余永国:测序技术如何实现“精准”的疾病诊断?
为人父母,经常为孩子们的身体和智力发育落后而担忧,尤其当遇到传统医学无法检测的“罕见病”病因时,父母倍感焦急甚至乱投医。随着现代生物技术的迅猛发展,上海交通大学医学院附属新华医院正在采取一些新型的诊断方法,使得原来的“试错模式”向“精准诊断”转变,患儿也不用因未知病因而被延误治疗。 这些新型的技术适合于哪些人群?它是如何对儿童疾病进行早期筛查和诊断的?它采用的是什么技术和平台?它可以用于产前诊断吗?父母们如何在第一时间接触到这些技术? 针对上述疑问,生物探索记者有幸采访到了新华医院儿童内分泌/遗传科的余永国医师。余博士早年在美国哈佛大学医学院进修分子诊断多年,在遗传性罕见病的分子诊断方面有着极其丰富的经验,回国后成功搭建了基因芯片和二代测序研究与诊断平台;并将全基因组高分辨芯片和二代测序应用于临床诊断,为提高孤独症、智力落后、多发畸形、罕见病等疾病的遗传诊断率与转化研究做出了重要成绩。 以下是生物探索对余博士的采访实录......阅读全文
遗传病的基因诊断
根据出生缺陷监测和残疾儿调查结果显示,我国是出生缺陷高发国家,每年有近100万出生缺陷儿发生,30%在出生前后死亡,40%造成终生残疾,只有30%可以治愈或纠正。在这些出生缺陷儿中,80%是由于遗传因素造成的。如果能对这些患儿进行症状前诊断或产前诊断,给予及时而适当的治疗和预防,其经济和社会效益是不
基因缺失型遗传的诊断(1)α地贫的基因诊断
α地贫主要是由于基因缺失引起的,缺失的基因可以由1-4个。正常基因组用BamHⅠ切割,可以得到一个14kb的片段,而缺失一个α基因时切点向5’端移位,得到一条10kb的片段。因此,当用α基因探针与基因组DNA进行Southern杂交时(图13-8),在α地贫2可见一条14kb和一条10kb的带,在正
基因缺失型遗传的诊断方法
(1)α地贫的基因诊断:α地贫主要是由于基因缺失引起的,缺失的基因可以由1-4个。正常基因组用BamHⅠ切割,可以得到一个14kb的片段,而缺失一个α基因时切点向5’端移位,得到一条10kb的片段。因此,当用α基因探针与基因组DNA进行Southern杂交时(图13-8),在α地贫2可见一条14kb
遗传病的基因诊断选择
一、直接诊断和间接诊断 基因诊断可分为两类:一类是直接检查致病基因本身的异常。它通常使用基因本身或紧邻的DNA序列作为探针,或通过PCR扩增产物,以探查基因无突变、缺失等异常及其性质,这称为直接基因诊断,它适用已知基因异常的疾病;另一类是基因间接诊断。当致病基因虽然已知但其异常尚属未知时,或致
遗传病与肿瘤的基因诊断
从DNA水平上寻找确诊遗传病的指标或探讨遗传病和肿瘤的病因等方面,已取得很大成绩,这对产前诊断,早期确诊和突变基因携带者的检出等都有重要意义。所用的方法大体有以下几种。 一、分离基因进行结构分析 利用DNA离体转化,制备探针,制备基因文库进行筛检,最后鉴定载体中插入DNA片段的特性等一系列技术,
遗传病与肿瘤的基因诊断
从DNA水平上寻找确诊遗传病的指标或探讨遗传病和肿瘤的病因等方面,已取得很大成绩,对产前诊断,早期确诊和突变基因携带者的检出等都有重要意义。所用的方法大体有以下几种。 一、分离基因进行结构分析 利用DNA离体转化,制备探针,制备基因文库进行筛检,最后鉴定载体中插入DNA片段的特性等一系
基因检测:尽早诊断儿童遗传性疾病
“我国开展儿童遗传病的研究正是最好的时候,由于基因测序技术蓬勃发展,为新生儿遗传病的检测提供了简便有效的手段”。日前,来自复旦大学附属儿科医院儿童发育与疾病转化医学研究中心、上海市出生缺陷防治重点实验室的王慧君副研究员在接受科技日报采访时告诉记者。 为儿童遗传病提供有效手段 1990年,住在
基因异常不明的遗传病的诊断方法
基因异常不明的遗传病的诊断 成年型多囊肾病(adult polycystic kidney disease,APKD)是一种常染色体显性遗传病,发病率高,约1000人中有1名致病基因的携带者,起病较晚,多在30岁以后,主要为肾和肝中出现多发性囊肿,临床表现为腰疼、蛋白尿、血尿、高血压、肾盂肾炎、肾结
最新遗传性反复发热基因诊断指南
图为拟定的遗传性反复发热基因诊断报告模版。该图以隐匿性疾病为例,显示了最低限度的报告项目。理想报告应加亮标出主要结果且不超过1页。HGVS:人类基因组变异学会 遗传性反复发热(HRF)是以发热反复发作和浆膜炎为特征的一组单基因自身炎症性疾病,这种疾病由参与重要自然免疫的调节基因发生致病性突
上海儿童医院与浪潮合作推进罕见病基因诊断
上海市儿童医院正利用浪潮基因一体机G100开展多个儿童罕见病研究项目,而这些项目将让成千上万名罹患罕见病的儿童从中获益。 据了解,目前国际公认的罕见病有近7000种,但仅有不到5%的罕见病能被有效干预或治疗。研究发现,约80%的罕见病由基因缺陷导致。因此,测序罕见病的基因组是预防与治疗此类疾病
上海儿童医院与浪潮合作推进罕见病基因诊断
上海市儿童医院正利用浪潮基因一体机G100开展多个儿童罕见病研究项目,而这些项目将让成千上万名罹患罕见病的儿童从中获益。 据了解,目前国际公认的罕见病有近7000种,但仅有不到5%的罕见病能被有效干预或治疗。研究发现,约80%的罕见病由基因缺陷导致。因此,测序罕见病的基因组是预防与治疗此类疾病
因美纳与迪拜医院合作,促进重症儿童基因诊断
位于阿拉伯联合酋长国迪拜的 Al Jalila 儿童专科医院近日表示,它已与因美纳签署协议,合作进行快速全基因组测序以诊断重症儿童。 根据协议条款,合作伙伴将合作开展一项为期两年的临床 rWGS 对新生儿和儿科护理单位影响的研究。该研究将包括 200 名 18 岁以下的儿童及其父母。 因美纳将
多基因遗传与数量遗传
多基因遗传(polygenic inheritance)是指生物和人类的许多表型性状由不同座位的较多基因协同决定,而非单一基因的作用,因而呈现数量变化的特征,故又称为数量性状遗传。多基因遗传时,每对基因的性状效应是微小的,故称微效基因(minor gene),但不同微效基因又称为累加基因
多重PCR在遗传病诊断方面的应用基因重排
免疫球蛋白( immunoglobulin,Ig)和T细胞受体( T cell receptor,TCR)位点包含很多不同的V、D、J基因片段,参与早期白细胞分化的重排过程。VDJ片段重排由重组酶复合体介导,其中RAG1和RAG2蛋白通过识别、切割DNA重组信号序列( recombinatio
中国制定单基因遗传性心血管疾病基因诊断指南
由专家历时一年半、多次修改制定的《单基因遗传性心血管疾病基因诊断指南》24日在《中华心血管病》杂志发表,标志着心血管疾病诊疗向精准化、个体化方向迈出坚实一步。 《指南》由中华医学会心血管病学分会精准心血管病学学组、中国医疗保健国际交流促进会精准心血管病分会组织专家制定。 单基因遗传性心血管疾
多重PCR在遗传病诊断方面的应用抗性基因检测
抗生素的广泛使用导致具有耐药性微生物的增多,比如耐甲氧西林金黄色葡萄球菌( methi-cillin resistant Staphylococcus aureus,MRSA)、万古霉素抗性肠球菌( vancomycin resistant enterococcl)和多重耐药结核分枝杆菌( mu
浅谈遗传诊断的反例
在精准医学的框架中,基因诊断是临床诊疗的环节之一。跟其它的诊断检测一样,它自有其标准,马虎仓促的诊断不但贻误病情,严重的状况就是草菅人命。今年9月15日,诸大美国媒体机构报道了LabCorp诊断公司与Wuth一家的5000万美金的诉讼官司。尽管这一诉讼似乎已经尘埃落定,但对于我们诊断咨询界,却似乎不
贺林院士加盟厦门市第五医院开展基因检测诊断
昨日,厦门市第五医院又迎来了一个喜人的时刻,在市卫生计生委的指导、支持下,聘请了中国科学院贺林院士、美国加州大学UCLA医学部研究助理教授、厦门市“双百人才”田晓丽博士担任医学顾问,并与贺林院士签署了贺林院士新医学临床转化工作站合作意向书,拟在院内建设第二个院士专家工作站。 随着两位顶级专家
基因“剪刀”可加速特定基因遗传
CRISPR可增加雌性实验鼠将特定基因传给后代的几率。图片来源:ISTOCK近日,研究人员首次使用被称为基因“剪刀”的基因组技术CRISPR加快哺乳动物特定基因的遗传。这种极具争议的基因驱动策略几年前在实验室饲养的昆虫中得到证明。因为它能在整个物种中迅速传播一种基因,从而激发了人们利用
基因序列仪在遗传性疾病诊断上的应用
由于基因突变而导致的疾病具有遗传性和终身性的特点,一旦患上这种病,会给自身和整个家族带来痛苦。通过对被检人员进行基因测序,查看基因突变情况,判断是否存在基因遗传病,或者推断后代患病的概率为婚育提供指导,减少遗传性疾病的发病率。
几小时即可完成基因检测-遗传疾病诊断速度大幅提升
孟德尔遗传病患者通常要经过6年以上测试才能得到诊断结果。但现在,沙特阿卜杜拉国王科技大学研究人员开发出一种准确而快速的方法,名为NanoRanger,可在几个小时内对这一类疾病进行基因检测,从而改变传统遗传疾病诊断。研究成果发表在新一期《Med》杂志上。新技术使用简单的分子生物学策略来寻找疑似存在复
几小时即可完成基因检测-遗传疾病诊断速度大幅提升
孟德尔遗传病患者通常要经过6年以上测试才能得到诊断结果。但现在,沙特阿卜杜拉国王科技大学研究人员开发出一种准确而快速的方法,名为NanoRanger,可在几个小时内对这一类疾病进行基因检测,从而改变传统遗传疾病诊断。研究成果发表在新一期《Med》杂志上。 新技术使用简单的分子生物学策略来寻找疑
关于遗传性共济失调临床应用基因诊断的注意点介绍
第一:明确临床诊断是关键,否则基因诊断无法进行下去。 第二:确定其遗传方式,根据有无家族史确定其是家族性或散发性,家族性根据遗传方式判断是常染色体显性还是隐性遗传。 第三:根据临床特点推断最可能的SCA亚型,确定基因检测的先后顺序,节约资源和时间。虽然各亚型之间临床表现重叠,但根据临床实践及
遗传重组热点基因研究
遗传重组(它涉及DNA股的断开和重接以产生新的基因组合)是真核细胞生物中的一种基本的生物学过程。在哺乳动物减数分裂的时候,在这一专门化的细胞分裂过程中,来自母系和父系的染色体被一分为二并产生出精子细胞和卵子细胞,而重组过程则将同源染色体的不同部分连接在了一起,从而导致了后代中的基
基因与性状的遗传
生物体的各种性状是由基因控制的。性状的遗传实质上是亲代通过生殖过程把基因传递给了子代。在有性生殖过程中,精子和卵细胞就是基因在亲子间传递的“桥梁”。在生物的体细胞(除生殖细胞外的细胞)中,染色体是成对存在的。如人的体细胞中染色体为23对。基因也是成对存在的,分别位于成对的染色体上,如人的体细胞中23
-瑞金医院找到人体肥胖基因
小鼠去除LGR4基因后能量消耗和新陈代谢增加,体重减轻 未来,肥胖者可能不再需要为减肥烦恼。早报记者昨日从瑞金医院获悉,由宁光教授领衔的内分泌科团队对肥胖有了新发现,通过调节小鼠体内LGR4基因开关,可以影响肥胖的发生。 调查了千余名肥胖者 随着大众对健康的关注度越来越高,肥胖
遗传病的诊断分析
遗传病的诊断(diagnosis of hereditary disease)可分为产前诊断、症状前诊断和现症病人诊断三种类型。遗传病的确诊是开展遗传咨询和防治工作的基础。遗传病诊断方法有普遍性诊断原则,又有遗传学的特殊诊断手段。普遍性诊断原则是与诊断一般疾病相同的方法,即通过对病史、症状、
基因诊断
医生需要综合患者的病史,症状,及各种检查的结果作出临床诊断。随着人们对疾病的病因及发病机理的认识的不断深入,临床检查的手段也在不断进步。目前看来,绝大多数疾病的发生,发展都与患者遗传背景或者其改变有关,所以临床上越来越有必要检查这种变化。这种用分子生物学方法检测患者体内遗传物质的水平或结构变化而
具有遗传风险的基因介绍NBN基因
该基因突变与nijmegen破碎综合征(一种以小头畸形、生长迟缓、免疫缺陷和癌症易感性为特征的常染色体隐性染色体不稳定综合征)有关。编码蛋白是由5种蛋白质组成的MRE11/RAD50双链断裂修复复合物的成员。这种基因产物被认为与DNA双链断裂修复和DNA损伤诱导的检查点激活有关。
具有遗传风险的基因介绍POLE基因
该基因编码DNA聚合酶epsilon的催化亚单位。这种酶参与DNA修复和染色体DNA复制。该基因突变与结直肠癌12和面部畸形、免疫缺陷、利维多和身材矮小有关。