清华大学Nature子刊:将Cas9应用于分子克隆

在4月21日的《自然实验手册》(Nature Protocols)杂志上,清华大学的朱听(Ting Zhu)研究员与博士生姜文君(Wenjun Jiang)撰文,详细介绍了利用一种叫做Cas9辅助靶向染色体片段(CATCH)的方法,靶向分离及克隆100kb微生物基因组序列的优化实验方案。 朱听研究员的主要研究方向包括合成生物学、人造细胞;新一代高通量DNA测序、宏基因组学;高通量DNA测序在癌症和传染病等疾病领域中的应用;生命的起源、远古生命与极端条件下生命体的发现与测序。 随着各种微生物基因组测序工作的不断完成和序列信息的大量累积,微生物基因组研究的重点已从结构基因组学转为功能基因组学,大量未知功能的基因和基因簇有待大家去解析。在细菌的基因组中,功能密切相关的基因常聚集在一起,形成一个大的基因簇或操控子。很多细菌的基因组中存在基因组岛,与细菌的毒力、耐药等密切相关,它们常作为一个整体在细菌之间进行转移。要分析基因簇或基......阅读全文

大豆主效基因的克隆和分子验证取得新进展

近日,华南农业大学林学与风景园林学院教授葛良法和农学院教授年海合作,在大豆主效基因的克隆和分子验证取得新进展。他们利用自然群体和双亲群体精细定位克隆到高油高产基因MOTHER-OF-FT-AND-TFL1(GmMFT)。相关研究论文发表于New Phytologist。蔡占东、冼沛琪和程艳波为该论文

分子克隆常用技术简介(核酸纯化、浓缩、电泳和DNA、RNA的...

分子克隆常用技术简介(核酸纯化、浓缩、电泳和DNA、RNA的定量)一、核酸的纯化在分子克隆的所有操作中,最基本的操作是核酸的纯化。其关键步骤是去蛋白质,通常只要用酚/氯仿。氯仿抽提核酸的溶液即可。每当需要把克隆有某一些所用的酶灭活或去除以便进行下一步时,可进行这种抽提。然而,如要从细胞裂解液等复杂的

分子克隆常用载体(质粒、单链丝状噬菌体和噬粒)

DNA 片段的克隆需要合适的载体,载体或是质粒,或是噬菌体,或是病毒,通常大多经过人工改造[地的。作为载体必须具备两条件:一是该载体在细胞内必须能自主复制,即必须具备复制原点;二是该载体必须具备适合的酶切位点,且这些酶切位点不在复制原点区域内。以上两条,保证了载体的可繁殖性和可利用性。为了便于获

ORF克隆和cDNA克隆在操作技术上的区别(二)

二、 相关产品   看到这里,相信大家对cDNA克隆和ORF克隆有了一定的了解,那接下来就来聊聊相关的产品吧! 1.全长cDNA克隆产品  cDNA克隆(长度是指编码区) FL / MFL开头的cDNA克隆现在基本不销售,主卖表达克隆 0-100

强大的基因组编辑工具Crisp/cas9(三)

人类 sgRNA 文库相关产品  货号 文库 sgRNA 数目 基因数目 管数 载体 L01-LS03 Innate kinases & ubiquitin ligases 475 239

2015年最热门的质粒技术

  无论是克隆和表达、还是基因组编辑,质粒都是我们必备的工具。常用的质粒,实验室一般都有,或者隔壁实验室有,那就你有我有大家有。不过,对于基因组编辑这种新的应用,手头的质粒肯定不合适。2015年有哪些热门的质粒技术出现?Addgene最近有统计。  分裂的Cas9系统  大家都知道,Cas9蛋白是由

清华大学团队发文揭示代谢分子肌酸的免疫调节功能

  2019年8月6日,清华大学医学院胡小玉课题组联合药学院陈立功课题组在《细胞》(Cell)子刊《免疫》(Immunity)杂志在线发表了题为 《Slc6a8介导的肌酸转运和积累通过调控细胞因子应答来重编程巨噬细胞的极化》(Slc6a8-mediated creatine uptake and a

清华大学PNAS发布全新基因编辑系统

  11月4日,清华大学医学院倪建泉教授研究组在《美国科学院院刊》(PNAS)发表题为《高效及可遗传性果蝇基因组Cas9编辑技术》(Optimized gene editing technology for Drosophila melanogaster using germline-speci

用克隆环分离细胞克隆

实验方法原理 将集落在瓷制克隆环、玻璃环、PTFE 环或者不锈钢环中用胰蛋由酶消化后移至24 孔或12 孔板中的一个孔或者直接种于 25 cm2 的培养瓶内。实验材料 胰蛋白酶试剂、试剂盒 硅油仪器、耗材 克隆培养环巴氏吸管生长培养基多孔板无菌镊移液器粗头笔实验步骤 1. 观察细胞克隆,用毡制粗头笔

单克隆与克隆的区别

无性增殖(分裂、生殖)叫做克隆,克隆是一个很大的范围,单克隆是指的单克隆抗体,它由融合的细胞得来。是由单一B细胞克隆产生的高度均一、仅针对某一特定抗原表位的抗体。“单”和“克隆”要分开看,克隆是因为它是无性增殖来的,通常是一种人工诱导的无性生殖方式或者自然的无性生殖方式(如植物)。是原来细胞的基因的

用克隆环分离细胞克隆

实验方法原理将集落在瓷制克隆环、玻璃环、PTFE 环或者不锈钢环中用胰蛋由酶消化后移至24 孔或12 孔板中的一个孔或者直接种于 25 cm2 的培养瓶内。实验材料胰蛋白酶试剂、试剂盒硅油仪器、耗材克隆培养环巴氏吸管生长培养基多孔板无菌镊移液器粗头笔实验步骤1. 观察细胞克隆,用毡制粗头笔或 Nik

用克隆环分离细胞克隆

实验方法原理将集落在瓷制克隆环、玻璃环、PTFE 环或者不锈钢环中用胰蛋由酶消化后移至24 孔或12 孔板中的一个孔或者直接种于 25 cm2 的培养瓶内。实验材料胰蛋白酶                                                          试剂、试剂盒

用克隆环分离细胞克隆

            实验方法原理 将集落在瓷制克隆环、玻璃环、PTFE 环或者不锈钢环中用胰蛋由酶消化后移至24 孔或12 孔板中的一个孔或者直接种于 25 cm2 的培养瓶内。 实验材料

揭示衰老相关克隆性造血分子的机制——DNMT3A突变

克隆性造血属于血液肿瘤的癌前病变状态,越来越多的研究发现,克隆性造血会随着个体的衰老而不断加剧,因而也被称为衰老相关克隆性造血。克隆性造血的个体发生白血病的风险较正常人增加了10倍,并出现髓系细胞分化偏向性,从而导致系统性慢性炎症,进而使得炎症相关疾病如动脉粥样硬化、心肌梗死以及中风的发生率提高了约

什么是CRISPR/Cas9技术

CRISPR/Cas9系统的原理是利用gRNA特异性识别靶序列,并引导Cas9核酸内切酶对靶序列的PAM上游进行切割,从而造成靶位点DNA双链断裂,随之利用细胞的非同源末端连接(NHEJ)或同源重组(HDR)的方式对切割位点进行修复,实现DNA水平的基因敲除、敲入或点突变。

什么是CRISPR/CAS9技术

CRISPR/Cas9(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)是最新出现的一种由RNA指导的Cas9核酸酶对靶向基因进行编辑的技术。CRISPR/Cas9是细菌和古细菌为应对病毒和质粒不断攻击而演化来的获得性免疫防御机制。

什么是CRISPR/Cas9技术

CRISPR/Cas9系统的原理是利用gRNA特异性识别靶序列,并引导Cas9核酸内切酶对靶序列的PAM上游进行切割,从而造成靶位点DNA双链断裂,随之利用细胞的非同源末端连接(NHEJ)或同源重组(HDR)的方式对切割位点进行修复,实现DNA水平的基因敲除、敲入或点突变。

crispr-cas9基因敲除原理

基本原理:CRISPR簇是一个广泛存在于细菌和古生菌基因组中的特殊DNA重复序列家族,其序列由一个前导区(Leader)、多个短而高度保守的重复序列区(Repeat)和多个间隔区(Spacer)组成。前导区一般位于CRISPR簇上游,是富含AT长度为300~500bp的区域,被认为可能是CRISPR

crispr-cas9基因敲除原理

基本原理:CRISPR簇是一个广泛存在于细菌和古生菌基因组中的特殊DNA重复序列家族,其序列由一个前导区(Leader)、多个短而高度保守的重复序列区(Repeat)和多个间隔区(Spacer)组成。前导区一般位于CRISPR簇上游,是富含AT长度为300~500bp的区域,被认为可能是CRISPR

什么是CRISPR/CAS9技术

CRISPR/Cas9(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)是最新出现的一种由RNA指导的Cas9核酸酶对靶向基因进行编辑的技术。CRISPR/Cas9是细菌和古细菌为应对病毒和质粒不断攻击而演化来的获得性免疫防御机制。

生物物理所等揭示Cas9切割DNA及其被AcrIIC3抑制的分子机理

  CRISPR/Cas系统是广泛存在于细菌和古菌中抵抗病毒、质粒等外源核酸的获得性免疫系统。II型的Cas9在RNA的介导下可以特异性识别、切割dsDNA,具有可编辑性,因此被广泛用作基因编辑工具。由于其重要性,Cas9被系统地研究,大量的文献报道了Cas9的原子分辨率结构、单分子测量结果、分子动

里程碑:清华大学在分子生物学领域获突破

 据清华新闻网报道,日前,的《科学》杂志在线发表了清华大学生命科学学院施一公教授研究组的两篇具有里程碑意义的论文,宣布得到了高分辨率的剪接体三维结构和剪接体对前体信使RNA执行剪接的基本工作机理,从而将分子生物学的“中心法则”在分子机理的研究上大幅度向前推进。   这两篇文章的题目分别为“3.6埃的

清华大学肖百龙与李雪明等揭示触觉的分子机制

PIEZO2是进化上保守的机械敏感Piezo通道家族的成员,介导机械激活和快速灭活初级感觉神经元中的阳离子电流。缺乏PIEZO2的小鼠和PIEZO2中功能丧失突变的患者的研究已经证明其在感知触觉中的重要作用:如触觉疼痛,本体感受,气道拉伸和肺膨胀 ,以及用于感应血压和调节心率的压力感受器。此

Nature2019年度十大影响世界科学人物:“CRISPR转化者”邓宏魁

  分析测试百科网讯 近日,Nature发布了“2019年度影响世界的十大科学人物”。我国学者,来自北京大学-清华大学生命科学联合中心的邓宏魁教授入选该榜单。  邓宏魁教授主要进行干细胞增殖分化的分子机理以及抗体工程等方面的研究。  邓宏魁教授发现艾滋病病毒(HIV)感染人体巨噬细胞所需的共受体CC

广州生物院培育嵌入小分子药物调控基因剪刀的工具猪

  近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员赖良学课题组在《基因组生物学》(Genome Biology)上,发表了题为Doxycycline-dependent Cas9-expressing pig resources for conditional in vivo gene nullif

单克隆抗体的克隆方法

经过抗体测定的阳性孔,可以扩大培养,进行克隆,以得到单个细胞的后代分泌单克隆抗体。克隆的时间一般说来越早越好。因为在这个时期各种杂交瘤细胞同时旺盛生长,互相争夺营养和空间,而产生指定抗体的细胞有被淹没和淘汰的可能。但克隆时间也不宜太早,太早细胞性状不稳定,数量少也易丢失。克隆化的阳性杂交瘤细胞,经过

多个sgrna作用于同一个基因相互之间会不会有影响

但因为结构得到了简化更方便研究者使用,进而对目的DNA双链进行切割。 由于PAM序列结构简单(5’-NGG-3’)。 通过基因工程手段对crRNA和tracrRNA进行改造CRISPR (clustered,作用是时间也比较长、鱼类及哺乳动物细胞, regularly interspaced,且长期

如何检测-crispr-基因敲除成功

CRISPR (clustered, regularly interspaced, short palindromic repeats)是一种来自细菌降解入侵的病毒 DNA 或其他外源 DNA 的免疫机制。在细菌及古细菌中,CRISPR系统共分成3类,其中Ⅰ类和Ⅲ类需要多种CRISPR相关蛋白(Ca

清华大学Cell子刊发表CRISPR新文章

  来自清华大学、哈佛医学院和斯坦福大学等机构的研究人员,通过优化sgRNA的参数提高了CRISPR/Cas9系统在果蝇中的特异性和效率。研究结果发布在10月23日的《Cell Reports》杂志上。  清华大学医学院的倪建泉(Jian-Quan Ni)博士和斯坦福大学的Jin Billy Li教

强大的基因组编辑工具Crisp/cas9(二)

三、 产品推荐 针对sgRNA和cas9,我们有如下产品可供选择哦: 1.sgRNA系列。 (1)sgRNA载体类型  货号 载体 启动子 sgRNA 是否含有Cas9核酸酶基因 筛选标记/报告基因 SG001