新“分子时钟”预测癌症更近一步
日前，中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所与英国伦敦大学学院的研究人员在《基因组生物学》杂志上合作发表的一项最新研究成果表明，生命周期中细胞分裂导致的DNA分子变异积累可被用于癌症发生风险的预测。 组织细胞的分裂速度与该组织的癌症发生风险高度相关。研究人员利用计算建模方法设计了一个“分子时钟”，并利用它对个体特定组织生命周期中细胞分裂的次数进行估算。他们同时针对一种只在DNA特定序列上发生的修饰，即DNA甲基化修饰，设计出变异的“有丝分裂时钟”运行节律。 研究表明，基因组特定位点的DNA甲基化会随着个体生理年龄的增加而积累，这一发现表明可利用这一“分子时钟”对个体年龄进行精确预测。然而，同一个体中不同器官组织虽然具有相同的生理年龄，但却具有不同的癌症发生风险，因此该基于DNA甲基化的早期“时钟”无法用于癌症发生的风险预测。 由计算生物学所研究员、英国伦敦大学学院教授Andrew Teschendorff领导的研......阅读全文
一滴血检测癌症靠谱吗？基因检测可预测癌症风险
“一滴血检测癌症”的新闻近日在朋友圈刷了屏，已经有多家媒体和机构出来强力辟谣。但是，一滴血虽然无法检测癌症，却能预测癌症。记者从中山大学孙逸仙纪念医院获悉，该院细胞分子诊断中心在广东省率先正式开展BRCA1/2基因高通量测序检测服务。普通人群可以据此“查三代”，看看自己以及后代是否有乳腺癌或卵巢
分子反应预测研究中取得新进展
近日，华中农业大学人工智能与知识发现团队提出了一种适用于多种分子网络关联预测任务的、可迁移的对比自监督深度图神经网络模型：CSGNN。此项工作是图神经网络在分子网络关联预测应用的最新成果。 大数据时代存在不同类型的分子网络，例如药物-靶点互作网络，药物-疾病关联网络、蛋白质-蛋白质互作网络等，
预测小分子抗癌活性有了新算法
记者从中科院昆明动物研究所获悉，该所李功华博士在研究员黄京飞的指导下，开发了一个新的基于分子药效团的小分子比对算法，并成功应用于预测小分子的抗癌活性。近日，该研究发表在顶级计算生物学杂志《生物信息学》上。 据李功华介绍，开发新的抗癌药物是科学界和医学界的热点和难点。直接采用实验的方法筛选抗
Cancer－cell：癌症复发的分子根源
根据美国癌症协会的统计，今年在美国将有近4万的妇女死于乳腺癌。其中的大多数并非死于原发性肿瘤，而是死于治疗后的肿瘤复发。 一直以来人们对于导致乳腺癌复发的确切原因认识不足，但现在他们找到了其中的一块拼图：宾夕法尼亚大学Perelman医学院的研究人员，确定了参与乳腺癌复发的一个重要分子。这
华人女学者：预测癌症和死亡的新方法
表观遗传学年龄是衡量你生物学年龄的一种新方法。最近，美国西北大学的一项研究表明，当你的生物学（表观遗传学）年龄大于你的实际年龄时，你患癌症的风险就会增加。而且，这两种年龄之间的差异越大，罹患癌症的风险就越高。相关研究结果发表在2月15日的《EBioMedicine》。 本研究通讯作者侯丽芳（音
人工智能预测患者的癌症起源和治疗反应
麻省理工学院（MIT）和丹娜-法伯癌症研究所的研究人员在国际顶尖医学期刊 Nature Medicine 上发表题为：Machine learning for genetics-based classification and treatment response prediction in c
利用数学增模型来预测癌症的发展趋势
近日，来自杜克大学的数学家通过研究开发出了一种新方法，该方法可以帮助医生们预测不同类型的癌症如何发展，尤其是当肿瘤的尺寸无法测量时，相关研究发表于国际杂志Bulletin of Mathematical Biology上。 在美国超过三分之一的个体都会在其生命阶段的某个时刻被诊断为癌症，而对肿
科学报告：化学计算能够预测癌症的发生
最近，赖斯大学的科学家们开发出了一种鉴别癌前体细胞何时会变成成熟的癌症的方法。 血液中的生物标记物可能会揭示出突变的细胞是否已转向形成肿瘤，以及这一过程可能需要多长时间（取决于癌症类型）。这可以使患者意识到他们生病之前面临的风险。 在最近一项研究中，Anatoly Kolomeisky与博士
从《我不是药神》看预测性癌症基因检测
近日，随着电影《我不是药神》的观影热潮，“慢性粒细胞性白血病”“格列卫”等恶性肿瘤有关的词汇成为焦点。癌症，是众多健康人群的恐惧中心。预测性癌症基因检测也随之日渐火爆起来。 最早将预测性癌症基因检测带入公众视野的是著名影星安吉丽娜·朱莉。2013年2月，朱莉决定切除双侧乳腺，因为她检测了自己
Nature－Methods：科学家成功使用AI预测癌症进化
一个来自英国和美国的联合研究团队已经开发出了一种使用人工智能预测肿瘤可能如何改变以及如何在病人体内传播的方法，相关研究成果于近日发表在《Nature Methods》上，题为“Detecting repeated cancer evolution from multi-region tumor
研究发现细胞的快速循环或能预测癌症的发生
如今科学家们对癌症的进展进行了广泛的研究，而且还对癌症进展的关键步骤进行了图谱绘制（至少在某些实体瘤中），介导癌症风险的基因的损伤往往会积累，并改变正常的细胞行为，从而诱发早期癌细胞的出现，最终会诱发正常细胞转变为恶性癌细胞。 图片来源：CC0 Public Domain 近日，一项刊登在国
芯片内部时钟电路原理
芯片内部时钟电路原理芯片内部时钟电路是一种用于提供芯片内部时钟信号的电路。它通常由一个振荡器、一个分频器和一个时钟控制器组成。振荡器是一种电路，它可以产生一个固定频率的时钟信号。振荡器可以是晶体振荡器（XO）、外部振荡器或内部振荡器。分频器是一种电路，它可以将振荡器产生的时钟信号除以一个固定的数字，
重订的遗传－时钟－
加州大学圣地亚哥分校的科学家们已经开发出一种可能减缓细胞衰老过程的方法，使用一个振荡的基因"时钟"。在测试中，发现酵母细胞的寿命明显长于那些没有的细胞。我们都害怕的熟悉的衰老症状从细胞层面开始。 构成人体的数万亿个细胞中的每一个都在其一生中经历了一连串的分子变化，承受着不同类型的损害，直到最后
蛋白质结构预测和分子动力学
作为结构基因组研究的互补，蛋白质结构预测的目标是发展出有效的能够提供未知结构（未通过实验方法得到）蛋白质的可信的结构模型。目前最为成功的结构预测方法是同源建模；这一方法是利用序列相似的蛋白质（已知结构）的结构作为“模板”。而结构基因组的目标正是通过解析大量蛋白质的结构来为同源建模提供足够的模板
检测癌症分子“指纹”可改进早期诊断
《分子细胞》杂志11日发布了一项研究，指出不同类型的癌症拥有独特的分子“指纹”，这些特征可以在疾病早期被检测到。这项由巴塞罗那基因组调控中心进行的研究发现，利用小型便携式扫描仪只需几个小时，就能以极高的精度获取这些“指纹”，为开发新的非侵入性诊断测试铺平了道路。这种测试能够比现有方法更快、更早地识别
分子影像学：癌症早期诊疗现生机
未来将会怎样？为什么我们不能更早地发现重症癌症？为什么我们要在疾病后期花费那么多时间和金钱？“我们应该对病人更好一些！”作为美国分子影像学的权威，美国国家科学院院士、斯坦福大学分子影像中心与核医学科主任Sanjiv Sam Gambhir教授在他的演讲开头提出了几个引人深思的问题。
分子分型－催生癌症问诊“新语系”
美国癌症基因组图谱研究发现，一些不同器官上的癌症具有很强的分子相似性，而有的癌症虽然发生在同一器官，却拥有完全不同的分子亚型。 “布满黄豆、绿豆大的小结节”“切面呈灰白色，坏死处呈灰黄色”……外观变化、色彩暗淡等因素一直以来被临床医生用作对癌症的判断依据。与此同时，癌症的发生，自然而然地依
数码DNA测试可帮助预测癌症患者的存活率
一种新的以数码方式计数T细胞的DNA检测可对卵巢癌患者的存活预测有帮助。这些发现增添了证据，这些证据提示含有大量的一种被称为肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)的T细胞与卵巢癌患者存活率的改善有关。Harlan Robins及其同事研发了一种基于DNA的测试，它能够以数码的方式对任何存在于某组织样本中
科学家称可通过DNA检测提前预测癌症发病
X射线下的乳房肿瘤----美联社 据卡塔尔半岛电视台网站8月5日报道，俄罗斯科学家宣布他们可以通过DNA检测提前三到五年预测到癌症的发病。如果这是真的，这将为癌症的预防和治疗打开新的视野。 “俄通社-塔斯社”周一援引莫斯科大学第一医学院新闻办公室消息称，医学院专家们发现了一种能够提前三到
Science发布癌症重要成果：能预测反应的新技术
两个研究组研发出了一种新型技术，能实时追踪癌症治疗复合疗法的疗效，这两个分别来自Fred Hutchinson 癌症研究中心，以及麻省理工的研究组将他们的研究成果发表在4月22日的Science Translational Medicine杂志上。 随着研究的深入，我们逐渐了解了肿瘤生物学，但
活细胞“内部时钟”首次找到
据物理学家组织网9月11日报道，美国科学家利用先进的荧光显微镜技术，首次对人体活细胞内细胞核的形状变化进行了动态研究，发现细胞核表现出快速波动性，这种“内部时钟信号”标志着人类首次找到表征细胞周期改变的物理特性，为理解生命物质构成和疾病成因提供新途径。 之前的相关研究，只能将发育到生命周期某个
最精准太空时钟即将发射
4月21日，最精确的太空时钟在美国佛罗里达州肯尼迪航天中心搭载美国太空探索技术公司的“猎鹰9”号火箭发射，并将利用地球上最好的时钟建立一个高度同步网络。然而，这个准备了数十年的项目只能运行几年，然后随着国际空间站在这十年结束时脱离轨道而燃烧殆尽。 太空原子钟组合（ACES） 是欧洲航天局（ES
海里的时钟－－氟氯烃
早上看科学新闻，看到了一条不大不小的消息。米国科罗拉多大学大石头（Boulder）分校（下面简称科大）在昨天（5月16日）发表在《自然》杂志上一项研究说自九十年代初期以来就被禁止生产的一种作为冰箱和空调致冷剂的化合物氟利昂在2012年后居然又有开始重新溜回大气趋势。这个发现原理上很简单 -因为
史上最精确的时钟诞生
科学家在制造一种全新类型的时钟方面迈出了重大的一步——一种基于原子核能量微小变化的时钟。原则上，核时钟甚至比目前世界上最好的计时器——光学时钟更精确，而且对干扰也不那么敏感。原则上，核时钟应该比光学时钟（如图）更精确、更稳定。图片来源：Andrew Brookes, National Physica
PNAS：脑膜瘤分子图谱帮助预测肿瘤的复发
最近，来自贝勒医学院和德克萨斯儿童医院神经科学研究所的研究人员在《PNAS》杂志上发表文章称，通过使用分子谱，能够更好地预测脑膜瘤复发。 第一作者Akash J. Patel博士解释说：“目前的脑膜瘤分类是根据世界卫生组织（WHO）提出的标准。它将脑膜瘤分为三类：I级（良性），II级（非典型）
三种分子可预测新冠肺炎严重程度
国际战“疫”行动 英国科学家在最新一期《自然·医学》杂志上撰文称，他们分析了63位新冠肺炎患者的血液样本，在患者血液中浓度异常的几种分子中，发现了可预测患者未来病情严重程度的3种分子：IP-10、白介素10和白介素，最新研究有助于对患者进行更好的管理。 据物理学家组织网20日报道，来自弗朗西
Nature：外核体的特殊靶标或可预测癌症的转移走向
理解肿瘤为何会在特殊器官中发生转移而不会在别的器官中转移是肿瘤学研究领域的一大目标，126年前，英国伦敦皇家医院的助理外科医生斯蒂芬？佩吉特(Stephen Paget) 提出了癌细胞转移的”种子与土壤”假说，该假说指出，癌症转移需要肿瘤细胞的扩散，同时也需要目的器官中良好的环境。 近日，一项
理化所等在癌症患者血栓风险精准预测方面获进展
静脉血栓栓塞症（VTE）是癌症患者致命的并发症。由于临床缺乏准确和有效的VTE风险评估方法，VTE的漏诊常常造成医疗干预的延迟甚至患者的死亡。研究表明，细胞外泌体（EVs）通过表面携带的组织因子，启动外源性凝血反应，致使血液的高凝状态甚至促进VTE的形成。有研究初步探讨了血浆EVs的促凝能力，但如何
癌症筛查需要个体化，不能仅仅依赖预期寿命预测
癌症筛查早期发现癌症和癌前病变的重要途径，但并不是立竿见影的，已经证明癌症筛查大约有10年的滞后期。越来越多的研究和临床实践指南建议，癌症筛查应考虑到患者的预期寿命，预期寿命有限的患者可能会受到筛查的短期危害。虽然，考虑预期寿命为癌症筛查提供信息是合理的，但如何在实践中最好地应用目前存在争议。
PNAS：“分子影院”开启癌症疗法新时代
近日，一项刊登在国际杂志Proceedings of the National Academy of Sciences上的研究论文中，来自利物浦大学等处的科学家通过研究开发了一种“结构影院”（structural movie），其可以帮助揭示机体中重要天然化学物的产生过程，这对于研究某些癌症非常