上海生科院发表关于神经系统环形RNA研究的专评

6月4日,国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员陈玲玲和计算生物学研究所研究员杨力题为Gear up in circles的专评,对当期Molecular Cell 和4月刊Nature Neuroscience 上发表的两项“神经系统中环形RNA”的研究工作进行了点评和推荐。 真核生物蛋白编码基因在转录生成前体RNA后,通常会通过RNA剪接将含有蛋白编码信息的外显子序列顺序地连接在一起,形成成熟的线形mRNA分子。有意思的是,在真核生物体内还存在特殊的反向剪接反应(back splicing),使得下游外显子序列反向与上游外显子连接环化,最终产生环形RNA分子(circular RNA)。最新的研究表明,在高等真核转录组中存在大量的环形RNA新分子,其生成加工受到顺式作用元件和反式作用因子的调控。虽然环形RNA在模式生物果蝇的大脑中高......阅读全文

北京生科院建立单细胞环形RNA分析技术及表达图谱

  环形RNA是一类在真核细胞中广泛存在的内源性非编码RNA分子,在生物体发育过程中发挥重要作用。之前研究已在不同物种中鉴定出数百万个环形RNA分子,并产生了大量用于揭示生物体组织表达模式的环形RNA数据资源。然而,由于大多数环形RNA表达量较低,传统的转录组测序方法无法表征单个细胞环形RNA表达谱

环形RNA获新研究进展

  9月18日,国际著名学术期刊《细胞》在线发表了中科院上海生命科学研究院计算生物学伙伴研究所杨力课题组和生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲课题组关于环形RNA研究的最新进展。该研究成果首次阐明了互补序列对外显子来源环形RNA产生的调节机制,并进一步揭示了互补序列竞争性配对介导的可变环化调控,以全新的

环形RNA可变反向剪接和可变剪接表达图谱被系统绘制

  6月30日,国际学术期刊Genome Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所杨力研究组和生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于环形RNA研究的最新进展:Diverse alternative back-splicing and alternative spl

赵方庆团队开发环形RNA定量和差异表达分析新方法

  2020年1月3日,中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-通讯》(Nature Communications)杂志上发表题为Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform sw

太阳环形耀斑及其相关活动研究获进展

  太阳耀斑是太阳大气中短时间内剧烈的能量释放过程。环形耀斑(CRF:circular-ribbon flare)是TRACE太阳探测器于2009年发现的一种特殊耀斑,通常由一个圆形或椭圆形亮带和内部致密的亮带组成,具有特殊的磁拓扑结构。日冕暗化(coronal dimming)则是与太阳耀斑爆发相

生物艺术:“随机”的造物表达

  基因,在艺术家的眼中,褪去了科学赋予其固有的硬壳,从内而外地打破了不同物种之间高低等级的界限,真正自由地融合,表达出生命本真的意义。  在近期举办的“中国当代艺术收藏系列展 李山”中,60只2米高的“蜻蜓人”翱翔在展览入口的上空。这些蜻蜓人是以李山自己的身体为模型,在基因层面上,将靠近人类头部和

研究开发出高效环形RNA检测与定量工具

近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)高远团队与动物研究所赵方庆团队,开发出面向TB级转录组数据的高效环形RNA检测与定量工具CIRI3,通过反向剪接序列比对与跨样本整合算法设计,实现了TB级数据的超高速处理,并可高灵敏识别低丰度及非传统剪接信号的新型环形RNA,突破了环形RNA大规模

生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功...(一)

生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功能学检测RealTime ready 应用生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功能学检测RealTime ready应用 Sabine Lohmann*, Andrea Herold*, Tobias Bergauer#, Anton Belouso

《基因组生物学》—夏庆友小组—家蚕基因表达研究

日前,国际生物学权威期刊《基因组生物学》在线发表了西南大学蚕学与系统生物学研究所夏庆友教授领衔的课题组关于利用家蚕全基因组芯片分析家蚕多种组织基因表达特征的最新研究成果。 家蚕是重要的经济昆虫,既能用于蚕丝的生产、也能作为生物反应器生产外源蛋白;同时,家蚕也是鳞翅目昆虫生化、分子遗传以及基因组研究的

生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功...(三)

靶基因表达标准化参考基因选择对于相关定量分析来说,通过参考基因表达进行靶基因表达标准化。理想情况下,标准化处理应该能够补偿 RNA/cDNA起始量变异情况,以及cDNA合成或 PCR 扩增中潜在抑制剂的作用。参考基因作为内源性样本材料对照,工作流中,与靶基因一同被处理。为获取可靠结果,标准化

生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功...(四)

FFPET 样本特异性RealTime ready qPCR检测潜在生物标志物假设检验我们使用的第一套临床样本来自于各种用于人类研究的福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织。肿瘤来源的 FFPE  组织是临床试验或生物标志物研究中,治疗复合物研发最具有相关性的样本材料。使用 High Pure

生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功...(二)

材料与方法 细胞培养于标准条件下进行肿瘤细胞系(ACHN、Caki、SJSA、PANC-1、MDA-MB231、AsPC-1、SK-MES、NCI-H322M、22RV1)培养。使用TWEAK或 Anti-TWEAK(RO5458640)分别对细胞进行处理。于不同时间点收集肿瘤细胞系(0、6、2

原核生物基因表达调控途径

真核:转录和翻译分地点进行,转录在核,翻译在基质,翻译是第一个氨基酸是甲硫氨酸,调控方式复杂,多层次,区间性原核:转录和翻译都在基质甚至没转录完就开始翻译,翻译是第一个氨基酸为甲酰甲硫氨酸,调控机制多为操纵子原核生物没有内含子,dna复制和转录相对较容易也比较简单,调控几乎完全由基因上游的rna聚合

研究称环境影响基因表达

   随环境改变“脾气”的小蜜蜂  几年前,美国伊利诺斯大学阿巴纳香槟分校昆虫学系的吉恩·E·鲁滨逊教授,请墨西哥南部的伙伴帮他捕获了1000只新生的小蜜蜂——500只性情温和的意大利蜜蜂和500只生性凶猛的非洲蜜蜂。这两个蜜蜂亚种在基因上相似得几乎难以分辨,但后者却在领地防御上厉害很多。  鲁滨逊

北京生科院在环形RNA研究领域取得新进展

  6月28日,国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组实验室赵方庆团队题为Comprehensive identification of internal structure and alternative splicing even

阐述原核生物基因表达调控途径

这个题目在微生物学上是整整一章的内容,所以要想详细叙述太难了,我大概给你列出吧。转录水平调控:1.操纵子的转录调控;2.分解代谢物阻遏调控;3.细菌的应急反应;4.通过σ因子更换的调控;5.信号转导和二组分调节系统;6.噬菌体溶源化和裂解途径的转录调控。转录后调控:1.翻译起始调控;2.mRNA的稳

保定米奇生物:体外蛋白表达系统特点

在大肠杆菌蛋白表达实验中,我们经常会遇到蛋白表达不出来、表达出的蛋白没有活性、蛋白表达过程中容易形成包涵体等情况,还要分析出现这些情况的原因。1、目的蛋白不适合在大肠杆菌中表达。包括稀有密码子、mRNA结构、跨膜区等;2、表达条件需要进一步优化。比如温度、分子伴侣、适合的表达宿主等;3、采用哪种温和

研究揭示环形RNA促进相分离调控肿瘤发展分子机制

  环形RNA是由pre-mRNA通过反向剪接形成的闭合环状RNA分子,在生物体内可发挥miRNA海绵、结合蛋白以及翻译成短肽等分子功能来调控各种生理和病理过程。与线性mRNA相比,环形RNA独特的环状结构使其具有更高的稳定性,在细胞内可更稳定地存在。因此,环形RNA更适合作为肿瘤的分子标志物及治疗

Science开发创新基因表达研究方法

  来自卡罗林斯卡学院和瑞典皇家理工学院(KTH)的科学家们,开发出了一种高分辨率的新方法来研究组织中活化的基因。这种方法可用于所有的组织类型,对于临床前研究和癌症诊断均具有价值。他们的研究结果发布在7月1日的《科学》(Science)杂志上。  疾病会改变组织中一些RNA分子和蛋白质的表达。在实验

海生院发现NF90/NF110对环形RNA表达调控和功能作用新机制

  6月15日,国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)在线发表了中国科学院-马普计算生物学研究所杨力研究组和中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于环形RNA(circRNA)研究的最新进展:Coordinated circRNA biogenesis

简述生物体内控制基因表达的机制—基因调控的研究方法

  1、筛选突变型  这是在原核生物中广泛应用的方法,例如在乳糖操纵子的研究中筛选失去了基因调控能力的组成型,包括调节基因发生突变和操纵基因发生突变的突变型,以及筛选即使有乳糖或其他诱导物存在的情况下仍然不能合成β-半乳糖糖苷酶的超阻遏型等等。  2、激素诱导  在高等的真核生物中,除了离体培养的体

真核生物与原核生物基因表达调控的差异

原核生物同一群体的每个细胞都和外界环境直接接触,它们主要通过转录调控,以开启或关闭某些基因的表达来适应环境条件(主要是营养水平的变化),故环境因子往往是调控的诱导物。而大多数真核生物,基因表达调控最明显的特征是能在特定时间和特定的细胞中激活特定的基因,从而实现“预定”的,有序的,不可逆的分化和发育过

显微镜环形灯

显微镜环形灯LED灯采用控流开关电源技术,体积小,重量轻,能效高,发热量小,环保,输出稳定,纹波小,寿命长等优点。输入功率:3W荧光灯源具有光效高、耗电省、显色性好,长时间照明不疲劳等优点。是新一代理想的绿色照明光源。我们一直秉诚信经营、质优价廉、真诚服务的作风、以及互惠互利的原则,为客户提供理想的

E花环形成试验

实验目的 1.掌握T淋巴细胞E花环试验的原理、正常值,了解其方法和用途。2.熟悉光镜下E花环的形态和计数方法。实验原理 T细胞表面具有能与绵羊红细胞(SRBC)表面糖肽结合的受体,称为E受体(CD2)。已证实E受体是人类T细胞所特有的表面标志。当T细胞与SRBC混合后,SRBC便粘附于T细胞表面,呈

环形变压器

使用环境                                            1、周围空气温度-30℃至+40℃,24小时的平均值不超过+35℃;超过+40℃时变压器的负载能力下降,低于0℃以下时,变压器的负载能力上升,负载功率可略超出额定功率。在-30℃的低温环境并不影响环形变压

酶催化八元氧杂桥环形成机制研究获进展

  中国科学院深圳先进技术研究院研究员周佳海与上海有机化学研究所研究员唐功利课题组等合作,在《自然-催化》(Nature Catalysis)上,在线发表了题为Enzymatic catalysis favours eight-membered over five-membered ring clo

关于原核生物的基因表达调控介绍

  原核生物的基因表达调控虽然比真核生物简单,然而也存在着复杂的调控系统,如在转录调控中就存在着许多问题:如何在复杂的基因组内确定正确的转录起始点?如何将DNA的核苷酸按着遗传密码的程序转录到新生的RNA链中?如何保证合成一条完整的RNA链?如何确定转录的终止?  上述问题决定于DNA的结构、RNA

关于真核生物基因表达调控的介绍

  真核生物基因表达调控与原核生物有很大的差异。原核生物同一群体的每个细胞都和外界环境直接接触,它们主要通过转录调控,以开启或关闭某些基因的表达来适应环境条件(主要是营养水平的变化),故环境因子往往是调控的诱导物。而大多数真核生物,基因表达调控最明显的特征是能在特定时间和特定的细胞中激活特定的基因,

概述杆状病毒表达系统的生物特性

  杆状病毒(又称多角体病毒或颗粒体病毒)有两类病毒体[1],芽殖病毒体(buded virion,BV)和多角体源性病毒体(polyhedron derived virion,PDV)。在病毒复制过程中,首先产生BV,BV核壳产生后通过芽生方式从细胞中释放出来,再感染其它细胞,复制后期产生PDV,

真核生物基因表达调控有哪些环节

可分为三种主要途径环节:1、遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2、调控转录因子与转录机制相互作用,3、表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。转录调控通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合位点,具