借鉴:人类基因组计划六大科研经验

日前,美国国家人类基因组研究所的三位历(现)任所长回顾了人类基因组计划(HGP)大科学项目实施所取得的历史经验。他们认为,几年前围绕HGP的讨论主要集中在该计划已经或将对人类疾病的认识带来何种见解。但现在明确的是,HGP除了极大地加速了生物医学研究,还开启了科学研究的新方式和组织管理新模式。 作为生物学领域的首个大型项目,HGP为后来众多的合作研究项目铺平了道路。对于那些追求大型科学项目的科研人员,HGP仍然能够提供很多宝贵经验。 经验一:拥抱合作关系 HGP成功将超过2000名来自不同国家、科学领域和资历的研究者凝聚在一起——尽管各小组得到不同资助机构的支持。计划的成功源于资助者强有力的领导、共享任务重要性的责任感、研究人员为集体利益放弃个人成就的意愿。 很多合作型基因组学项目紧随其后,包括千人基因组计划:对人类基因组中的序列变异进行分类;癌症基因组图谱计划:描绘癌症基因组突变的特征,以及人类微生物组计......阅读全文

美启用癌症“登月计划”-旨在分享癌症相关数据

  据外媒报道,美国副总统拜登6日宣布,启用癌症“登月计划”首个大型开放数据库,旨在更好地分享癌症相关数据,帮助科研人员更好地认识癌症,从而开发出更有效的疗法。  白宫发表声明说,这个名为“基因组数据共用”的数据库将为储存、分析和分享癌症基因组数据及相关临床数据提供一个公共平台,这对推进精准医学、改

拜登癌症“登月计划”呼吁分享更多数据

  美国副总统乔·拜登近日公开了未来5年对加速抵抗癌症的设想。其中包括大量政策建议与国家研究研究所(NCI)和其他联邦机构需要额外资助项目的一份细目清单。  拜登及其妻子吉尔与数千名专家和患者倡议者见面,他们在提交给总统巴拉克·奥巴马的一份17页纸的战略计划汇中作了解释,奥巴马在今年1月曾请拜登牵头

加拿大个人基因组计划公布首批数据

  加拿大个人基因组计划(PGP-Canada)于2012年启动,欲建立一个在线的加拿大人基因组数据库,供全世界的研究人员使用。近日,该计划公布了首批测序数据。根据《加拿大环球邮报》(the Globe and Mail)的报道,研究人员发现了许多意想不到的结果。  这个计划测序了首批56名参与者的

改革过渡期国家重点研发计划组织管理有关事项

科技部 财政部关于改革过渡期国家重点研发计划组织管理有关事项的通知国科发资〔2015〕423号  国务院各部委、各直属机构,各省、自治区、直辖市、计划单列市科技厅(委、局)、财政厅(局),新疆生产建设兵团科技局、财务局,各有关单位:  2014年,国务院印发了《关于改进加强中央财政科研项目和资金管理

大数据驱动的管理与决策研究重大研究计划项目指南

  大数据驱动的管理与决策研究重大研究计划2016年度项目指南  移动互联环境下的新兴技术快速发展与应用(如物联网、云计算、可穿戴设备、人工智能、增强/虚拟现实等)催生了新模式、新业态和新人群,为社会经济生活注入了新的活力,也进一步丰富和拓展了大数据应用创新领域,并为学术界、产业界以及政府

解读美材料基因组计划:数据共享乃大势所趋

  美国的材料基因组计划(MGI)启动至今已有两年,5位专家日前在《自然》杂志撰文,指出材料科学家应该如何在该计划中实施工作。   Sally Tinkle: 借鉴其他项目   华盛顿科技政策研究所政策分析师   MGI由总统巴拉克·奥巴马于2011年6月启动,旨在将应用于能源、交通和安全等领

中国聋病基因组计划启动-建立中国聋病大数据

  日前,“中国聋病基因组计划项目研讨会”在深圳举办。中国人民解放军总医院耳鼻咽喉研究所所长王秋菊在会上指出,先天性耳聋是公认的最常见的出生缺陷之一,不仅严重影响患者生活质量,且治疗与康复训练成本昂贵,我国作为世界人口大国,所面临的聋病问题尤为突出。在我国开展“中国聋病基因组计划”研究旨在深度揭示聋

解读美材料基因组计划:数据共享乃大势所趋

  MGI于2011年6月启动,旨在将应用于能源、交通和安全等领域的先进材料的开发时间和资金成本减半。  美国的材料基因组计划(MGI)启动至今已有两年,5位专家日前在《自然》杂志撰文,指出材料科学家应该如何在该计划中实施工作。   Sally Tinkle:借鉴其他项目   华盛顿科技政策研究

合同能源管理分享节能大餐

3000亿元市场有待开掘合同能源管理分享节能大餐   “由于形势严峻,国家相关部门正在制定节能减排预案,预计6月份就将出台,预案涉及关闭能耗过大的相关企业和实施节能措施等两方面内容。”日前,在江西南昌召开的全国能耗数据联审及节能情况分析会上,国家统计局能源统计司司长耿勤透露。  

烟草基因组计划

生物技术和生命科学将成为21世纪引发新科技革命的重要推动力量。实施基因组计划可以获得一批具有自主知识产权的烟草重要性状功能基因,全面揭示种质资源的遗传背景,确立我国在烟草基因组研究上的核心优势,对提升烟草育种工作整体水平、实现烟草品种的根本性突破、培育烟草新兴产业、更好地发挥烟草模式作物的基础研究作

光谱大数据来自耿耿星河-海量数据世界分享

LAMOST望远镜内部拼接镜面。LAMOST望远镜全景。  ■走近中国大科学工程   黑暗的燕山之巅,瞪着一只亮闪闪的眼——郭守敬望远镜(LAMOST),3月底,其获得的首批220万条巡天光谱数据正式向世界发布。  LAMOST是光谱加工厂,每个观测夜经“流水线”生产出万余条天体

【分享】激光粒度仪测量数据与筛分测量数据差异问题

  粒度分布的测量方法有很多种,如:筛分法、沉降法、图像法、激光散射法粒、库尔特法等。在实验室的应用中,筛分法和激光散射法是比较常用的两种粒径测量手段。但是一直以来,这两种方法测量的可比性存在较多问题。  1、筛分法原理及优缺点  筛分法是颗粒粒径测量中最为通用也最为直观的方法。  筛分的实现非常简

谷歌云服务助力自闭症研究-建最大自闭症基因库

       10 日,美国谷歌(Google)公司和自闭症代言人组织(Autism Speaks)宣布开展合作,由谷歌为后者的自闭症基因研究提供云服务,帮助其应对管理、分析和分享基因组数据方面的挑战。自闭症代言人组织表示,这项合作将推动自闭症基因研究,有助实现突破。  自闭症代言人组织是

植物无糖组织培养技术分享交流

  植物无糖组培快繁技术(Sugar-free micropropagation)又称为光自养微繁衍技术(Photoautotrophic micropropagation)是指在植物组织培育中改动碳源的品种,以CO2替代糖作为植物体的碳源,经过输入CO2气体作为碳源,并控制影响试管苗生长发育的环境

关于改革过渡期国家重点研发计划组织管理有关事项的通知

  国务院各部委、各直属机构,各省、自治区、直辖市、计划单列市科技厅(委、局)、财政厅(局),新疆生产建设兵团科技局、财务局,各有关单位:   2014年,国务院印发了《关于改进加强中央财政科研项目和资金管理的若干意见》(国发〔2014〕11号,以下简称11号文)和《关于深化中央财政科技计划(专项、

知识分享:动物细胞基因组DNA提取

  实验原理   真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内,制备DNA将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,同时保持DNA分子的完整。提取DNA的过程是指将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质,再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质,得到的DNA溶液经乙醇沉

人类全基因组测序计划

  全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年, Renato Dulbecco是Z早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列,对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部(DOE)与美国国家卫生研究院(NIH),分别在1986年与1987年加入人类基

投资分享计划:4万亿投资下的环保诉求

  去年11月8日,在出口、投资、工业增加值等一系列指标出现全面下滑的情况下,国务院提出了扩大内需促进增长的10项措施,并同时宣布了两年总计4万亿元的投资计划。针对4万亿元投资,国务院明确要求“出手要快、出拳要重、措施要准、工作要实”。   政府强有力的投资计划,给了民众极大的信心。专家认为,通过

科学数据,如何科学管理

  《科学数据管理办法》(以下简称《办法》),2018年1月经中央深改组审议通过,近日由国务院办公厅正式印发。《办法》旨在进一步加强和规范科学数据管理,保障科学数据安全,提高开放共享水平,更好地为国家科技创新、经济社会发展和国家安全提供支撑。  这是我国第一次在国家层面出台科学数据管理办法。当前,为

科学数据,如何科学管理

  《科学数据管理办法》(以下简称《办法》),2018年1月经中央深改组审议通过,近日由国务院办公厅正式印发。《办法》旨在进一步加强和规范科学数据管理,保障科学数据安全,提高开放共享水平,更好地为国家科技创新、经济社会发展和国家安全提供支撑。  这是我国第一次在国家层面出台科学数据管理办法。当前,为

集成的数据管理创新

集成的数据管理创新最新的紧凑式秤可以做许多事情,不仅仅是称重和计数;新的数据库创新技术可使之存储所有的物品和交易数据。凭借轻松的数据分析、更好的可追溯性和多种打印选项,这一改进帮助企业做出更明智的决定。先进的紧凑式秤可使用户快速、简单地访问数据,并确保完全的过程可追溯性,从而轻松地符合监管规定。 这

从动物组织提取基因组DNA

实验概要本实验以哺乳动物新鲜组织为材料,学习基因组DNA提取的一般方法。实验原理基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀

植物组织制备基因组DNA实验

实验方法原理 加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部, 从而达到提取的目的。实验材料 植物组织试剂、试剂盒 抽提缓冲液十二烷基肌氨酸钠TE异丙醇溴化乙锭氯化铯仪器、耗材 离心机实验步骤   收取1

植物组织制备基因组DNA实验

氯化铯法 CTAB法             实验方法原理 加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则

中国新生儿基因组、胚胎基因组计划启动

  为从根本上实现新生儿遗传病的早发现、早诊断、早干预,7日,中国遗传学会遗传咨询分会联合复旦大学附属儿科医院在上海发起中国新生儿基因组计划。  中国新生儿基因组计划将在未来的5年内开展10万例样本的新生儿基因检测,旨在构建中国新生儿基因组数据库,建立新生儿遗传病基因检测标准,促进新生儿遗传病基因检

组织库冷冻样本管理流程(一)

一. 取材和编号/标签部分在本环节进行组织和血液的取材,并制作条形码标签,将样本进行分装。1. 取材单:手术医生根据临床病例情况在术前一日通知样本库次日取样本,同时在医嘱中注明需要抽取血样数量、种类。样本库根据次日样本情况预先准备样本提取单,并预先定义好流水编号。样本提取单上的信息可包含并不仅限于以

组织库冷冻样本管理流程(四)

四. 超低温冰箱的考虑因素1. 冰箱类型。    超低温冰箱有立式和卧式之分,温度有-80 度和-150 度。目前市面上-150 度冰箱都是卧式。卧式冰箱优点是开门冷气散发较小,缺点是占地面积大,立式冰箱正好相反。所以大规模建库的情况下,推荐使用立式冰箱做大规模存储,而卧式冰箱做经常开关门的

组织库冷冻样本管理流程(二)

10. 样本库标识建议在冰箱外门上贴上磁性冻存架模拟标识,并在对应的空格位置上填写冻存盒的信息。例如冻存盒内样本名称,冻存盒编号,冻存盒内样本编号起止等。这样,在打开冰箱门之前,对内部的样本基本情况也能一目了然。注:【根据某些样本最终的实验要求,可能需要设计不同的存储流程,比如有些需要做蛋白实验的样

组织库冷冻样本管理流程(五)

2.卧式冰箱卧式冰箱的标本位置信息也采用类似于立式冰箱的方式,区别是卧式冰箱里的冻存架的高度是用方框内的格子表达的。请参考如下:3. 液氮灌一个标本的位置信息会用AA-BB-CC-DD 表达,AA 是液氮灌在整个冰箱/液氮灌的主界面排列中的编号。BB 是冻存架的编号,可以选择A…..Z 的编号,也可

组织库冷冻样本管理流程(三)

一. 组织库冷冻保存管的常见形态与保存温度。组织:冻存管保存(以内旋冻存管为多),常保存于-80 度/-150 度冰箱或液氮,也有很多单位将部分组织以RNAlater 浸润后保存于-30 度或-80 度条件,此外也有OCT 包埋,蜡块等组织保存形态。在条件允许的情况下,尽量保留T/P/N 三