Science:三十年追寻终获突破
转录起始复合体是读取DNA遗传信息的关键媒介,由Richard H. Ebright和Eddy Arnold领导的罗格斯大学研究团队三十年来首次获得了转录起始复合体的三维结构,增进了人们对转录起始机制的了解。该文章即将发表在Science杂志上。 转录起始复合体是起始转录的“分子机器”,由RNA聚合酶和起始因子sigma组成,特异性识别基因上游的特定位点,与DNA结合,使DNA解旋,并调整DNA为下一步转录过程做准备。研究人员首次获得了转录起始复合物的三维结构,揭示了它的详细作用机制。 “得到功能性转录起始复合体的结构,是相关研究人员三十年来的研究目标,”罗格斯大学化学和化学生物学系教授Ebright说, 研究人员获得的是来自于细菌的转录起始复合体,为了解细菌转录的起始和转录调节打下了基础,并且有望帮助人们研制抑制细菌转录的抗菌药物。细菌与高等生物的转录结构和转录机制是相关联的,该成果也为高等生物(包括......阅读全文
Science:三十年追寻终获突破
转录起始复合体是读取DNA遗传信息的关键媒介,由Richard H. Ebright和Eddy Arnold领导的罗格斯大学研究团队三十年来首次获得了转录起始复合体的三维结构,增进了人们对转录起始机制的了解。该文章即将发表在Science杂志上。 转录起始复合体是起始转录的“分子机器”
T7-RNA聚合酶/启动子表达实验
实验材料 载体试剂、试剂盒 氨苄青霉素卡那霉素pGP裂解缓冲液仪器、耗材 培养箱分光光度计离心机实验步骤 1. 将含有待表达基因的片段亚克隆于pT7-5、pT-6或pT7-7中,转化一种标准大肠杆菌菌株,此菌株不应带有可指导T7 RNA聚合酶合成的质粒。转化物涂布于氨苄青霉素平皿,于37℃温育培养
T7-RNA聚合酶/启动子表达实验
基本方案 备选方案 备选方案2 实验材料 载体 试剂、
T7-RNA聚合酶/启动子表达实验3
实验材料噬菌体试剂、试剂盒PEGIPTG仪器、耗材培养箱离心机实验步骤1. 制备从M13噬菌体mGP1-2原种,加PEG溶液沉淀浓缩噬菌体。重悬噬菌体于M9培养基,滴定其滴度。 2. 将由“基本方案”步骤1所得的含T7 启动子表达质粒转化M13许可性大肠杆菌细胞,转化物涂布于氨苄青霉素平皿上,3
T7-RNA聚合酶/启动子表达实验2
实验材料蛋白质试剂、试剂盒氨基酸混合物M9培养基甲硫氨酸甲醇仪器、耗材荧光显微镜离心机分光光度计实验步骤1. 将含有待表达基因的片段亚克隆于pT7-5、pT-6或pT7-7中,转化一种标准大肠杆菌菌株,此菌株不应带有可指导T7 RNA聚合酶合成的质粒。转化物涂布于氨苄青霉素平皿,于37℃温育培养过
T7-RNA聚合酶/启动子表达实验1
在适宜的条件下,T7 RNA聚合酶/启动子系统表达的基因产物可占细胞总蛋白的25%以上,但多数情况下产量比这个比例要低得多。实验材料载体试剂、试剂盒氨苄青霉素卡那霉素pGP裂解缓冲液仪器、耗材培养箱分光光度计离心机实验步骤1. 将含有待表达基因的片段亚克隆于pT7-5、pT-6或pT7-7中,转化
RNA干涉实验——采用RNA聚合酶Ⅲ启动子表达siRNA分子
实验方法原理因为哺乳动物细胞不具备低等真核生物细胞所具有的扩增 RNAi 信号的机制,因此人工合成或体外转录的 siRNA 分子在细胞内的作用是瞬时性的,不适合用于进行靶基因的表达受到抑制后细胞表型的长期变化观察,也不适于进行文库的筛选。此外,体外制备 siRNA 分子的成本比较高,而且 siRNA
TATA结合蛋白质的基本概念
中文名称TATA结合蛋白质英文名称TATA-binding protein;TBP定 义转录因子TFⅡD的组分之一,特异地与TATA框结合并指导起始复合体的形成,也可以是与RNA聚合酶Ⅲ或RNA聚合酶Ⅰ共同发挥作用的转录因子之一。即使基因无TATA框,也能通过与TBP结合因子间相互作用而起调节作用
分子遗传学词汇TATA结合蛋白质
中文名称:TATA结合蛋白质英文名称:TATA-binding protein;TBP定 义:转录因子TFⅡD的组分之一,特异地与TATA框结合并指导起始复合体的形成,也可以是与RNA聚合酶Ⅲ或RNA聚合酶Ⅰ共同发挥作用的转录因子之一。即使基因无TATA框,也能通过与TBP结合因子间相互作用而起调
史上最详细人DNA转录前起始复合体结构出炉!
作为所有生命必不可少的一个过程,基因表达分两步:DNA转录为RNA,然后RNA翻译为蛋白。 在一项新的研究中,来自美国佐治亚州立大学、加州大学伯克利分校和西北大学等多家机构的研究人员将低温电镜技术(Cryo-EM)和最新的计算建模方法结合在一起,史无前例地详细解析出近原子分辨率下的人转录前起始
简述前起始复合体形成的步骤
1、TATA结合蛋白 (TBP,TFIID的一个亚基) 与启动子结合; 2、TFIIA与启动子结合; 3、TFIIB与启动子结合; 3、RNA聚合酶II和TFIIF与启动子结合; 4、TFIIE加入复合体,并吸引TFIIH,有ATP酶及解链酶活性; 5、亚基中有AT
科学家揭示A型流感病毒RNA聚合酶复合体结构
A型流感病毒RNA聚合酶复合体四体总体结构及二体、四体、单体之间的转换 1月22日,Molecular Cell 杂志在线发表了题目为Cryo-EM Structure of Influenza Virus RNA Polymerase Complex at 4.3 Å Resolu
研究揭示纤维小体转录调控因子的结构功能机制
纤维小体是一类可以高效降解木质纤维素生物质的多酶复合体,在生物质能源与合成生物学中具有广泛的应用价值。产纤维小体细菌根据底物种类调控纤维小体组分的表达,从而实现对特定底物类型的高效降解。在典型的产纤维小体细菌热纤梭菌中,一类特殊的σ和anti-σ因子SigI-RsgI负责感应底物并调控纤维小体基
中国科学院揭示调控因子σI的启动子识别机制
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510398.shtm2023年10月13日,中国科学院生物物理研究所朱平研究团队与中国科学院青岛生物能源与过程研究所冯银刚研究团队合作,在《Nature Communications》杂志发表了题为"S
启动子解脱的定义
中文名称启动子解脱英文名称promoter escape定 义发生在真核生物基因转录起始过程后期的一个现象,即转录起始复合体形成后RNA聚合酶从启动子上脱离,此后RNA聚合酶不再依赖启动子就能继续完成转录,但是转录的速度也因此而受到限制。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二
启动子解脱的定义
中文名称启动子解脱英文名称promoter escape定 义发生在真核生物基因转录起始过程后期的一个现象,即转录起始复合体形成后RNA聚合酶从启动子上脱离,此后RNA聚合酶不再依赖启动子就能继续完成转录,但是转录的速度也因此而受到限制。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二
分子遗传学词汇启动子解脱
中文名称:启动子解脱英文名称:promoter escape定 义:发生在真核生物基因转录起始过程后期的一个现象,即转录起始复合体形成后RNA聚合酶从启动子上脱离,此后RNA聚合酶不再依赖启动子就能继续完成转录,但是转录的速度也因此而受到限制。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与
Cell:武汉大学阐明真核基因中的转录调控机制
近日,来自武汉大学、加州大学圣地亚哥分校的研究人员在新研究中证实,SR蛋白与7SK和启动子相关新生(Nascent )RNA协同作用,促进了转录过程中停顿的聚合酶释放。这一研究发现为阐明真核基因中的转录调控机制,深入了解相关疾病提供了重要的理论依据。相关论文发表在5月9日的《细胞》(Cell
转录起始复合体
中文名转录起始复合体真核细胞启动子上的TATA框转录因子TFIIA,TFIIB转录起始复起始转录的“分子机器”定义真核细胞中,启动子上的TATA框与转录因子TFIID结合形成稳定的复合物,然后由其他转录因子(TFIIA,TFIIB,TFIIF,TFIIE,TFIIH等)和RNA聚合酶按一定顺序与DN
有解旋酶活性的相关介绍
转录前先是TFⅡ-D与TATA盒结合; 继而TFⅡ-B以其C端与TBP-DNA复合体结合,其N端则能与RNA聚合酶Ⅱ亲和结合; 接着由两个亚基组成的TFⅡ-F加入装配,TFⅡ-F不仅能与RNA聚合酶形成复合体,还具有依赖于ATP供给能量的DNA解旋酶活性,能解开前方的DNA双螺旋,在转录链延伸中
Nature-Microbiology:流感病毒聚合酶调控RNA合成机制
流感病毒是危害全球公共卫生健康的重要病原之一,能在人群中引起大规模流行和季节性流感,每次暴发都会引起人类死亡并造成巨大的经济损失。流感病毒(Influenza virus)是分节段的负链RNA病毒(Segmented Negative-Sense RNA virus, sNSV),属于正粘病毒科
分子遗传学词汇转录起始复合体
中文名称:转录起始复合体定义:真核细胞中,启动子上的TATA框与转录因子TFIID结合形成稳定的复合物,然后由其他转录因子(TFIIA,TFIIB,TFIIF,TFIIE,TFIIH等)和RNA聚合酶按一定顺序与DNA结合形成转录起始复合体。
概述启动子的基本结构
启动子是一段位于结构基因5'端上游区的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确地相结合并具有转录起始的特异性。因为基因的特异性转录取决于酶与启动子能否有效地形成二元复合物,故RNA聚合酶如何有效地找到启动子并与之相结合是转录起始过程中首先要解决的问题。有实验表明,对许多启动子
寡核苷酸引物的作用
PCR技术中的引物的本质和作用。引物是一小段单链DNA或RNA,引物可以做为DNA复制开始时DNA聚合酶的结合位点,在细胞外的条件下,只有通过引物,DNA才可以开始进行复制。引物是人工合成的两段寡核苷酸序列,一个引物与感兴趣区域一端的一条DNA模板链互补,另一个引物与感兴趣区域另一端的另一条DNA模
分子遗传学词汇转录复合体
中文名称:转录复合体英文名称:transcription complex定 义:由启动子、RNA聚合酶和其他各种转录因子构成的复合物。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
染色质免疫共沉淀研究
真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在,研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。与传统的EMSA技术相比,染色质免疫沉淀技术(ChIP)能真实完整地反映结合在DNA序列上的调控蛋白,是目前研究体内DNA与蛋白质相互作用的最佳方法。染色质免疫沉淀技术(chro
张余课题组揭示细菌Class-III转录激活机制
9月28日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心合成生物学重点实验室研究员张余课题组在Nature Chemical Biology上,在线发表题为CueR activates transcription through a DNA distortion mechanism的研究论文,主要研究细菌
张余研究组等揭示不依赖DNA相互作用的转录激活机制
12月18日,eLife 杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张余研究组、赵国屏研究组,上海科技大学杨贝研究组和浙江大学冯钰研究组合作的题为Crl activates transcription by stabilizing active conformation
植物转录起始调控机制研究获进展
在国家自然科学基金面上项目和青年项目的资助下,中国科学院华南植物园研究员陈琛团队联合广东省农业科学院研究员刘军、加拿大农业部伦敦研发中心研究员崔玉海在植物转录起始调控机制研究方面取得新进展。相关研究近日发表于《核酸研究》(Nucleic Acids Research)。 转录复合体将DNA转录
华南植物园关于植物转录起始调控机制的研究获进展
转录复合体将DNA转录为RNA,是遗传信息由细胞核向细胞质转递的基础。由于核小体与基因组的紧密结合,转录复合体需克服核小体障碍进而确保功能基因的表达。染色质重塑复合体(Chromatin Remodeler)被认为在转录过程中发挥了重要作用。这类蛋白复合体能通过水解ATP来调控核小体的组成和分布