NatureMethods发表论文报道5醛基胞嘧啶测序新技术
2015年9月7日,北京大学生命科学学院伊成器研究组在《Nature Methods》杂志在线发表题为“Bisulfite-free, base-resolution analysis of 5-formylcytosine at the genome scale”的研究论文(DOI: 10.1038/nmeth.3569)。文章报道了一种通过化学标记和富集手段,首次实现了免亚硫酸氢盐处理(bisulfite-free)的5-醛基胞嘧啶(5fC)单碱基分辨率、全基因组水平测序。 5-甲基胞嘧啶修饰(5mC)是真核细胞基因组中最为重要的表观遗传修饰之一。5mC可以在TET家族酶的作用下,逐步氧化生成5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)、5-醛基胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC);后两者也可以被TDG糖基化酶所识别并切除。对于上述几种新型DNA修饰的功能研究是目前核酸表观遗传学的一个研究热点。而其中一个主要的难题,就是如何......阅读全文
氟胞嘧啶注射液的禁忌症是什么?
氟胞嘧啶注射液的禁忌症主要包括严重肾功能不全及对本品过敏的患者禁用。 具体来说,氟胞嘧啶注射液是用于治疗由念珠菌属和隐球菌属引起的多种感染,如心内膜炎、脑膜炎、败血症、肺部感染和尿路感染。但是,以下情况的患者不宜使用此药: 肾功能严重受损的患者,因为药物的排泄主要通过肾脏,肾功能不全可能导致
氟胞嘧啶注射液的适应症及用法用量
适应症 用于念珠菌属心内膜炎、隐球菌属脑膜炎、念珠菌属或隐球菌属真菌败血症、肺部感染和尿路感染。 用法用量 静脉滴注,一日0.1~0.15g/kg,分2~3次给药,静滴速度4~10ml/分。
简述胞嘧啶阿拉伯糖苷的药物相互作用
四氢尿苷可抑制脱氧酶,延长阿糖胞苷血浆半衰期,提高血中浓度,起增效作用。本品可使细胞部分同步化,继续应用柔红霉素、阿霉素、环磷酰胺及亚硝脲类药物可以增效。本品不应与5-Fu并用。
关于胞嘧啶阿拉伯糖苷的体内代谢的介绍
口服时,仅有少于20%的阿糖胞苷被消化系统吸收,效果很差。口服后会因首关效应,迅速被肝脏的胞嘧啶脱氨酶代谢为无活性的尿嘧啶阿糖胞苷。而皮下或肌肉注射时,经过氚标记的阿糖胞苷在给药20到60分钟之间产生血浆放射性峰浓度远比静脉注射的低。至于连续静脉注射则能够产生的相对恒定的血浆药物水平。 静脉注
关于胞嘧啶阿拉伯糖苷的注意事项介绍
1、使用本品时可引起血清丙氨酸氨基转移酶ALT(SGPT)、血及尿中尿酸量的增高; 2、下列情况应慎用:骨髓抑制、白细胞及血小板显著减低者、肝肾功能不全、有胆道疾患者、有痛风病史、尿酸盐肾结石病史、近期接受过细胞毒药物或反射治疗; 3、用药期间应定期检查:周围血象、血细胞和血小板计数、骨髓涂
氟胞嘧啶注射液的用法用量及不良反应
用法用量 静脉滴注,一日0.1~0.15g/kg,分2~3次给药,静滴速度4~10ml/分。 不良反应 1.本品可致恶心、呕吐、厌食、腹痛、腹泻等胃肠道反应。 2.皮疹、嗜酸性粒细胞增多等变态反应。 3.肝毒性反应可发生,一般表现为血清氨基转移酶一过性升高,偶见血清胆红素升高,肝肿大者
关于胞嘧啶阿拉伯糖苷的不良反应介绍
1、造血系统:主要是骨髓抑制,白细胞及血小板减少,严重者可发生再生障碍性贫血或巨幼细胞性贫血; 2、白血病、淋巴瘤患者治疗初期可发生高尿酸血症,严重者可发生尿酸性肾病; 3、较少见的有口腔炎、食管炎、肝功能异常、发热反应及血栓性静脉炎。阿糖胞苷综合症多出现于用药后6-12小时,有骨痛或肌痛、
Nature-Methods发表论文报道5醛基胞嘧啶测序新技术
2015年9月7日,北京大学生命科学学院伊成器研究组在《Nature Methods》杂志在线发表题为“Bisulfite-free, base-resolution analysis of 5-formylcytosine at the genome scale”的研究论文(DOI: 10.1
氟胞嘧啶注射液的药理毒理及药代动力学
药理毒理 本品为抗真菌药。对隐球菌属、念珠菌属和球拟酵母菌等具有较高抗菌活性。对着色真菌、少数曲霉属有一定抗菌活性,对其他真菌的抗菌作用均差。本品为抑菌剂,高浓度时具杀菌作用。其作用机制在于药物通过真菌细胞的渗透酶系统进入细胞内,转化为氟尿嘧啶。替代尿嘧啶进入真菌的脱氧核糖核酸中,从而阻断核酸
氟胞嘧啶注射液的药代动力学及适应症
药代动力学 静脉注射本品2g的血药峰浓度(Cmax)约为50mg/L,血清蛋白结合率为2.9~4%,表观分布容积(Vd)为0.78± 0.13L/kg。药物广泛分布于肝、肾、心、脾、肺组织中,其浓度大于或等于同期血药浓度,炎性脑脊液中药物浓度可达同期血药浓度的50—100%。本品亦可进入感染的
科研人员利用人工智能开发出新型碱基编辑工具
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所动物表观基因组学创新团队运用人工智能(AI)来挖掘新型胞嘧啶脱氨酶,开发了高效、无序列偏好的胞嘧啶碱基编辑工具。相关研究成果发表在《自然—生物医学工程》(Nature Biomedical Engineering)上。挖掘新的功能性蛋白在生物医药和农业应用等领
生化与细胞所DNA去甲基化机制研究有新发现
高等生物的基因组DNA中除含有腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)四种常见的碱基形式外,还含有胞嘧啶的修饰形式:5-甲基胞嘧啶(5mC),被称为第5种碱基。而且它可以进一步被氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5hmC),也被称为第6碱基。这些修饰形式在表观调控中都具有重要的作用,但它们
科学家提出基因编辑领域发展新方向
4月18日,中国科学院上海营养与健康研究所研究员杨力与上海科技大学生命技术学院教授陈佳、上海科技大学免疫化学研究所副研究员杨贝,应邀在国际学术期刊《自然-生物技术》(Nat Biotechnol)上发表题为To BE or not to BE, that is the question 的新闻与
设计基因编辑工具的AI大模型问世
记者27日从中国农业科学院获悉,该院农业基因组研究所农业基因编辑技术研发与应用创新团队构建了全球规模最大的实验验证数据集,并基于此开发出人工智能(AI)大模型AlphaCD。该模型不仅能高效预测超过2万余种胞嘧啶脱氨酶的酶活特征,还能设计出新型高性能碱基编辑工具。相关成果日前发表于国际期刊《细胞
两篇PNAS:蛋白纳米孔检测DNA甲基化
两个独立的研究团队利用通道蛋白实现纳米孔测序,成功鉴别了5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶。这两篇文章发表在同一期的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 基因组所蕴含的编码信息,包括DNA序列和核苷酸修饰两个部分。其中,动态的DNA甲基化模式,是基因表达的重要调控者,与细胞分化、胚胎发育和癌症
我国学者成功开发基于脱氨酶APOBEC的新型普适碱基编辑器
中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康院)中国科学院-马普计算生物学研究所杨力研究组与上海科技大学生命学院陈佳研究组和黄行许研究组合作,成功开发出一系列基于人胞嘧啶脱氨酶APOBEC的新型普适碱基编辑器,其中基于人APOBEC3A(hA3A)的碱基编辑器可高效介导甲基化胞嘧啶mC到胸腺嘧啶T的
Nature子刊:新技术开辟表观遗传研究新领域
来自犹他大学Huntsman癌症研究所(HCI)的研究人员,开发了一种强有力的新技术,可在人类RNA中鉴别出一组称作RNA胞嘧啶甲基转移酶(RMTs)的酶的靶标。他们将这一技术应用于一种与人类精神发育迟滞和癌症相关的特异RMT——NSUN2上,发现并确认了大量从前未知的RMT靶标,从而表明了这一
上海药物所表观遗传分子机制合作研究取得新进展
中科院上海药物研究所蒋华良课题组与美国芝加哥大学化学系何川课题组合作,针对胸腺嘧啶DNA糖苷化酶及细菌转录因子AgrA在表观遗传与转录调控中的作用开展研究,取得了良好进展。研究论文分别于2012年2月及2012年5月在线发表在Nature Chemical Biology和PNA
美国哈佛大学医学院张毅教授到生物物理所交流
张毅教授作报告 11月14日,应生物大分子国家重点实验室许瑞明研究员的邀请,哈佛大学医学院的张毅教授在生物物理所图书馆报告厅作了一场题为Mechanism and function of Tet-mediated 5-methylcytosine Oxidation的报告。
中国农科院植保所成功开发水稻单碱基编辑升级系统
近日,中国农业科学院植物保护研究所(以下简称植保所)周焕斌团队在国际著名期刊《分子植物》上发表了题为《利用CRISPR/Cas9引导的人源AID(胞嘧啶脱氨酶)蛋白在水稻中进行高效靶标基因的单碱基替换技术》(影响因子8.827)的论文,优化和扩展了水稻中靶标基因单碱基定向替换技术及其应用范围。
科学家首次证实线粒体碱基编辑器的脱靶效应
脱靶检测技术工作流程。中国农科院供图 日前,中国农业科学院深圳农业基因组研究所左二伟团队与国内其他科研单位合作,首次证实线粒体碱基编辑器(DdCBE)会导致核基因组严重的脱靶效应,因而医学应用存在严重的安全风险。该研究对研发高效安全的线粒体碱基编辑器具有指导意义。相关研究成果在线发表在《
科学家首次证实线粒体碱基编辑器的脱靶效应
脱靶检测技术工作流程。中国农科院供图 日前,中国农业科学院深圳农业基因组研究所左二伟团队与国内其他科研单位合作,首次证实线粒体碱基编辑器(DdCBE)会导致核基因组严重的脱靶效应,因而医学应用存在严重的安全风险。该研究对研发高效安全的线粒体碱
华东师范大学JBC发表表观遗传研究新成果
来自华东师范大学的研究人员在新研究中证实,Tet (Ten-Eleven Translocation)蛋白家族受到O-GlcNAc糖基转移酶(OGT)的差异调控。这一研究发现发表在1月6日的《生物化学杂志》(JBC)上。 文章的通讯作者是华东师范大学生命医学研究所的翁杰敏(Jiemin
科学家确定DNA的第7种和第8种碱基
据美国每日科学网站7月22日(北京时间)报道,美国科学家在7月21日出版的《科学》杂志上撰文指出,他们找到了DNA的第7种、第8种碱基,并在人体胚胎干细胞和实验老鼠器官染色体组的DNA中发现了这两个碱基的踪迹。科学家们指出,最新发现对干细胞和癌症研究非常重要。 几十年来,科学
高效双碱基编辑器研发成功并在水稻中实现基因定向进化
近日,中国农业科学院作物科学研究所作物精准育种技术创新团队成功开发了一种高效、编辑范围更广的胞嘧啶和腺嘌呤双碱基编辑融合系统,利用该系统对水稻内源基因编码区进行改造,获得了高抗草甘膦的水稻新型基因资源。相关研究成果在线发表在《植物学报(Journal of Integrative Plant B
高彩霞团队开发出不依赖CRISPR的全新碱基编辑工具
基因组编辑可以对生物体遗传信息进行精准、高效的修饰,已成为生命科学领域的一项颠覆性技术。通过融合nCas9(切口酶形式的Cas9)与脱氨酶,美国哈佛大学David Liu团队先后开发出胞嘧啶碱基编辑系统(Cytosine base editor,CBE)和腺嘌呤碱基编辑系统(Adenine ba
复旦大学、中科院Nature发布表观遗传新成果
来自复旦大学、中科院上海药物研究所等机构的研究人员,揭示出了TET在介导DNA氧化去甲基化作用时的底物偏好及结构基础。研究成果发布在10月28日的《自然》(Nature)杂志上。 复旦大学上海医学院的徐彦辉(Yanhui Xu)教授和中科院上海药物研究所的罗成(Cheng Luo)研究员是这篇
AlphaCD发布:蛋白质功能高通量预测全新范式
近日,中国农业科学院农业基因组研究所农业基因编辑技术研发与应用创新团队构建了迄今为止规模最大的实验验证数据集,并在此基础上开发了多模态机器学习模型AlphaCD。该模型不仅能够高效预测超过2万种胞嘧啶脱氨酶的酶活特征,还能设计出新型高性能碱基编辑工具。该研究为蛋白质功能高通量鉴定和基因编辑工具开发提
AlphaCD发布:蛋白质功能高通量预测全新范式
近日,中国农业科学院农业基因组研究所农业基因编辑技术研发与应用创新团队构建了迄今为止规模最大的实验验证数据集,并在此基础上开发了多模态机器学习模型AlphaCD。该模型不仅能够高效预测超过2万种胞嘧啶脱氨酶的酶活特征,还能设计出新型高性能碱基编辑工具。该研究为蛋白质功能高通量鉴定和基因编辑工具开
简述注射用阿糖胞苷的药物相互作用
1、地高辛 患者接受含环磷酰胺、长春新碱和强的松的化疗方案,无论是否包括阿糖胞苷或甲基苄肼,联合β~醋地高辛治疗,其地高辛稳态血浆浓度和肾葡萄糖分泌发生可逆性地下降。洋地黄毒苷的稳态浓度似不变。因此接受类似联合化疗方案治疗的患者需密切监测地高辛的浓度。此类患者可考虑用洋地黄毒苷替代地高辛的使用