专访柴之芳、张新荣:金属组学将使原子光谱迎来第二春
分析测试作为新兴学科,即使对于很多原子光谱领域的科研工作者来说,“金属组学”都是一个新名词。金属组学是一门旨在研究生物体系内金属元素的分布、化学种态、含量、结构特征、功能及其应用的新兴学科,与基因组学和蛋白质组学紧密相关。开展金属组学研究可以深入认识金属的生物效应及作用机理,进一步探究与金属相关疾病的发生机制,也可以为金属药物的设计提供依据。2002 年Haraguchi等人提出了“金属组学(metallomics)”这一术语,认为“金属组学是继基因组学、蛋白质组学和代谢物组学之后的一种新的组学”,目前金属组学研究已经得到长足发展并有了相关的刊物。 2015年第十二届中国分析化学年会上,分析测试百科网采访了中国科学院高能物理研究所柴之芳院士和清华大学理学院化学系张新荣教授,两位专家就金属组学的现状和发展发表了自己的看法。 中国科学院高能物理研究......阅读全文
前沿:空间转录组学研究案例简析
上一期,我们介绍了空间转录组测序产品,对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品,用起来到底好不好使呢?我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。 01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1] 影响因子:11.878 发表时间:2018.06 发表期刊:Nat C
临床代谢组学研究常见问题(一)
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后,所收集到的常见问题,供大家学习和参考。 Q:如何设置验证集和测试集? A:按我理解你想问的问题是:training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这
临床代谢组学研究常见问题(一)
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后,所收集到的常见问题,供大家学习和参考。 Q:如何设置验证集和测试集? A:按我理解你想问的问题是:training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这
蛋白质组学研究-可投哪些期刊?
蛋白质作为功能的直接行使者,已经被科研工作这广泛应用于不同领域中,目前蛋白组学有很多优秀的科研成果,在各个领域及期刊上发表,其中也不乏CNS在内的顶级期刊。那我们的蛋白组学文章可以投哪些期刊呢?了解已发表文章的情况可以帮助我们很好的解决这个问题。这里,我们以“Proteomics”为关键词,
糖组学的概念、研究技术和应用
概念:醣体学(Glycomics)是生物学的一个学门,专门研究寡醣类(oligosaccharide)构造与功能。Glycomics一词是从表示糖或甜味的「glyco-」与基因体学(genomics)和蛋白质体学(proteomics)之命名规律而来。此规律也导致了醣体(glycome)一字的出现,
蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
第五届金属组学国际研讨会圆满落幕
分析测试百科网讯 2015年9月9日-12日,第五届金属组学国际研讨会(The 5th International Symposium on Metallomics)在北京西郊宾馆召开,会议由中国科学院科院高能物理研究所、清华大学共同主办,邀请金属组学领域国际著名的专家、学者
重大科学项目“抑郁症的蛋白质组学和多肽组学研究”启动
近日,国家重大科学研究计划项目“抑郁症的蛋白质组学和多肽组学研究”在渝启动。“抑郁症的蛋白质组学和多肽组学研究”项目是由重庆市科委组织推荐,由重庆医科大学牵头并联合军事医学科学院、武汉大学生命科学院、中南大学4家国内知名高校共同组织向科技部申报,于2008年底正式批准立项,这是我市围绕“蛋白质、
岛津携手质谱专家,北京共话组学发展 ——2023北京质谱专家沙龙组学专题会议
2023年8月17日,岛津企业管理(中国)有限公司举办的“2023质谱专家沙龙-组学专题会议”在北京成功召开。会议旨在促进质谱及组学行业专业人士交流、学习与合作。来自于国内各大高校及科研院所的四十余位专家学者参加了本次会议。 会议现场 主持人 岛津企业管理(中国)有限公司,分析计测事业部营业部,北京
研究人员开发定量蛋白质组学数据的下游分析工具
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507985.shtm
Illumina副总裁:基因组学如何影响肿瘤学未来的发展?
专访Illumina肿瘤业务营销副总裁John Leite 基因组学正在改变肿瘤研究,其最终目标是推进癌症的诊断、治疗、监控及最终的筛查方式。Illumina的肿瘤业务营销副总裁John Leite介绍了这一领域的最新进展,以及随着今天的研究转化为临床,他对未来的期望。 基因组学如何影响肿瘤
深度解读:个人基因组学的现状与发展
什么是Personal Genomics? Personal Genomics,一般翻译为“个人基因组学”。是基因组学的一个分支,主要关注个人基因组的测序和分析。 1990年开始发起的浩大的“人类基因测序计划”是从大量的个体中获取基因信息,综合之后建立一个具有“参考价值”的人类“平均”基因组
与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有何优点
那年夏天Forever与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有以下优点:①代谢组学放大了基因和蛋白表达的微小变化,从而使检测更容易;②代谢组学的研究不需建立全基因组测序及大量表达序列 标签(EST)的数据库,且代谢产物的种类要远小于基因和蛋白的数目.③ 由于给定的代谢产物在每个组织中都是一样的,所以研究
“空间定位组学”和“4D组学”建起科学研究与疾病治疗的桥梁
分析测试百科网讯 布鲁克一直以MALDI技术闻名全球,并已在成像领域占据领导地位;自去年推出timsTOF Pro创新组学系统后,在深度覆盖和高通量蛋白质组学分析中取得了突破性的进展,并且迅速和国内院校和企业开展了一系列深度的合作。比如timsTOF系列,已和北京大学、清华大学、复旦大学、厦门大
综述:基于质谱技术的糖蛋白质组学与糖组学研究进展
糖是组成生命体的四大类重要分子之一,糖蛋白质是由糖链与肽链中的特定氨基酸残基以糖苷键共价连接而成的蛋白质。糖蛋白质普遍存在于生物体内,在很多生命过程中起着重要作用,如蛋白质的折叠、细胞之间的相互识别、炎症反应等。同时,糖基化修饰在疾病中,特别是肿瘤的发生、发展和转移过程中也起到重要作用,许多疾
大连化物所等肝癌代谢组学研究取得进展
近日,中科院大连化学物理研究所许国旺研究员领导的高分辨分离分析及代谢组学研究团队(1808组)与上海东方肝胆医院王红阳院士课题组合作,将基于液相色谱-质谱用于肝癌组织非靶标代谢组学研究并取得了重要进展,相关研究成果已经在线发表在Cancer Research杂志上。 原发性肝癌是全球最
外泌体及其蛋白质组学研究
外泌体是什么? 外泌体(Exosome),是一种能被大多数细胞分泌的微小膜泡,具有脂质双层膜结构,直径大约40-200 nm。外泌体存在于体液中,包括血液、唾液、尿液和母乳等,不同组织来源的外泌体在内容物组成和功能方面存在差异,这种差异受到细胞外基质和微环境的动态调控。越来越多的证据表明,宿主
研究发布大豆多维组学数据库SoyOmics
大豆(Glycine max (L.) Merr.)是重要的粮油作物之一,其产量提升、品质改进关乎全球人口的需求和利益。高通量测序技术的发展促使大豆组学研究不断深入。实现大豆多维组学数据的整合分析,将会为大豆遗传育种提供有力支持。 近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜团队联合北京基因组
作物基因组学研究进展(二)
⑵小麦基因组研究小麦是全球最重要的粮食作物之一,小麦的稳产和增产对我国乃至全世界粮食安全的影响举足轻重。近年来由于全球气候变化、环境变化的影响,小麦生产面临严峻的挑战,对于小麦的育种和品种改良工作提出了新的要求。普通小麦(Triticum aestivum L.)是3个不同亚基因组形成的异源
长寿的代谢特征代谢组学研究的启示
长生不老是人类自古以来的夙愿。 中国古代神话故事中,有菩提老祖的大品天仙诀,王母娘娘盛会上的蟠桃,太上老祖炼丹炉里的不老丹,还有妖怪们梦寐以求的唐僧肉都可以实现长生不老。在史学瀚海中,《史记》记载秦始皇东巡碣石,携童男童女入海求仙,寻求长生不老药;在现代科学中,衰老仍然是生物医学领域热门主题之
蛋白质组学研究的策略和范围
蛋白质组学一经出现,就有两种研究策略。一种可称为“竭泽法”,即采用高通量的蛋白质组研究技术分析生物体内尽可能多乃至接近所有的蛋白质,这种观点从大规模、系统性的角度来看待蛋白质组学,也更符合蛋白质组学的本质。但是,由于蛋白质表达随空间和时间不断变化,要分析生物体内所有的蛋白质是一个难以实现的目标。另一
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息
作物基因组学研究进展(一)
作物基因组学研究进展农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展,已经实现对重要农作物,如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序,在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了2018年度主要农
蛋白组学的研究意义是什么
蛋白质组学,是以蛋白质组为研究对象,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。这个概念最早是在1994年,由Marc Wikins首先提出的新名词。 随着人类基因组计划的实施和推进,生命科学研究已进入了后基因组时代。在这个时代,生命科学的主要研究对象是功能基因组学,包括结构基因组研究
安捷伦科技资助定量蛋白质组学研究
安捷伦科技通过都柏林国立大学 Newman 奖学金计划 资助定量蛋白质组学研究 2010 年 5 月 12 日,加利福尼亚州圣克拉拉市和爱尔兰都柏林市 — 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)和都柏林国立大学(University College Dublin, UCD)今日宣布 Ben
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息。如
植物表型组学研究平台建设及技术应用
在生物学和遗传育种领域,表型是指构成生物体的全部特征,包括外观、基本维度、形态和颜色,是基因型和环境因素互相作用的结果。表型采集分析是指以定性和定量的方式测量这些特征。表型组(phenome)则是指某一生物的全部性状特征,不仅局限于农艺性状,还包括植株所表现出来的生理状态及生化组分。随着许多重要作物
作物基因组学研究进展(三)
⑸棉花基因组研究棉花是重要的天然纤维和油料作物,也是研究多倍体进化和作物驯化的重要模式植物。南京农业大学张天真等课题组通过将栽培棉与野生棉对比,绘制出了棉花表观遗传基因的“甲基化基因图谱”,对野生棉和栽培棉之间超过1200万个的差异甲基化胞嘧啶进行分析,鉴定出519个表观等位基因(epiallele
大连化物所蛋白质组学研究取得进展
蛋白质甲基化是一种非常重要的翻译后修饰现象,其甲基供体为S-腺苷甲硫氨酸(SAM)。由于甲基化可发生在氨基酸残基的N-,O-和S-中心,并且N-中心甲基化还存在不同状态,同时甲基化对分离行为影响非常细微,限制了对蛋白质甲基化组的解析。常规基于抗体的研究策略仅捕获了部分N-中心甲基化的信息。中国科