Science:绘制“垃圾DNA”的新技术
在很长一段时间内被认作是“垃圾DNA”,我们现在知道了基因间的一些区域也执行着至关重要的功能。这些DNA区域突变可以严重损害人类的发育,有可能在生命后期导致一些严重的疾病。然而直到现在,都难以寻找调控DNA区域。 德国慕尼黑工业大学计算生物学教授Julien Gagneur,马克斯普朗克生物物理化学研究所(MPI) 的Patrick Cramer教授领导科学家们,现在开发出了一种方法来寻找活化和控制基因的调控DNA区域。 我们DNA中的基因包含着详细的蛋白质装配指令,这些蛋白质“工人”执行和控制着我们细胞中几乎所有的过程。为了确保每种蛋白都在适当的时间及我们身体的正确部位完成任务,对应基因的活性必须受到严格控制。基因间的DNA调控区域接管了这一功能,充当了复杂的控制机器。 马克斯普朗克生物物理化学研究所所长Patrick Cramer教授解释说:“一些DNA调控区域对于人类发育、组织保护和免疫应答等至关重要。此外,它们......阅读全文
Cell:动态DNA或能帮助有效抵御机体基因损伤
近日,发表在国际杂志Cell上的一篇研究报告中,来自爱丁堡大学的研究人员通过研究鉴别出了DNA保护性结构的特性,这或许能够帮助研究人员对人类基因组深入理解,参与DNA支持性构架的分子往往会通过动态学变化和效应改变来应对突变;研究人员认为,这项研究或能帮助他们理解DNA损伤和基因组组织的机制,当
哺乳动物中制备基因组DNA实验
制备DNA 实验材料 动物组织
华大基因新品:24时完成DNA样本分析
据悉,华大基因将推出一款桌面化的测序仪系统,可以让多种检测实现“一键式”操作。 这套系统名为BGISEQ-500,是继本月初华大基因推出的一款完全集成式的“超级测序仪”——RevolocityTM之后,第二款基于Complete Genomics技术的测序系统。与Revolocit
Science:宏基因组研究挑战DNA编码规则
人们一直认为DNA编码的指令是所有生命通用的,例外情况极少。但本期Science杂志上的一项新研究显示,自然界中的生物又一次打破了既定的规则。 美国能源部联合基因组研究所的Edward Rubin领导研究团队,获得来自1776种环境(包括17个人体区域)的微生物宏基因组数据,以便在其中寻找重编
DNA四螺旋结构富集在基因开关区确认
继2013年发现脱氧核糖核酸(DNA)也有四螺旋结构后,英国剑桥大学研究团队再次识别出人体细胞中这些四螺旋DNA结构在基因组内的具体位点,并证明这种DNA结构将在开发新型靶向性癌症疗法中扮演重要角色。该大学官网近日公布了这一刊登在《自然·遗传学》杂志上的研究成果。 2013年,剑桥大学化学系
使用离心机提取植物基因组DNA
植物基因组DNA提取使用什么样的离心机做?具体步骤怎么样?植物组织提取基因组DNA 一、材料 幼嫩叶子。 二、设备 移液器,冷冻高速离心机,台式高速离心机,水浴锅,陶瓷研钵,50ml离心管(有盖)及5ml和1.5ml离心管,弯成钩状的小玻棒。(这时选择设备的时候注意选择那种通用性强的,可以一机配多种
基因技术普及-DNA检测助中国人寻根
据香港《南华早报》6月17日报道,26岁的李军(音)是江西赣州的一名政府工作人员,他从小在江西长大,全家自其祖父母那一代就一直在此生活,但他有时仍想知道他们是如何到此定居的。 当李军的表兄从一家DNA检测公司买了两个试剂盒时,李军高兴地按说明要求提交了自己的唾液。四个星期后,他拿到检测报告,解
应用黏粒载体构建基因组DNA文库
实验方法原理 在 λ 噬菌体中构建基因组 DNA 文库的步骤与在黏粒载体中的步骤基本一致。在这两种系统中,真核 DNA 在体外与载体 DNA 连接,形成能包装到 λ 噬菌体颗粒中的多联体。构建在 λ 噬菌体中的文库以具有感染性的重组噬菌体形式贮存和增殖。实验材料 T4 噬菌体 DNA 连接酶牛小肠碱
Southern印迹及基因组DNA杂交技术实验
实验材料 基因组 DNA试剂、试剂盒 限制性缓冲液仪器、耗材 琼脂糖凝胶实验步骤 1. 7~20 μg 基因组 DNA 稀释到 500 μl 合适的限制性缓冲液中。4℃ 过夜。2. 每管加 10~20 单位限制性酶。孵育 4~6 小时。10 μl 消化液在小琼脂糖凝胶上电泳检测消化的程度。如果需要,
基本方案2-基因组-DNA-的扩增
实验材料基因组DNA试剂、试剂盒4dNTP 混合物10 X PCR 扩增缓冲液寡聚核苷酸引物Taq DNA 聚合酶矿物油筛(子)琼脂糖DNA 分子大小标准参照物仪器、耗材聚丙稀微量离心管循环变温加热器实验步骤
基因兴奋剂:-DNA中植入的邪恶之花
马钱子碱,又名“士的宁”,是一种极毒白色晶体碱,曾用于中枢神经兴奋剂。1904年美国圣路易斯奥运会马拉松比赛,有运动员依靠它获得金牌,但由于副作用失去了再次参赛的可能。图为装有士的宁的瓶子上写着“毒药”。 图片来源:chm.bris.ac.uk 兴奋剂这只狡猾的“老鼠”与反兴奋剂“猫”之间
没有Dna2,基因就会“乱蹦乱跳”
贝勒医学院等机构的研究人员在《Nature》发表的一项研究显示,缺失Dna2后,小DNA片段就会从整个基因组中跳跃到染色体断裂处。这种新机制可以解释癌症或抗体多样化过程出现的类似事件。 “我们实验室的兴趣之一是了解DNA复制的基本机制,”文章通讯作者、分子和人类遗传学副教授Greg Ira说。
磁珠法提取基因组DNA的原理
(a) 磁珠法中的细胞裂解液是一种蛋白变性剂,可使动植物的细胞裂解,并使与DNA结合的蛋白质变性,DNA游离释放,磁球可以特异地吸附DNA,通过洗涤,去除DNA以外的RNA、蛋白质等杂质,再因洗脱液解离吸附在磁珠上的DNA,得到纯度和浓度均很高的DNA,可用于PCR扩增、酶切、分子杂交等。(b) 生
从总-RNA-中除去基因组-DNA-实验
从总 RNA 中除去基因组 DNA 实验 试剂、试剂盒 变性(甲醛)琼脂糖凝胶 琼脂糖 蒸馏
基因转染(磷酸钙DNA共沉淀法)
实验材料 细胞样品试剂、试剂盒 HBSCaCl2TEG418(新霉素G418)液G418选择培养基仪器、耗材 培养瓶
应用黏粒载体构建基因组DNA文库
在 λ 噬菌体中构建基因组 DNA 文库的步骤与在黏粒载体中的步骤基本一致。在这两种系统中,真核 DNA 在体外与载体 DNA 连接,形成能包装到 λ 噬菌体颗粒中的多联体。构建在 λ 噬菌体中的文库以具有感染性的重组噬菌体形式贮存和增殖。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理
磁珠法提取基因组DNA的原理
a) 磁珠法中的细胞裂解液是一种蛋白变性剂,可使动植物的细胞裂解,并使与DNA结合的蛋白质变性,DNA游离释放,磁球可以特异地吸附DNA,通过洗涤,去除DNA以外的RNA、蛋白质等杂质,再因洗脱液解离吸附在磁珠上的DNA,得到纯度和浓度均很高的DNA,可用于PCR扩增、酶切、分子杂交等。(b) 生物
Southern印迹及基因组DNA杂交技术实验
Southern 印迹 放射性标记的探针与固定化核酸进行杂交 实验方法原理 硝酸纤维膜或尼龙滤膜对单链DNA的吸附能力很强,当电泳后凝胶经过DNA变
在基因组范围定位DNA甲基化
DNA甲基化在哺乳动物基因表达中扮演了重要角色。尽管通过线粒体遗传且随时间稳定,但是细胞分化、疾病或环境影响都会改变DNA甲基化的模式。近年来,科学家们开发出多种新方法,试图在基因组范围定位DNA甲基化。 尽管从理论上来说,全基因组亚硫酸氢盐测序能让研究人员全面观察甲基化组,但它还是面临技
细菌中制备基因组DNA实验——小量制备
真核生物的一切有核细胞(包括培养细胞)都能用来制备基因组 DNA。真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内,因此,制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持DNA分子的完整。实验方法原理提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液
微量基因组DNA提取试剂盒说明
本试剂盒提供了高效、快速从各种微量生物样本中纯化得到较高浓度基因组DNA的方法,例如:微量血液、细胞、动物组织、干燥血迹、临床棉签、毛囊等。采用本公司特有的DNA-only硅胶膜离心柱和配方,搭配Foregene Protease,可以在20-80分钟提取到较高浓度、高质量的基因组DNA。专
新“基因魔剪”按需敲入长DNA序列
北京11月27日电 据最新一期《自然·生物技术》发表的一项研究,在CRISPR基因编辑系统的基础上,美国麻省理工学院研究人员设计了一种新工具,可以更安全、更高效的方式剪除有缺陷的基因并用新基因替换它们。 使用这个系统,研究人员可将长达36000个DNA碱基对的基因传递给几种类型的人类细胞,以及小
从总-RNA-中除去基因组-DNA-实验
为了进行 FDD 基因表达的分析,以及使用任何其他基于 RNA 的基因表达技术,在反转录合成单链 cDNA 和后续的 PCR 操作之前,必须除掉污染的基因组 DNA。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒变性(甲醛)琼脂糖凝胶琼脂糖蒸馏水甲醛蒸馏水乙醇甲醛MOPS
基因组DNA文库构建必备实验技巧2
技术支持资料:材料缓冲液和溶液- 碱裂解液I , 4°C50 mM 葡萄糖25 mM Tris-Cl (pH 8.0)10 mM EDTA (pH 8.0)配制碱裂解液I 约100ml,灭菌,保存在四度。- 碱裂解液II,新鲜配置,室温保存0.2 N NaOH (从10N的NaOH新鲜制备)1% (
基因转染(磷酸钙DNA共沉淀法)
实验方法原理 核酸以磷酸钙-DNA 共沉淀物的形式出现时,可使DNA 附在细胞表面,利于细胞吞入摄取,或通过细胞膜脂相收缩时裂开的空隙进入细胞内,进入细胞的DNA 仅有1%~5%可以进入细胞核中,其中仅有不到1%的DNA 可以与细胞D
Southern印迹及基因组DNA杂交技术实验
放射性标记的探针与固定化核酸进行杂交试剂、试剂盒预杂交液SSCSDS仪器、耗材硝酸纤维素滤膜实验步骤1. 准备适合即将进行的工作的杂交溶液。每平方厘米硝酸纤维素滤膜或尼龙膜大约需要 0.2 ml 预杂交液。预杂交液:用于检测低丰度序列:或者6x SSC ( 或 6x SSPE)5 x Denhard
克隆化酵母DNA的操作实验——基因置换技术
实验材料酵母实验步骤一、整合性破坏1. 将基因的内部片段亚克隆到YIP载体。2. 在此内部片段中将质粒线性化。3. 继续整合性转化步骤3(见基本方案1)。二、基因破坏一步法1. 将合适的选择性基因亚克隆到目的基因上,必要时,可在亚克隆的同时引入一个缺失。2. 采用合适的限制性位点,从步骤1
磁珠法提取基因组DNA的原理
(a) 磁珠法中的细胞裂解液是一种蛋白变性剂,可使动植物的细胞裂解,并使与DNA结合的蛋白质变性,DNA游离释放,磁球可以特异地吸附DNA,通过洗涤,去除DNA以外的RNA、蛋白质等杂质,再因洗脱液解离吸附在磁珠上的DNA,得到纯度和浓度均很高的DNA,可用于PCR扩增、酶切、分子杂交等。(b) 生
酵母菌基因组DNA的提取实验
实验材料 酵母菌试剂、试剂盒 SE缓冲液山梨醇EDTA溶菌酶PVP蛋白酶K缓冲液 Tris仪器、耗材 高速冷冻离心机台式离心机恒温水浴低温冰箱冷冻真空干燥器取液器电泳仪水平电泳槽紫外观测仪实验步骤 1. 1.5 ml 对数生长期细菌细胞。2. 离心,12 000 rpm,1-2 min。3.
酵母菌基因组DNA的提取实验
基本方案 实验材料 酵母菌 试剂、试剂盒