生物物理所抗生素耐药性研究获进展
8月4日，中国科学院生物物理研究所张凯组和赵永芳组合作在Cell Research 发表了题为Substrate-bound structure of the E. coli multidrug resistance transporter MdfA 的研究成果。 细菌的药物抗性是当今全球面临的最主要的公共健康威胁之一。抗药性相关的机制研究及对策已成为世界卫生组织和各国政府共同关注的问题。细菌有多种形式的抗药机制，最普遍的一种机制是利用细胞膜上的多个药物外排泵，将抗生素外排出细胞。大肠杆菌MFS家族的多药物外排蛋白MdfA是抗药机制研究中的范例，对该蛋白结构的解析有助于深入认识细菌的药物外排机制。张凯课题组成功解析了MdfA-氯霉素以及MdfA与多个底物类似物复合物的高分辨率晶体结构（最高2.0 Å）。在MSF家族中，药物底物与转运蛋白复合物的晶体结构的报道仍属首次。 MdfA形成12次跨膜螺旋的拓扑结构，含有由3次跨膜......阅读全文
如何选择蛋白晶体结构？
在使用殷赋云计算平台的时候，有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。1. 确定蛋白种属在实验当中，研究人员通常使用动物模型（如小鼠）来研究人源蛋白。这样做有许多原因，比如：1） 无
如何选择蛋白晶体结构
在使用殷赋云计算平台的时候，有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。 1. 确定蛋白种属 在实验当中，研究人员通常使用动物模型（如小鼠）来研究人源蛋白。这样做有许
用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验
试剂、试剂盒 ATP储存液实验步骤 一、Mg-ATP 储存液的配制ATP 买来时通常是钠盐。大多数激酶需要 ATP 镁盐作为高效底物。有时可以用锰代替镁。1. 20 mmol/L MgCl2 或 MgSO42. 20 mmol/L Na2-ATP以 1:1 的比例混合这两种溶液，测 pH 值。慢慢将
用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验
ATP储存液的配制依赖环核苷酸的蛋白质激酶蛋白质激酶C酪蛋白激酶酪氨酸激酶凝胶蛋白质激酶分析试剂、试剂盒ATP储存液 实验步骤一、Mg-ATP 储存液的配制ATP 买来时通常是钠盐。大多
用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验
ATP储存液的配制 依赖环核苷酸的蛋白质激酶 蛋白质激酶C 酪蛋白激酶 酪氨酸激酶 凝胶蛋白质激酶分析
酪蛋白激酶分析实验_用多肽底物
实验方法原理酪蛋白激酶 I 可用多肽 AspAspAspGluGluSerIleThrArgArg 进行分析，最近酿蛋白激酶 II 也已被特异性的多肽底物分析，如 ArgArgArgGluGluGluThrGluGluGlu（下划线残基是磷酸受体）。两个多肽均可通过精氨酸残基结合到 P81 磷酸纤维
用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验——酪蛋白激酶
试剂、试剂盒酪蛋白激酶分析缓冲液β-酪蛋白β-酪蛋白储存液实验步骤1. 在置于冰上的离心管内配制含下列成分的 20 μl 反应混合物：5X 酪蛋白激酶分析缓冲液 4 μl β-酪蛋白
用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验—蛋白质激酶C
试剂、试剂盒PKC 分析缓冲液组蛋白 HI 储存液磷脂酰丝氨酸甘油二油酸脂实验步骤1. 在冰浴的离心管内配制如下 20 μl 反应混合物：5X PKC 分析缓冲液 4 μl10 mg/ml 组蛋白 HI 储存液
用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析—凝胶蛋白质激酶分析
试剂、试剂盒Tris-HClDTT盐酸胍尿素激酶分析缓冲液仪器、耗材SDS-PAGE实验步骤1. 准备下列材料：SDS-PAGE 要用到的所有试剂50 mmol/L Tris-HCl，室温（pH 8.0)，1 mmol/L DTT6 mol/L 盐酸胍，50 mmol/L Tris-HCl，室温（p
中国科学家解析寨卡病毒蛋白晶体结构
近日，《自然—结构和分子生物学》网络版发表了中科院微生物研究所研究员施一和中科院院士高福团队最新发现的寨卡病毒（ZIKV）的非结构蛋白1（NS1）的分子结构，并提供了一个原子层面的图像。NS1参与了例如登革热、西尼罗河病毒等疾病的发病机制当中。 蚊子传播的寨卡病毒目前正在美洲流行。虽然寨卡病毒
中科院发现寨卡病毒关键蛋白晶体结构
近日，中科院微生物研究所院士高福和中科院北京生命科学研究院副研究员施一带领的科研团队针对寨卡病毒（ZIKV）进行分析，发现非结构蛋白1（NS1）的分子结构。该研究成果提供了非结构蛋白1的原子层面图像，在这之前非结构蛋白1同样参与了登革热、西尼罗河病毒等疾病的发病机制，相关研究成果在线发表于4月1
微生物所解析寨卡病毒蛋白晶体结构
中国科学院微生物研究所研究员施一和中国科学院院士高福团队通力合作在揭示寨卡病毒致病机制方面取得新进展，研究结果以Zika virus NS1 structure reveals diversity of electrostatic surfaces among flaviviruses（《寨卡病
关于胰蛋白酶的底物溶液的制备介绍
取N-苯甲酰-L-精氨酸乙酯盐酸盐85.7mg，加水溶解使成100ml，作为底物原液；取10ml，用磷酸盐缓冲液（取0.067mol/L磷酸二氢钾溶液13ml与0.067mol/L磷酸氢二钠溶液87ml混合，pH值为7.6）稀释成100ml，照紫外－可见分光光度法（2010年版药典二部附录Ⅳ A
什么是底物？
底物为参与生化反应的物质，可为化学元素、分子或化合物，作用可形成产物。一个生化反应的底物往往同时也是另一个化学反应的产物。
底物的定义
底物为参与生化反应的物质，可为化学元素、分子或化合物，作用可形成产物。一个生化反应的底物往往同时也是另一个化学反应的产物。
底物的定义
底物为参与生化反应的物质，可为化学元素、分子或化合物，作用可形成产物。一个生化反应的底物往往同时也是另一个化学反应的产物。
什么是底物？
底物为参与生化反应的物质，可为化学元素、分子或化合物，经酶作用可形成产物。一个生化反应的底物往往同时也是另一个化学反应的产物。在异裂反应中，底物即为亲电试剂或亲核试剂进攻的物质特定的底物会在特定的酶作用下，合成或分解。
黄病毒重要蛋白NS5晶体结构研究取得突破
中国科学院武汉病毒研究所龚鹏学科组在乙型脑炎非结构蛋白NS5的研究中取得突破，相关结果于8月8日在线发表于病毒学期刊PLoS Pathogens上，题为Crystal Structure of the Full-Length Japanese Encephalitis Virus NS5
用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验——酪氨酸激酶
试剂、试剂盒烯醇化酶酪氨酸激酶分析缓冲液实验步骤1. 制备酸变性的烯醇化酶从兔肌肉中纯化的烯醇化酶通常以硫酸铵沉淀或者悬液的形式存在。(1) 含 100 μg 的烯醇化酶，于 4℃ 全速离心 5 分钟。(2) 去上清，加入含有 1 mmol/L DTT 的 10 μl 50 mmol/L HEPES
用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验—依赖环核苷酸
试剂、试剂盒激酶分析缓冲液组蛋白 2B 储存液环核苷酸依赖的蛋白质激酶分析缓冲液环核苷酸储存液实验步骤1. 在置于冰上的离心管内配制含下列成分的 20 μl 反应混合物：5X 激酶分析缓冲液 4 μl，10 mg/ml 组蛋白 2B 储存液 1 μl，[γ-32P] ATP（终浓度为 5 μCi/5
用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验——ATP储存液的配制
试剂、试剂盒ATP储存液实验步骤一、Mg-ATP 储存液的配制ATP 买来时通常是钠盐。大多数激酶需要 ATP 镁盐作为高效底物。有时可以用锰代替镁。1. 20 mmol/L MgCl2 或 MgSO42. 20 mmol/L Na2-ATP以 1:1 的比例混合这两种溶液，测 pH 值。慢慢将 p
高福、施一等解析寨卡病毒蛋白晶体结构
近日，《自然—结构和分子生物学》网络版发表了中科院微生物研究所研究员施一和中科院院士高福团队最新发现的寨卡病毒（ZIKV）的非结构蛋白1（NS1）的分子结构，并提供了一个原子层面的图像。NS1参与了例如登革热、西尼罗河病毒等疾病的发病机制当中。 蚊子传播的寨卡病毒目前正在美洲流行。虽然寨卡病
Nat－Chem－Biol：首次解析癌症蛋白的3D晶体结构
来自格里菲斯大学的科学家日前在Nature Chemical Biology杂志上刊登了他们的最新研究成果，研究者通过研究确定了一种和癌症扩散相关的特殊蛋白的三维结构图谱，研究者表示，这种关键蛋白的3-D图谱展示了细菌的乙酰肝素酶的架构及原子水平细节，而乙酰肝素酶是一种可以降解名为硫酸类肝素的酶
徐彦辉等《自然》揭示TET蛋白底物偏好性机制
今天，国际顶级学术期刊《自然》（Nature）在线发表了复旦大学生物医学研究院徐彦辉教授课题组的论文。该项研究成果揭示了TET蛋白底物偏好性机制，对研究多种疾病的发病机制，尤其对血液肿瘤（如髓系白血病）治疗性药物开发有重大意义。 这 篇题为“晶体结构揭示TET蛋白介导的氧化反应底物偏好性机制”
关于角蛋白酶的底物特异性作用介绍
角蛋白酶作用的底物除了角蛋白外，它还可水解多种蛋白质底物，包括可溶和不可溶的蛋白质。角蛋白酶可以降解如酪蛋白、明胶、牛血清白蛋白等可溶的蛋白质。也可以降解包括羽毛、羊毛、角质、人发、指甲等不可溶的蛋白质。个别角蛋白酶的底物范围很窄，例如鸡毛癣菌角蛋白酶只能降解鸟类羽毛，较难降解其它种类的角蛋白。
晶体结构测定方法
晶体结构测定方法，crystal structure determination，即利用晶体 X射线衍射可测定晶体结构。但衍射实验只能测得衍射强度（即结构振幅）而测不到相角，这样就不可能直接从强度得到晶体结构数据，而要利用其他方法。
硅的晶体结构
两个面心立方结构相互套构而成，其中一个面心立方结构沿另一个的体对角线平移1/4。
晶体结构测定方法
晶体结构测定方法，crystal structure determination，即利用晶体 X射线衍射可测定晶体结构。但衍射实验只能测得衍射强度（即结构振幅）而测不到相角，这样就不可能直接从强度得到晶体结构数据，而要利用其他方法。
什么是晶体结构？
晶体结构是指晶体以其内部原子、离子、分子在空间作三维周期性的规则排列为其最基本的结构特征。任一晶体总可找到一套与三维周期性对应的基向量及与之相应的晶胞，因此可以将晶体结构看作是由内含相同的具平行六面体形状的晶胞按前、后、左、右、上、下方向彼此相邻“并置”而组成的一个集合。晶体学中对晶体结构的表达可采
什么是底物循环？
也称之底物循环（substrate cycle）。一对催化两个途径的中间代谢物之间循环的方向相反、代谢上不可逆的反应。有时该循环通过ATP的水解导致热能的释放。例如，葡萄糖+ATP=葡萄糖-6-磷酸+ADP与葡萄糖-6-磷酸+H2O=葡萄糖+Pi反应组成的循环反应，其净反应实际上是ATP+H2O=A