2015生物医疗大数据高峰论坛在沪隆重开幕
2015年9月10日，由生物谷主办的"2015生物医疗大数据高峰论坛"在上海上海斯波特大酒店隆重开幕，现场座无虚席。来自科研及医疗领域的科学家及医生学者们共聚一堂，探讨医疗大数据与疾病风险评估相关事宜。 大数据被认为是改变行业的关键节点。随着生物科技和医疗技术的迅猛发展、高通量手段的成熟，生物医疗行业的大数据急剧膨胀。然而，与其它行业的数据不同，生物医疗行业的数据呈现分散、破碎、低透明度、以及意义尚等解析等特征。不象其它行业，数据具有时效性以及数据很轻、易于解析；生物医疗行业的数据普遍很“重”、信息量超大、不同的解析策略可能得出丰富的结果；而且生物医疗大数据随着时间推移，数据累积量的增加，数据价值将变得越来越重要。关系型数据库逐渐从IT行业中淡出，但生物医疗行业大数据却十分重视数据间的复杂关系。加上中国健康人群及患者数量庞大，就越发会产生超海量的数据网络。在医疗大数据的时代，如何构建大数据基础架构与上层应用的生态系统、解决......阅读全文
科学家研究认为：大数据时代“小数据”仍有未来
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504106.shtm大数据时代，“小数据”有未来吗？武汉纺织大学数理科学学院江健教授团队与美国密歇根州立大学Guo-wei Wei教授团队共同研究认为：“有！”相关研究成果日前在线发表在国际期刊《化学评论
科学家如何保护研究敏感数据
在丢失了自己的电子设备后，美国耶鲁大学生物信息学家Mark Gerstein感到十分焦虑，因为设备里有其私人信息和研究数据。 “我非常有安全意识，但也有点健忘。”Gerstein说。 Gerstein回忆起到波士顿的一次旅行，当时他就把手机忘在了出租车上。幸运的是，Gerstein能联系到出
我国科学家“腐蚀大数据”在《自然》发表
我国科学家的一项“腐蚀大数据”的研究成果日前发表在《自然》杂志上，中国科学家率先提出“腐蚀大数据”的概念，并结合建库、建模、模拟仿真、共享和工程应用等工作，构建腐蚀学科新模式，将推动腐蚀研究成果在多领域更快速、系统化应用。 腐蚀是材料与环境作用发生化学反应并导致材料破坏的过程。材料的腐蚀涉及国
科学家开发完成水稻多组学数据整合和信息共享数据库
水稻不仅是世界近一半人口的主要粮食作物，同时也是一种重要的模式生物。高通量测序技术的迅速发展促进了水稻组学数据的广泛积累，使深入研究控制水稻重要农艺性状、种质资源多样性以及水稻驯化过程的机制成为可能。为此，研究人员构建了相关的水稻数据库，主要包括RAP-DB（日本农业生物资源研究所构建的水稻注释
科学家构建出中国种子性状数据库
植物性状是表征环境适应策略与资源分配模式的关键指标，为理解物种分布、群落构建及生态系统功能提供了重要基础。近年来，全球及区域尺度的植物性状数据库不断完善，推动了宏观生态学、功能生态学及生物多样性保护等领域的发展。然而，现有数据库主要聚焦于叶片等生长器官，种子、果实等繁殖器官的记录相对不足，形成显著的
科学家构建首个油菜基因转录数据库
近日，中国农业科学院油料作物研究所油料作物基因组学与抗病性改良创新团队破译了油菜基因组的全转录信息密码，构建了油菜十万余个基因的转录全景图，使得油菜基因功能研究第一次有了标准的可参考的基因转录数据库，将有力支撑油菜功能基因的相关研究。该项研究成果在线发表在《植物学报（The Plant Jour
科学家打造“食物周期表”数据库
人类摄入的植物和动物超过3万种。但在大多数情况下，人们对它们的成分知之甚少。研究人员只彻底分析了几百种最常见食物的分子成分，这让人们的营养知识留有巨大空白。中国种植的红藜麦。图片来源：STR/AFP VIA GETTY IMAGES据《科学》报道，上周，食品科学家和活动人士启动了一个旨在缩小这一知识
科学家搭建草莓基因组数据库
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓为蔷薇科草莓属，因芳香多汁、营养丰富受到喜爱，在全国各地均可种植。栽培草莓为异源多倍体，基因组复杂，杂合度高。 2019年，《自然—遗传学》发表了利用三代测序数据组装的高
科学家提出基因测序数据分类新标准
有助于开发出更有效的疫苗;更迅速应对潜在公共卫生突发事件 最近，美国洛斯阿拉莫斯国家实验室(LANL)的一个遗传学小组和一国际财团联合提出了一套旨在阐明可公开获取的基因测序数据信息的质量标准。新标准最终可使遗传研究人员开发出更有效的疫苗，或有助于公共健康部门或安全人员更迅速地应对潜在的公共卫生
英科学家推动共享实验动物组织细胞数据
新华社电 英国利兹大学1月13日说，目前世界各国已有200多位科研人员加入该校教授领衔建立的动物细胞组织共享数据库，随着这种实验材料共享行为不断普及，未来科学实验中活体动物的使用量有望减少。 据利兹大学介绍，这个数据库自2014年正式成立以来，目前已涵盖了近90种动物模型的细胞组织资源，欧洲、
科学家建立人类与环境相互作用数据
很多研究试图量化人类对地球影响的各个方面。但对研究人员、政策制定者和公众而言，通过整理相关数据解析人类对环境产生的实际影响是一项挑战。 美国斯坦福大学研究者创建了一个名为“人类影响数据库”（Anthroponumbers.org）的网站，收集了300多个关键数据，他们希望这些数据能帮助人们
科学家倡议共建全球人类表型组数据库
北京时间12月13日，国际人类表型组研究协作组（IHPC）第四次理事会在线召开。来自14个国家30余位协作组理事和多位表型组学领域的一流科学家出席了此次会议，就下一步加快推进人类表型组国际大科学的重要事项展开国际协商和深入探讨。 人类表型组国际大科学计划持续推进 当天的理事会上，美国医学科学
科学家开发出细胞外囊泡数据库
近日，中国科学院动物研究所、城市环境研究所开展多学科数据交叉合作，共建细胞外囊泡数据库。相关成果以EV-COMM: A database of interspecies and intercellular interactions mediated by extracellular vesicl
科学家倡议共建全球人类表型组数据库
北京时间12月13日，国际人类表型组研究协作组（IHPC）第四次理事会在线召开。来自14个国家30余位协作组理事和多位表型组学领域的一流科学家出席了此次会议，就下一步加快推进人类表型组国际大科学的重要事项展开国际协商和深入探讨。人类表型组国际大科学计划持续推进 当天的理事会上，美国医学科学院院士
日本科学家因数据问题撤销《肿瘤学》论文
据Retraction Watch网站消息，由于论文数据存在问题，日本大分大学（Oita University）Noriyuki Takai博士撤销了他发表在《肿瘤学》（Oncology）上的一篇论文。 该论文主要研究卵巢癌中组蛋白的信号通路。《肿瘤学》发布通告称，论文作者发现一些数据和原始
科学家用LAMOST数据发现超3000颗多星
银河系中约有一半的恒星处于双星系统中，双星对于研究恒星乃至银河系形成与演化至关重要。传统上，发现双星系统的主要手段之一是“掩食法”，但这一方法难以观测到不发生“掩食”的双星。光谱观测则是发现它们的有效方法。 近日，国家天文台博士研究生李春乾、研究员施建荣、“星云计划”研究员闫宏亮等研究者利用L
英科学家推动共享实验动物组织细胞数据
英国利兹大学1月13日说，目前世界各国已有200多位科研人员加入该校教授领衔建立的动物细胞组织共享数据库，随着这种实验材料共享行为不断普及，未来科学实验中活体动物的使用量有望减少。 据利兹大学介绍，这个数据库自2014年正式成立以来，目前已涵盖了近90种动物模型的细胞组织资源，欧洲、美国和澳大
科学家尝试用可穿戴设备获取数据监测健康
它们距离我们已经越来越近，我们可以自然而然地想象，它们最终和人体的相处会水乳交融。 表面传感器需要像皮肤一样灵活、可伸展。 Goran Gustafsson眼睛看着行人，脑里想着汽车——那些数十年前装配线上生产的老模型。Gustafsson说，今
一华裔科学家在美涉嫌伪造数据遭调查
发表于《自然—医学》的论文已被撤销 美国研究诚信办公室(ORI)秋季报告中披露了一起论文学术不端事件，一篇发表于2006年6月的《自然—医学》论文被宣布撤回。 这篇论文是关于自身免疫疾病的调节因子的研究，被撤稿的原因是该论文涉嫌重复使用同一张图片以及伪造数据。 论文第二作者Zh
数据+知识+AI，科学家解锁新靶标药物虚拟筛选
6月6日，中国科学院上海药物研究所研究员郑明月课题组构建了一种通用蛋白质-配体相互作用评分方法EquiScore，在药物虚拟筛选场景和先导化合物优化场景中，EquiScore对训练未见的新靶标表现出了良好的泛化性能，其可解释性分析为基于结构的药物设计提供了有价值的线索。相关研究发表于《自然—机器智能
日本科学家因数据问题撤销《肿瘤学》论文
据Retraction Watch网站消息，由于论文数据存在问题，日本大分大学（Oita University）Noriyuki Takai博士撤销了他发表在《肿瘤学》（Oncology）上的一篇论文。 该论文主要研究卵巢癌中组蛋白的信号通路。《肿瘤学》发布通告称，论文作者发现一些数据和原始
科学家提出地理大数据实时呈现新方法
地理空间数据分析在生物多样性、移动通讯、网络监控、环境监测等领域应用广泛，如生物地理分析、即时通讯场景的位置共享、手机定位、卫星定位等。因此，大规模地理数据的快速呈现具有重要的理论意义和实际应用价值。然而，由于技术难题，尚无法有效实现地理动态大数据的实时性呈现。实际上，技术问题可以被刻画为一个数
科学家组建大数据平台解决科研资源共享难题
英国敦提大学日前发布消息说，该校科学家领衔的团队构建了一个科研用大型图像数据库，利用这个平台全球科学家可方便地共享各类与科研相关的图像数据，从而提升科研效率。 来自敦提大学、剑桥大学、布里斯托尔大学以及欧洲生物信息学研究所的科学家合作开展了这个名为“图像数据资源”的项目。这个大型数据库广泛收集
英教授研究称科研数据过量引科学家热议
据《自然》报道，英国格拉斯哥大学细胞生物学家Robert Insall教授在《e生命》上发表论文指出，生物医学领域论文数量越来越多，论文的质量及信誉却在下降。 Robert Insall通过采访20位匿名美国资深科学家，对目前利用同行评议系统处理过量研究数据进行了反思。瑞典卡罗林斯卡医学院细
科学家呼吁共享新能源数据信息提高产出
可再生能源领域数据共享机制的缺乏正在阻挠技术进步，让改善能源市场错失良机。 能源产业一直在通过改变能耗速率满足人们的需求。控制一个燃油发电厂的发电量，就像改变一辆汽车的速度一样：踩下油门踏板，就会有更多汽油涌向发动机。 但风能却不能如此随心所欲。不过，智能软件却可以让风电厂提高能效，增强对位
科学家获取首个中国地区古人基因组数据
记者从中国科学院古脊椎动物与古人类研究所获悉，由该所研究员付巧妹、高星、同号文及博士后Melinda Yang领衔的古人类研究团队，与德国马普进化人类研究所等团队合作，于前不久获取了第一个中国地区古人的基因组数据。这也是截至目前东亚地区最为古老的人类基因组数据。 10月12日，这项成果以“4万
基因测癌：科学家在大数据中酝酿“中国突破”
研制鼻咽癌疫苗，引进国际先进的基因检测平台……我国科学家表示，如果加大对临床试验的数据采集和共享，有望通过基因测序技术让更多癌症患者受益。 中医提倡“治未病”，西医也在研究通过基因提前治病。一批国际知名的生命科学学者和临床医学专家，近日共同交流基因测序的最新研究成果，并探讨如何在临床转化上取得
PNAS撤销美国科学家一篇“数据造假”论文
据Retratchion Watch网站消息，《美国科学院院刊》（PNAS）发布一篇声明称，由于数据造假，撤销美国德州大学奥斯汀分校研究人员关于EB病毒的一篇。 文章的第一作者是德州大学 Jennifer Cox博士。她于2010年至2015年攻读博士学位，尚不清楚其是否已获得博士学位。
美科学家：大数据驱动的健康将革新医疗范式
“利用每个人的基因组学图谱和表型组学测量来生成一个独特的‘可操作的可能性’列表。在大多数情况下，这些积极主动的行为，经过临床研究验证，将优化健康，或防止/阻止躯体和大脑从健康向疾病的演变。当疾病演化发生时，全面的、整体的和数据驱动的方法将为精准医疗应对提供信息，即利用大规模数据分析为每个个体提供有效
科学家呼吁关注全球基因组数据库污染
样品处理有可能是导致DNA数据库广泛污染的最主要原因 2月16日发表在《公共科学图书馆·综合》（PLoS ONE）期刊上的一份研究报告称康涅狄格大学的遗传学家Mark Longo及同事发现由顶级公共测序机构提供的测序结果构建的基因组数据库中的大约1/5的细菌、植物和非灵长类动物基因