PacBioQ3收入下降，但仪器安装创新高
Pacific Biosciences公司在上周四收市后宣布，其第三季度的收入同比下降33%，因为去年第三季度收到了罗氏的1000万美元里程碑付款，而今年没有。这家单分子测序公司第三季度的总收入为1390万美元，低于华尔街预计的1580万美元。 在今年第三季度，PacBio的产品收入（包括仪器和耗材收入）增长12%，从去年同期的680万美元增长到760万美元。同时，服务及其他收入也增长27%，从220万美元增长到280万美元。 仪器收入从去年的350万美元下降至220万美元，但这一季度的PacBio RS II测序仪安装数量创下了新纪录。耗材收入则大幅增长，从去年的330万美元增至540万美元，幅度达64%。据PacBio的CEO Mike Hunkapiller介绍，如今平均每台仪器每年的耗材收入超过13.5万美元。 在本月早些时候，PacBio公司推出了新的单分子测序仪 C Sequel系统。这台高通量、可扩展的......阅读全文
数十个测序平台技术参数盘点
1.第二代测序技术1.1 Roche 454 测序平台Roche 454（Genome Sequencer 20 System）是第一个NGS测序平台，由美国454 Life Sciences公司于2005年推出，2007年被瑞士Roche公司收购。此后Roche公司在此基础上开发了Roch
华大基因引入亚洲首台Sequel测序仪更全面的基因组研究服务
2015年12月24日，中国深圳--全球最大的基因组研发机构华大基因今天宣布与实时单分子测序技术（SMRT）领导者加利福尼亚太平洋生物科学公司（Pacific Biosciences of California, Inc.，以下简称PacBio）再次合作，购入亚洲第一台Seque
单分子测序推动复杂动植物的研究
Pacific Biosciences公司近日风光无限，发布了新系统，带动股价大涨。同时，它的单分子实时（SMRT）测序技术也助力了多个植物和动物基因组的研究。这些成果近期发表在多个期刊上，展现了SMRT测序的独特魅力。 最新一期的《Nature》杂志发表了Oropetium thomaeum
－Nature等三篇论文发布SMRT测序技术新应用成果
Pacific Biosciences公司近日风光无限，发布了新系统，带动股价大涨。同时，它的单分子实时（SMRT）测序技术也助力了多个植物和动物基因组的研究。这些成果近期发表在多个期刊上，展现了SMRT测序的独特魅力。 最新一期的《Nature》杂志发表了Oropetium thomaeum
华大基因引入亚洲首台Sequel测序仪器系统
12月24日，华大基因宣布与实时单分子测序技术（SMRT）领导者加利福尼亚太平洋生物科学公司（PacificBiosciencesofCalifornia,Inc.，以下简称PacBio）再次合作，购入亚洲第一台Sequel测序系统，并有后续购买计划，会将SMRT测序平台纳入其全球业务。今年初华
Nature－子刊：第三代测序技术或将迎来新升级
第三代测序技术，即单分子测序技术，又称纳米孔测序，以美国太平洋生物（Pacific Biosciences）的 SMRT 技术为代表。DNA 测序时，不需要经过 PCR 扩增，实现对每一条 DNA 分子的单独测序。 SMRT 测序面临的一个挑战是将更长的 DNA 分子放入 100 纳米大小的零
上海伯豪三代测序服务助力梭状芽胞杆菌研究
研究背景： 含碳气体，如CO、CO2等，是重要的碳资源。构建能够高效利用含碳气体的人工细胞工厂，实现将其生物转化为石油基化学品，将为解决全球资源和能源问题开辟一条新路，对工业可持续发展具有重大意义。梭菌是一类重要的可利用含碳气体产生各类化学品的厌氧微生物。而其中，Clostridium c
Pacific－合作国内基因公司开展转化医学项目研究
Pacific Biosciences将向湖滨盘古基因公司提供PacBio® RS II DNA测序系统。 湖滨盘古基因公司已在天津东丽湖科技园建立了一个1500平方米的基因组学研究机构，致力于利用PacBio单分子实时（ SMRT® ）测序平台，进行转化医学项目研究。 “我们的目标是要成为
Sanger研究所测序3,000种危险细菌
对于人类而言，细菌扮演着多重角色，有时是亲密的伙伴，有时是致命的敌人。英国著名的Wellcome Sanger研究所近日与Pacific Biosciences（PacBio）合作，测序了3,000多种细菌的基因组，其中包括一些世界上最危险的细菌。 这些细菌是由英国国家菌种保藏中心（NCTC
长读长测序显优势－基因组复杂结构变异检测实现新突破
基因组结构变异是很多癌症、遗传病等疾病的重要诱因。目前基于二代测序技术检测基因组结构变异存在很大的局限性，而三代测序存在错误率较高等多种问题，尤其针对复杂结构变异大多软件识别能力较差。针对这一问题，近日，在Nature Methods发表的一项最新研究中，研究人员开发了基因组比对工具NGMLR和
DNA测序仪相关
分析或打印出彩色测序图谱 上机操作按仪器操作说明书安装毛细管，进行毛细管位置的校正，人工手动灌胶和建立运行的测序顺序文件。仪器将自动灌胶至毛细管，1.2kv预电泳5min，按编程次序自动进样，再预电泳(1.2kv，20min)，在7.5kv下电泳2h。电泳结束后仪器会自动清洗，灌胶，进下一样品
DNA测序仪原理
abi prism 310型基因分析仪(即dna测序仪)，采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳，应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddntp(标记终止物法)，因此通过单引物pcr测序反应，生成的pcr产物则是相差1个碱基的3''''末端为4种不同荧光染料的单
计算/DNA测序仪
测序反应精确度计算公式：100%－差异碱基数(不包括n数)/650×100%差异碱基即测定的dna序列与已知标准dna序列比较不同的碱基，n为仪器不能辨读的碱基。
DNA测序仪定义
DNA序列测定分手工测序和自动测序，手工测序包括sanger双脱氧链终止法和maxam-gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今 dna序列分析的主流。美国pe abi公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等dna测序仪，其中310型是临床检测实验室中使用最多
基因测序仪定义
基因测序仪又称DNA测序仪，是测定DNA片段的碱基顺序、种类和定量的仪器。主要应用在人类基因组测序、人类遗传病、传染病和癌症的基因诊断、法医的亲子鉴定和个体识别、生物工程药物的筛选、动植物杂交育种等方面。
AB－SOLiD测序仪
AB SOLiD测序仪可以对由任何方法制成的DNA文库进行测序。AB SOLiD测序仪有一个极大的特点就 是能够将富集模板片段的微珠在芯片上进行高度可控的任意排列。AB SOLiD测序仪也是使用如图5a中所示 的微乳液PCR方法扩增模板片段的，不过，它这里使用的是直径只有1μm的小磁珠。PCR扩增反
基因测序仪分类
根据电泳类型分为平板型电泳和毛细管电泳两类： 1. 平板型电泳：平板型电泳的凝胶灌制在两块玻璃板中，聚合后厚度一般小于0.4mm或更薄，因此又称为超薄片层凝胶电泳。是经典的电泳技术，具有样品判读序列长（600-900bp）、一块凝胶板上可同时进行多个样品测序的优点。 2. 毛细管电泳：将凝胶
基因测序仪原理
目前DNA测序仪的工作原理主要基于Sanger发明的双脱氧链末端终止法或Maxam-Gilbert发明的化学降解法。这两种方法在原理上虽然不同，但都是根据在某一固定的位点开始核苷酸链的延伸，随机在某一个特定的碱基处终止，产生以A、T、C、G为末端的四组不同长度的一系列核苷酸链，在变性聚丙烯酰胺凝
RNAseq综述（二）
短读长cDNA测序短读长已经成了在整个转录组范围内对基因进行检测和定量的事实方法(de facto method)，部分原因是这种方法比芯片成本更低，操作更方便，但是其主要原因还是因为这种方法能生成更全面，更高质量的数据，这种方法能够 对整个转录组中的基因表达水平进行定量。使用Illumina短读长
科研人员开发出低DNA用量、无扩增的PacBio建库技术
基因组信息在生命科学研究中具有重要价值。基于三代长读长的测序组装越来越广泛地应用于基因组学研究。其中，PacBio高保真测序技术因高精度的测序质量被认为是三代测序的金标准。然而，PacBio标准建库方法需要大量DNA输入，限制了其在小型昆虫或珍稀样本中的应用。DNA扩增虽然可以降低样本输入量，但
动物所等开发出低DNA用量、无扩增的PacBio建库技术
基因组信息在生命科学研究中具有重要价值。基于三代长读长的测序组装越来越广泛地应用于基因组学研究。其中，PacBio高保真测序技术因高精度的测序质量被认为是三代测序的金标准。然而，PacBio标准建库方法需要大量DNA输入，限制了其在小型昆虫或珍稀样本中的应用。DNA扩增虽然可以降低样本输入量，但会引
继英国之后，Illumina收购PacBio再受美国监管机构反对
当地时间2019年12月17日，美国联邦贸易委员会（Federal Trade Commission，FTC）宣布已授权采取行动，以阻止Illumina提出的以12亿美元收购PacBio的交易。 FTC在一份尚未公开的行政申诉中表示，Illumina试图通过“合并作为新生竞争威胁的PacBio
PacBio－HiFi助力破译高度复杂的LPA串联重复序列的变异
背景介绍Lp (a)脂蛋白是冠状动脉疾病风险的重要因素，其表达与LPA基因的长度有关。不同种族/民族之间血浆中 LP (a)的水平存在显著差异性。个体之间在LP (a)水平上的差异也是巨大的，其变化范围能达到平均水平的3倍。例如，非洲人后裔的血浆LP (a)水平是欧洲或亚洲人的2-3倍。之前的研究证
单分子测序揭示艾滋病毒可变剪切新模式
最新一期Nucleic Acids Research上发表了一篇利用PacBio单分子测序方法对HIV-1病毒转录组可变剪切模式的研究。HIV-1病毒是一种典型的RNA病毒，其基因组比目前已知的任何一种病毒基因组都复杂。HIV-1只有一个转录起始位点，却有多种剪切异构体，是研究可变剪切的一种
三代测序服务助力梭状芽胞杆菌研究
研究背景：含碳气体，如CO、CO2等，是重要的碳资源。构建能够高效利用含碳气体的人工细胞工厂，实现将其生物转化为石油基化学品，将为解决全球资源和能源问题开辟一条新路，对工业可持续发展具有重大意义。梭菌是一类重要的可利用含碳气体产生各类化学品的厌氧微生物。而其中，Clostridium carboxi
PCR仪的安装
应安放在湿度较低、灰尘较少并远离水源和热源的地方，无腐蚀性气体或强磁场干扰。 环境温度建议在18~35℃之间。仪器之间应保持50cm 以上距离，降低仪器之间的影响。
详解牛津纳米孔测序仪
牛津纳米孔测序仪在美国人类遗传学学会年会上公布技术参数 2014年的ASHG年会于10月18日开始在圣地亚哥举行，有幸亲眼目睹了牛津纳米孔公司MinIon的现场演示，技术之创新，令人震惊!21日下午，牛津纳米孔公司特地在旁边的Hardrockho举行了一个小型的封闭式的技术说明会，讲解了纳米孔的
HiFi测序：单碱基分辨率的高通量端粒长度测量方法
端粒是线状染色体末端的特殊核蛋白结构，包含约5-15 kb的富含TTAGGG的双链重复序列和保护染色体末端的shelterin蛋白复合物，3'末端为富含G的单链悬突，对于维持人类基因组的稳定和完整复制至关重要。 端粒主要依赖端粒酶进行合成，长度也并非一成不变。除了生殖细胞和干细胞，体细
一台笔记本电脑、一个USB！科学家在南极完成了测序
在过去的几年中，研究界和商业界已经开始开发能用于野外现场研究的测序仪，牛津纳米孔技术就是典型的例子之一。牛津纳米孔公司的MinION测序仪是这几年备受瞩目的一款手持式纳米孔测序商业设备，去年人家可是上过太空的，它也是唯一上过太空的测序仪。如今，科学家们又仅凭一台MinION设备、一台便携式电脑就
带您了解单分子测序技术
单分子测序技术，也被称为纳米测序技术，是通过纳米孔只允许一条链进入的方式，根据碱基的荧光或者电流阻断来识别碱基序列的一种新型测序技术。这种技术包括PacBio技术和Nanopore技术两种主要方法。 PacBio技术主要是利用荧光标记不同的碱基与待测序列、DNA聚合酶一起放入纳米孔底部。当DN