Nature发布大规模癌症蛋白质基因组学研究重要成果

基于来自癌症基因组图谱(TCGA)计划的数据,一个多机构科学家小组完成了首个大规模的乳腺癌“蛋白质基因组学”( proteogenomic)研究,将一些DNA突变与蛋白质信号联系到一起,并帮助确定了一些驱动癌症的基因。 这项研究旨在通过蛋白质和它们的修饰来更好地认识癌症。发表在5月25日《自然》(Nature)杂志上的研究论文,证实了相比于单独采用任一种分析方法,整合基因组和蛋白质组数据来生成更完整的癌症生物学图像的能力。 论文的资深作者、Baylor医学Lester 和Sue Smith乳腺中心主任及教授Matthew Ellis博士说:“我们还没有充分认识复杂的癌症基因组是如何转化为导致复发和死亡的驱动生物学的。这些研究结果表明整合蛋白质基因组学有一天可能会被证明是一种强大的临床工具,使得我们能够横跨癌症基因组学与临床效应之间巨大的知识鸿沟。” 索取博奥生物蛋白质组学与核酸平台详细技术资料请填写联系方式 这项研究......阅读全文

宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组

  来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。   由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。   宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术,并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

基因组所肝癌全基因组合作研究取得新进展

  近日,由中国科学院北京基因组研究所所长吴仲义及其科学团队与国立台湾大学医学院陈定信院士、陈培哲院士共同合作开展的“肝癌癌症基因组合作研究”计划获最新进展,相关学术论文在在最新出版的PNAS杂志上发表。  “肝癌癌症基因组合作研究”计划于2009启动,作为基因组所一项长期的癌症基因

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析完成

9月22日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位,成功绘制了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱,构建了栽培和野生豌豆泛基因组,解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构,为揭示豌豆起源驯化,以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支撑。

植物基因组“剪刀”-被成功打造-可编辑基因组任意位置

中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组通过模仿和改造微生物中的一种抵御外源侵染的防护机制,成功开发出能对植物基因组进行精确定点修饰的技术,从而使高效植物分子改良性状成为可能。这一适用于植物的CRISPR-Cas技术就像一把剪刀,可以对基因组中任意感兴趣的位置进行编辑,它的成功开发将革命性地改变

北京基因组研究所Plant-cell基因组研究新成果

  来自中科院北京基因组研究所、荷兰瓦赫宁根大学和中科院/马普学会等10多家机构的研究人员组成的一个研究小组,通过测序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因组提供了关于十字花科植物繁殖性状和基因组进化的新认识。相关研究发表在植物学权威期刊The Plant Cell杂志上

美国百万基因组PK英国十万基因组-只为助力“精准医疗”?

  1月下旬,美国总统奥巴马在2015年国情咨文演讲中深情地说道,美国已经消灭了小儿麻痹症、绘制出人类基因组等举措,这意味着美国已经 使人类医学迈入一个新的时代……接下来,我们致力于治愈癌症和糖尿病等疾病,让所有人获得需要保障自己和家人健康的个性化的信息,并宣布了新的项目——精 准医疗计划(Pr

科学家进行基因组测序-成功破译金雕基因组

   作为一种知名度极高的猛禽,金雕经常以威猛霸气的形象出现在影视作品和小说中。现在,英国研究人员完成了对金雕的基因组测序工作,希望从基因层面深入了解这一物种,以便更好地保护它们。 金雕以巨大的体型和敏捷有力的飞行等特征而著名,其成鸟的翼展平均超过2米,体长可达1米。金雕一般生活于多山或丘陵地区

北京基因组所揭示线粒体基因组氧化损伤修复分子机制

  线粒体是真核生物细胞主要的能量代谢场所,其中呼吸链氧化磷酸化过程伴随有高水平的氧自由基(ROS)的产生。线粒体基因组缺乏组蛋白结合保护,所以容易受到ROS攻击而发生损伤,其突变的累积已证实与多种人类疾病(如神经退行性病变、糖尿病、心血管疾病和癌症等)的发生密切相关。有关核基因组DNA损伤修复分子

聚焦基因组组装-至今最大组装竞赛寻找最优基因组指标

  2013年7月23日,由华大基因和BioMed Cental联合创办的开放式期刊《GigaScience》发表了当前最大、最系统的基因组组装过程及评价结果。在第二届Assemblathon竞赛中,共有21个团队基于由三种不同的测序技术所得的鸟、鱼和蛇的未组装基因组数据,提交了43个组装结果,

蛋白质测序

  进行蛋白质测序的方法包括:  埃德曼降解  肽质量指纹图谱  质谱分析  蛋白酶水解法  如果编码蛋白质的基因是已知的,那么目前测序和推断蛋白质序列要容易得多。通过上述方法之一确定蛋白质氨基酸序列的一部分(通常是一端)可能足以鉴定携带该基因的克隆。

蛋白质标记

Biosynthetic labeling (Sefton Lab)Biotinylation of Antibody (Contributed by Nanci Donacki)125I Labeling of Protein using ICl (ScienceXchange)Protein (

蛋白质纯化

蛋白质的分离纯化在生物化学研究应用中使用广泛,是一项重要的操作技术。 一个典型的真核细胞可以包含数以千计的不同蛋白质,一些含量十分丰富,一些仅含有几个拷贝。为了研究某一个蛋白质,必须首先将该蛋白质从其他蛋白质和非蛋白质分子中纯化出来。

蛋白质定量

Quantitative Determination of Peptides by Sulfhydryl (-SH) Groups New (Contributed by David Van Horn, Dept. of Chemistry, UC Berkeley Greg Bulaj, Dept

蛋白质测序

一、概念当前,所谓蛋白质测序,主要指的是蛋白质的一级结构的测定。蛋白质的一级结构(Primary structure)包括组成蛋白质的多肽链数目。很多场合多肽和蛋白质可以等同使用。多肽链的氨基酸顺序,它是蛋白质生物功能的基础。  蛋白质氨基酸顺序的测定是蛋白质化学研究的基础。自从1953年F.San

蛋白质测序

Edman降解法             实验方法原理 主要有质谱法,利用蛋白质测序仪进行测序以及利用蛋白质对应DNA或mRNA进行间接测序。传统的蛋白质测序实验一般包括以下步骤:1

蛋白质纯化

  蛋白质的分离纯化在生物化学研究应用中使用广泛,是一项重要的操作技术。  一个典型的真核细胞可以包含数以千计的不同蛋白质,一些含量十分丰富,一些仅含有几个拷贝。为了研究某一个蛋白质,必须首先将该蛋白质从其他蛋白质和非蛋白质分子中纯化出来。用于分离蛋白质的最重要特性有大小、电荷、疏水性和对其他分子的

蛋白质染色

  二维凝胶电泳(2-DE)是广为蛋白质组学科学家们应用的经典技术之一,蛋白混合物在两个维度上被分离。第一步是常规的等电聚焦,此过程中蛋白质根据其等电点被分离。接着,第二维使用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),将蛋白质按分子量进一步分离。上述两步操作在互相垂直的两个方向上,使分离的蛋白

蛋白质电泳

蛋白质电泳(主要内容如下)One-Dimensional SDS-PAGETwo-Demensional SDS-PAGEProtein Electrophoresis in Agarose Gel Gel StainingRecipesOne-Dimensional SDS-PAGE·      

蛋白质纯化

是当代生物产业当中的核心技术。该技术难度、成本均高;例如一个生物药品的成本75%都花在下游蛋白质分离纯化当中。常用技术有:1、沉淀,2、电泳:蛋白质在高于或低于其等电点的溶液中是带电的,在电场中能向电场的正极或负极移动。根据支撑物不同,有薄膜电泳、凝胶电泳等。3、透析:利用透析袋把大分子蛋白质与小分

蛋白质测序

一、概念当前,所谓蛋白质测序,主要指的是蛋白质的一级结构的测定。蛋白质的一级结构(Primary structure)包括组成蛋白质的多肽链数目。很多场合多肽和蛋白质可以等同使用。多肽链的氨基酸顺序,它是蛋白质生物功能的基础。  蛋白质氨基酸顺序的测定是蛋白质化学研究的基础。自从1953年F.San

蛋白质亚基

在结构生物学,一个蛋白质亚基是一个单一的蛋白质分子,其组装(或“ coassembles ”)与其他蛋白质分子以形成蛋白复合物。一些天然存在的蛋白质具有相对较少的亚基,因此被描述为寡聚体,例如血红蛋白或DNA聚合酶。其他的可能由非常多的亚基组成,因此被描述为多聚体,例蛋白质亚基如微管和其他细胞骨架蛋

蛋白质测序

一、概念当前,所谓蛋白质测序,主要指的是蛋白质的一级结构的测定。蛋白质的一级结构(Primary structure)包括组成蛋白质的多肽链数目。很多场合多肽和蛋白质可以等同使用。多肽链的氨基酸顺序,它是蛋白质生物功能的基础。  蛋白质氨基酸顺序的测定是蛋白质化学研究的基础。自从1953年F.San

蛋白质测定仪测奶制品蛋白质

  随着人们生活水平的提高,鲜奶已成为人们普遍食用的营养佳品。鲜奶中蛋白质、脂肪、糖类含量丰富,且易被人体消化吸收;鲜奶中钙、铁等矿物质含量也很丰富,是人们补钙的天然优良食品。在日本就有一杯奶改善一个民族之说。蛋白质是鲜奶的重要组成成分,也是评价鲜奶质量的重要营养学指标之一。    目前,市售部分大

蛋白质的结构及蛋白质的功能(一)

   蛋白质为生物高分子物质之一,具有三维空间结构,因而执行复杂的生物学功能。蛋白质结构与功能之间的关系非常密切。在研究中,一般将蛋白质分子的结构分为一级结构与空间结构两类。  一、蛋白质的一级结构  蛋白质的一级结构(primary structure)就是蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序(

用蛋白质底物进行蛋白质激酶分析实验

ATP储存液的配制依赖环核苷酸的蛋白质激酶蛋白质激酶C酪蛋白激酶酪氨酸激酶凝胶蛋白质激酶分析试剂、试剂盒ATP储存液                                                          实验步骤一、Mg-ATP 储存液的配制ATP 买来时通常是钠盐。大多

球状蛋白质和纤维状蛋白质区别

以长轴和短轴之比为标准,球状蛋白质小于10,纤维状蛋白质大于10。纤维状蛋白多为结构蛋白,是组织结构不可缺少的蛋白质,由长的氨基酸肽链连接成为纤维状或蜷曲成盘状结构,成为各种组织的支柱,如皮肤、肌腱、软骨及骨组织中的胶原蛋白;球状蛋白的形状近似于球形或椭圆形。许多具有生理活性的蛋白质,如酶、转运蛋白

蛋白质组与蛋白质组学简介2

3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合,然后将DNA从被修饰的碱基处切割,电泳分离,结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰,不能切断,可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白

关于蛋白质工程融合蛋白质的介绍

  脑啡肽(Enk)N端5肽线形结构是与δ型受体结合的基本功能区域,干扰素(IFN)是一种广谱抗病毒抗肿瘤的细胞因子。黎孟枫等人化学合成了EnkN端5肽编码区,通过一连接3肽编码区与人α1型IFN基因连接,在大肠杆菌中表达了这一融合蛋白。以体外人结肠腺癌细胞和多形胶质瘤细胞为模型,采用3H-胸腺嘧啶