上海生科院科研人员研发了premRNA可变剪接分析软件CASH
4 月 6 日，国际著名生物信息学期刊 Briefings in Bioinformatics 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）冯英组和浙江农林大学吴文武博士，上海列冰生物科技有限公司宗杰博士的最新研究进展“CASH： a constructing comprehensive splice site method for detecting alternative splicing events”。该研究开发了 pre-mRNA 可变剪接分析软件 CASH（Comprehensive Alternative Splicing Hunting），并利用该软件研究了剪接蛋白 SRSF10 在不同物种中的剪接调控模式的保守和演化。 pre-mRNA 可变剪接事件的发现，是研究可变剪接的前提步骤，而基因组注释（包括人类、拟南芥等最受重视的模式生物）存在不准确或未注释的可变剪接；不同细胞或组织中往往又存在异常的......阅读全文
上海生科院科研人员研发了－premRNA可变剪接分析软件CASH
4 月 6 日，国际著名生物信息学期刊 Briefings in Bioinformatics 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）冯英组和浙江农林大学吴文武博士，上海列冰生物科技有限公司宗杰博士的最新研究进展“CASH： a constructing comprehensiv
环形RNA可变反向剪接和可变剪接表达图谱被系统绘制
6月30日，国际学术期刊Genome Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所杨力研究组和生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于环形RNA研究的最新进展：Diverse alternative back-splicing and alternative spl
关于可变剪接的基本介绍
可变剪接(alternative splicing)是指在同一个mRNA前体内部数个外显子之间产生的差异性连接。这种剪接可以使同一个基因在不同的发育阶段、不同分化状态甚至不同生理状态下,得到多个相似但有差异的mRNA,进而被翻译为氨基酸序列相近似、性质和功能有差异的蛋白质。高度通用性的剪接位点G
tRAS（转录组可变剪接调控深度分析）
本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了专业高效的生物信息分析流程，对您获得的海量RNA-seq序列的质量、特征等重要信息进行图形可视化；根据对照和实验组，系统分析您样品中所蕴藏的可变剪接调控规律，中肯分析所揭示出的重要科学规律；让您快速“发现”所关注的生物学，医学和农业问题的答案。 我们
调控玉米性状－可变剪接“火”起来
可变剪接，这个早在上世纪就被提出的概念，在近几年的研究中，又“火”了起来。科学家们发现，可变剪接不仅丰富蛋白质组多样性，还在生物体内起着重要的调控作用。 可变剪接是什么？这项研究有了什么新发现？是怎样得出来的？实验中的难点是什么？对之后的研究有怎样的借鉴意义？科技日报就此采访了该研究团队。
调控玉米性状－可变剪接“火”起来
最近，中国农业大学国家玉米改良中心田丰教授团队与杨小红教授团队合作研究，以368份玉米自交系未成熟籽粒为实验材料，定位玉米种全基因组水平QTL(数量性状位点），全面解析了其可变剪接的调控机制，并为研究表型变异提供了重要线索。相关论文近日发表在《植物细胞》杂志上。 可变剪接，这个早在上世纪就
premRNA中存在的修饰及其对剪接影响
2018年10月7日 讯 /生物谷BIOON/--日前，作为“诺贝尔奖风向标”的拉斯克奖——拉斯克·科什兰医学特殊成就奖颁给了Joan Argetsinger Steitz教授（致敬Joan Steitz！2018年拉斯克特别成就奖获得者），以表彰她在生物医学领域，尤其是RNA生物学领域中所发挥
Nature：U6－snRNP在premRNA剪接中的作用
前体信使RNAs (pre-mRNAs) 被剪接体(它由五个被称为snRNPs的子复合物组成)和其他辅助因子处理。每个snRNP含有一个由7个成分构成的蛋白环结构和一个相关的RNA分子。 施一公及同事获得了U6 snRNP的Lsm蛋白环在有和没有一个包含U6 snRNA的3′端的
杨力受邀发表MolecularCell综述解析可变剪接
中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所杨力研究组受邀在《分子细胞》（Molecular Cell）发表了题为RNA structure switches RBP binding 的专评文章，对该刊同期发表的一项题为RNA sequence context effects measured in
遗传发育所在大豆可变剪接研究中取得进展
作为一种重要的基因转录后调控机制，可变剪接在真核生物中普遍发生，在基因表达和功能多样性调控中起着重要的作用。不同物种、同一物种的不同组织以及不同基因家族的可变剪接在形式和比例上都存在差异，然而，决定这些差异的因素还尚不为人知。 中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜课题组通过对来自大豆不同
新研究揭示可变剪接调控光形态建成的分子机制
太阳光不仅是植物光合作用的能量来源，也是一种重要的环境信号，调节植物的生长发育进程。其中幼苗光形态建成受光质、光量的精确调控，涉及不同的光受体和一系列信号调控因子。COP1是光形态建成的一个明星蛋白，它作为一种E3泛素连接酶，与目标蛋白互作并促进其降解，COP1在植物和动物中广泛存在。真核生物
tNAS（转录组新可变剪接位点的发现）
本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了专业高效的生物信息分析流程，对您获得的海量RNA-seq序列的质量、特征等重要信息进行图形可视化；发现您样品中的新可变剪接事件，揭示出的重要科学问题进行中肯分析；让您快速“发现”所关注生物学问题，医学问题和农业问题的答案。 我们的流程：1. Pr
GUT揭示癌症治疗靶点调控RNA可变剪接的分子机制
来自浙江大学基础医学院，中国药科大学等处的研究人员发表了题为“SRSF6-Regulated Alternative Splicing that Promotes Tumor Progression Offers a Therapy Target for Colorectal Cancer”的文
肺癌细胞中异常剪接的关键调控因子
Pre-mRNA可变剪接是一种增加基因组多样性和调控基因表达的重要机制。在肿瘤的发生发展过程中，许多剪接事件发生异常变化。然而，我们并不清楚这些异常剪接事件是如何产生的，异常剪接产物对肿瘤细胞的生物学功能产生什么影响。肺癌是最常见的恶性肿瘤之一，在全球范围是癌症相关致死的头号杀手。由于缺乏有效的
上海生科院揭示RNA可变剪接在细胞周期时序性的调控机制
3月25日，国际学术期刊Elife 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所王泽峰研究组的最新论文“An extensive program of periodic alternative splicing linked to cell cycle progression”。该工作
上海生科院发现肺癌细胞中异常剪接的关键调控因子
4月10日，国际学术期刊PLOS Genetics 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所惠静毅课题组题为The RNA-binding protein QKI suppresses cancer-associated aberrant splicing 的研究
JECCR：中南大学湘雅三医院团队发现肝癌发生新机制！
作为最常见的消化系统恶性肿瘤之一，肝细胞癌（HCC）已成为全球癌症相关死亡的第四大原因，是严重威胁人类健康的重大疾病[1]。 肝癌的发病过程涉及众多异常表达的基因及相应信号通路，目前研究已表明基因表达的RNA转录后调控异常是导致肝癌的重要机制[2]。 可变剪接（AS）是一种常见的转录后调控方式，通过
酵母剪接体分析实验
实验方法原理 前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋白复合体，它由 5 种 snRNP 和大量的非 snRNP 蛋白组成，每一种 snRNP 由一个 snRNA 和几种蛋白质构成。
酵母剪接体分析实验
前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋白复合体，它由 5 种 snRNP 和大量的非 snRNP 蛋白组成，每一种 snRNP 由一个 snRNA 和几种蛋白质构成。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验方法原理前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋
前剪接体和剪接体的分离及分析实验
剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体（RNP)，它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成，在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验方法原理剪接体是由 RNA 和蛋白质
前剪接体和剪接体的分离及分析实验
实验方法原理 剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体（RNP)，它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成，在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。
前剪接体和剪接体的分离及分析实验
实验方法原理 剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体（RNP)，它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成，在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。实验材料 PIP 10 载体核苷酸焦磷酸酶RNasinT7 RNA 聚合酶
真核premRNA加工过程
mRNA的加工在真核生物、细菌和古细菌中差异很大。实质上，非真核mRNA在转录时是成熟的，除极少数情况外不需要加工。然而，真核pre-mRNA需要大量加工。5’端加帽子：5‘ 帽（也称为RNA帽，RNA 7-甲基鸟苷帽或RNA m7G帽）就是一个经修饰的鸟嘌呤核苷酸，在转录开始不久后就被添加到新产生
清华施一公院士Science同期发表两篇新文章
清华大学的施一公（Yigong Shi）教授是国际著名的结构生物学家，在细胞凋亡、大分子机器、膜蛋白研究领域占据国际领先地位。曾荣获国际赛克勒生物物理学奖、香港求是基金会杰出科学家奖、谈家桢生命科学终身成就奖、瑞典皇家科学院爱明诺夫奖等多个国内外大奖。 2008年施一公放弃国外的优厚条件选择回
MassARRAY®－分析软件
MassARRAY® 分析软件是一套模块化应用程序，用于基因分型、甲基化、基因表达、拷贝数变异等多种应用的数据分析。以MassARRAY® Typer4软件为例，该软件用于MassARRAY系统的iPLEX SNP基因分型。用户可利用它进行分析结果的评估和管理，通过表格和图形格式进行数据的可视化，
酵母剪接体分析实验（一）
实验方法原理 前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋白复合体，它由 5 种 snRNP 和大量的非 snRNP 蛋白组成，每一种 snRNP 由一个 snRNA 和几种蛋白质构成。试剂、试剂盒 Tris HCI 溶液EDTATE乙酸钠SDSRNA 的匀浆缓冲液RNA 的溶解缓冲液T
酵母剪接体分析实验（二）
4. 设备(1) 液氮 （N2）。(2) 离心机，匀浆器，旋转真空浓缩仪。(3) 各种试管、离心管。(4) 玻璃板：一块为 26.5 cm 高、20.2 cm 宽、0.4 cm 厚。带凹口的玻璃板尺寸同前一块，但带一 2.2 cm 深、16.3 cm 宽的凹口。(5) 聚四氟乙烯垫片和梳子：垫片和梳
赵方庆团队开发环形RNA定量和差异表达分析新方法
2020年1月3日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-通讯》（Nature Communications）杂志上发表题为Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform sw
研究人员开发环形RNA定量和剪接体转换识别新方法
2020年1月3日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-通讯》（Nature Communications）杂志上发表题为Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform sw
清华施一公院士Science同期发表两篇新文章
清华大学的施一公（Yigong Shi）教授是国际著名的结构生物学家，在细胞凋亡、大分子机器、膜蛋白研究领域占据国际领先地位。曾荣获国际赛克勒生物物理学奖、香港求是基金会杰出科 学家奖、谈家桢生命科学终身成就奖、瑞典皇家科学院爱明诺夫奖等多个国内外大奖。2008年施一公放弃国外的优厚条件选择回国