上海生科院通过生物大数据揭示反式剪接的基因演化功能
11月2日，Nature Communications 发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李轩研究组题为The evolutionary landscape of intergenic trans-splicing events in insects 的研究论文。该工作揭示了反式剪接引导基因功能多样化的过程，并首次阐述了反式剪接在维持破碎基因功能方面的作用。 真核生物的基因具有复杂的剪接（splicing）机制。与比较常见的发生在同一个转录本（pre-mRNA）上的顺式剪接(cis-splicing)不同，RNA反式剪接(trans-splicing)是将不同基因转录本上的外显子连接起来，形成嵌合mRNA的现象。虽然真核生物中已有一些基因反式剪接案例的报道，但反式剪接的一些关键问题仍然没有得到解决: 包括反式剪接是剪接过程中的噪音还是具有显著的生物学功能？基因反式剪接在多大程度上影响了一个物种的转录组和蛋......阅读全文
上海生科院发现肿瘤恶病质的潜在基因治疗方法
12月5日，国际学术期刊《分子治疗》（Molecular Therapy）发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所丁秋蓉研究组的最新研究成果Prevention of Muscle Wasting by CRISPR/Cas9 -mediated Disruption of Myosta
上海生科院开发出肿瘤基因组等位基因特异性表达新算法
7月13日，国际学术期刊Bioinformatics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所李亦学研究组的最新研究论文cisASE: A likelihood-based method for detecting putative cis-regulated allele-spec
上海生科院开发出肿瘤基因组等位基因特异性表达新算法
7月13日，国际学术期刊Bioinformatics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所李亦学研究组的最新研究论文cisASE: A likelihood-based method for detecting putative cis-regulated allele-spec
上海生科院发现胰岛素调控肝脏生物钟的分子机制
8月31日，国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所刘浥研究组的最新研究论文Insulin post-transcriptionally modulates Bmal1 protein to affect the
上海生科院发现转录中介体基因能够控制肥胖及糖尿病
9月16日，国际学术期刊Cell Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王纲研究组的最新研究成果，该工作发现在小鼠肝脏中删除中介体MED23基因能够减缓肥胖和糖尿病的发生发展, 揭示了中介体MED23在肝脏糖脂代谢调控和糖尿病发生发展过程中的作用及机制
上海生科院利用CRISPR/Cpf1系统实现水稻多基因定点编辑
3月19日，《分子植物》（Molecular Plant）杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Multiplex Gene Editing in Rice using the CRISPR-Cpf1 System 的研究论文。该工作在水稻中利用CRIS
上海生科院Science解析重要分子机制
来自中国科学院上海生命科学研究院的研究人员，在对多年生草本植物弯曲碎米荠(Cardamine flexuosa)的研究中揭示了年龄相关性春化作用的分子基础。相关论文“Molecular Basis of Age-Dependent Vernalization in Cardamine f
上海生科院揭示等位遗传调控机制
5月14日，国际学术期刊Cell Reports在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Involvement of multiple gene silencing pathways in a paramutation-like phenomenon in A
上海生科院举办第一作者讲坛
会议现场 10月26日下午，由中科院上海生命科学研究院研究生部主办的“第一作者讲坛”第68期报告在中科大厦举行，上海生科院健康科学研究所戈宝学研究员指导的严大鹏博士作了以“细菌安插‘内应’，假传体内‘太平’”为题的精彩报告。 报告是以严大鹏所在课题组最近的研究成果为切入口
张亚平到上海生科院调研
11月9日至10日，中国科学院副院长张亚平率队赴中科院上海生命科学研究院调研指导工作。期间，他出席了中国科学院战略性先导科技专项（B类）《脑功能联结图谱》实施工作会议，并听取了生科院关于上海植物逆境生物学研究中心筹建情况等方面的汇报。 在中国科学院战略性先导科技专项（B类）《
华大揭秘企鹅的演化历程与适应环境的“基因秘诀”
作为南半球的标志性物种之一，企鹅虽为鸟类，却不会飞翔。它们是如何发生演化，抛弃蓝天转而适应了海洋的生态系统，又是如何在地球上最极端的环境中生存下来的？近日，深圳华大生命科学研究院领衔的一项研究通过多学科联合的方式重建了企鹅的起源与演化过程，并以此为案例揭示了环境变化、气候及地质事件对生物演化的作用，
上海生科院生物技术中心两个科技成果转化项目奠基
奠基仪式现场 4月25日，中科院上海生命科学研究院湖州工业生物技术中心科技成果转化项目——浙江中科瑞泰生物科技有限公司和浙江中科鸿安生物工程有限公司项目举行奠基仪式。中科院副院长李家洋，湖州市委副书记、市长马以，市委副书记朱坤民，副市长周杰、沈建平，中科院院地合作局局长戚强、生命
上海生科院等揭示miRNA在植物非生物胁迫中的重要作用
11月3日，PLoS Genetics杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组与其合作者完成的题为The miR165/166 Mediated Regulatory Module Plays Critical Roles in ABA Homeostasis
上海生科院在植物微生物相互作用研究中取得重要进展
6月8日，国际学术期刊《科学》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所王二涛研究组关于植物-微生物相互作用的最新研究成果。研究论文Plants transfer lipids to sustain colonization by mutualistic mycorrhizal a
上海生科院揭示长非编码RNA对MYC基因转录调控的分子机制
5月5日，中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲课题组在《细胞研究》(Cell Research)发表当期封面文章Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-range chromatin
上海生科院发现小分子RNA靶基因介导植物抗热途径新机制
4月11日，中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所何玉科研究组在Plant Cell 杂志上在线发表题为HEAT-INDUCED TAS1 TARGET1 Mediates Thermotolerance via HEAT STRESS TRANSCRIPTION FACTOR
上海生科院举办食品安全风暴论坛
11月30日下午，求索讲坛年终特辑“食品安全风暴论坛”在中科院上海生命科学研究院举行。本次讲坛邀请了第一财经“头脑风暴”节目主持人、零点研究咨询集团董事长袁岳担任嘉宾主持。上海交通大学生命科学技术学院副院长张大兵教授、家乐福中国食品安全总监柏韦亚(Xavier Bodenes)、江南大学食品
上海生科院揭示根系发生的新通路
种子植物的根系由主根、侧根和不定根共同组成。主根起始于胚胎发育时期，侧根和不定根则不断补充胚后发育的根系系统。传统教科书中对侧根的描述为“根上发生的根”，而不定根是“非根器官上发生的根”。8月29日，中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所徐麟研究组题为Non-canonical WOX1
上海生科院揭示大脑编码情绪的模式
生活中充满了七情六欲，喜乐哀愁。为什么人们高兴时心花怒放，如步云端，痛苦时又五内俱焚，似坠深渊？在这些情绪的背后，大脑中发生了些什么样的变化？大脑如何使人表现欢喜或悲伤，又怎样让人心弦微动或被情绪的风暴席卷而无法自拔？情绪使生活多姿多彩，帮助人们趋利避害，对生存和生活至关重要。然而，长久以来
上海生科院揭示根系发生的新通路
种子植物的根系由主根、侧根和不定根共同组成。主根起始于胚胎发育时期，侧根和不定根则不断补充胚后发育的根系系统。传统教科书中对侧根的描述为“根上发生的根”，而不定根是“非根器官上发生的根”。8月29日，中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所徐麟研究组题为Non-canonical WOX1
上海生科院CancerRes癌症研究新发现
来自中科院上海生命科学研究院营养科学研究所的研究人员在新研究中证实，TRAF6上调了HIF-1α表达，促进了肿瘤血管生成。相关论文发表在5月30日的《癌症研究》(Cancer Research)杂志上。 论文的通讯作者是中科院上海生命科学研究院营养科学研究所的方靖(Jing Fan
Illumina与PacBio测序数据帮助质体基因组多样性演化机制
近日，中科院植物研究所研究员张宪春、副研究员向巧萍等揭示了自养维管植物中目前已知最特异的质体基因组。相关研究成果发表于《植物学报》。近年来质体基因组研究揭示了复杂多样的结构和序列变异，对教科书上经典的四分体结构提出了挑战。质体基因组多样性演化的机制常被笼统地诉诸于DNA修复系统可能存在缺陷。科研人员
－生物医学基因大数据：现状与展望
生物医学大数据广泛涉及人类健康相关的各个领域：临床医疗、公共卫生、医药研发、医疗市场与费用、个体行为与情绪、人类遗传学与组学、社会人口学、环境、健康网络与媒体数据。 大数据(big data)是指由于容量太大和过于复杂，无法在一定时间内用常规软件对其内容进行抓取、管理、存储、检索、共享、传输和
我国学者发现奥陶纪末大灭绝后古生物地理演化规律
生物大灭绝事件不仅使生态系统和生态结构遭受重创，也会对全球古生物地理格局产生影响，相关研究不胜枚举。然而关于灭绝事件对其后古生物地理的长期影响却罕有探讨。有国外学者对二叠纪末大灭绝后陆生脊椎动物的最新研究发现，存在广布分子在复苏期显著增加，而复苏期之后又减少的有趣现象。 近期，中国科学院南京地
“生物信息学基础信息整编”项目实施方案论证会在沪举行
“生物信息学基础信息整编”项目实施方案论证暨启动会在沪举行 6月2日，国家科技基础性工作专项重点项目“生物信息学基础信息整编”项目实施方案论证暨启动会在上海生科院举行。科技部基础研究司司长张先恩、综合与基础性工作处处长沈建磊，上海市科委施强华副巡视员，中科院计划财务局副局长
上海生科院揭示tRNA氨基酸在蛋白质生物合成中的作用
上海生科院揭示了tRNA氨基酸接受末端在蛋白质生物合成及其精确性调控中的作用 7月20日，《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所王恩多研究组的最新研究成果。该研究揭示了tRNA氨基酸接受末端在蛋白质生物合成及其精确性
上海生科院揭示虫草素和喷司他丁伴随生物合成分子机制
10月19日，中国科学院上海生命科学研究院上海植物生理生态研究所王成树研究组的最新研究成果，以Fungal cordycepin biosynthesis is coupled with the production of the safeguard molecule pentostatin为题
上海生科院在放线菌天然产物的合成生物学方面取得进展
1月11日，国际学术期刊《代谢工程》（Metabolic Engineering）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物生理生态研究所姜卫红研究组题为Multiplexed site-specific genome engineering for overproducing bioact
上海生科院提出高效新方法定位具进化优势的基因突变
8月18日，国际学术期刊Molecular Biology and Evolution 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所博士生汪敏先的最新研究论文Detecting Recent Positive Selection with High Accuracy and Relia
上海生科院科研人员研发了－premRNA可变剪接分析软件CASH
4 月 6 日，国际著名生物信息学期刊 Briefings in Bioinformatics 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）冯英组和浙江农林大学吴文武博士，上海列冰生物科技有限公司宗杰博士的最新研究进展“CASH： a constructing comprehensiv