绍(II)－Cytoscape
本期为大家介绍一个开放源码的生物资讯软件 –Cytoscape，它可以建构可视化的分子交互作用网络，并可将已有的基因表达信息(gene expression profiles) 整合进此网络中，轻易观察分子间 (蛋白质—蛋白质 或 蛋白质—DNA…) 的关联性。Cytoscape 是 Ins
论文常用数据分析方法
论文常用数据分析方法论文常用数据分析方法，对好的论文分析研究方法应该从哪些方面展开，如何表达才能显得自己对该论文真的有所理解，应该看哪些书呢？下面我整理了论文常用数据分析方法，一起了解看看吧!论文常用数据分析方法1论文常用数据分析方法分类总结1、 基本描述统计频数分析是用于分析定类数据的选择频数和百
实时定量PCR数据分析
所谓的实时荧光定量 PCR 就是通过对 PCR 扩增反应中每一个循环产物荧光信号的实时检测从而实现对起始模板定量及定性的分析。在实时荧光定量 PCR 反应中，引入了一种荧光化学物质，随着 PCR 反应的进行，PCR 反应产物不断累计，荧光信号强度也等比例增加。每经过一个循环，收集一个荧光强度信号，这