生物物理所抗生素耐药性研究获进展

8月4日,中国科学院生物物理研究所张凯组和赵永芳组合作在Cell Research 发表了题为Substrate-bound structure of the E. coli multidrug resistance transporter MdfA 的研究成果。 细菌的药物抗性是当今全球面临的最主要的公共健康威胁之一。抗药性相关的机制研究及对策已成为世界卫生组织和各国政府共同关注的问题。细菌有多种形式的抗药机制,最普遍的一种机制是利用细胞膜上的多个药物外排泵,将抗生素外排出细胞。大肠杆菌MFS家族的多药物外排蛋白MdfA是抗药机制研究中的范例,对该蛋白结构的解析有助于深入认识细菌的药物外排机制。张凯课题组成功解析了MdfA-氯霉素以及MdfA与多个底物类似物复合物的高分辨率晶体结构(最高2.0 Å)。在MSF家族中,药物底物与转运蛋白复合物的晶体结构的报道仍属首次。 MdfA形成12次跨膜螺旋的拓扑结构,含有由3次跨膜......阅读全文

如何选择蛋白晶体结构?

在使用殷赋云计算平台的时候,有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。1. 确定蛋白种属在实验当中,研究人员通常使用动物模型(如小鼠)来研究人源蛋白。这样做有许多原因,比如:1) 无

如何选择蛋白晶体结构

  在使用殷赋云计算平台的时候,有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。   1. 确定蛋白种属   在实验当中,研究人员通常使用动物模型(如小鼠)来研究人源蛋白。这样做有许

用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验

ATP储存液的配制 依赖环核苷酸的蛋白质激酶 蛋白质激酶C 酪蛋白激酶 酪氨酸激酶 凝胶蛋白质激酶分析            

用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验

试剂、试剂盒 ATP储存液实验步骤 一、Mg-ATP 储存液的配制ATP 买来时通常是钠盐。大多数激酶需要 ATP 镁盐作为高效底物。有时可以用锰代替镁。1. 20 mmol/L MgCl2 或 MgSO42. 20 mmol/L Na2-ATP以 1:1 的比例混合这两种溶液,测 pH 值。慢慢将

用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验

ATP储存液的配制依赖环核苷酸的蛋白质激酶蛋白质激酶C酪蛋白激酶酪氨酸激酶凝胶蛋白质激酶分析试剂、试剂盒ATP储存液                                                          实验步骤一、Mg-ATP 储存液的配制ATP 买来时通常是钠盐。大多

酪蛋白激酶分析实验_用多肽底物

实验方法原理酪蛋白激酶 I 可用多肽 AspAspAspGluGluSerIleThrArgArg 进行分析,最近酿蛋白激酶 II 也已被特异性的多肽底物分析,如 ArgArgArgGluGluGluThrGluGluGlu(下划线残基是磷酸受体)。两个多肽均可通过精氨酸残基结合到 P81 磷酸纤维

用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验——酪蛋白激酶

试剂、试剂盒酪蛋白激酶分析缓冲液β-酪蛋白β-酪蛋白储存液实验步骤1. 在置于冰上的离心管内配制含下列成分的 20 μl 反应混合物:5X 酪蛋白激酶分析缓冲液                            4 μl  β-酪蛋白                               

用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验—蛋白质激酶C

试剂、试剂盒PKC 分析缓冲液组蛋白 HI 储存液磷脂酰丝氨酸甘油二油酸脂实验步骤1. 在冰浴的离心管内配制如下 20 μl 反应混合物:5X PKC 分析缓冲液                                        4 μl10 mg/ml 组蛋白 HI 储存液      

用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析—凝胶蛋白质激酶分析

试剂、试剂盒Tris-HClDTT盐酸胍尿素激酶分析缓冲液仪器、耗材SDS-PAGE实验步骤1. 准备下列材料:SDS-PAGE 要用到的所有试剂50 mmol/L Tris-HCl,室温(pH 8.0),1 mmol/L DTT6 mol/L 盐酸胍,50 mmol/L Tris-HCl,室温(p

关于胰蛋白酶的底物溶液的制备介绍

  取N-苯甲酰-L-精氨酸乙酯盐酸盐85.7mg,加水溶解使成100ml,作为底物原液;取10ml,用磷酸盐缓冲液(取0.067mol/L磷酸二氢钾溶液13ml与0.067mol/L磷酸氢二钠溶液87ml混合,pH值为7.6)稀释成100ml,照紫外-可见分光光度法(2010年版药典二部附录Ⅳ A

中国科学家解析寨卡病毒蛋白晶体结构

  近日,《自然—结构和分子生物学》网络版发表了中科院微生物研究所研究员施一和中科院院士高福团队最新发现的寨卡病毒(ZIKV)的非结构蛋白1(NS1)的分子结构,并提供了一个原子层面的图像。NS1参与了例如登革热、西尼罗河病毒等疾病的发病机制当中。  蚊子传播的寨卡病毒目前正在美洲流行。虽然寨卡病毒

中科院发现寨卡病毒关键蛋白晶体结构

  近日,中科院微生物研究所院士高福和中科院北京生命科学研究院副研究员施一带领的科研团队针对寨卡病毒(ZIKV)进行分析,发现非结构蛋白1(NS1)的分子结构。该研究成果提供了非结构蛋白1的原子层面图像,在这之前非结构蛋白1同样参与了登革热、西尼罗河病毒等疾病的发病机制,相关研究成果在线发表于4月1

微生物所解析寨卡病毒蛋白晶体结构

  中国科学院微生物研究所研究员施一和中国科学院院士高福团队通力合作在揭示寨卡病毒致病机制方面取得新进展,研究结果以Zika virus NS1 structure reveals diversity of electrostatic surfaces among flaviviruses(《寨卡病

什么是底物?

底物为参与生化反应的物质,可为化学元素、分子或化合物,经酶作用可形成产物。一个生化反应的底物往往同时也是另一个化学反应的产物。在异裂反应中,底物即为亲电试剂或亲核试剂进攻的物质特定的底物会在特定的酶作用下,合成或分解。

底物的定义

底物为参与生化反应的物质,可为化学元素、分子或化合物,作用可形成产物。一个生化反应的底物往往同时也是另一个化学反应的产物。

底物的定义

底物为参与生化反应的物质,可为化学元素、分子或化合物,作用可形成产物。一个生化反应的底物往往同时也是另一个化学反应的产物。

什么是底物?

底物为参与生化反应的物质,可为化学元素、分子或化合物,作用可形成产物。一个生化反应的底物往往同时也是另一个化学反应的产物。

用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验——酪氨酸激酶

试剂、试剂盒烯醇化酶酪氨酸激酶分析缓冲液实验步骤1. 制备酸变性的烯醇化酶从兔肌肉中纯化的烯醇化酶通常以硫酸铵沉淀或者悬液的形式存在。(1) 含 100 μg 的烯醇化酶,于 4℃ 全速离心 5 分钟。(2) 去上清,加入含有 1 mmol/L DTT 的 10 μl 50 mmol/L HEPES

黄病毒重要蛋白NS5晶体结构研究取得突破

  中国科学院武汉病毒研究所龚鹏学科组在乙型脑炎非结构蛋白NS5的研究中取得突破,相关结果于8月8日在线发表于病毒学期刊PLoS Pathogens上,题为Crystal Structure of the Full-Length Japanese Encephalitis Virus NS5

用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验—依赖环核苷酸

试剂、试剂盒激酶分析缓冲液组蛋白 2B 储存液环核苷酸依赖的蛋白质激酶分析缓冲液环核苷酸储存液实验步骤1. 在置于冰上的离心管内配制含下列成分的 20 μl 反应混合物:5X 激酶分析缓冲液 4 μl,10 mg/ml 组蛋白 2B 储存液 1 μl,[γ-32P] ATP(终浓度为 5 μCi/5

用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验——ATP储存液的配制

试剂、试剂盒ATP储存液实验步骤一、Mg-ATP 储存液的配制ATP 买来时通常是钠盐。大多数激酶需要 ATP 镁盐作为高效底物。有时可以用锰代替镁。1. 20 mmol/L MgCl2 或 MgSO42. 20 mmol/L Na2-ATP以 1:1 的比例混合这两种溶液,测 pH 值。慢慢将 p

什么是假底物?

假底物是可以特异地结合到酶的活性中心但不被催化、阻止真底物结合的物质。

底物溶液的配制

pH 5.0磷酸-柠檬酸缓冲液加入邻苯二胺1mg/ml,再加入30%的H2O2 (1μl/ml)溶解后即为ELISA底物液,临用前配制,避光保存。

什么是底物循环?

也称之底物循环(substrate cycle)。一对催化两个途径的中间代谢物之间循环的方向相反、代谢上不可逆的反应。有时该循环通过ATP的水解导致热能的释放。例如,葡萄糖+ATP=葡萄糖-6-磷酸+ADP与葡萄糖-6-磷酸+H2O=葡萄糖+Pi反应组成的循环反应,其净反应实际上是ATP+H2O=A

什么是自杀底物?

自杀底物是一类酶的天然底物的衍生物或类似物,在它们的结构中含有一种化学活性基团,当酶把他们作为底物结合时,其潜在的化学基团能被解开或激活,并与酶的活性部位发生共价结合,使结合物停留在某种状态,从而不能分解成产物,酶因而致“死”,此过程称为酶的自杀,这类底物称为自杀底物(suicide substra

荧光底物有哪些

(一)荧光色素   许多物质都可产生荧光现象,但并非都可用作荧光色素.只有那些能产生明显的荧光并能作为染料使用的有机化合物才能称为免疫荧光色素或荧光染料.常用的荧光色素有:  异硫氰酸荧光素2.四乙基罗丹明  3.四甲基异硫氰酸罗丹明4.藻红蛋白(二)其他荧光物质   1.酶作用后产生荧光的物质:某

什么是自杀底物?

自杀底物是一类酶的天然底物的衍生物或类似物,在它们的结构中含有一种化学活性基团,当酶把他们作为底物结合时,其潜在的化学基团能被解开或激活,并与酶的活性部位发生共价结合,使结合物停留在某种状态,从而不能分解成产物,酶因而致“死”,此过程称为酶的自杀,这类底物称为自杀底物(suicide substra

什么是假底物?

中文名称假底物英文名称pseudosubstrate定  义可以特异地结合到酶的活性中心但不被催化、阻止真底物结合的物质。有些酶具有假底物结构域,其中的特定序列或残基作为假底物结合到酶的活性部位,抑制酶活性,当酶与配基结合后发生构象变化,释放假底物,恢复催化功能。这是体内调节酶活性的一种重要方式。应

CHROMOGENIX发色底物

  CHROMOGENIX提供基于生色底物的止血和纤溶测试解决方案,用于医院,临床实验室,血库和药物测试。CHROMOGENIX产品组合包含30多种产品,包括单个发色底物以及完整的试剂盒,其中包含在自动化仪器上进行特定分析所需的所有试剂。   CHROMOGENIX发色底物   S-2222

底物循环的概念

无效循环(futile cycle):也称之底物循环(substrate cycle)。一对催化两个途径的中间代谢物之间循环的方向相反、代谢上不可逆的反应。有时该循环通过ATP的水解导致热能的释放。例如,葡萄糖+ATP=葡萄糖-6-磷酸+ADP与葡萄糖-6-磷酸+H2O=葡萄糖+Pi反应组成的循环反