新“分子时钟”预测癌症更近一步
日前，中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所与英国伦敦大学学院的研究人员在《基因组生物学》杂志上合作发表的一项最新研究成果表明，生命周期中细胞分裂导致的DNA分子变异积累可被用于癌症发生风险的预测。 组织细胞的分裂速度与该组织的癌症发生风险高度相关。研究人员利用计算建模方法设计了一个“分子时钟”，并利用它对个体特定组织生命周期中细胞分裂的次数进行估算。他们同时针对一种只在DNA特定序列上发生的修饰，即DNA甲基化修饰，设计出变异的“有丝分裂时钟”运行节律。 研究表明，基因组特定位点的DNA甲基化会随着个体生理年龄的增加而积累，这一发现表明可利用这一“分子时钟”对个体年龄进行精确预测。然而，同一个体中不同器官组织虽然具有相同的生理年龄，但却具有不同的癌症发生风险，因此该基于DNA甲基化的早期“时钟”无法用于癌症发生的风险预测。 由计算生物学所研究员、英国伦敦大学学院教授Andrew Teschendorff领导的研......阅读全文
新“分子时钟”预测癌症更近一步
日前，中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所与英国伦敦大学学院的研究人员在《基因组生物学》杂志上合作发表的一项最新研究成果表明，生命周期中细胞分裂导致的DNA分子变异积累可被用于癌症发生风险的预测。 组织细胞的分裂速度与该组织的癌症发生风险高度相关。研究人员利用计算建模方法设计了一个“分
基因“时钟”或能预测脊椎动物寿命
近日，一个澳大利亚研究团队报告了一种采用基因标记准确估算不同脊椎动物物种寿命的模型。这个“寿命时钟”筛选了CpG（核苷酸对）位点的42个特定基因，以预测某脊椎动物物种成员可能拥有多长的寿命。CpG位点是DNA上的短片段，其密度与寿命相关。相关论文刊登于《科学报告》。 一个物种的最大寿命难以定义
发现生物“时钟”，可预测人的寿命？
单看面相，说林志颖和郭德纲相差20岁，都会有人信。实际上，两人年龄只差一岁。我们身边也常有这种情况，有的人容貌和身体状况看起来比实际年龄年轻许多，但有的却十分显老。更重要的是，年轻或衰老，并非只在表面。3月9日，深圳华大生命科学研究院主导的一项多组学研究发现，我们身体内的各种器官和系统都有自己的生物
Nature：拨慢人类DNA分子时钟
人类祖先的故事一直只是写在骨骼化石中，不过自上个世纪60年代DNA检测介入其中，我们就了解的更加深入了，比如说一些研究结果表明，所有现代人类都源自10多万年前生活在非洲人，但其中人类进化的一些关键事件与考古学相悖。 现在，考古学家和遗传学家又开始重新解析这些事件，由于DNA突变率――基于遗
Nature子刊：揭秘开花分子时钟
鲜花不仅吸引眼球，还吸引着蜜蜂等传粉者。植物需要最大程度的利用传粉者来进行繁殖，开花的时机也就对植物及其产量有重大影响。人们一直认为外界环境的光和温度是控制开花的主要因素。然而，冷泉港实验室CSHL的助理教授Zach Lippman博士及其同事在Nature Genetics杂志上发表了新研
有用？哈佛科学家开发预测寿命的“生命时钟”
通常我们按照日历计算，以出生时间为起点，计算至今活了多久。然而，这种实际年龄（chronological age）未必真正体现一个人的生理年龄（biological age）。毕竟，遗传、营养、感染、压力等种种因素会让老化速度因人而异，每个人“显老”的程度不一样。 为了更准确地测出一个人老化、
哈医大发明分子探针－可预测癌症靶向治疗效果
科技日报讯 日前，《科学》子刊《科学·转化医学》杂志刊载论文，报道我国哈尔滨医科大学申宝忠团队成功构建了一种PET（正电子发射计算机断层显像）成像的分子探针——18F-MPG。通过该探针能够实时、动态、精准识别肺癌EGFR（表皮生长因子受体）分型，指导临床靶向药物治疗的决策，预测并评价癌症靶向治
一种血液“蛋白质时钟”可预测疾病风险
8月8日，一项发表于《自然-医学》的研究显示，一种基于血液中约200种蛋白质的年龄“时钟”可以预测18种慢性疾病的风险，包括心脏病、癌症、糖尿病和阿尔茨海默病等。对血液中200多种蛋白质的分析为死亡风险和十几种与衰老相关的慢性疾病提供了线索。图片来源：Vo Trung Dung/Look At Sc
神奇！两套脑部“时钟”可预测毫秒之内的未来
其中一套“时钟”需依赖于我们的过往经历，另一套则依赖于节奏。但我们要想在世间从容游走，这两套“时钟”都必不可少。有了这两套内置时钟，我们才能在红灯即将变成绿灯时，知道何时该踩下油门。 人脑的这种内部“时钟”是在专家研究帕金森综合征患者预期计时的精确度时发现的。有了这两套内置时钟，我们才能在放声
《Nature－Genetics》解读肿瘤利器，预测癌症进化
伦敦玛丽王后大学的研究人员开发了一款计算分析模型，可用于预测肿瘤进展。这项研究发表在《Nature Genetics》，目的是让临床医生具备预测肿瘤生长轨迹的能力，从而先发制人地控制病程和选择相应治疗方案。 研究人员采用亚克隆选择计算模型和适用于高通量测序数据的理论种群遗传学来监测人类癌症克隆
计算机算法预测分子气味
这不是一件可被嗤之以鼻的事情。计算机破解了一道困扰化学家几个世纪的难题：从分子的结构预测它的味道。这一壮举或许使香水制造商和味道专家得以在试验和错误大大减少的情况下创造新产品。相关成果日前发表于生命科学预印本网站bioRxiv。和结果可通过分析光波长或声音被预测出来的视觉和听觉不同，人类的嗅觉一直很
癌症扩散的关键分子
癌症是一种细胞生长的疾病，但大多数肿瘤只有从其原发位置扩散到全身各处时，才会变得具有致命性。最近，美国托马斯杰弗逊大学的研究人员发现，一个分子可能是驱动前列腺癌转移的重要调控因子。这项研究结果，发表于七月十三日的《Cancer Cell》，为开发药物防止前列腺癌以及可能其他癌症的转移，提供了一个
AI分析组织样本准确预测癌症结果
美国得克萨斯大学西南医学中心研究人员开发了一种新的人工智能（AI）模型，可分析组织样本中细胞的空间排列。12月11日发表在《自然·通讯》上的这一创新方法，准确地预测了癌症患者的结果，标志着在利用AI进行癌症预后和个性化治疗策略方面取得了重大进展。 细胞的空间组织就像一个复杂的拼图，每个细胞都是
防患未然！基因检测帮助预测癌症风险
癌症，一直是健康领域的一个热点问题。随着人们认识的提高，许多人对癌症的了解也都不断加深。例如诱发癌症的因素有很多，例如抽烟、酗酒等等都会极大程度增加人们患上癌症的风险。 然而，很少有人意识到，基因也是导致癌症的重要因素之一。例如一个名为BRCA的基因一旦出现突变，携带次突变型的女性患上乳腺癌的
AI分析组织样本准确预测癌症结果
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514129.shtm 使用Ceoggraph进行病理图像分类的图示。图片来源：物理学家组织网美国得克萨斯大学西南医学中心研究人员开发了一种新的人工智能（AI）模型，可分析组织样本中细胞的空间排列
Nature综述：表观遗传学预测癌症弱点
由Bellvitge生物医学研究协会癌症表观遗传与生物学研究组Manel Esteller领导的研究组，发表题为“DNA methylation profiling in the clinic: applications and challenges”的综述文章，概况了近期在应用表观遗传
DNA的端粒长度可以有效预测癌症风险
匹兹堡大学癌症研究所（UPCI）的科学家在美国华盛顿特区的AACR年会上报道，保护染色体末端的DNA端粒长度可以预测癌症的风险并成为未来治疗的潜在靶标。 皮特和新加坡科学家率先研究的研究表明，超过预期的端粒由重复的DNA序列组成，每次细胞分裂时都会缩短---与癌症风险增加相关。 持有阿诺德·
常规血液测试可预测癌症患者存活时间！
研究人员在新加坡ESMO亚洲2016年大会上报告，常规的血液检查可以预测姑息治疗中癌症患者的存活时间。 首席作者日本京都大学肿瘤学家Yu Uneno博士说，“需要姑息治疗中癌症患者诚实和准确的预后信息，但这种信息很敏感，必须尊重患者。” “患有晚期癌症的患者及其家属必须对治疗做出决定，何时寿
新方法提高癌症预测准确率
来自中山大学肿瘤防治中心戎铁华教授等通过肿瘤分子信息和数据挖掘方法可以预测早期非小细胞肺癌5年内是否死亡，这一预测的总正确率达到87.2%，研究成果在杂志Journal of Clinical Oncology上发表，该杂志影响因子达到15.484。 肺癌主要分为小细胞肺癌及非小细胞肺癌，
耶鲁大学医学院：表观遗传时钟预测衰老的可靠性增加
表观遗传时钟是一种基于DNA甲基化的强大生物标志物，其能被开发用来追踪人口研究中的衰老、临床试验和个人健康应用，旨在测定机体的生物学年龄，其能强烈预测人类年龄相关的发病率和死亡率，以及机体健康的其它方面。近日，一篇发表在国际杂志Nature Aging上题为“A computational solu
分子水平揭示癌症转移的新型分子机制
近日，一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中，来自耶鲁大学的科学家们通过研究在分子水平上揭示了机体癌症转移的分子机制，同时研究者开发出了一种新型工具来检测特定癌症患者机体中引发疾病的诱导子，相关研究结果有望帮助科学家们开发治疗癌症的新型疗法。图片来源：Levc
科学家首次展示RNA剪接分子时钟精确原子模型
西湖大学生命科学学院施一公教授研究组题为《ATP水解酶/解旋酶Prp2及其激活因子Spp2催化剪接体激活过程中结构重塑的分子机理》的论文，11月27日在《科学》杂志以长文形式发表。此文报道了酿酒酵母处于激活状态的剪接体2.5埃的高分辨率电镜结构，该结构是目前报道的最高分辨率的剪接体结构，首次展
高校女教师困境：当生育时钟与考核时钟同时响起
3个月前，37岁的高校女教师王漾生下了小孩，但她并未沉浸于初为人母的喜悦。按照她任职学校“非升即走”的制度，若考核期内未能晋升副教授者，王漾就面临离职风险。今年是她考核期的最后一年，论文还没发够的她在每天短暂的睡眠中，一遍又一遍地梦到考试。 近十年来，随着新聘任机制的全面推开，中国相当多的高校实
以色列希伯来大学成像技术可以帮助预测癌症
耶路撒冷希伯来大学正在开展一项新的研究，对同一患者进行不同时间的脑部扫描，在不进行侵入性或危险程序的情况下区分健康和患病的脑组织。 希伯来大学研究人员将这种阅读MRI的新方法与进行血液检测相比较。当我们进行血液检查时，它向我们展示了我们身体中白细胞的确切数量以及这个数字是否因疾病而高于正常水平。这
AI模型可预测癌症原发灶位点
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506190.shtm根据《自然·医学》杂志7日发表的一篇论文，美国麻省理工学院和达纳-法伯癌症研究所的研究人员开发了一种新方法，使识别一些神秘癌症的原发灶位置变得更容易。 在原发灶不明的癌症中，癌
AI模型可预测癌症原发灶位点
根据《自然·医学》杂志7日发表的一篇论文，美国麻省理工学院和达纳-法伯癌症研究所的研究人员开发了一种新方法，使识别一些神秘癌症的原发灶位置变得更容易。 研究人员利用近3万名22种已知癌症的患者数据来训练机器学习模型，它可分析大约400个基因序列，这些基因经常在癌症中发生突变。然后，研究人员使用
液态活检预测癌症复发－循环肿瘤再立大功
术后血液ctDNA与癌症复发有关 利用数字PCR和原发性肿瘤体细胞突变标识，该研究团队研究了55名早期乳腺癌患者手术前后血液ctDNA的变化，这些患者均接受化疗和手术。研究人员报道，治疗后血液样本ctDNA与乳腺癌高风险复发相关。治疗后血液ctDNA呈阳性的患者癌症复发的概
多基因评估能更好地帮助预测癌症风险
得知自己携带乳腺癌基因BRCA1突变的女性往往面临艰难的抉择。医生或基因顾问会这样告诉她们：携带这种基因突变的女性一生中罹患乳腺癌的风险平均为72%，罹患卵巢癌的风险平均为44%。 考虑到这一点，一半的女性通常决定进行预防性的乳房切除手术，许多人同时还切除了卵巢。 但最近的研究显示，将其他基
NEJM：生物标志物可预测癌症化疗反应
DNA的错配修复(MMR)主要负责纠正复制后的错误以及维持基因组的稳定，有时候MMR的异常会引发一系列癌变表型，近日来自约翰霍普金斯基墨尔癌症中心（Johns Hopkins Kimmel Cancer Center ）的研究人员发现，MMR基因的突变或可帮助准确预测病人对化疗药物—PD-1抑制
16种常见癌症可做预测性基因检测
研究人员正在进行肿瘤组织基因组提取。 随着癌症发病率逐年上升，癌症基因检测愈发流行。基于自身健康的考虑，一些高危人群开始主动进行癌症基因检测。目前，癌症基因检测还处于发展阶段，多数用于肿瘤的靶向治疗以及临床疾病的药物治疗，不过我国现在已有16种常见癌症变异基因被破译，可做预测性基因检测。 精