AACR:“GENIE”呼之欲出,志在共享癌症基因组临床数据
11月6日,Genomeweb报道,美国癌症研究协会(AACR)推出了一项叫做“GENIE”的国际基因组和临床数据共享项目,旨在将不同癌症中心的基因组和结果数据汇总起来。 该项目中的“GENIE”寓意Genomics(基因组学)、Evidence(证据)、Neoplasia(肿瘤)Information(信息)Exchange(交换),是这5个单词的首字母缩写。 “GENIE”项目的启动阶段由来自美国,加拿大和欧洲的七个创始成员和两个信息合作伙伴参与,共享他们拥有的肿瘤患者临床测序数据。 这个联盟的创始成员包括: 荷兰乌德勒支个性化癌症治疗中心(the Center for Personalized Cancer Treatment in Utrecht, the Netherlands);波士顿Dana-Farber癌症研究所(Dana-Farber Cancer Institute in Boston);法国维勒瑞......阅读全文
利用大规模比较基因组学绘制A群链球菌候选疫苗图谱
近日,澳大利亚昆士兰大学等科研人员在Nature Genetics上发表了题为“Atlas of group Astreptococcalvaccine candidates compiled using large-scale comparative genomics”的文章,利用大规模比较基
中科院微生物所在细菌耐药基因组学研究获进展
中科院微生物所朱宝利课题组在细菌耐药基因组学研究中的最新进展,研究首次以基因组学大数据为依托,深入解析了耐药基因在细菌间的传播网络和规律,对深入认识细菌耐药性的进化、细菌耐药的形成机制等具有重要意义。成果近日在线发表于《应用与环境微生物学》,并将于第82卷22期以“封面故事”形式发表。副研究员
东北地理所发表大豆基因克隆及功能基因组学综述文章
中科院东北地理与农业生态研究所大豆分子育种实验室夏正俊研究员近期发表了中英文综述文章,重点介绍了大豆生育期基因的克隆及大豆光周期反应机理等方面所取得的进展。 自上世纪20年代伊始,美国科学家以大豆等作物为材料发现光周期现象近百年来,人们对该现象的研究在模式作物拟南芥及水稻中研究取得了一系列
上海市资源植物功能基因组学重点实验室通过验收
2016年12月13日,上海市资源植物功能基因组学重点实验室验收会于上海辰山植物园(中国科学院上海辰山植物科学研究中心)举行。会议由上海市科委基地处周婧主持,上海市科委基地处处长过浩敏处长、7名验收评审专家及重点实验室相关领导和人员出席了本次验收会。 会上,辰山科研中心副主任马金双研究员对科委
北京生科院等在大型褐藻海带群体基因组学研究中取得进展
4月24日,国际学术期刊Nature Communications在线发表了中国科学院北京生命科学研究院研究员赵方庆团队与中国水产科学院黄海水产研究所和复旦大学合作研究的研究论文Saccharina genomes provide novel insight into kelp biology。
武汉病毒所蝙蝠飞行和免疫适应进化基因组学研究获进展
近期,由5个国家9个实验室组成的联合研究团队解析了2种蝙蝠的全基因组序列。这2种蝙蝠分别来自澳大利亚的大蝙蝠狐蝠(Pteropus.alecto)和中国的小蝙蝠大卫鼠耳蝠(Myotis.davidii)。分析结果提供了蝙蝠飞行、免疫系统及其它独特生物学特性的适应性进化的生物信息学
动物所发表鸟类适应青藏高原特殊环境的基因组学证据
地山雀(Parus humilis)是青藏高原的特有鸟种,属山雀科鸟类。由于其形态特征与地鸦相近,曾长期被认为是鸦科鸟类,并被命名为“褐背拟地鸦”。 中科院动物研究所动物进化与系统学院重点实验室雷富民研究员领导的鸟类学研究组与诺禾致源合作,对地山雀开展全基因组de novo测序,同
冠状动脉钙化机制揭示:基因组学研究发现新的遗传因素
由美国马萨诸塞州总医院等中心的研究人员领导的国际团队已经找到了导致冠状动脉钙化(CAC)的新的和已知的遗传因素,这是一种由动脉粥样斑块标志的病症,可能增加患心脏病的风险。马萨诸塞州总医院心脏病学家,MGH心血管研究中心的研究员、共同资深作者和共同通讯作者拉吉夫·马尔霍特拉(Rajeev Malhot
农科院生物所搭建全国玉米功能基因组学研究协作平台
近日,由中国农业科学院生物技术研究所、安徽农业大学和齐鲁师范学院共同主办的第四届全国玉米功能基因组学术研讨会在海南三亚召开。会议旨在通过创新共享玉米EMS突变体库种质材料,搭建全国玉米功能基因组研究协作平台,协力推动我国玉米功能基因组学研究迈上新台阶。 会议特邀国家玉米产业技术体系首席科学家、
广州地化所发展出单细胞SIP反向基因组学技术
微生物是地球上丰富且分布广泛的生命形式,在生态系统中对有机物的生物地球化学循环发挥着关键作用。微生物降解是有机污染物分解过程中的重要环节。其中,降解功能微生物可将污染物转化为无毒化合物,是有机污染物降解的执行者。因此,研究原位降解功能微生物的种类和代谢特性,并从复杂环境微生物群落中发掘具有“特定
PNAS:与珊瑚有关的微生物群的宏基因组学
对珊瑚礁相关微生物群落的一个大尺度宏基因组学调查表明,这些微生物的分类学组成最多地受到了珊瑚和水藻等深海底大生物体的影响,而它们的代谢特化随着局部海洋学状况而变化。微生物群落影响相关珊瑚礁的健康,但是支配微生物群落结构和基因流的机制在很大程度上仍然未知。 Linda Wegley Kelly
2012营养基因组学与代谢健康国际会议在沪举行
为了促进在营养基因组学在代谢与健康领域方面的研究,推动促进国际国内学术交流和科研合作,由中国科学院营养与代谢重点实验室牵头,联合上海交通大学公共卫生学院、哈佛大学营养系和加拿大拉瓦尔大学于10月15日至16日在上海举办了“2012营养基因组学与代谢健康国际会议”。 会议主要围绕营养基因组学
直击化妆品,护肤品:基因组学和芯片新技术
科技的发展越来越贴近生活,譬如化妆品,护肤品之类也更多的加入了高科技元素,目前科学家们正利用基因芯片等生物学技术分析年轻肌肤的秘密,了解为何衰老的皮肤会出现凹陷,皱纹,以及斑点,然后寻找能激活在衰老或日照受损过程中丢失的基因分子,从而令肌肤恢复紧致和肤色均匀。一些市面上的皮肤护理产品,如Olay
昆明植物所山茶属代表植物比较叶绿体基因组学研究获进展
山茶属是山茶科中包含许多举世闻名经济植物的一个重要类群,包括为人类提供天然保健饮料的茶(Camellia sinensis var. assamica 和C. sinensis var. sinensis),健康型高级食用植物油的油茶(C. oleifera)以及观赏花卉云南山茶(C. reti
浙大樊龙江团队如何从基因组学角度证实作物拟态的存在
稗草(Echinochloa crus-galli)是田间头号杂草,为了除掉它,人类已经努力了几千年。浙江大学农业生物与技术学院樊龙江教授团队与中国水稻所等单位合作研究最新发现,为了避免人类的“驱逐”,田间的稗草们竟学会了“伪装”。几千年来,它们与水稻越长越像,从原来松垮贴地的懒样子,进化出了今
新方向:基因组学助力心血管疾病的精准用药
心血管疾病是目前全球面临的一种致死率较高的疾病。根据2013年WHO统计数据,预计到2030全球将有2300万人死于心血管疾病。多年生命医学研究,已经让人类在治疗心血管疾病领域取得了相当大的进展。对致病因素(高血压、2型糖尿病、吸烟和缺乏运动等)积极管理和治疗药物的研发,让心血管疾病患者的死亡率
Illumina公布2020年Q2财报:基因组学业务潜力无限
分析测试百科网讯 Illumina公司今天公布了其2020财年第二季度的财务业绩。 2020年第二季度的结果反映了全球COVID-19大流行病的影响: 收入6.33亿美元,与2019年第二季度的8.38亿美元相比下降了25% Illumina股东在该季度的公认会计准则净收益为4700万美元
武汉植物园在裸子植物叶绿体基因组学研究方面获进展
篦子三尖杉(Cephalotaxus oliveri)是我国特有珍稀濒危植物,属裸子植物三尖杉科(Cephalotaxaceae)三尖杉属(Cephalotaxus)。它在三尖杉属中的地位特殊,形态、解剖、胚胎发育、孢粉、核型及分子系统学的研究均支持将其独立成篦子三尖杉组。 松杉类植物
总裁专访:构建后基因组学生态-布鲁克引领质谱技术前沿
——布鲁克生命科学质谱事业部总裁Rohan Thakur博士专访随着第1000套timsTOF的安装,再次彰显布鲁克在高端前沿质谱领域获得的巨大成功。近年来,布鲁克在单细胞组学、4D多组学、空间定位组学、质谱成像等领域不断实现技术突破,2024年ASMS,布鲁克不仅推出更高灵敏度的timsTOF U
“基因组学+脑科学”双轮驱动,红杉中国医疗加速器启用
11月17日,“红杉中国智能医疗加速器”在上海张江正式宣布启用。上海市人民政府副秘书长陈鸣波、浦东新区区长杭迎伟、上海市经济和信息化委员会副主任张英、上海推进科技创新中心建设办公室专职副主任侯劲、上海市浦东新区副区长吴强、红杉中国创始及执行合伙人沈南鹏以及来自科研、产业、医疗机构的多位专家共同见证了
章冰博士:首次阐析人类癌症“蛋白组基因组学”特征
由范德堡大学领导的一个研究小组鉴别出了驱动大肠癌的一些遗传突变的蛋白质“标签”。这项发表在《自然》(Nature)杂志上的重要研究,第一次综合阐析了人类癌症的“蛋白组-基因组学”(proteogenomic)特征,这将推动结直肠(大肠癌)癌诊断和治疗取得新的进展。在美国,结直肠癌是仅次于肺癌的第
福建农林大学长江学者番木瓜基因组学研究刊登国际期刊
2016年11月28日的,福建农林大学、英国爱丁堡大学、美国迈阿密大学、夏威夷农业研究中心、伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校等处的研究人员,在国际生物学权威期刊《Genome Biology》发表一项重要研究成果,题为“Extremely low nucleotide diversity in the
深圳市化学基因组学重点实验室通过建设计划论证
2010年9月16日,深圳市科技工贸和信息化委员会组织专家在深圳对依托北京大学深圳研究生院的深圳市化学基因组学重点实验室―省部共建国家重点实验室培育基地的建设计划进行可行性论证。科技部基础研究司、深圳市科技工贸和信息化委员会有关负责同志以及依托单位的领导和实验室工作人员参加了会议。
“特色植物功能基因组学研究与应用”项目总结交流会召开
近日,“十二五”国家863计划现代农业技术领域“特色植物功能基因组学研究与应用”项目总结交流会在中国农业科学院棉花研究所海南繁育基地召开。科技部农村科技司郭志伟副司长出席会议并讲话,农村科技司农业科技处和农村中心有关同志,项目首席专家、中国工程院院士喻树迅研究员,项目牵头单位中国农业科学院棉花研
科学家找到深度学习基因组学应用的一顶“黑帽子”
研究人员首次将深度学习与贝叶斯假设检验结合,利用深度学习强化RNA可变剪接分析的准确性。 在生命科研领域,常有人说深度学习的基因组学应用好比是“一个盲人在一间黑暗的房子里寻找一顶并不存在的黑色帽子”。言下之意,是遗憾深度学习的基因组学应用并没有给人们带来太多惊喜。不过,近日宾夕法尼亚大学和费
-mBio:宏基因组学揭示700年前男性骨架中的布鲁氏菌感染
华威大学的研究人员和意大利人类学家Raffaella Bianucci一起,从意大利一个中世纪村庄的废墟中找到了一个700年的人类骨架,并且从中分离出了致病性细菌——布鲁氏菌,获得了其全部基因组信息。 布鲁氏菌是能够引发人畜共患病的一种致命细菌,通常是从未经高温消毒的奶制品或者直接接触感染的动
阳庆元提出多孔材料高通量构筑的全新基因组学方法论
在国家自然科学基金(No. 21536001, 21706106, 21878229)和国家重点研发计划(2016YFA0201701)等项目的资助下,北京化工大学化学工程学院阳庆元教授与仲崇立教授研究团队近期在材料基因基因组学领域取得重要进展,在国际上提出纳米多孔材料高通量构筑的全新基因组学方
中科院微生物所等在油棕基因组学研究获进展
中科院微生物所叶健课题组与中科院外籍院士、美国洛克菲勒大学教授蔡南海和新加坡淡马锡生命科学研究院教授岳根华等人合作,完成了高产母本厚壳Dura基因组的高质量的序列测定和多个种质资源的基因组重测序以及进化分析。研究为油棕分子辅助育种和基因组编辑抗性育种工作奠定了坚实基础,对日趋竞争激烈的全球食用
云南省禾本科种质资源与基因组学省创新团队通过认定
6月6日,由云南省科技厅主持,邀请有关专家,对“中国科学院昆明植物研究所禾本科种质资源与基因组学省创新团队”进行认定,经专家组认真审查有关认定资料,听取了团队带头人李德铢的工作汇报。 专家组认为,该创新团队通过三年的实施培养,建立了有国际影响力的禾本科植物的比较功能基因组学与进化基因组学研
澳大利亚CSIRO机构与中科院将在植物基因组学进行合作
据GenomeWeb记者报道,2011年3月10日—澳大利亚联邦科学与工业研究组织(CSIRO)今天宣布,将在下周与中科院共同探索在植物基因组研究上的合作计划。 这项研究合作,将重点放在水稻和小麦农作物上。水稻和小麦将同玉米一并成为在世界上种植最广泛的三大农作物;来自两个研