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地球最强悍动物测序的惊人发现

缓步动物(tardigrade),更常见的俗名是“水熊虫”,因为它看起来像可爱的多腿小熊。这种微小的动物对几乎所有的东西都有抵抗力:煮,冻,辐射,丢真空——它都很难死掉,可以说是地球上最强悍的生物之一。因此,生物学界对水熊虫不仅叹为观止,而且视之为研究瑰宝,期望它会带来可与果蝇相比拟的贡献。 最近,来自北卡罗来纳大学教堂山分校(UNC)的研究人员,对这种几乎坚不可摧的缓步动物进行了基因组测序,并发现了一些他们意想不到的事情:它们基因组的一大部分——近六分之一或百分之17.5,是来自于外源DNA。 本文共同作者、UNC艺术与科学学院生物系教师BobGoldstein指出:“我们并不知道,一个动物的基因组,是由这么多的外源DNA组成。我们知道,许多动物都获得了外源基因,但我们不知道,它会发生到如此程度。” 这项工作,发表在十一月二十三日的《PNAS》,不仅提出了“外源基因和水熊虫在极端环境中的生存能力之间是否存在关联?”的......阅读全文

全部脊椎动物基因组测序再上路

  为了获得更多的关注和支持,研究人员迫切希望对所有脊椎动物的基因组进行测序。近日,科学家正式启动了脊椎动物基因组计划(VGP),发布了14个物种的15个高质量基因组。但该计划仍远未筹集到所需资金,以记录地球上约6.6万种脊椎动物的基因组。  这个项目已经进行了3年,其前身是2009年启动的基因组1

动物全物种基因组测序仍有很大空白

   近日,美国华盛顿州立大学领导的一项研究发现,目前对动物基因组进行的测序多数集中在与人类相似的动物上,研究人员警告称,该现状可能会忽视大量的生物多样性和机会。相关研究结果发表于美国《国家科学院院刊》。  研究人员分析发现,近3300种动物的基因组已被测序。虽然动物物种测序工作一直在进行,但与世界

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序

  “桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、   有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983

2018年基因组测序盘点——各种有趣的动物

  2018年,各国科学家继续卯足了劲,对本国的珍(qi)稀(pa)动物进行基因组测序。他们的目标是保护濒危动物(如考拉、金枪鱼),对付入侵物种(如小龙虾、海蟾蜍),抑或是从中发现长寿的秘密(如乌龟、鹦鹉)。  与之前采用单一技术的研究不同,如今的基因组测序研究大多结合Illumina短读长和Pac

454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目

  一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代,其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1,科学家通过454全基因组测序,掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因,包括抗病能力、牛奶产量,这些性状已通过北美的当

基因组测序仪简介

  基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年12月19日启用。  技术指标  个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。  主要功能  样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库,从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道,以节约试剂用量。

PNAS:甜瓜基因组测序

  甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。   联合国粮农组织2009年

认识泛基因组测序

什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

Nature:基因组测序解析这种与恐龙同时代的动物

喙头蜥(tuatara)是新西兰标志性的陆生脊椎动物,从三叠纪到现在一直没怎么进化,被人称为爬行动物中的“活化石”。在2.5亿年前,这种动物还有不少亲戚,但只有它们活到了现在。因此,对喙头蜥的深入研究有助于我们了解羊膜动物的进化。近日,新西兰奥塔哥大学、欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)等机构