施扬教授Cell子刊发布表观遗传新成果
来自哈佛医学院、华盛顿州立大学等处的研究人员利用小鼠模型证实了,X染色体连锁智力障碍(X-linked Intellectual Disability,XLID)与组蛋白甲基化移除受损有关。这一研究成果发布在1月21日的《Cell Reports》杂志上。 著名华人科学家、哈佛大学终生教授、波士顿儿童医院讲席教授施扬(Yang Shi),华盛顿州立大学的Jun Xu,以及哈佛医学院的Shigeki Iwase是这篇论文的共同通讯作者。 XLID是位于X染色体上的基因发生突变引起的一类先天性智力障碍,所涉及的先天性智力障碍约占所有先天性智力障碍的15%。依据除了智力障碍外是否有其他其他生理方面的缺陷,XLID分为两类:S-XLID和NS-XLID。S-XLID表现在除了智力障碍外,还在新陈代谢方面、神经特征或者其他的体征——如骨骼、颅面部上有异常或者缺陷。 组蛋白去甲基化酶在转录调控中发挥了重要作用,其在神经系统疾病中......阅读全文
DNA去甲基化酶催化作用介绍
DNA去甲基化由DNA去甲基化酶催化。DNA去甲基化是在DNA糖苷酶的作用下脱掉甲基化碱基的反应,等同于被损伤的DNA在糖苷酶及无碱基核酸酶酶切偶联催化下的修复反应。5一甲基胞嘧啶糖基化酶是体内侯选去甲基化酶。此外,甲基化CpG结合蛋白如MBD2等也具有去甲基化酶的活性。
中国农大JBC解析RNA去甲基化酶晶体结构
2014年3月10日,在百年老牌杂志《生物化学杂志》(Journal of Biological Chemistry)发表的一项最新研究中,中国农业大学、清华大学和多伦多大学的研究人员,报道了RNA去甲基化酶Alkbh5催化核心的5个高分辨率晶体结构。该研究的通讯作者为中国农业大学的陈忠周教
科学家揭示去甲基化酶在肿瘤中的致病机理
11月21日,肿瘤学研究领域的国际权威杂志《癌症研究》在线发表了武汉大学李枫教授团队和中国科学院北京基因组所吕雪梅研究员最新合作研究成果。该研究以“KDM4B通过激活LINE-1促进DNA损伤”为题,解析了组蛋白去甲基化酶(KDM4B)在肿瘤中所扮演的新角色,从全新角度揭示了KDM4B在肿瘤细
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用
表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成,还有文章探究过其在急性白血病中的作用,但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在Molecular
Oncogene:组蛋白去甲基化酶如何影响癌症相关的糖酵解
糖酵解途径(glycolysis)是肿瘤细胞中重要的能量来源途径,然而,目前对于这条代谢相关途径的调控方式的了解,还十分有限。来自厦门大学生命科学学院,南京大学等处的研究人员发现JMJD1A作为一个组蛋白去甲基化酶,它能够影响膀胱肿瘤细胞糖代谢途径关键酶的启动子上组蛋白甲基化修饰水平,从而影响酶
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用
文章导读 表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成,还有文章探究过其在急性白血病中的作用,但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在M
我科学家发现新组蛋白去甲基化酶及其调控机理
陈德桂研究组发现新组蛋白去甲基化酶及其调控机理 继4个月前生化与细胞所陈德桂研究组与景乃禾研究组合作发表一个新的组蛋白去甲基化酶KIAA1718(KDM7A)的发现及其在胚胎干细胞神经分化过程中的功能,及两周前陈德桂研究组与基因敲除与转基因小鼠平台合作发表另一个新的组蛋白去
去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制
研究揭示酿酒酵母组蛋白去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制 11月10日,Biochemical Journal在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所丁建平组关于酿酒酵母组蛋白去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制的研究成果。 人和酵母等真核生物中存在一类含有
研究揭示拟南芥组蛋白去甲基化酶JMJ13的结构功能
3月21日,《自然-通讯》(Nature Communications)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心杜嘉木研究组、中科院遗传与发育生物学研究所曹晓风研究组和河北师范大学孙大业研究组合作完成的题为The Arabidopsis H3
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用(二)
4.ALKBH5抑 制胰腺ai细胞生长和转移将过表达ALKBH5的ai细胞移植到裸鼠体内,发现过表达ALKBH5的ai细胞生成的肿 瘤体积明显小于对照组,并且细胞生长的指示分子Ki-67的表达也明显降低。染色显示过表达ALKBH5的组织中侵袭和转移的指示分子MMP-2和MMP-9表达降低,敲
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用(一)
文章导读表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成,还有文章探究过其在急性白血病中的作用,但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在M
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用(三)
总结本文作者通过RNA-seq, m6A-seq, MeRIP-qPCR, ChIP, CoIP,双荧光素酶实验等方法,研究发现去甲基化酶ALKBH5缺失会加重胰腺ai的发生和不良临床病理表现特征。ALKBH5的过度表达可降低了体外肿 瘤的增殖、迁移和侵袭活性,改善了体内肿 瘤生长,而ALK
研究揭示RNA去甲基化酶的氧化还原修饰调控番茄果实成熟机制
活性氧作为重要的信号分子,在植物抵御病原菌侵染、响应逆境胁迫以及维持正常生长发育的多个生物学过程中发挥重要的调控作用。在多种活性氧分子中,过氧化氢具有较长的半衰期,可调控干细胞分化、花粉管伸长、气孔发育、果实成熟等植物发育过程,但过氧化氢如何与其他信号途径协同作用,共同调控植物发育过程却不甚清楚。中
遗传发育所发现植物组蛋白去甲基化酶招募的新机制
核小体作为真核生物染色质的基本单位,由DNA缠绕组蛋白八聚体构成。组蛋白N端存在多种共价修饰,这些翻译后修饰通过影响染色质的状态而调控基因表达等过程。组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化修饰(H3K27me3)通过维持基因的沉默状态,在动植物细胞命运决定以及发育中起着重要的调控作用。实验室前期研究
伊成器等学者解析去甲基化酶底物特异性的分子机制
核酸的可逆化学修饰对细胞命运的调控具有重要作用。E. coli AlkB蛋白是首个核酸氧化去甲基化酶,通过识别并作用于1-甲基腺嘌呤这一类型的DNA/RNA损伤来维持基因组的稳定性。目前已发现9 个AlkB的人类同源蛋白,其中许多蛋白对细胞生命活动的维持都起到重要作用。例
我国揭示KDM5亚家族组蛋白去甲基化酶的底物识别机制
12月12日,中国科学院植物逆境生物学研究中心杜嘉木课题组,中科院院士、中科院遗传与发育生物学研究所曹晓风课题组合作完成的论文,以Structure of the Arabidopsis JMJ14-H3K4me3 Complex Provides Insight into the Substr
DNA去甲基化酶TET3调控I型干扰素表达新机制
7月14日,国际学术期刊《细胞-报告》(Cell Reports)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王红艳研究组的最新研究成果:TET3 inhibits type I IFN production independent of DNA demethylation。
NCB-|-这一次,FTO是snRNA的m6Am去甲基化酶
RNA的m6A修饰是RNA表观遗传学研究领域的大热门,近年来相关研究多次登上高分杂志。从胚胎发育到疾病进程,从RNA的稳定性到可变剪接和翻译效率,m6A的功能几乎无处不在(图1)。图1 由于m6A是一种RNA修饰,若想知道它在某一体系(发育阶段或癌症)中的作用,目前大部分研究都是基于影响m6A
DNA去甲基化酶ROS1负调控基因印记和种子休眠新机制
9月28日,国际学术期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心黄朝锋研究组和朱健康研究组合作完成的题为DNA demethylase ROS1 negatively regulates the imprinting
郑辉课题组揭示阿片类药物与DNA去甲基化酶相互作用机制
3月17日,中国科学院广州生物医药与健康研究院/广州再生医学与健康广东省实验室郑辉课题组在国际学术期刊Cell Reports 在线发表了题为Morphine and Naloxone Facilitate Neural Stem Cells Proliferation via a TET1-d
DNA去甲基化酶ROS1负调控基因印记和种子休眠新机制
国际学术期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心黄朝锋研究组和朱健康研究组合作完成的题为DNA demethylase ROS1 negatively regulates the imprinting of DO
阿片类药物与DNA去甲基化酶相互作用新机制被发现了
3月17日,中国科学院广州生物医药与健康研究院/广州再生医学与健康广东省实验室郑辉课题组在国际学术期刊Cell Reports 在线发表了题为Morphine and Naloxone Facilitate Neural Stem Cells Proliferation via a TET1-d
我国学者揭示去甲基化酶KDM6家族调控人神经作用机制
近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院潘光锦课题组在《自然-通讯》(Nature Communications)上发表了题为JMJD3 and UTX determine fidelity and lineage specification of human neural progenitor
上海生科院发现组蛋白去甲基化酶Jmjd3促进Th17细胞的分化
4月3日,国际学术期刊Journal of Molecular Cell Biology 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院健康科学研究所张笑人研究组和时玉舫研究组合作研究的最新成果The histone H3 lysine-27 demethylase Jmjd3 plays a crit
研究发现去甲基化酶REF6是基因组中靶向的重要因素
核小体是真核生物染色质的基本单位,由DNA缠绕组蛋白八聚体构成。组蛋白翻译后共价修饰是表观遗传调控的重要方式之一,通过影响染色质的状态而调控基因表达等过程。组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化修饰(H3K27me3)通过维持基因的沉默状态,在动植物细胞命运决定以及生长发育中发挥重要的调控作用。基因
遗传发育所植物组蛋白H3K27me3去甲基化酶研究获进展
PcG介导的组蛋白H3第27位赖氨酸上三甲基化(H3K27me3)在基因沉默和发育调控中起着至关重要的作用。小鼠胚胎干细胞中超过10%的基因受该种修饰调控,拟南芥中超过7,000个基因受该修饰调控。拟南芥中H3K27me3主要由CLF和SWN两个甲基转移酶催化,并招募LHP1结合以有效抑制基因表
上生科院揭示DNA去甲基化酶TET3调控I型干扰素表达新机制
7月14日,国际学术期刊《细胞-报告》(Cell Reports)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王红艳研究组的最新研究成果:TET3 inhibits type I IFN production independent of DNA demethylation。
DNA甲基化酶的分类
基因组中DNA的甲基化模式是通过DNA甲基转移酶实现的。DNA甲基化酶分为2类,即维持DNA甲基化转移酶(Dnmtl或维持甲基化酶)和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能,真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类:Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与C
H3K27me3去甲基化酶KDM6家族调控人神经发生的关键作用
中国科学院广州生物医药与健康研究院潘光锦课题组在《自然-通讯》(Nature Communications)上发表了题为JMJD3 and UTX determine fidelity and lineage specification of human neural progenitor ce
DNA甲基化酶的基本信息
大多数限制性内切酶常常伴随有1~2种修饰酶,即DNA甲基化酶,它能保护细胞自身的DNA不被限制性内切酶破坏。限制修饰系统(R-M系统)Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型中的甲基化酶可使细菌DNA分子中的胞嘧啶和腺嘌呤发生甲基化,形成5‘-甲基胞嘧啶和6‘-甲基腺嘌呤.在DNA重组实验中,常用的甲基化酶属于Ⅱ型,它与相应的