遗传学家开始通过互联网进行在线DNA测试
遗传学家和电脑程序员组成的联盟（自称为世界基因组学与卫生联盟）正在开发一种可以在互联网范围内交换DNA信息的协议。研究人员希望他们的工作在医学领域能够起到重要作用，如同Tim Berners-Lee在1989年发明的HTTP协议在互联网中发挥的作用一样。 该组织第一批示范项目中的其中一个项目是简单的搜索引擎。利用这种引擎，可以梳理出存放在包括谷歌的服务器群和英国莱斯特大学等九个位置的成千上万封人类基因组DNA信件。根据该组织（包括人类基因组项目的核心成员在内）的介绍，搜索引擎是DNA网络的开关，最终是将数以百万计的基因联系到一起。 正在开发的技术被称为应用程序接口（API），可以实现不同基因数据库之间的交流。汇集信息可以加快取得发现的步伐，这些发现涉及的方面是通过将疑似存在基因突变的儿童与已确诊存在基因突变的其他人进行配对，确定何种基因能够并帮助医生诊断出罕见的先天缺陷， 在两年前于纽约召开的一次会议上，因为担心基因组......阅读全文
新联盟呼吁负责任的基因组编辑研究和创新
一个欧洲科学家群体创建了一个国际联盟，旨在对基因组编辑技术的伦理使用进行讨论并提供指导，因为这种技术具有改变从食物生产到人类健康再到科学自身等一切事物的潜力。近日，组织者在法国巴黎的一次会议上启动了负责任的基因组编辑研究和创新联盟（ARRIGE）。图片来源：ISTOCK.COM 基因技术能够产
国际大豆种植联盟游说中国：加快转基因品种审批
4月21日，国际大豆种植者联盟（ISGA）在京举办“2015年生物技术与全球大豆贸易论坛”上，21世纪经济报道记者采访了解，国际大豆种植者联盟将会与中国农业部进行沟通，希望中国政策主管部门能加快转基因大豆新品种审批进程。 当天，对外经贸大学教授杨军与中国科学院农业政策研究中心主任黄季焜的报告显
首个近完整黄瓜基因组及多组学综合数据库发布
近日，中国农业科学院蔬菜花卉研究所葫芦科蔬菜遗传育种创新团队在黄瓜基因组学方面取得重要进展，首次完成接近完整的黄瓜参考基因组组装和基因注释，搭建了第一个黄瓜多组学综合数据库。相关研究成果发表在《分子植物》（Molecular Plant）上。 黄瓜是葫芦科的重要经济蔬菜作物。黄瓜基因组中有近3
首个近完整黄瓜基因组及多组学综合数据库发布
近日，中国农业科学院蔬菜花卉研究所葫芦科蔬菜遗传育种创新团队在黄瓜基因组学方面取得重要进展，首次完成接近完整的黄瓜参考基因组组装和基因注释，搭建了第一个黄瓜多组学综合数据库。相关研究成果发表在《分子植物》（Molecular Plant）上。黄瓜参考基因组“9930”和核心种质资源。中国农科院蔬菜所
Nature子刊公布世界最大的自闭症基因组数据库
自闭症，或称为自闭症谱系障碍，是指包括了社会技能、重复行为、语言和非语言交流、以及与众不同的优势或差异等多表征型障碍。我们现在得知，自闭症分好多亚型，大多数由遗传和环境共同作用造成。据估计，每68名儿童中就有一人患有自闭症。虽然，目前自闭症的干预方法很多。但是大多数缺乏循证医学的证据。尚无最优治
BRCA基因突变信息－美国国家癌症研究所启动BRCA数据库
日前，美国国家癌症研究所（NCI）宣布启动BRCA Exchange。这是一个汇集了全球成千上万个遗传性BRCA1和BRCA2基因变异信息的数据库。大众可以通过一个网站和一款智能手机app来获取数据库中的信息。这一数据资源让临床医生们可以参考专家们对不同BRCA基因变异与癌症关系的评估，从而对解
北京基因组所构建出多物种转录图谱综合数据库
随着高通量测序技术的发展，转录组测序（RNA-seq）已成为系统研究基因转录及转录后水平调控状态的常规方法，并在多个物种中得到广泛应用。海量转录组数据以前所未有的速度产生，以数据驱动为导向的大规模数据整合、挖掘与解析面临挑战。为更充分展现转录组数据蕴含的丰富信息，服务生物医学基础研究领域需求，构
贝瑞和康建成全球最大妇科肿瘤基因组数据库
基因组大数据的重大意义开始凸显，贝瑞和康与阿里云合作开展的“神州基因组数据云”项目取得的阶段性成果，便已经收效显著。 9月23日，在第十九届全国临床肿瘤学大会暨CSCO学术年会上，北京贝瑞和康生物技术股份有限公司（以下简称“贝瑞和康”）公布了在生物信息分析领域和大数据建设方面做出的重要成果。
GenBank数据库概述（三）
结构： 1、 结构主页 — 关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划，另外也可以访问分子模型数据库（MMDB）和用来搜索和显示结构的相关工具。 2、 MMDB：分子模型数据库 — 一个关于三维生物分子结构的数据库，结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。MMDB是来源于Brook
核酸数据库的概念
中文名称核酸数据库英文名称nucleic acid data bank定 义DNA、RNA序列的资料库，主要包括已知序列名称、DNA或RNA全序列及其特性，如启动区、起始和终止密码的位置、编码区、限制酶切位点以及推导的翻译产物蛋白质序列等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二级
GenBank数据库概述（一）
1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，包括EMBL和DDBJ。是NIH遗传序列数据库，一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。唯一人类基因序列集合（UniGene），人类基因组基因图
GenBank数据库概述（二）
FTP GenBank and Daily Updates：1. GenBank普通文件格式 — 参见GenBank记录样本和在GenBank公布通知中的详细描述，下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。 2. ASN.1格式 — 摘要句法记号1，国际标准组织（ISO）数据表示格式，下载
GenBank数据库概述（四）
NCBI站点地图---其他基因组数据介绍：1、 小鼠基因组 1) 小鼠基因组资源向导 ：把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起，包括序列，图谱，和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。 2) 小鼠基因组测序：小鼠基因组计划的测序进展，HTG序列contigs（可以用大小和染色体号来浏览）由
深圳法语联盟揭牌
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498282.shtm4月10日，深圳法语联盟在深圳大学正式揭牌，法国驻华大使白玉堂（Bertrand LORTHOLARY），深圳大学校长、中国科学院院士毛军发出席活动，并共同为联盟揭牌。揭牌仪式现场 深
世界骨科联盟成立
由近70个国家和地区的骨科专家组成的世界骨科联盟(WOA)11月15日在中国北京成立，中华医学会骨科学分会主任委员王岩教授任联盟主席。WOA是以提高发展中国家骨科医疗水平为目的的国际学术团体。联盟希望通过成员携手合作，提高中国和其他发展中国家医疗水平、推动医生教育和产品开发等活动，为骨骼与肌肉创
热带高校联盟成立
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512294.shtm11月14日，热带高校联盟成立大会在海南省三亚市举行。 ?热带高校联盟正式成立。海南大学供图热带高校联盟由致力于热带地区高等教育和社会发展的高校，如海南大学、埃及开罗大学
宁夏草业发展联盟、西北百合产业发展联盟成立
7月22日，由中科院农业项目办、宁夏自治区农发办、盐池县政府、隆德县政府共同发起的宁夏草业发展联盟、西北百合产业发展联盟成立大会在银川召开。 优质牧草产业是宁夏自治区党委和政府确定的13个优势特色产业之一。发展优质牧草，能够有效解决围栏封育、生态移民、改善生态环境、调整种植结构等政策的实施
研究人员发布全基因组单核苷酸变异数据库
10月22日，国际学术期刊Genome Biology 以PGG.SNV： understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse popul
最大的海洋微生物基因数据库有助于药物发现
迄今对包括细菌、病毒和真菌在内的海洋微生物基因进行的最全面分析，可为研究人员发现抗生素、追踪气候变化影响和保护濒危物种奠定基础。1月16日，相关成果发表于《科学前沿》。据《自然》报道，2021年，研究人员构建了一个目录，其中包含约3亿组陆地微生物和海洋微生物的基因。现在，沙特阿拉伯阿卜杜拉国王科技大
首个近完整黄瓜参考基因组及多组学综合数据库发布
近日，中国农业科学院蔬菜花卉研究所葫芦科蔬菜遗传育种创新团队在黄瓜基因组学方面取得重要进展，首次完成接近完整的黄瓜参考基因组组装和基因注释，搭建了第一个黄瓜多组学综合数据库。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》（IF5 year = 21.4）上。黄瓜（Cucumis s
北京基因组所开发完成DNA甲基化重编程数据库
DNA甲基化是一个重要的表观遗传标记，在胚胎早期发育过程中起到至关重要的作用，不同物种所采用的机制亦各不相同。因而，整合多个物种的海量甲基化数据并提供在线的数据浏览、获取及其功能分析，可帮助更多研究人员深入探析不同物种在早期发育时期的DNA甲基化差异，并揭示其DNA甲基化重编程过程与机制。
国际人类基因变异组项目设立中国区建立20种疾病数据库
国际人类基因变异组项目（HVP）26日在京为该项目的中国区工作委员会授牌。作为国际人类基因变异组项目的核心成员，中国将在未来5年进行约20种重要疾病的变异基因数据收集、建立分病种数据库，为健康指导提供精准医学指标。 国际人类基因变异组项目是一个由联合国教科文组织支持、来自全球81个国家的成员共
华北理工团队搭建大规模植物开花基因数据库平台
开花是被子植物从营养生长到过渡到生殖生长的重要生物学标志。然而，不同开花调控途径涉及的基因较多，使基因搜集耗时耗力，急需建立一个全面综合的植物开花基因数据共享及分析平台。对此，华北理工大学教授宋小明团队搜集了837个高质量植物基因组，并对其进行了开花基因的鉴定及深入分析，并搭建了“植物开花基因数据库
英、中等国科学家将建耐药结核杆菌基因数据库
英国牛津大学２４日发布消息说，该校将与中国等国的研究人员合作，对来自世界多个地区的结核杆菌样本展开全基因组测序，建立耐药结核杆菌的基因数据库，以便提高对耐多药结核病的诊断和用药效率。 病菌的耐药性问题近年来日渐严峻，耐药结核病更呈迅猛上升趋势。据世界卫生组织介绍，耐多药结核病是耐药结
科学家得到详细的恶性胶质细胞瘤细胞基因组数据库
科学家启动了肿瘤基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas，TCGA)，打算分析所有组织的肿瘤细胞的基因组。脑组织肿瘤是科学家的第一个目标，因为其挑战性大回报也最大。 TCGA收集了多形性成胶质细胞瘤(glioblastoma multiforme，GBM)的组
北京基因组所合作开发完成长非编码RNA数据库
长非编码RNA（Long non-coding RNA, lncRNA）是近年来国际研究的新热点,与人类癌症、神经系统等疾病发生密切相关，在疾病诊疗方面表现出了潜在的重大应用价值。虽然长非编码RNA表达量相对较低，但由于其在转录、基因组印记、翻译、可变剪切、转录后表达调控、蛋白运输与定位等过程的
最大的海洋微生物基因数据库有助于药物发现
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516176.shtm迄今对包括细菌、病毒和真菌在内的海洋微生物基因进行的最全面分析，可为研究人员发现抗生素、追踪气候变化影响和保护濒危物种奠定基础。1月16日，相关成果发表于《科学前沿》。据《自然》报道，
天津大学：新冠病毒基因组注释数据库向全球开放
疫情就是命令！30日从天津大学获悉，该校生物信息中心新型冠状病毒基因组注释数据库上线，并纳入中国国家基因组科学数据中心向全球开放服务。新型冠状病毒基因组注释数据库 ZCURVE_CoV Database 网站截图 面对疫情加快蔓延的严重形势，科技界正在争分夺秒与病毒抗争，开展病毒防治相关药物的
上海生科院发布基因组多样性和祖源信息数据库
该研究分析了涵盖全球范围107个国家的356个人类族群的基因组多样性和祖源信息，并发布了开放获取的专门数据库——PGG.Population（群体基因组学·族群）。PGG.Population是迄今唯一在基因组水平专门解析人类族群遗传关系和祖源信息的公开数据库，也是目前收集族群数量最大的群体基
默克投资750万加元加入结构基因组学联盟
默克公司近日宣布将投资750万加元(约600万美元)加入结构基因组学联盟(SGC)。 默克公司在声明中表示，投资所支持的研究项目是为开发分子探针以研究基因调控的表观遗传机制，探针的应用也将加深对多个疾病领域的生物学理解，尤其是在癌症和炎症性疾病方面。 默克和SGC表示，支