非编码MiRNA双重调控作用的全新分子机制研究获系列进展
根据印尼肥料生产协会（APPI）公布的数据，今年前四个月印尼农业生产共消耗化学肥料310万吨。其中，尿素消耗量最大，达130万吨,氮磷钾肥料（NPK）次之，达110万吨，而同期有机肥使用量仅22万吨。 印尼科学院研究人员表示，土壤需要源源不断的有机物质来提供碳资源，如果土壤失去了碳，肥力将会降低，并预测如继续大规模使用化学肥料，未来25年印尼将发生严重的土壤破坏。 为此，印尼科学院的团队研究了一种改良土壤退化的有效方法。印尼科学院的研究证实，一种存活于植物根部、被称作根际细菌（rhizobacteria）的土壤微生物，能显著改善植物根部的免疫系统，可在土壤修复aMicroRNAs（MiRNAs）是近年来RNA生物学领域中的重大发现。它是一类平均长度只有22个核苷酸的小分子非编码RNA。在人类中表达的MiRNA有一千多种，人体中60%的基因都可能被其调节。MiRNA对靶基因的调节参与了个体发育、细胞分化与增殖、凋亡等一系......阅读全文
高通量快速验证miRNA靶基因
尽管现在人们可以越来越准确地预测microRNA的沉默效果，但还是需要高通量而且准确的直接验证技术来验证microRNA的沉默效果。microRNA 这个在生物科学史上具有重要意义的小分子，在2008年又一次成为了世人瞩目的焦点。microRNA通过与目标mRNA的3’UTR区域结合来阻止其翻译
如何预测和鉴定miRNA的靶基因
免疫沉淀当然，确定miRNA与mRNA之间的互作，我们还有更直接的方法，那就是从实验上寻找物理相互作用。我们可以利用RNA诱导沉默复合物（RISC）中的Argonaut（AGO）蛋白的抗体进行免疫共沉淀（co-IP）。目前更先进的方法是通过紫外线照射以交联复合物，然后开展深度测序以鉴定发现的RNA，
二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆（Glycine soja）是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱，碱，盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究，将有助于栽培大豆的遗传改良。近日，华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通量测
植物内源激素油菜素内酯负调控miRNA靶基因的翻译抑制
植物体内非常重要的小分子非编码RNA——miRNA在翻译水平介导的靶标基因抑制是一种非常保守的基因沉默机制。在模式植物拟南芥中，miRNA被装载到其效应分子ARGONAUTE1（AGO1）蛋白上，以碱基互补配对的方式与其靶标mRNA结合，最终诱导细胞质中靶基因mRNA的切割，或者在内质网中抑制靶
二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱，碱，盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究，将有助于栽培大豆的遗传改良。近日，华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代
BMC－Plant－Biology测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆（Glycine soja）是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱，碱，盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究，将有助于栽培大豆的遗传改良。近日，华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通
miRNA－mimics－miRNA－inhibitor
miRNA mimics 是模拟生物体 内源的miRNAs，运用化学合成的方法合成，能增强内源性miRNA的功能。miRNA inhibitor 是化学修饰的专门针对细胞中特异的靶miRNA的抑制剂。近年来人工合成的miRNA（artificial miRNA，amiRNA）已经成功应用于沉默预期靶
找出病变基因当“靶点”
提起最佳的射击，很多人的答案都是正中靶心。对于癌症病人来说，能够准确地找到病变原因，不仅能够实现真正的对症下药，还能大大减轻病人身体上所受的痛苦。在青岛市中心医院肿瘤综合治疗科，通过检测基因序列，发现病变基因，来揭示病人患上癌症的核心“密码”，尤其是对于癌症晚期病人来说，无疑是黑暗中的“柳暗花明
miRNA海绵—长效抑制miRNA
随着研究的深入，已知miRNA的数量与日俱增，目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过，大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中，最有效的方法是阻止特定基因的功能，然后了解其后果。miRNA同样如此。然而，相比之下，miRNA的功能研究要困难得多。为什么
miRNA海绵—长效抑制miRNA
miRNA海绵随着研究的深入，已知miRNA的数量与日俱增，目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过，大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中，最有效的方法是阻止特定基因的功能，然后了解其后果。miRNA同样如此。然而，相比之下，miRNA的功能研究要困
关于小分子RNA的作用方式介绍
microRNA-RISC对靶基因mRNA的作用主要取决于它与靶基因转录体序列互补的程度，有三种方式。 第一种是切断靶基因的mRNA分子——miRNA与靶基因完全互补结合，作用方式和功能与siRNA非常相似，最后切割靶mRNA。在植物中，大部分miRNA都以这种方式，靶基因mRNA断裂后，无p
PCR技术要素模板(靶基因)核酸
模板(靶基因)核酸 模板核酸的量与纯化程度,是PCR成败与否的关键环节之一,传统的DNA纯化方法通常采用SDS和蛋白酶K来消化处理标本。SDS的主要功能是: 溶解细胞膜上的脂类与蛋白质,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜,并解离细胞中的核蛋白,SDS 还能与蛋白质结合而沉淀; 蛋白酶K能水解消化蛋白质,特别
Affymetrix推出AxiommiRNA靶基因分型芯片
2012年11月6日，来自加利福尼亚州圣克拉拉的消息――Affymetrix公司(纳斯达克代码：AFFX)推出了 Axiom® miRNA靶基因分型芯片，唯一一款可在全基因组范围评估microRNA(miRNA)靶基因位点的高密度基因分型工具。这些新的芯片将实现全面研究，以阐明miRNA调控
什么是小分子RNA？
MicroRNA (miRNA) 是一类由内源基因编码的长度约为22 个核苷酸的非编码单链RNA分子，它们在动植物中参与转录后基因表达调控。在动植物以及病毒中已经发现有28645个miRNA 分子(Release 21: June 2014) 。大多数miRNA 基因以单拷贝、多拷贝或基因簇(c
miRNA调控植物对镉的应激反应
土壤中的重金属污染是一个世界范围内严重的环境问题，主要是由于一些人为活动，如采矿，工业活动和有机磷的使用等造成。土壤中镉（Cd）可以很容易地被植物吸收，从而导致各种中毒症状，如降低生物量，叶片失绿，抑制根系生长，发生形态学改变，甚至植株死亡。大量研究表明，在植物中，microRNA（miRNA）参与
华南农大：miRNA调控植物对镉的应激反应
土壤中的重金属污染是一个世界范围内严重的环境问题，主要是由于一些人为活动，如采矿，工业活动和有机磷的使用等造成。土壤中镉（Cd）可以很容易地被植物吸收，从而导致各种中毒症状，如降低生物量，叶片失绿，抑制根系生长，发生形态学改变，甚至植株死亡。大量研究表明，在植物中，microRNA（miRNA
如何设计miRNA－mimics
miRNA mimic能模拟细胞中内源性成熟miRNA的高水平表达，以增强内源性miRNA的调控作用，是miRNA功能研究的一大利器。miRNA mimic是一种简单高效的miRNA研究工具，只需用转染试剂包裹即可转染进入细胞，无需构建载体的繁琐操作，无需病毒防护方面的担忧，用转染对照即可观察其转染
浙大：RNA编辑阻止RISC识别靶标mRNA
MicroRNAs（miRNAs）结合Ago形成RNA诱导沉默复合体，通过沉默靶mRNA调控基因表达。miRNA的RNA编辑可能影响miRNA的加工，Ago复合物的组装，以及靶mRNA的结合。然而，组装进Ago复合物的被编辑的miRNA的功能，还没有被深入研究过。 浙江大学生命科学学院章晓波教
四川农大：揭示miRNA调控玉米穗发育机制
microRNA(miRNAs)是一类内源性的非编码小RNA，在植物的多种生理过程中发挥重要调控作用，包括代谢，激素反应，转座子的表观遗传控制，胁迫应答。在模式植物如水稻和拟南芥中已进行了广泛的miRNA研究。在玉米中，胁迫应答相关miRNA和其靶基因的研究也已开展过很多。然而，关于miRNA参
小分子RNA的简介
MicroRNA (miRNA) 是一类内生的、长度约为20-24个核苷酸的小RNA，其在细胞内具有多种重要的调节作用。每个miRNA可以有多个靶基因，而几个miRNA也可以调节同一个基因。这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达，也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某
microRNAs（miRNAs）简介(1)
microRNAs（miRNAs）是一种小的，类似于siRNA的分子，由高等真核生物基因组编码，miRNA通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体（RISC）降解mRNA或阻碍其翻译。miRNAs在物种进 化中相当保守，在植物、动物和真菌中发现的miRNAs只在特定的组织和发育阶段表达，m
甘肃农业大学：光刺激下miRNA对土豆次级代谢的影响如何
光是影响土豆代谢途径和刺激其产生次生代谢物的一个重大的环境因素。光诱导马铃薯引发的代谢途径和生理功能的自适应改变，在一定程度上反应了基因表达的变化。土豆转录水平上的次生代谢途径一直得到广泛的研究，但microRNA（miRNA）转录后调控机制研究却少之又少。甘肃农业大学张金文课题组，运用miRNA测
揭示糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动...（一）
揭示糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复文章导读血管平滑肌细胞（VSMC）在健康状态下处于去分化表型，在其受损时，循环系统中的血小板快速激活，通过凝血反应为受伤部位止血，同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质，使VSMC切换为高分化表型，同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增
miRNA研究
一、miRNA研究的基本问题和研究方法二、miRNA研究的综合解决方案1. miRNA微阵列芯片服务Agilent miRNA 芯片（21.0） Affymetrix miRNA 4.0 芯片2. miRNA测序服务 miRNA-seq文库构建流程 miRNA测序数据分析流程3. miRNA R
糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复
血管平滑肌细胞（VSMC）在健康状态下处于去分化表型，在其受损时，循环系统中的血小板快速激活，通过凝血反应为受伤部位止血，同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质，使VSMC切换为高分化表型，同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增生型糖尿病就是由于VSMC分化和去分化状态切换机制失调引起的。
miRNA和siRNA的基本介绍及区别
1998年，Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术：通过dsRNA诱导特异基因的沉默，即所谓RNAi。2000年，Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs，mall temporal RNAs)。RNA干涉（RNAi）在实验室中是
miRNA和siRNA简介及区别
1998年，Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术：通过dsRNA诱导特异基因的沉默，即所谓RNAi。2000年，Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs，mall temporal RNAs)。RNA干涉（RNAi）在实验室
糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复
血管平滑肌细胞（VSMC）在健康状态下处于去分化表型，在其受损时，循环系统中的血小板快速激活，通过凝血反应为受伤部位止血，同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质，使VSMC切换为高分化表型，同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增生型糖尿病就是由于VSMC分化和去分化状态切换机制失调引起的。
研究发现HYL1蛋白调控miRNA介导的翻译抑制过程
中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员何玉科研究组在The Plant Cell上，发表了题为Cytoplasmic HYL1 modulates miRNA-mediated translational repression的研究论文。该研究组发现，HYL1蛋白除了介导m
筛选或验证RNA修饰直接靶点，研究RNA修饰靶基因的调控...
筛选或验证RNA修饰直接靶点，研究RNA修饰靶基因的调控机制技术简介用体外转录法标记生物素RNA探针，然后与胞浆蛋白提取液孵育，形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合，从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后，通过Western Blot检测特定的RNA结合蛋白是否与R