中科院Cell子刊发表lncRNA新发现

生物通报道:长非编码RNA(lncRNA)是一些长度超过二百个核苷酸的RNA分子,来自于基因组的非编码区域。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段特异性表达。研究者们普遍认为lncRNA具有重要的生物学意义,但对它们的具体功能还知之甚少。 中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所的研究团队最近鉴定了一种源自多顺反子转录本的lncRNA。他们在Molecular Cell杂志上发表文章指出,一种不寻常的加工机制会生成能隔离多个RNA结合蛋白的SPA LncRNA。这项研究的通讯作者是中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所的陈玲玲(Ling-Ling Chen)研究员。 研究显示,SPA LncRNA具有5′snoRNA帽子和3′多聚腺苷酸化。这种LncRNA的加工不仅与新生mRNA 3′加工有关,还涉及XRN2修剪与Pol II延伸的动态竞争。研究人员发现,位于15q11 -q......阅读全文

南京大学、第二军医大Nature揭示支持肿瘤起始细胞的lncRNA

肾肿瘤起始细胞(T-IC)推动了肾细胞癌(RCC)的发生、发展和药物抵抗。南京大学和第二军医大学的研究人员在Nature Communications杂志上发表文章,揭示了肾肿瘤起始细胞的一个增殖机制。文章通讯作者是第二军医大学的王林辉(Linhui Wang) 和南京大学医学院的张征宇(Zheng

Cell子刊:挑战传统理论的lncRNA

  几乎整个人类基因组都会转录成RNA,但只有一部分RNA被用于蛋白质生产。大多数RNA(非编码转录组)的功能还是未知的,长非编码RNA(lncRNA)就是其中之一。  德国亥姆霍兹慕尼黑中心(Helmholtz Zentrum München)的研究人员发现,一种lncRNA(称为PARTICLE

Cell子刊:挑战传统理论的lncRNA

  一度被认为在线虫和果蝇中即便不是不存在但也不会多见的DNA甲基化表观遗传标记,实际上普遍存在于这些生物体和藻类的整个基因组,且其并非发生于在哺乳动物中已知被修饰的胞嘧啶而是在腺嘌呤上。来自中外的华人科学家将这一重大发现发布在4月30日《细胞》(Cell)杂志上的3篇研究论文中。  西班牙塞维利亚

Diabetes:新研究发现调节leptin表达的lncRNA

  长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200nt的非编码RNA,其在转录沉默、转录激活、染色体修饰等方面有重要的功能。许多研究已经发现肥胖会诱导脂肪细胞发生剧烈的转录组变化,最近一些证据表明长非编码RNA在该过程中发挥关键作用。来自新加坡的研究人员对棕色脂肪细胞和白色脂肪细胞中与肥胖相关

四川农大BMC发表lncRNA新成果

  在过去的几年里,长非编码RNAs(lncRNAs)已经得以广泛研究。有研究已在小鼠、大鼠和人类中鉴定了大量的lncRNAs,其中一些已被证明在肌肉发育和生成过程中起着重要的作用。然而,对于覆盖家畜骨骼肌所有发育阶段的lncRNAs的特性,报道还较少。  8月22日,四川农业大学动物科技学院的研究

著名院士Nature重要发现:调控免疫的lncRNA

  来自宾夕法尼亚大学、Jackson基因组医学实验室、康涅狄格大学健康中心等处的研究人员,揭示一种叫做Morrbid的新型长链非编码RNA(lncRNA)调控了Bim及短寿骨髓细胞的寿命。这一重要的研究发现发布在8月15日的《自然》(Nature)杂志上。  纽约大学医学院的Richard A.

华裔学者Nature综述:lncRNA的独特之美

  几乎整个人类基因组都会转录成RNA,但只有一部分RNA被用于蛋白质生产。科学家们逐渐意识到,非编码RNA并不是基因组中的垃圾序列,而是许多基础生命过程的核心,有着广泛的生物学功能。然而,大多数RNA(非编码转录组)的功能还是未知的,长非编码RNA就是其中之一。  长非编码RNA(lnc

Nature:神秘lncRNA让免疫无过无不及

  根据宾夕法尼亚大学Perelman医学院病理学和实验医学助理教授Jorge Henao-Mejia博士领导的一项研究,称作长链非编码(lncRNAs)的特殊RNA分子是维持免疫健康的关键控制因子。这一研究发现为以一组白细胞异常寿命为特征的一些炎症性疾病提供了一个潜在药物靶点。研究论文发布在《自然

同济大学团队解析癌症中的lncRNA

  为了在氧含量较低的条件下存活,细胞需要启动一个复杂的响应机制,这一机制主要受到转录复合物HIF(缺氧诱导因子)的控制。几乎所有实体瘤的内部都是缺氧的,癌细胞也需要在HIF的帮助下适应环境,因此高水平HIF在实体瘤中非常常见。  人们普遍认为,缺氧条件以HIF-2α依赖的方式促进肾细胞癌(RCC)

中国学者解析肝癌中的lncRNA

  肝细胞癌(HCC)是原发性肝癌的主要类型, 也是恶性程度最高的肿瘤之一。作为全世界最常见的一种癌症类型,全球每年有超过50万新患者,严重地危害着人们的身体健康。我国是肝癌高发国家,每年约有11万人死于肝癌,其死亡率在我国十大恶性肿瘤的排名中已从第三位上升到第二位。尽管HCC的诊断和治疗已经取得了

lncRNA在农业领域的研究成果(二)

【思路及相应结果】内容与图片源:(王立方,2015)【结论】通过全转录组测序、lncRNA测序和实时荧光定量的方法发现和鉴定了与家蚕产丝相关的lncRNA和其在不同产丝阶段的表达量变化,挑出了与家蚕产丝调控紧密相关的非编码RNA和lncRNA。例如位于P25基因下游互补链的lncR2034,与P25

华人学者Nature-Genetics发布lncRNA重要发现

  研究人员通过研究遗传变异准确地找到了45个与前列腺癌疾病发生发展有关的基因。  项目负责人、大学健康网络玛格丽特公主癌症中心科学家、多伦多大学医学生物物理学系助理教授Hansen He说,发布在《自然遗传学》(Nature Genetics)上的研究结果,阐明了这些称作为“长链非编码RNA”(l

lncRNA在农业领域的研究成果(一)

miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar --没想到在农业上大展身手啦 你没看错!不是标题党。说到miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar,想必聪明博学的你就已经猜到了是lncRNA。今天大阅哥要给大家挖一挖lncRNA在农业上的研究进展。为了写这篇主题,大阅哥呕心沥

江南大学Nature子刊解析促癌lncRNA

  最近的初步研究报道了长非编码RNA——UCA1在结直肠癌中的促癌作用。然而,UCA1在结直肠癌中的功能和分子机制,仍然不明确。4月5日,Nature子刊《Scientific Reports》在线刊登了江南大学附属医院、苏州大学第二附属医院和复旦大学上海医学院的一项最新研究成果,题为“LncRN

lncRNA在农业领域的研究成果(三)

【结论】①通过lncRNA测序,在上万条白菜中候选的lncRNA中挑出了1,300余条与花粉授粉相关的lncRNAs。分析结果显示一部分lncRNA在花蕾到授粉受精整个发育过程中持续表达,其余的部分为阶段、部位特异性表达。lncRNA在白菜不同发育阶段花蕾种的表达呈现出较明显的差异,在V级花蕾中特异

lncRNA反向遗传学研究的典型案例

研究背景长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)普遍被认为是一类不能编码蛋白的长链RNA。由于其序列较长,所以可以有较大的潜力形成多种复杂构象,从而通过不同生物学途径发挥其作用。此外,由于其不具备蛋白编码能力,因此此类RNA也主要由其碱基序列形成的高级结构来执行生物

Cell-亮点|-反义lncRNA如何调控基因的表达?

  反义lncRNA(antisense lncRNA)是指由基因(通常是蛋白编码基因)的反义链转录,并与该基因的mRNA存在序列重叠的RNA分子。随着对非编码RNA研究的深入,研究发现约70%的基因均有反义lncRNA【1】。更为重要的是,反义lncRNA往往与其正义链基因的表达存在相关性,提示反

细胞外囊泡中富含lncRNA编码多肽/小蛋白且有疾病特异性

  lncRNAs是一类长度大于200个碱基且不编码蛋白的RNAs转录本。近年来,越来越多实验证据表明,许多lncRNAs转录本中的小开放阅读框(small open reading frame,smORFs)可以编码多肽/小蛋白(smORF encoded polypeptides or micr

Sci-Rep:PRC2与lncRNA相互作用的序列特异性新发现

  国际学术期刊《科学报告》(Scientific Reports)近期在线发表了中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所邵振研究组关于PRC2与长非编码RNA(lncRNA)之间相互作用的序列特异性研究成果。  由多梳(PcG)家族蛋白组成的表观调控复合物PRC2是控制动物组织发育的重要因子,但在

PRC2与lncRNA相互作用的序列特异性研究获进展

  国际学术期刊《科学报告》(Scientific Reports)近期在线发表了中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所邵振研究组关于PRC2与长非编码RNA(lncRNA)之间相互作用的序列特异性研究成果,题为The PRC2-binding long non-coding RNAs in hu

孙树汉:长链非编码RNA在肝癌转移过程中的功能研究

  10月31日,2014(第二届)非编码RNA学术研讨会继续在上海好望角大饭店(中科院上海学术活动中心)如火如荼地进行。  来自第二军医大学遗传学教研室的孙树汉教授介绍了长链非编码RNA在肝癌转移过程中的功能研究。在研究非编码RNA肝炎病毒致癌过程的作用中,该课题组发现在HCV中,miR-155表

研究发现空气污染诱发肺癌关键长链非编码RNA

  中科院动物所周光飚研究组通过深入研究,发现了空气污染诱发肺癌的关键长链非编码RNA。相关成果日前发表于肿瘤学杂志Oncotarge。  据了解,肺癌已成为全球发病率最高、致死人数最多的癌症,其中90%的肺癌由吸烟、空气污染等环境因素引起。然而,空气污染诱发肺癌的分子机制目前尚不清楚。  此前研究

陈玲玲研究员Cell-Res解析癌相关lncRNA

  报道 来自中科院上海生命科学研究院、第二军医大学的研究人员在新研究中证实,人类结直肠癌特异性的CCAT1-L lncRNA调控了MYC基因位点的远程染色质相互作用。这一研究发现在线发表在3月25日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。   论文的通讯作者是中科院上海生命科学院

LncRNADILC阻碍肝癌干细胞更新和增殖

   中国工程院院士、第二军医大学王红阳教授课题组长期从事恶性肿瘤的基础与临床研究,对肿瘤发生发展的分子病理机制和细胞信号转导有重要建树。近期,该实验室使用Arraystar LncRNA芯片发现了与肝癌干细胞的自我更新相关的分子--Lnc-DILC。高表达的Lnc-DILC可以竞争性结合IL-6,

应用Arraystar-LncRNA芯片研究宿主抗病毒反应

中科院微生物研究所/福建农林大学的陈吉龙研究员长期从事流感病毒致病机理、抗病毒免疫学、病毒感染诱导肿瘤发生机理、肿瘤免疫学等领域的研究。近期,其实验室利用Arraystar Human LncRNA 芯片研究发现了一种新的调控宿主抗病毒反应的长链非编码RNA——NRAV,通过抑制干扰素刺激基

Nature-子刊:研究lncRNA功能的新方法

  长非编码RNA(lncRNA)是长达两百个核苷酸以上的转录本。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。细胞中绝大多数lncRNA位于细胞核,它们对应的DNA区域有的与蛋白编码基因重叠,有的位于基因间或者内含子中。

揭示lncRNA在EMT过程中发挥的作用

西班牙塞利维亚大学教授José A Pintor-Toro长期从事生物化学与细胞生物学研究, 近期,其实验室利用Arraystar LncRNA芯片研究发现了在TGF-β诱导的上皮-间质细胞转化(EMT)过程早期起直接调控作用的lncRNA分子—lnc-Spry1,TGF-β诱导直接引起lnc-Sp

Arraystar-lncRNA芯片应用于乳腺癌研究

德克萨斯大学安德森癌症中心的华人学者杨柳青博士主要从事肿瘤转移及信号传导方面的基础研究。近期,杨柳青博士应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了乳腺癌组织的长链非编码RNA(lncRNA)表达情况,并且发现部分lncRNA可以直接和脂质(磷脂酰肌醇三磷酸PIP3、卵磷脂PC等)发生相互

共表达分析挖掘lncRNA的生物学功能

  lncRNA研究是目前生命科学领域的研究热点,但是,目前对于lncRNA的功能理解还处于初级阶段。据不完全统计,目前已知功能的lncRNA不超过1000条。因此,怎么在现有基础上去挖掘lncRNA的生物学功能呢?针对lncRNA和mRNA的共表达研究,为我们理解lncRNA在疾病中的生物学功能提

食物中的成分如何影响重要的lncRNA表达?

  尽管不断有突破性研究成果涌现,癌症依然还是令人谈虎色变的绝症。各种传说中的防癌食品一会儿备受热捧,一会儿又被各种科技网红辟谣扒皮,令人搞不清方向。不过常言道,research,research,就是要反反复复来来回回地search,不然那怎么叫re-search?众多网红的抗癌食物中,花椰菜始终