史上最详细人DNA转录前起始复合体结构出炉!

作为所有生命必不可少的一个过程,基因表达分两步:DNA转录为RNA,然后RNA翻译为蛋白。 在一项新的研究中,来自美国佐治亚州立大学、加州大学伯克利分校和西北大学等多家机构的研究人员将低温电镜技术(Cryo-EM)和最新的计算建模方法结合在一起,史无前例地详细解析出近原子分辨率下的人转录前起始复合体(transcription pre-initiation complex, PIC)的分子结构。人PIC是一个蛋白组装体,将RNA聚合酶安排在合适的位置从而确保能够启动转录。 这些新的结构有助深入认识在转录起始整个过程---包括识别基因转录开始启动的DNA启动子区域、打开这个启动子区域和起始转录---中人PIC发生的一系列构象变化。相关研究结果于2016年5月11日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Near-atomic resolution visualization of human transcription ......阅读全文

史上最详细人DNA转录前起始复合体结构出炉!

  作为所有生命必不可少的一个过程,基因表达分两步:DNA转录为RNA,然后RNA翻译为蛋白。  在一项新的研究中,来自美国佐治亚州立大学、加州大学伯克利分校和西北大学等多家机构的研究人员将低温电镜技术(Cryo-EM)和最新的计算建模方法结合在一起,史无前例地详细解析出近原子分辨率下的人转录前起始

转录起始复合体

中文名转录起始复合体真核细胞启动子上的TATA框转录因子TFIIA,TFIIB转录起始复起始转录的“分子机器”定义真核细胞中,启动子上的TATA框与转录因子TFIID结合形成稳定的复合物,然后由其他转录因子(TFIIA,TFIIB,TFIIF,TFIIE,TFIIH等)和RNA聚合酶按一定顺序与DN

细菌DNA转录偶联修复的结构基础

 活跃的转录基因中的DNA损伤修复比基因组中不活跃的区域更迅速。在细菌中,这个过程被转录修复偶联因子(transcription repair coupling factor , TRCF)介导。TRCF破坏DNA损伤位点的处的RNA聚合酶,并重新启动DNA切除修复机制(DNA excisi

DNA转录“控制器”的关键结构被破译

  中介体是一种复杂的分子机器,在DNA(脱氧核糖核酸)的转录过程中扮演重要角色,被称为“真核转录调控中的中央控制器”。据美国物理学家组织网7月3日报道,美国印第安纳大学研究人员破译了中介体最关键的部分——其头部的蛋白组成结构,为研究中介体增加了重要的砝码,使人们能更深入理解细胞中基因

分子遗传学词汇转录复合体

中文名称:转录复合体英文名称:transcription complex定  义:由启动子、RNA聚合酶和其他各种转录因子构成的复合物。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

核孔复合体的结构

  核孔复合体是指镶嵌在核孔上的一种复杂的结构。主要有以下四种结构组分:  1.胞质环:位于核孔边缘的胞质面一侧,又称外环;  2.核质环:位于核孔边缘的核质面一侧,又称内环;  3.辐:由核孔边缘伸向中心,呈辐射状八重对的纤维;  4.栓:又称中央栓。位于核孔中心,呈颗粒状或棒状。  核孔复合体对

分子遗传学词汇转录起始复合体

中文名称:转录起始复合体定义:真核细胞中,启动子上的TATA框与转录因子TFIID结合形成稳定的复合物,然后由其他转录因子(TFIIA,TFIIB,TFIIF,TFIIE,TFIIH等)和RNA聚合酶按一定顺序与DNA结合形成转录起始复合体。

关于DNA解旋酶转录的介绍

  1、 不需要: DNA复制需要解旋酶,可是与DNA复制相类似的转录过程并不需要解旋酶,基因的转录是由RNA聚合酶催化进行的。基因的上游具有结合RNA聚合酶的区域,叫做启动子。启动子是一段具有特定序列的DNA,具有和RNA聚合酶特异性结合的位点,决定了基因转录的起始位点。RNA聚合酶与启动子结合后

核孔复合体的结构及功能

  结构  核孔复合体是指镶嵌在核孔上的一种复杂的结构。主要有以下四种结构组分:  1.胞质环:位于核孔边缘的胞质面一侧,又称外环;  2.核质环:位于核孔边缘的核质面一侧,又称内环;  3.辐:由核孔边缘伸向中心,呈辐射状八重对的纤维;  4.栓:又称中央栓。位于核孔中心,呈颗粒状或棒状。  核孔

《科学》:DNA绕个圈转录转向

  在玩具赛车轨道游戏里,出老千的玩家会扳动开关,让他们对手的车辆进入一个循环轨道,从而赢取比赛。细胞也会这一招――改变“轨道”布局,影响细胞功能,来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)和牛津大学的科学家们发现通过形成或撤销基因环结构(gene loops),细胞能调控转录机器,控制它是沿着遗传物

动物所发现转录能够远程诱导DNA产生G四链体结构

  含有连续鸟嘌呤碱基的核苷酸能够形成G-四链体结构,倾向形成G-四链体结构的序列(PQS)广泛分布在原核生物和真核生物的基因组中,G-四链体结构参与一些重要的生理和病理过程,如DNA的复制,转录和癌症的发生等。然而对于G-四链体结构如何在基因组中产生这一问题仍然不清楚。   中科院动物研究所端粒

研究发现DNA损伤修复与DNA转录的协同作用

  最近,来自挪威科学技术大学的Barbara van Loon博士等人在遗传信息修复方面有了新发现,该发现发表在最近的《Nature Communications》杂志上。  Van Loon的研究小组发现,阅读DNA的分子元件和纠正DNA错误的分子元件可以协同工作。(图片来源:NTNU)  Va

逆转录元件发生反向剪接插入DNA过程的原理与结构基础

  逆转录元件是一种以RNA为媒介,通过“copyand paste”的方式在基因组中不断扩增的基因元件【1,2】。在哺乳动物基因组中有超过45%的遗传成分都是逆转录元件,因此逆转录转座事件如果在不恰当的地方发生就会导致基因紊乱或者基因疾病等严重后果【3】。  II组内含子(Group II int

转录终止的结构功能特点

转录终止: 当RNA链延伸到转录终止位点时,RNA聚合酶不再形成新的磷酸二酯键,RNA-DNA杂合物分离,转录泡瓦解,DNA恢复成双链状态,而RNA聚合酶和RNA链都被从模板上释放出来,这就是转录的终止(termination)。

重大科学研究计划重要病毒转录复制蛋白复合体进展顺利

   2014年8月14日,由中国科学院武汉病毒研究所承担的国家重大科学研究计划“重要病毒转录复制蛋白复合体的结构与功能研究”项目中期总结会议在武汉召开。项目责任专家、专家组成员、国内同行专家以及项目组成员等40余人参加会议。   首先,项目首席科学家对前两年总体执行情况进行了汇报;然后,各课题负责

核孔复合体外环结构研究获进展

  2022年1月11日,中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室孙飞课题组联合北京大学张传茂课题组等,在爪蟾核孔复合体外环结构研究方面取得了最新成果。相关研究成果以8 Å structure of the outer rings of the Xenopus laevis nuclear

核孔复合体外环结构研究获进展

  2022年1月11日,中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室孙飞课题组联合北京大学张传茂课题组等,在爪蟾核孔复合体外环结构研究方面取得了最新成果。相关研究成果以8 Å structure of the outer rings of the Xenopus laevis nuclear

高尔基复合体的超微结构特征

在电镜下,高尔基复合体是由一-组 扁平囊和周围大量大小不等的囊泡组成的膜性立体网状结构。在大部分细胞中,有明显极性,-般由 3~ 10层略弯曲的扁平膜囊平行排列形成高尔基堆。主要有三部分:①顺面高尔基网:也称凸面、形成面或顺面,囊膜较薄,接受来自于内质网的包含新合成物质的小囊泡,并进行分选,然后将大

核糖核蛋白复合体的结构和功能

中文名称核糖核蛋白复合体英文名称ribonucleoprotein complex定  义由RNA和蛋白质组成的复合体。小的核糖核蛋白复合体有:信号识别颗粒、端粒酶、核糖核酸酶P等;大的核糖核蛋白复合体如核糖体。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

Science:三十年追寻终获突破

  转录起始复合体是读取DNA遗传信息的关键媒介,由Richard H. Ebright和Eddy Arnold领导的罗格斯大学研究团队三十年来首次获得了转录起始复合体的三维结构,增进了人们对转录起始机制的了解。该文章即将发表在Science杂志上。   转录起始复合体是起始转录的“分子机器”

Nature:DNA修复新模式解答转录争议

  紫外线和其他环境因素不多对我们的DNA造成破坏,可以说我们的健康在很大程度上依赖于细胞发现和修复DNA损伤的能力。纽约大学医学院的一项新研究展示,RNA聚合酶负责在基因组中搜寻DNA损伤,并招募盟友对其进行修复。这一机制能够有效减少突变,帮助人体控制癌症和其他疾病。这项研究由Evgeny N

-长读取测序揭秘转录本结构

  短读取的 RNA-seq 虽然可以精确计数已表达的转录本,但无法提供这些转录本的结构信息。   现在,斯坦福大学研究人员在《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上报告称,他们开发出了一种能保留转录本结构信息的新方法,他们通过环状 cDNA 模板和长读取测序,

基因转录图的结构或功能

转录图基因转录图即是把细胞内染色体或DNA上所有基因定位在染色体或DNA基因组的不同位置上,反映在 正常或受控条件下能够表达的cDNA片段数目、种类、结构与功能的信息,是用来表示DNA上哪些核苷酸序列可以编码蛋白质。生物性状是由结构或功能蛋白决定的,功能蛋白是由信使RNA(mRNA)编码的,mRNA

基础转录装置的结构特点

基础转录装置(basical transcriptional apparatus):在TFⅡA~F等参与下,RNA聚合酶Ⅱ与TFⅡD、TFⅡB等聚合,形成一个功能性的前起始复合物PIC,可以开始转录但其速率低,因此称为基础转录装置。7.重叠基因(overlapping gene): 是一种转录单位,

简述反转录病毒的结构特征

  (1)所有的反转录病毒都有一个结构特征,即粗大的球形颗粒,大小为 80~100 nm。并有完好的突起的外膜。  (2)反转录病毒颗粒的化学成分几乎是一样的,RNA 占 2%,蛋白质占 60%~70%,其中 5%~ 7% 是复杂的糖蛋白,脂类为 30%~40%,碳水化合物为 1%~2%。  (3)

如何分离DNA蛋白质复合体与RNA蛋白质复合体的混合物

可以借助一些多组分抽提试剂,比如TRIzol可以将RNA/DNA/蛋白质分开。经TRIzol处理后,RNA位于上层水相中,DNA处于中间层,蛋白质则在下层。可分别取出水相用异丙醇沉淀回收RNA;用乙醇沉淀中间层回收DNA;用异丙醇沉淀有机相回收蛋白质。

DNA发卡结构介绍

发卡结构(hairpin structure):这些结构是由于DNA单链分子通过自身回折使得互补的碱基对相遇,形成氢键结合而成的,称为发卡结构。又译:发夹结构。

DNA发卡结构特点

发卡结构(hairpin structure):这些结构是由于DNA单链分子通过自身回折使得互补的碱基对相遇,形成氢键结合而成的,称为发卡结构。又译:发夹结构。

闭环DNA的结构

由于具有螺旋结构的双链各自闭合,结果使整个DNA分子进一步旋曲而形成三级结构。自然界中主要是负超螺旋.另外如果一条或二条链的不同部位上产生一个断口,就会成为无旋曲的开环DNA分子。从细胞中提取出来的质粒或病毒DNA都含有闭环和开环这二种分子。可根据两者与色素结合能力的不同,而将两者分离开来。

DNA-结构域的结构特点

结构域(domain)是位于超二级结构和三级结构间的一个层次。结构域是在蛋白质的三级结构内的独立折叠单元,通常都是几个超二级结构单元的组合。在较大的蛋白质分子中,由于多肽链上相邻的超二级结构紧密联系,进一步折叠形成一个或多个相对独立的致密三维实体,即结构域。结构域与分子整体以共价键相连,一般难以分离