遗传学家开始通过互联网进行在线DNA测试
遗传学家和电脑程序员组成的联盟(自称为世界基因组学与卫生联盟)正在开发一种可以在互联网范围内交换DNA信息的协议。研究人员希望他们的工作在医学领域能够起到重要作用,如同Tim Berners-Lee在1989年发明的HTTP协议在互联网中发挥的作用一样。 该组织第一批示范项目中的其中一个项目是简单的搜索引擎。利用这种引擎,可以梳理出存放在包括谷歌的服务器群和英国莱斯特大学等九个位置的成千上万封人类基因组DNA信件。根据该组织(包括人类基因组项目的核心成员在内)的介绍,搜索引擎是DNA网络的开关,最终是将数以百万计的基因联系到一起。 正在开发的技术被称为应用程序接口(API),可以实现不同基因数据库之间的交流。汇集信息可以加快取得发现的步伐,这些发现涉及的方面是通过将疑似存在基因突变的儿童与已确诊存在基因突变的其他人进行配对,确定何种基因能够并帮助医生诊断出罕见的先天缺陷, 在两年前于纽约召开的一次会议上,因为担心基因组......阅读全文
怎样用david数据库进行基因功能分析
Pathway功能分析及显著性判断对差异表达基因进行Pathway功能分析,并计算Pvalue进行显著性判断,Pvalue越小,表明该pathway变化越显著,并可对每条Pathway通路图进行展示,同时在相应的位置标注差异表达基因。2. Pathway中基因相关性分析根据每两个基因共出现在同一pa
世界最大的自闭症基因组数据库公布
自闭症,或称为自闭症谱系障碍,是指包括了社会技能、重复行为、语言和非语言交流、以及与众不同的优势或差异等多表征型障碍。我们现在得知,自闭症分好多亚型,大多数由遗传和环境共同作用造成。据估计,每68名儿童中就有一人患有自闭症。虽然,目前自闭症的干预方法很多。但是大多数缺乏循证医学的证据。尚无最优治
武汉科研团队破译并公布莲基因组数据库
近日,武汉市园林科学研究院和中科院武汉植物园携手研发出破译荷花遗传密码的莲基因组数据库。日前,该数据库在国际知名学术期刊公布,供各国荷花研究人员免费共享。 据介绍,水生植物莲是地球上最早出现的开花植物之一。研究发现,早在约1.4亿年前蕨类植物和恐龙称霸地球的时代,在北半球许多水域已有莲的分布。
科学家呼吁关注全球基因组数据库污染
样品处理有可能是导致DNA数据库广泛污染的最主要原因 2月16日发表在《公共科学图书馆·综合》(PLoS ONE)期刊上的一份研究报告称康涅狄格大学的遗传学家Mark Longo及同事发现由顶级公共测序机构提供的测序结果构建的基因组数据库中的大约1/5的细菌、植物和非灵长类动物基因
国际癌症基因组联盟公布逾1万个癌症基因组数据
国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium,简称"ICGC")近日向科研界公布了超过1万个癌症基因组的数据。这些数据能更好地帮助全世界的癌症研究者从基因方面了解癌症,加快对癌症的研究并帮助更多癌症靶向治疗的发展。 安大略癌症研究所所
遗传学家开始通过互联网进行在线DNA测试
遗传学家和电脑程序员组成的联盟(自称为世界基因组学与卫生联盟)正在开发一种可以在互联网范围内交换DNA信息的协议。研究人员希望他们的工作在医学领域能够起到重要作用,如同Tim Berners-Lee在1989年发明的HTTP协议在互联网中发挥的作用一样。 该组织第一批示范项目中的其中一个项目是
遗传学家开始通过互联网进行在线DNA测试
遗传学家和电脑程序员组成的联盟(自称为世界基因组学与卫生联盟)正在开发一种可以在互联网范围内交换DNA信息的协议。研究人员希望他们的工作在医学领域能够起到重要作用,如同Tim Berners-Lee在1989年发明的HTTP协议在互联网中发挥的作用一样。 该组织第一批示范项目中的其中一个项目是
-遗传学家:通过互联网进行在线DNA测试
遗传学家和电脑程序员组成的联盟(自称为世界基因组学与卫生联盟)正在开发一种可以在互联网范围内交换DNA信息的协议。研究人员希望他们的工作在医学领域能够起到重要作用,如同Tim Berners-Lee在1989年发明的HTTP协议在互联网中发挥的作用一样。 该组织第一批示范项目中的其中一个项目是
国家基因库全国出生缺陷联盟搭建健康大平台
从国家基因库获悉,自去年7月“国家基因库全国出生缺陷联盟”正式启动至今,已累积收集出生缺陷样本12731份,获取基因数据5000份,建设完成中国最大的出生缺陷样本库以及数据库。 据《中国出生缺陷防治报告(2012)》估计,目前我国出生缺陷发生率在5.6%左右,每年新增出生缺陷数约90万例。
国家农业基因组科技创新联盟在深圳成立
7月24日,时值第19届国际植物学大会期间,国家农业基因组科技创新联盟成立大会在深圳举行,中国农业科学院农业基因组所长黄三文当选联盟理事长。农业部科教司副司长郑芸瑄、中国农业科学院副院长吴孔明、深圳市副市长陈彪出席会议。 据悉,联盟首批成员由中国农科院、中国科学院、中国热带农业科学院、中国农
国家基因库全国出生缺陷联盟搭建健康大平台
国家基因库自2013年3月开始筹建“国家基因库全国出生缺陷联盟”(以下简称:“联盟”),同年7月联盟宣布正式启动,至今已累积收集出生缺陷样本12,731份,获取基因数据5000份,建设完成中国最大的出生缺陷样本库以及数据库。联盟已支撑了43项科研项目,发表了24篇科研论文。 出生缺陷是指婴
《植物学报》英文版基因信息被TAIR数据库收录
《植物学报》英文版(Journal of Integrative Plant Biology,JIPB)已和国际最完善的物种基因功能数据库TAIR建立正式合作关系,TAIR将于2010年5月开始收录发表于JIPB的所有关于拟南芥的基因数据(含过刊)。今后,读者将可以直接从TAIR点击发
全国HIV毒株的基因变异和流行特征数据库建立
为查清我国目前艾滋病病毒HIV-1亚型的种类和变化、新重组病毒的类型及其在人群中的传播特点,并利用其研究成果解决我国HIV防治工作中遇到的实际问题,以中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心牵头,在全国各省疾病预防控制中心的积极配合下开展了我国HIV毒株的基因变异和流行特征研究。该项目日前获得20
北京基因组所开发表观组关联分析数据库
近日,由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核
华中农大建成全球首个水稻基因索引数据库
华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室张建伟教授课题组近日发表最新研究成果,他们建成世界上首个基于同源基因的水稻泛基因组综合数据库——水稻基因索引数据库。据介绍,这个数据库如同一本近义词词典。在数据库里,亚洲稻的每一个基因都能轻松找到同源或相近的基因,以及追踪其演变历史。目前,数据库
华中农大建成全球首个水稻基因索引数据库
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498200.shtm 华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室张建伟教授课题组近日发表最新研究成果,他们建成世界上首个基于同源基因的水稻泛基因组综合数据库——水稻基因索引数据库。 据
我国发布首个柑桔全基因组变异数据库
近日,《园艺研究》(Horticulture Research)在线发表了中国农业科学院柑桔研究所构建完成的柑桔全基因组变异数据库CitGVD(http://citgvd.cric.cn/home),这是第一个园艺类作物全基因组变异数据库。 柑桔是全世界最重要的商业水果作物之一。当前,柑桔类物
南京农大构建世界首个植物重复基因数据库
图片说明:植物界不同类型重复基因含量分布及其随时间变化规律 2月21日,南京农业大学园艺学院教授张绍铃团队在国际著名学术期刊Genome Biology在线发表研究论文,系统鉴定了梨等141种植物基因组中不同类型重复基因,构建世界首个植物重复基因数据库,揭示重复基因进化的普遍规律。 植物在千百年
我国建立灵长类特异新基因数据库并系统预测新基因功能
灵长类特异乃至人特异新基因起源是推动人类表型演化的重要推动力,但只有少量新基因功能已知。近年来基因编辑技术和类器官技术的发展使得系统揭示新基因在人之所以为人这一演化过程中的贡献成为可能。然而,由于基因年龄推断方法的差别以及较低的新基因注释质量(很难区分新蛋白编码基因和假基因),文献中已经发表的灵
深圳国家基因库全国出生缺陷联盟在深顺利启动
2013年7月10日,深圳国家基因库全国出生缺陷联盟启动仪式暨新闻发布会在深圳举行。知名医学专家、相关合作医院以及多家媒体嘉宾出席了活动并共同点亮了寓意降低全国出生缺陷率的爱心灯。 出生缺陷是导致早期流产、死胎、围产儿死亡、婴幼儿死亡和先天残疾的主要原因,不但严重危害儿童生存和生活质量,影
国产仪器示范联盟成为2012产业技术联盟试点
日前,科技部发布了2012年度产业技术创新战略联盟试点名单,其中包括国产科学仪器设备应用示范产业技术创新战略联盟等39个联盟开展产业技术创新战略联盟试点工作,试点期2年。 关于发布2012年度产业技术创新战略联盟试点名单的通知 各省、自治区、直辖市及计划单列市科技厅(委、局),新疆
药企高校联手打造史上最大非洲血统基因数据库
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510572.shtm
国内首个乙肝病毒基因多功能共享数据库建成
近日,国内首个乙型肝炎病毒基因多功能共享数据库在解放军302医院建成并投入使用,其收录了我国10000余例患者乙型肝炎病毒基因序列、基因克隆和相关临床资料,具有较强的生物信息学分析功能,为研究我国患者乙型肝炎病毒基因变异与耐药、分子致病机制、疫苗设计和免疫应答等提供了共享信息平台,也可
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance
华北理工搭建首个蔬菜作物激素基因数据库平台
植物激素对蔬菜和多种作物的耐盐等逆境胁迫和生长发育具有非常重要的作用。激素主要有生长素、乙烯、细胞分裂素、脱落酸和赤霉素等十余类。然而,目前没有一个数据库能够全面展示这些激素在不同蔬菜中的作用及调控模式。这严重制约了激素相关基因的比较和功能组学研究。对此,华北理工大学教授宋小明团队对469种蔬菜及代
期刊数据库更新
图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两年间发表
期刊数据库更新
图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两年间发表的文章数量,
获“产业技术创新联盟”专项支持联盟名单
关于公示“产业技术创新战略联盟促进”科技专项拟支持联盟的通知 各有关单位: 依据《北京市关于促进产业技术创新战略联盟加快发展的意见》,经组织专家评审,提出北京市2011年度拟支持产业技术创新战略联盟名单。单位和个人对名单中联盟有异议的,请自本通知发布之日起5个工作日内以书面形式提出。提
家犬基因组联盟发表dog10K计划白皮书
2016年,来自世界各地的20多位科学家成立家犬基因组联盟,全面深度探讨家犬起源与驯化、人工选择、疾病机制、医学模型等重大科学问题。自成立后,科研工作积极有序进行,近期研究联盟在国际刊物National Science Review上发表dog10K计划白皮书。 研究联盟指出,家犬是行为和表型