基因缺失和重复揭示了我们基因变化的“故事情节”
通过在数目极大的人口中仔细观察拷贝数的差异,研究人员如今对选择过程会如何影响全球各地人口的基因组有了较好的了解。拷贝数差异指的是基因组间的结构差异,它是在DNA的大块部分被复制或删除时发生的。它会涉及含有多个基因的基因组区域或重要的调节区域。由于这个原因,研究人员推测这些变化是受到选择的,但对于在我们的基因组内消除这些变化或者维持这些变化的作用力仍然不甚了解。为了更好地理解全球范围内的这些模式,Peter Sudmant和同事对来自125个人群的236个个体的基因组中的拷贝数变异进行了分析。通过这一分析,研究人员能够确定祖先模式以及来自远古人种的混合基因组的保持;大洋洲人群保留了大量的源自丹尼索瓦人世系的复制拷贝。正如研究人员所料想的那样,与非-非洲人群相比,非洲人更可能显示祖先基因组序列的证据,因为非-非洲人群经历了更多的种群瓶颈,从而导致了较低的多元化水平。与非洲人群相比,这些非-非洲人群的瓶颈事件还导致了较少的基因缺失......阅读全文
首张非洲人全基因组图谱问世
据《自然》杂志报道,2月6日,美国加州Illumina生物技术公司宣布,他们首次对一位非洲男子进行了完整的基因组测序。 在此之前,科学家已经对两位白人男性(James Watson和Craig Venter)和一位中国男性进行了全基因组测序,但从未对非洲人进行研究。因此,这位匿名的尼日利亚约鲁巴人男
首个古代非洲人基因组研究出现错误
近日,论文作者发布了一份报告,就他们在去年10月发表于《科学》杂志的论文中出现的错误作出了解释。该论文描述的是一名在4500年前来自埃塞俄比亚的男性的基因组。这也是来自非洲的首个完整的古代人类基因组。这名男性被命名为“莫塔洞穴”,即他的遗骸被发现的地方。 尽管最早的人类离开非洲是在约10万年
复旦等国际团队发表非洲人群全基因组测序新成果
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495156.shtm 北京时间3月3日,国际顶尖期刊《细胞》(CELL)以“全基因组测序揭示非洲人群的复杂演化历程与对环境的适应性进化(Whole-genome sequencing reveals
科学家们在非洲人种基因组中找到了肥胖特异性基因
在最近的一项研究中,来自美国NIH,国家人类基因组研究所的研究者们首次分析了非洲人以及非洲裔美国人的基因组序列,发现其中有百分之一的人群携带有患肥胖症的基因在,这一结果能够解释为什么肥胖症总是具有家族性的特征。相关结果发表在最近一期的《obesity》杂志上。 根据这一研究,携带SEMA4D基
基因序列揭示非洲人早期历史
人类在非洲的早期历史正日益成为人们关注的焦点。一项新的研究对源自这片大陆的十几个族群的180个基因组进行了研究,其中一些基因组之前从未被分析过。 初步研究结果表明,在4万多年前,其中两个族群(桑人和巴卡人)的规模相当于当时其他族群的两倍,并且这两个族群生活在中东部非洲或南部非洲。 研究人员在
基因缺失和重复揭示了我们基因变化的“故事情节”
通过在数目极大的人口中仔细观察拷贝数的差异,研究人员如今对选择过程会如何影响全球各地人口的基因组有了较好的了解。拷贝数差异指的是基因组间的结构差异,它是在DNA的大块部分被复制或删除时发生的。它会涉及含有多个基因的基因组区域或重要的调节区域。由于这个原因,研究人员推测这些变化是受到选择的,但对于
非洲首个大型人类基因组学研究揭示高水平遗传多样性
南非科技部资助的“南部非洲人类基因组计划(SAHGP)”,顺利完成了对24名来自不同民族语言个体的全基因组测序,证实非洲人群存在高水平的遗传多样性,研究结果发表在《自然-通讯》期刊上。 该计划是非洲首个由政府资助开展的人类基因组学研究,旨在揭示南部非洲人群的独特遗传特征,全方位发掘各类人群
非洲首个大型人类基因组学研究揭示高水平遗传多样性
南非科技部资助的“南部非洲人类基因组计划(SAHGP)”,顺利完成了对24名来自不同民族语言个体的全基因组测序,证实非洲人群存在高水平的遗传多样性,研究结果发表在《自然-通讯》期刊上。 该计划是非洲首个由政府资助开展的人类基因组学研究,旨在揭示南部非洲人群的独特遗传特征,全方位发掘各类人群
七年磨剑,揭示非洲人群演化历程与适应性进化
现代人类起源于非洲,相比于其他大陆,现代人类在非洲居住时间最长,并且在迁徙,融合和对环境适应性进化过程中形成了超过3000个民族和2100种语言。目前非洲人群不仅具有世界上最丰富的遗传多样性和表型多样性,且现代人类近1/3的语言都在非洲。 然而,目前的遗传学和基因组学研究中,只有不到3%的样本
DNA测序揭示早期人类如何在非洲扩散
关于古代人类DNA的研究并不是一项享有平等机会的努力。过去10年间,早期欧洲人和亚洲人的部分基因组被测序了上百次,欧亚历史也在这个过程中得以改写。然而,由于基因材料在温暖、潮湿的气候中衰变得非常迅速,因此时至今日,科学家仅测序了一种古代非洲人类的DNA。 近日,在美国得克萨斯州奥斯丁举行的分子
8月7日《科学》杂志精选
富裕国家将来可能面临更多洪灾影响 现在,许多富裕国家能够通过使脆弱性降低的投资在某种程度上减轻它们的三角洲洪灾风险,但一个陈述基础结构成本不断高涨的模型表明,这一降低风险措施可能不具有长期的可持续性。最终,富裕国家在将来可能经受与发展中国家相似程度的洪灾压力。为了计算某特定三角洲人群遭受洪灾
非洲基因组学研究有助制定精准公共卫生政策
过去5年,国际基金组织已经投资了超过1亿美元的项目来推动非洲基因遗传学研究,有望借此改善对非洲人以及在欧洲和美洲的非洲人后裔的治疗手段。现在,第一轮7000万美元资助发放完毕后,英美两国共同发起的“非洲人类遗传与健康计划项目”第二轮6400万美元项目资金正在接受申请。 虽然有人认为,这笔钱应该
Cell:全基因组测序揭示人类遗传多样性
遗传的历史就书写在现代非洲人的DNA中,但还需要一些调查工作来对其进行注释。在即将出现在8月3号《细胞》(Cell)杂志封面上的一篇报道中,宾夕法尼亚大学的遗传学家们和他们的同事对分属三个不同狩猎者(hunter-gatherer)群体的15个非洲人的完全测序基因组进行了分析,并破解了一些必定涉
基因组研究揭示人类大迁移之谜
《自然》日前发表的3篇论文报告了来自全球逾280个不同群体的个体高质量基因组。3项研究描述了通常研究覆盖不足的区域的基因多样性,共同为现代人类走出非洲的大迁移提供了新的认知。 人类种群由演化摇篮非洲向欧洲、亚洲和大洋洲扩张的时间和路线广受热议。一些模型显示,现今所有非非洲人的祖先都可追溯至单一
我科学家在人类个体基因组研究领域又取得一项重要成果
我科学家采用新一代测序技术为人类基因组结构变异检测提供新方法 我国科学家在人类个体基因组研究领域又取得一项重要成果。7月25日,由深圳华大基因研究院主导完成的“基于全基因组组装数据检测人类基因组结构变异(SVs)”的研究成果在国际著名学术杂志《自然·生物技术》上在线发表。 近年来,人类基因组
谁在先?“鸡基因组”和“鸡蛋基因组”
是先有鸡还是先有鸡蛋?这个问题相当恼人,恐怕很难说清楚。现在,研究人员回答了与这个问题一样恼人的问题:是人类基因组中的成千上万的长重复DNA片段中,那个是第一个产生的?那些被复制了? 这个答案发表在10月7日的《自然·遗传学》杂志上。该研究给出了人类基因组中DNA重复片段复制的第一个进化证据,这种
科学家发现阿尔泰尼安德特人含有早期现代人类基因
日前,一个由德国、美国和中国等国家研究人员组成的国际研究小组利用几种不同的遗传分析方法,确定大约10万年前尼安德特人和现代人之间发生了基因交流事件,早于先前记录的其它此类事件。相关研究于2月17日发表在《自然》杂志。中国科学院古脊椎动物与古人类研究所研究员付巧妹也是取得这一研究成果的国际科学家团
Cell封面:非洲狩猎者的全基因组
在非洲人类的多样性远胜过世界上任何其他的地方。不同的食物来源、地理、疾病和气候为自然选择提供了许多的目标,对非洲人施加强大的压力以改变和适应当地的环境。适应最好的个体最有可能复制和传递他们的基因组给后代。 遗传的历史就书写在现代非洲人的DNA中,但还需要一些调查工作来对其进行注释。在即将出
在西非人基因组中发现了神秘古人类的“幽灵”
据研究人员报告,现代西非人的祖先曾与一种还有待发现的古人类杂交,这与古欧洲人曾与尼安德特人发生交配的方式相似。他们的研究有助于了解古人类如何增添了当今非洲人的基因变异,而人们对后者知之甚少,其部分原因是因为非洲的化石记录稀缺以及要获取古人类的DNA颇为困难。作者的计算机建模技术克服了这些挑战,从
基因组测序
如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的
叶绿体基因组
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能的重要细胞器,叶绿体中进行的光合作用是严格地受到遗传控制的。早在20世纪初,人们就已知叶绿体的某些性状是呈非孟德尔式遗传的,但直到60年代才发现了叶绿体DNA(chloroplast DNA,ctDNA)。叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子,其大小在1
GenomeResearch发表基因组研究新发现基因组
多伦多大学的科学家们发现,作为基因组看门人的C2H2-锌指蛋白(C2H2-ZF)实际上肩负着更加多样化的职责。这项发表在Genome Research杂志上的研究,有助于我们更准确地解读个人基因组。C2H2-ZF有大约七百个成员,是规模最大的一种人类蛋白。然而,人们对这些蛋白一直知之甚少。C2H2-
全基因组的比较基因组杂交技术介绍
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
澳大利亚土著是地球上基因最独特的群体
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514548.shtm根据12月13日发表于《自然》上的两项研究,澳大利亚北部和中部地区的土著是地球上基因最独特的群体,他们的基因变异率很高,仅次于非洲人。 ?澳大利亚土著在观看足球比赛 图片
《基因组研究》:首张猫基因组草图绘就
猫是研究人类失明和艾滋病模型之一,因此测序结果大有用处 一只名为“肉桂”(Cinnamon)的4岁雌性阿比西尼亚猫有幸成为第一只完成基因组测序草图的猫。它也因此加入了包括狗、小鼠、大鼠以及黑猩猩等在内的基因组“俱乐部”。相关论文11月1日在线发表于《基因组研究》(Genome Research)杂
中国新生儿基因组、胚胎基因组计划启动
为从根本上实现新生儿遗传病的早发现、早诊断、早干预,7日,中国遗传学会遗传咨询分会联合复旦大学附属儿科医院在上海发起中国新生儿基因组计划。 中国新生儿基因组计划将在未来的5年内开展10万例样本的新生儿基因检测,旨在构建中国新生儿基因组数据库,建立新生儿遗传病基因检测标准,促进新生儿遗传病基因检
200年前被“解救”的非洲奴隶或来自中非西部
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508351.shtm200多年前,数千名被英国皇家海军从奴隶船上“解救”出来的非洲奴隶,被带到了南大西洋的圣赫勒拿岛。但他们的生活在历史书中或其他方面记录甚少。现在,古代DNA分析报告,为这些人的起源提供
烟草基因组计划
生物技术和生命科学将成为21世纪引发新科技革命的重要推动力量。实施基因组计划可以获得一批具有自主知识产权的烟草重要性状功能基因,全面揭示种质资源的遗传背景,确立我国在烟草基因组研究上的核心优势,对提升烟草育种工作整体水平、实现烟草品种的根本性突破、培育烟草新兴产业、更好地发挥烟草模式作物的基础研究作
基因组的定义
在分子生物学和遗传学领域,基因组是指生物体所有遗传物质的总和。这些遗传物质包括DNA或RNA(病毒RNA)。基因组包括编码DNA和非编码DNA、线粒体DNA和叶绿体DNA。研究基因组的科学称为基因组学。
基因组的分类
病毒基因组病毒基因组可以由RNA或DNA组成。 RNA病毒的基因组包含单链或双链RNA,也包含一种或多种单独的RNA分子。 DNA病毒基因组可以是单链或双链DNA。大多数DNA病毒基因组由单个线性DNA分子组成,但有些由DNA病毒基因组由环状DNA分子组成 。原核基因组原核生物和真核生物基因组由D