Science:绘制“垃圾DNA”的新技术

在很长一段时间内被认作是“垃圾DNA”,我们现在知道了基因间的一些区域也执行着至关重要的功能。这些DNA区域突变可以严重损害人类的发育,有可能在生命后期导致一些严重的疾病。然而直到现在,都难以寻找调控DNA区域。 德国慕尼黑工业大学计算生物学教授Julien Gagneur,马克斯普朗克生物物理化学研究所(MPI) 的Patrick Cramer教授领导科学家们,现在开发出了一种方法来寻找活化和控制基因的调控DNA区域。 我们DNA中的基因包含着详细的蛋白质装配指令,这些蛋白质“工人”执行和控制着我们细胞中几乎所有的过程。为了确保每种蛋白都在适当的时间及我们身体的正确部位完成任务,对应基因的活性必须受到严格控制。基因间的DNA调控区域接管了这一功能,充当了复杂的控制机器。 马克斯普朗克生物物理化学研究所所长Patrick Cramer教授解释说:“一些DNA调控区域对于人类发育、组织保护和免疫应答等至关重要。此外,它们......阅读全文

磁珠法提取基因组DNA的原理

(a) 磁珠法中的细胞裂解液是一种蛋白变性剂,可使动植物的细胞裂解,并使与DNA结合的蛋白质变性,DNA游离释放,磁球可以特异地吸附DNA,通过洗涤,去除DNA以外的RNA、蛋白质等杂质,再因洗脱液解离吸附在磁珠上的DNA,得到纯度和浓度均很高的DNA,可用于PCR扩增、酶切、分子杂交等。(b) 生

磁珠法提取基因组DNA的原理

(a) 磁珠法中的细胞裂解液是一种蛋白变性剂,可使动植物的细胞裂解,并使与DNA结合的蛋白质变性,DNA游离释放,磁球可以特异地吸附DNA,通过洗涤,去除DNA以外的RNA、蛋白质等杂质,再因洗脱液解离吸附在磁珠上的DNA,得到纯度和浓度均很高的DNA,可用于PCR扩增、酶切、分子杂交等。(b) 生

酵母菌基因组DNA的提取实验

实验材料 酵母菌试剂、试剂盒 SE缓冲液山梨醇EDTA溶菌酶PVP蛋白酶K缓冲液 Tris仪器、耗材 高速冷冻离心机台式离心机恒温水浴低温冰箱冷冻真空干燥器取液器电泳仪水平电泳槽紫外观测仪实验步骤 1.  1.5 ml  对数生长期细菌细胞。2.  离心,12 000 rpm,1-2 min。3.

克隆化酵母DNA的操作实验——基因置换技术

实验材料酵母实验步骤一、整合性破坏1.  将基因的内部片段亚克隆到YIP载体。2.  在此内部片段中将质粒线性化。3.  继续整合性转化步骤3(见基本方案1)。二、基因破坏一步法1.  将合适的选择性基因亚克隆到目的基因上,必要时,可在亚克隆的同时引入一个缺失。2.  采用合适的限制性位点,从步骤1

基因转染(磷酸钙DNA共沉淀法)

基因转染技术可以应用于:基因组功能研究(基因表达调控,基因功能,信号转导和药物筛选研究)和基因治疗研究。实验方法原理核酸以磷酸钙-DNA 共沉淀物的形式出现时,可使DNA 附在细胞表面,利于细胞吞入摄取,或通过细胞膜脂相收缩时裂开的空隙进入细胞内,进入细胞的DNA 仅有1%~5%可以进入细胞核中,其

哺乳动物中制备基因组DNA实验

实验材料 动物组织试剂、试剂盒 PBS乙酸铵乙醇酚氯仿异戊醇TE仪器、耗材 离心机摇床研钵实验步骤 1.  切下组织并立即剪成小块,置于液氮中冻结。 2.  将200 mg~1 g 的组织用预冷的研钵和研杵研碎,或用锤子将其捣为细粉末,每100 mg 组织用1. 2 ml 消化缓冲液悬浮。 3.  

在基因组范围定位DNA甲基化

  DNA甲基化在哺乳动物基因表达中扮演了重要角色。尽管通过线粒体遗传且随时间稳定,但是细胞分化、疾病或环境影响都会改变DNA甲基化的模式。近年来,科学家们开发出多种新方法,试图在基因组范围定位DNA甲基化。   尽管从理论上来说,全基因组亚硫酸氢盐测序能让研究人员全面观察甲基化组,但它还是面临技

植物组织制备基因组DNA实验——CTAB法

实验方法原理加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部, 从而达到提取的目的。实验材料植物组织试剂、试剂盒CTAB液2-疏基乙醇TE高盐TE氯仿异戊醇仪器、耗材研钵离心机培养箱实验步骤1.  在所需量

从总-RNA-中除去基因组-DNA-实验

从总 RNA 中除去基因组 DNA 实验             试剂、试剂盒 变性(甲醛)琼脂糖凝胶 琼脂糖 蒸馏

基因组DNA文库构建必备实验技巧2

技术支持资料:材料缓冲液和溶液- 碱裂解液I , 4°C50 mM 葡萄糖25 mM Tris-Cl (pH 8.0)10 mM EDTA (pH 8.0)配制碱裂解液I 约100ml,灭菌,保存在四度。- 碱裂解液II,新鲜配置,室温保存0.2 N NaOH (从10N的NaOH新鲜制备)1% (

基因组DNA提取纯化的注意事项

大多数动物组织可以用裂解缓冲液和蛋白酶/蛋白酶 K 进行高效裂解。在加入裂解液之前需要将组织切成小块,有条件的话建议使用 TissueLyser 或研钵等提前进行均质化。骨骼肌,心脏,皮肤等组织含有收缩蛋白,结缔组织和胶原蛋白,所以利用蛋白酶 / 蛋白酶 K 进行充分消化是必须的。FFPE

哺乳动物中制备基因组DNA实验

制备DNA             实验材料 动物组织 试剂、试剂盒

植物基因组总DNA的分离———SDS法

实验方法原理SDS(十二烷基磺酸钠)是一种强去污剂,可使细胞膜及核膜破裂,因此被用来分离DNA。该分离过程的第一步是用热的去污剂(SDS)进行抽提,然后将抽提物置于0℃并加入高摩尔浓度的乙酸钾,离心去除不溶物,以去除蛋白和多糖类杂质。实验材料植物新鲜叶片试剂、试剂盒液氮提取缓冲液(用前加入)20%S

植物基因组总DNA的分离———SDS法

实验方法原理 SDS(十二烷基磺酸钠)是一种强去污剂,可使细胞膜及核膜破裂,因此被用来分离DNA。该分离过程的第一步是用热的去污剂(SDS)进行抽提,然后将抽提物置于0℃并加入高摩尔浓度的乙酸钾,离心去除不溶物,以去除蛋白和多糖类杂质。实验材料 植物新鲜叶片试剂、试剂盒 液氮提取缓冲液(用前加入)2

质粒DNA电泳图与基因组DNA电泳图有什么区别

质粒DNA电泳图与基因组DNA电泳图的区别:1、DNA显色带条数:质粒DNA电泳有3条带;而基因组DNA应该只有一条带或者两条带。2、应用技术:质粒DNA电泳图与基因组DNA电泳图都是采用了凝胶电泳技术。质粒DNA电泳会有三条带,最远的是线形DNA(lDNA): 质粒的两条链均断裂;线性分子;中间的

质粒DNA电泳图与基因组DNA电泳图有什么区别

质粒DNA电泳图与基因组DNA电泳图的区别:1、DNA显色带条数:质粒DNA电泳有3条带;而基因组DNA应该只有一条带或者两条带。2、应用技术:质粒DNA电泳图与基因组DNA电泳图都是采用了凝胶电泳技术。质粒DNA电泳会有三条带,最远的是线形DNA(lDNA): 质粒的两条链均断裂;线性分子;中间的

北京将加快垃圾焚烧设施建设-破解垃圾困局

   作为特大城市的北京,常住人口已突破2200万人,每天产生生活垃圾1.84万吨,如果用装载量为2.5吨的卡车来运输这些生活垃圾,这些卡车连成一串,能够绕三环路一圈。令人担忧的是,生活垃圾的数量仍在不断增长。   生活垃圾处理是一个系统工程,当前在国际上垃圾处理的方式主要有卫生填埋、生化处理和垃圾

探访台湾垃圾焚化厂:垃圾边上喝咖啡

  坐高速电梯直抵120米高的旋转餐厅,坐下来一边喝咖啡、吃甜点,一边眺望阳明山、观音山,俯瞰淡水河、基隆河及关渡水鸟保护区,秀丽山川让人心旷神怡。   这不是在台北101大楼,而是位于北投区洲美街的台北市北投垃圾焚化厂。厂区里矗立着工厂常见的大烟囱,但特别的是这个烟囱不仅绘上彩虹般的五颜六色,而

浐灞垃圾分类见成效垃圾减量600吨

  近年来,随着城市的高速发展,城市人口的持续增长,生活垃圾量连年增加,生活垃圾处理正逐渐成为困扰城市发展的瓶颈。  记者了解到,2016年,以“垃圾分类,绿色生活”为主题的西安浐灞生态区生活垃圾分类项目启动仪式在浐灞半岛社区举行,标志着西安市开展的城市生活垃圾分类项目正式启动。据统计,浐灞生态区生

垃圾焚烧厂垃圾渗滤液的深度处理

随着城市规模的扩大和人口的增多,生活垃圾的产生量也迅速地增长。根据《城市生活垃圾管理办法》的要求,城市生活垃圾的治理实行减量化、资源化和无害化的原则,采用填埋、堆肥、焚烧等方法对生活垃圾进行处理。但是无论采用何种方法,均会产生垃圾渗滤液,若不加处理而直接排入环境当中,会造成严重的环境污染。本文以某垃

广州派发分类垃圾桶推进农村垃圾分类

  城市人垃圾分类派垃圾袋,农村则选择挨家挨户发垃圾桶。本报“垃圾分类广州范本”试点增城东洞村,昨天开始入户发放分类垃圾桶,普及垃圾分类知识。广州市委宣传部派驻东洞村的扶贫干部李永恒解释,垃圾桶符合农村实际,发垃圾袋反而制造更多垃圾。   有别于其他地方以奖励

Cell:“垃圾”RNA不垃圾,帮助细胞应对压力

  非编码RNA通常因不能编码蛋白质的RNA而被称为“垃圾RNA” ,包括小RNA以及长链RNA。近期,来自于哈佛大学医学院附属麻省总医院(MGH)的研究团队却发现,“垃圾”RNA并不垃圾,它通过与一种负责基因沉默的酶互作,确保应激基因的表达,促使细胞对抗胁迫。  研究人员发现的“垃圾”RNA是B2

地球已被太空垃圾包裹,漫天垃圾还需分类处理

  虽然人类已经可以对部分太空垃圾进行有效的编目管理,但对于如何批量处理太空垃圾,目前仍然缺乏直接高效的办法。专家认为,要区分太空垃圾所处的轨道高低和体积大小,有针对性地采取不同手段进行处理。  实习记者 都芃  不久前,一大块俄罗斯太空垃圾靠近国际空间站,导致国际空间站不得不进行机动规避,这也导致

评论:“土垃圾”已头疼,哪还容得下“洋垃圾”

   为完成“建设美丽中国”的神圣使命,我们不但要处理好本国制造的各种垃圾,还要拒绝不能用作原料的洋垃圾的入境,对可以用作原料的固体废物实行限制进口   美国的废弃塑料,英国的医疗垃圾,最后的归宿竟是远渡重洋之后在中国沿海的码头卸货――因为中国的买主能出别人两倍以上的价钱回收它们,经过重新加工,再流

长江大保护宜昌垃圾发电项目首车垃圾进厂

  2月28日,一车车生活垃圾送进湖北省宜昌市夷陵区鸦鹊岭镇凤凰观村。这里,宜昌市生活垃圾发电特许经营项目正紧张施工。首车垃圾顺利进厂,为该项目的试投产迈出了重要一步。  宜昌市生活垃圾发电特许经营项目占地约168亩,是三峡集团投资建设的第一个生活垃圾发电项目,也是宜昌市主城区首个垃圾发电项目,由三

PNAS破解新物种进化的难题

  经过将近5000亿次的尝试,美国德克萨斯大学(UT)奥斯汀分校的研究人员,见证了一个罕见的事件,也许解决了一个进化的难题:内含子——位于基因中的非编码DNA序列,在基因组中是如何增加的。研究结果发表在《PNAS》杂志上,解决了关于新物种进化的基本问题,并可以增进我们对于“基因表达以及癌

首次绘制出揭示人类遗传历史的“世界地图”

  当来自不同种族群体之间的个体进行异种杂交时,其后代个体的DNA就会变成混合的DNA分子,随后这种DNA分子就会遗传给后代;近日,来自德国马普研究所、牛津大学以及英国伦敦大学的研究者通过研究开发出了一种特殊的全球地图,通过该地图就可以清晰看出过去四年中世界上95个不同种族群体的遗传历史演变,相关研

这些年,你被“食品安全新闻”坑过吗

  11月20日,由国家食品药品监督管理总局新闻宣传中心、中国食品工业协会主办的2016食品安全科普创新竞赛启动仪式在北京大学新闻传播学院举行。国家食品安全风险交流中心的钟凯博士在启动仪式上给准备参与竞赛的大学生分析了那些年食品安全新闻背后的故事。  看完这些故事,你就会发现,这个世界上最远的路,就

Science重磅:缺少一段DNA会让小老鼠发生性别转换

  在今日最新出版的《科学》杂志上,一支跨国团队带来了一项重量级的研究。他们发现在不改变基因的前提下,缺少一段DNA,竟会让小鼠发生“性别转换”,从雄性变成雌性。  中学生物课本告诉我们,染色体决定了我们的性别,男性的XY染色体各有一条,而女性则有两条X染色体。对基因的认识,则从分子生物学的角度提供

测序“垃圾”数据变身宝藏

  基因组测序中曾经被视为是垃圾的数据,现在能够用来为人们提供重要的疾病线索。St. Jude儿童研究医院——华盛顿大学儿童癌症基因组项目的研究人员独辟蹊径,在染色体末端DNA重复片段的测序数据中,挖掘到了宝贵的癌症信息。   染色体末端的DNA重复片段被称为端粒,此前这种重复片段往往在二代测