国际知名学者综述:LncRNA分类

美国St. Laurent Institute的Philipp Kapranov教授,是基因组学与系统生物学领域具有重要国际影响的专家,长期从事系统生物学和基因组功能方面的研究,其发现人类基因组能够产生大量的有功能作用的非编码RNA,在概念层次上重新定义了“基因”,这一发现被Science选为最近10年内的10大发现之一。近十年在该领域累计发表国际高级别学术期刊论文50多篇,其中Nature、Science、Cell等国际顶尖期刊论文共计15篇。2014年4月,Philipp Kapranov作为华侨大学生物医学学院特聘教授,成功入选国家第四批“外专千人计划”。 长非编码RNA的研究越来越火热,延伸阅读:一个lncRNA可能是成功受孕的关键。但你是否注意到,lncRNA的命名和分类依然混乱。四月十日,Philipp Kapranov教授在Cell子刊《Trends in Genetics》发表题为“The Landscap......阅读全文

CCAAT转录因子

中文名称CCAAT转录因子英文名称CCAAT transcription factor定  义可与启动子中的CCAAT元件发生特异性相互作用的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

转录因子组成

真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分:亚基RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。复合物某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复

RNA-反转录

            实验材料 poly(A)+RNA 反转录酶 鼠源反转酶  或禽源反转录酶 试剂、试剂盒 oligo

转录的特点

转录时,细胞通过碱基互补的原则来生成一条带有互补碱基的mRNA,通过它携带密码子到核糖体中可以实现蛋白质的合成。与DNA的复制相比,转录有很多相同或相似之处,亦有其自己的特点。转录中,一个基因会被读取并复制为mRNA。就是说,以特定的DNA片段作为模板,以DNA依赖的RNA聚合酶作为催化剂,合成前体

核转录分析

            实验材料 cDNA 0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA 试剂、试剂盒 PBS

转录组测序与转录表达谱测序的异同

转录组测序可以得到特定条件下所有mRNA转录本的丰度信息,从而发现新的转录本和可变剪接体基因表达谱(gene expression profile):指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特

RNA的转录与逆转录相关介绍

转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大

转录组测序和全转录组测序的区别

全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术,可以全面获取样本中转录产物信息,结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制, 进行联合分析,深入挖掘转录水平调控网络。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有

RNA复制的转录与逆转录的过程介绍

  转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成

信使RNA的反转录酶与反转录过程

  定义:以反义RNA为模版,通过反转录酶,进行的RNA转录  1.概念反转录是以RNA为模板合成DNA的过程,也称逆转录。这是DNA生物合成的一种特殊方式。  2.反转录酶与反转录过程  反转录过程由反转录酶催化,该酶也称依赖RNA的DNA聚合酶(RDDP),即以RNA为模板催化DNA链的合成。合

3.3-核转录分析

核转录失控分析时,在体外将细胞核分离出来,然后在放射性同位素标记的核苷酸存在下进行转录,所合成的 KNA 均因掺入同位素而被标记,此混合 RNA 与固定在硝酸纤维素滤膜 h 的某一特定甚因的 DNA 探针杂交,就可以反映出该基因的转录狀态和转录速率。实验材料cDNA0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜酵

RNA-大量转录合成

实验材料 模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒 TE TE 饱和酚 氯仿异内醇 3mol LNaAc 无水乙醇 5X 转录缓冲液 lOOmmoL LDTT RNasin rATPrGTPrUTPrCTP SF6T3 或 T7RNA 聚合酶 异戊醇 DNase 7.5mol L 乙酸铵 无水乙醇 乙醇实验

什么是转录作图?

中文名称转录作图英文名称transcription mapping定  义标明转录物序列在基因组上的位置。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

什么是转录中止?

转录终止: 当RNA链延伸到转录终止位点时,RNA聚合酶不再形成新的磷酸二酯键,RNA-DNA杂合物分离,转录泡瓦解,DNA恢复成双链状态,而RNA聚合酶和RNA链都被从模板上释放出来,这就是转录的终止(termination。

胞外转录反应

实验概要RNA聚合酶由一条多胜肽  (polypeptides)所构成,其在进行转录反应时所须辨认的启动子长度仅20bp左右,而且转录起始位置非常明确,转录效能良好,成了目前进行胞外转录反应时的最佳选择。要进行胞外转录反应时,仅需将目标基因次选殖   (subclone)至带有SP6,T3或T7启动

3.5-RNA-反转录

利用 RNA 模板通过反转录获得 DNA,进而复制和感染细胞实验材料poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶试剂、试剂盒oligo(dT)12-18lmol LTris-Cl1mol LTris-Cllmol LKC125 mmol LMgCl2dNTP 混合物0.lmol LDTT

转录物的概念

中文名称转录物英文名称transcript定  义在DNA模板上由RNA聚合酶催化转录生成的mRNA。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

转录图谱的原理

所有生物性状和疾病都是由结构或功能蛋白质决定的,而已知的所有蛋白质都是由mRNA编码的,这样可以把mRNA通过反转录酶合成cDNA或称作EST的部分的cDNA片段,也可根据mRNA的信息人工合成cDNA或cDNA片段,然后,再用这种稳定的cDNA或EST作为“探针”进行分子杂交,鉴别出与转录有关的基

RNA-标准转录反应

            实验材料 模板 DNA 或质粒 试剂、试剂盒 TE 异丙醇 3mol LNaAc

转录物的定义

中文名称转录物英文名称transcript定  义在DNA模板上由RNA聚合酶催化转录生成的mRNA。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

转录的定义介绍

转录(Transcription)是遗传信息从DNA流向RNA的过程。即以双链DNA中的确定的一条链(模板链用于转录,编码链不用于转录)为模板,以A、U、C、G四种核糖核苷酸为原料,在RNA聚合酶催化下合成RNA的过程。作为蛋白质生物合成的第一步,进行转录时,一个基因会被读取并被复制为mRNA,即特

转录水平的调控

该模型认为在整合基因的5’端连接着一段具有高度专一性的DNA序列,称之为传感基因。在传感基因上有该基因编码的传感蛋白。外来信号分子和传感蛋白结合相互作用形成复合物。该复合物作用于和它相邻的综合基因组,亦称受体基因,而转录产生mRNA,后者翻译成激活蛋白。这些激活蛋白能识别位于结构基因(SG) 前面的

mRNA转录加工过程

加帽即在mRNA的5'-端加上m7GTP的结构。此过程发生在细胞核内,即对HnRNA进行加帽。加工过程首先是在磷酸酶的作用下,将5'-端的磷酸基水解,然后再加上鸟苷三磷酸,形成GpppN的结构,再对G进行甲基化。加尾这一过程也是细胞核内完成,首先由核酸外切酶切去3'-端一些过

转录图谱的定义

转录图谱是在识别基因组所包含的蛋白质编码序列的基础上绘制的结合有关基因序列、位置及表达模式等信息的图谱。在人类基因组中鉴别出占具2%~5%长度的全部基因的位置、结构与功能,最主要的方法是通过基因的表达产物mRNA反追到染色体的位置。

转录组测序原理

而转录组测序即是利用高通量测序技术,将细胞或组织中的全部或部分mRNA, miRNA, lnc RNA 进行测序分析的技术。通过RNA-seq,也就是转录组测序,可以帮助我们了解各种比较条件下所有基因的表达差异包括:正常组织与肿瘤组织;药物治疗前后的表达差异;发育过程中,不同发育阶段,不同组织的表达

RNA-标准转录反应

实验材料 模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒 TE 异丙醇 3mol LNaAc 无水乙醇 5×转录缓冲液 l00 mmol L DTT RNasin rATPrGTPrUTP 各 2.5 mmol L [α42P] rCTP SPGT3 或 T7RNA 聚合酶 TE-饱和的酚氯仿异戊醇 DN

tRNA转录加工过程

主要加工方式是切断和碱基修饰。真核生物tRNA前体一般无生物学特性,需要进行加工修饰。加工过程包括:(1)剪切和拼接tRNA前体在tRNA剪切酶作用下,切成一定大小的分子。大肠杆菌RnaseP特异切割tRNA前体5′旁侧序列,3′-核酸内切酶如RnaseF可将tRNA前体3′端一段序列切下来。Rna

转录的过程介绍

在转录过程中,DNA模板被转录方向是从3′端向5′端;RNA链的合成方向是从5′端向3′端。RNA的合成一般分两步,第一步合成原始转录产物(过程包括转录的启动、延伸和终止);第二步转录产物的后加工,使无生物活性的原始转录产物转变成有生物功能的成熟RNA。但原核生物mRNA的原始转录产物一般不需后加工

RNA-大量转录合成

            实验材料 模板 DNA 或质粒 试剂、试剂盒 TE   TE 饱和酚   氯仿

转录因子活性ELISA

转录因子活性ELISA是建立在ELISA基础上的高灵敏度的检测方法,比EMSA的灵敏度高l0倍,在5h内就能完成。不涉及放射性和凝胶电泳,安全简便,而且这种微孔板的形式能同时检测1—96个样品。ArrayStarTM转录因子活性ELISA试剂盒可以快速、灵敏地检测细胞核提取物中转录因子的DNA结合活