复旦等国际团队发表非洲人群全基因组测序新成果
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495156.shtm 北京时间3月3日，国际顶尖期刊《细胞》（CELL）以“全基因组测序揭示非洲人群的复杂演化历程与对环境的适应性进化（Whole-genome sequencing reveals a complex African population demographic history and signatures of local adaptation）”为题，在线发表了以复旦大学生命科学学院和人类表型组研究院樊少华青年研究员为第一作者、宾夕法尼亚大学遗传学系莎拉·蒂什考夫（Sarah A. Tishkoff）教授为通讯作者的国际科学团队历时7年完成的最新研究成果。 现有研究表明，现代人类起源于非洲，相比于其它大陆，现代人类在非洲居住时间最长，并且在迁徙，融合和对环境适应性进化......阅读全文
七年磨剑，揭示非洲人群演化历程与适应性进化
现代人类起源于非洲，相比于其他大陆，现代人类在非洲居住时间最长，并且在迁徙，融合和对环境适应性进化过程中形成了超过3000个民族和2100种语言。目前非洲人群不仅具有世界上最丰富的遗传多样性和表型多样性，且现代人类近1/3的语言都在非洲。 然而，目前的遗传学和基因组学研究中，只有不到3%的样本
复旦等国际团队发表非洲人群全基因组测序新成果
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495156.shtm 北京时间3月3日，国际顶尖期刊《细胞》（CELL）以“全基因组测序揭示非洲人群的复杂演化历程与对环境的适应性进化（Whole-genome sequencing reveals
复旦大学PNAS发表全基因组测序新发现
复旦大学上海医学院高谦（Qian Gao）教授课题组的研究人员与来自中国、西班牙、瑞士等国的科学家们展开合作，在新研究中采用全基因组测序结合大规模基因分型揭示出了结核分枝杆菌北京家族菌株的起源、进化及其与现代人类迁移的联系。这项研究发布在6月15日的《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志上。
Science：华大参与三种鳄鱼基因组测序
最近，德克萨斯理工大学的生物学家带领一个50多名科学家的研究小组，测定了三种鳄鱼——美洲鳄、咸水鳄和印度鳄的基因组序列。 生物学副教授David Ray指出，通过测定这些基因组序列，科学家们可以更好地了解鸟类的进化，它们是这类食肉动物的最近亲缘种。该研究小组完成了这三种鳄鱼的基因组，可以说真正
Science：华大参与三种鳄鱼基因组测序
最近，德克萨斯理工大学的生物学家带领一个50多名科学家的研究小组，测定了三种鳄鱼——美洲鳄、咸水鳄和印度鳄的基因组序列。 生物学副教授David Ray指出，通过测定这些基因组序列，科学家们可以更好地了解鸟类的进化，它们是这类食肉动物的最近亲缘种。该研究小组完成了这三种鳄鱼的基因组，可以说真正
首张非洲人全基因组图谱问世
据《自然》杂志报道，2月6日，美国加州Illumina生物技术公司宣布，他们首次对一位非洲男子进行了完整的基因组测序。 在此之前，科学家已经对两位白人男性（James Watson和Craig Venter）和一位中国男性进行了全基因组测序，但从未对非洲人进行研究。因此，这位匿名的尼日利亚约鲁巴人男
首个古代非洲人基因组研究出现错误
近日，论文作者发布了一份报告，就他们在去年10月发表于《科学》杂志的论文中出现的错误作出了解释。该论文描述的是一名在4500年前来自埃塞俄比亚的男性的基因组。这也是来自非洲的首个完整的古代人类基因组。这名男性被命名为“莫塔洞穴”，即他的遗骸被发现的地方。 尽管最早的人类离开非洲是在约10万年
基因组测序
如果楼主指的是人类基因组计划，那时用的方法叫做双脱氧终止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中，DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸）来作为原料，但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的，但与普通PCR不同，它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的
马少华：科学成果与社会理性
中国的探月飞行和世界的诺贝尔奖凑在一起，使我们在本周更多地接触到科学的信息。但是，大众传媒帮助人们接近这些伟大科学成果的方法，仍然是大量诉诸生活经验的修辞，而不是超越于生活经验的科学知识和科学思维。 比如，探月飞行最重要的影响因素是“引力”——地球的和月球的，实际上是普遍存在于宇宙中
研究揭秘人类身高与代谢率共同进化关键基因突变
复旦大学生命科学学院研究员李晋、青年研究员黄河、樊少华与合作者研究发现，将现代人类与非人类灵长类动物区分开来的两个特征是身材更高和基础代谢率更高，他们确定了一个有助于这些特征共同进化的遗传变异，这种突变似乎有助于人们长得更高——尤其是在他们摄入大量肉类时。相关研究5月21日发表于《细胞-基因组学》。
Veritas入华抢占基因测序市场
随着科学家对疾病与基因之间关系的深入研究，越来越多的生物技术公司意识到了基因检测将成为一个潜力巨大的市场。在美国，包括谷歌在内的互联网巨头都已经纷纷涉足这一领域。而中国——这个拥有13亿人的新兴市场，也顺理成章的成为了众多生物信息学公司的必争之地。最近，波士顿的VeritasGenetics宣布
解码“基因组学之父”桑格：测序，测序，测序
“桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’，他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础，彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、 有一天，65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验，转身走出实验室，宣布自己正式退休。那一年是1983
华大智造宣布超高通量基因测序仪落地南澳基因组学中心
2023年4月27日，华大智造宣布超高通量基因测序仪DNBSEQ-T7落地南澳基因组学中心（SAGC），该中心将基于DNBSEQ-T7测序平台开展各项科学研究，助力全面推动澳大利亚基因组学研究发展和成果转化。 南澳基因组学中心成立于2020年7月，是国际领先的基因组学中心之一，致力于支持整个澳洲及
PNAS：甜瓜基因组测序
甜瓜在世界范围具有很高的经济价值，日前西班牙的九个研究中心通力合作，利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组，科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组，文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。 联合国粮农组织2009年
认识泛基因组测序
什么是泛基因组？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念（pangenome，pan源自希腊语‘παν’，全部的意思），泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年，Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接，发现了个体独有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
基因组测序仪简介
基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器，于2012年12月19日启用。 技术指标 个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。 主要功能 样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库，从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道，以节约试剂用量。
关于全基因组测序的测序指标介绍
一、全基因组测序的测序指标— 深度 测序深度（Sequencing depth）是指测序得到的碱基总量（bp）与基因组大小的比值，它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系，测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。测序的个体，如果采用的是双末端或Ma
复旦大学附属中山医院院长—樊嘉：不断创新的“医学人生”
“要想完全攻克肝癌很难，至少还要50~100年。”樊嘉说，他目前正在做的只是很小一部分工作，整个研究体系就像庞大浩瀚的宇宙，他只找到了其中一颗很小的行星，不能解决整个宇宙的问题。 10月21日，2016年度何梁何利基金奖在北京颁奖。复旦大学附属中山医院院长、肝肿瘤外科樊嘉教授凭借在肝癌临床诊疗
深圳先进院访问华大基因研究院
2月18日下午，中国科学院深圳先进技术研究院院长樊建平带领60余位科研管理骨干参观走访位于深圳盐田的华大基因研究院。“感受华大创业激情，交流科学管理问题，相互促进可持续发展”是此行的目的。华大基因研究院院长汪健接待了樊建平一行。 座谈会上，汪建介绍了华大近年的发展情况，阐释了
DNA测序揭示早期人类如何在非洲扩散
关于古代人类DNA的研究并不是一项享有平等机会的努力。过去10年间，早期欧洲人和亚洲人的部分基因组被测序了上百次，欧亚历史也在这个过程中得以改写。然而，由于基因材料在温暖、潮湿的气候中衰变得非常迅速，因此时至今日，科学家仅测序了一种古代非洲人类的DNA。 近日，在美国得克萨斯州奥斯丁举行的分子
170万！复旦大学纳米孔测序仪招标项目
项目概况 复旦大学纳米孔测序仪 招标项目的潜在投标人应在复旦大学采购与招标管理系统（网址为：https://czzx.fudan.edu.cn）获取招标文件，并于2023年12月21日 09点30分（北京时间）前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号：1069-234Z20234618
454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目
一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代，其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1，科学家通过454全基因组测序，掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因，包括抗病能力、牛奶产量，这些性状已通过北美的当
非洲首个大型人类基因组学研究揭示高水平遗传多样性
南非科技部资助的“南部非洲人类基因组计划（SAHGP）”，顺利完成了对24名来自不同民族语言个体的全基因组测序，证实非洲人群存在高水平的遗传多样性，研究结果发表在《自然-通讯》期刊上。 该计划是非洲首个由政府资助开展的人类基因组学研究，旨在揭示南部非洲人群的独特遗传特征，全方位发掘各类人群
非洲首个大型人类基因组学研究揭示高水平遗传多样性
南非科技部资助的“南部非洲人类基因组计划（SAHGP）”，顺利完成了对24名来自不同民族语言个体的全基因组测序，证实非洲人群存在高水平的遗传多样性，研究结果发表在《自然-通讯》期刊上。 该计划是非洲首个由政府资助开展的人类基因组学研究，旨在揭示南部非洲人群的独特遗传特征，全方位发掘各类人群
454用于西红柿基因组测序
最近，西红柿基因组学会完成了一个农业种植西红柿品系Solanum lycopersicum的基因组图谱，以及一个野生型西红柿品系S. pimpinellifolium的基因组图谱，并将其与已知的土豆基因组以及其他植物比较，寻找与水果有些特性相关的基因，相关文献在Nature杂志作为封面文章发
盘点最新基因组测序成果
the scientist杂志发表文章盘点了几项最新的基因组测序成果以飨读者： 种属：非洲腔棘鱼（Latimeria chalumnae） 基因组：~2.86 billion bp 人们曾经认为腔棘鱼早在七千万年前就已灭绝，直到1938年一只腔棘鱼在南非海岸被渔民捕获。这种鱼看上去跟三亿年
Nature完成桉树基因组测序
一个横跨五大洲的科学团队宣布，巨桉(Eucalyptus grandis)的基因组测序已经完成，巨桉是世界上最广泛种植的树木之一。这一成果于六月十一日发表在Nature杂志上。 巨桉生长速度快，可以用作燃料和木材，是纤维、纸浆、生物燃料、药物和工业用油的重要可再生原料。这种树木原产于澳大利亚东
基因组测序的具体过程
讲起来很复杂哈，简单来说，就是边合成边测序，把所要测序的序列通过各种手段来建库，然后加上5‘和3’都加上接头，放在一个小玻璃片一样的芯片上，上面一般是8个lane，把样品加入到lane上之后和上面长好的接头序列相结合（之前的建库时加的接头与之反向互补），然后再经过PCR扩增的过程形成一个DNA簇，然
让基因组测序绕过PCR
在基因组测序中，PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而，PCR也带来一些问题，包括不均匀扩增，导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序（NGS）平台而言，测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR-
测序基因组勘探食品污染
上周，两家公司因李斯特菌食品感染发令召回其所有产品。Sabra Dippin召回30,000例鹰嘴豆泥制成的食品，至今疾病防治中心未发现因食用该公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而，堪萨斯州的蓝铃冰激淋工厂（Blue Bell Creameries）已确认有少量食品原料已感染李斯特菌，目